Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1376
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1376, 414 aa
1>>>pF1KA1376 414 - 414 aa - 414 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8342+/-0.000782; mu= 14.4379+/- 0.047
mean_var=71.2362+/-13.920, 0's: 0 Z-trim(108.5): 10 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.151958
statistics sampled from 10212 (10221) to 10212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 3.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34202.1 ARRDC3 gene_id:57561|Hs108|chr5 ( 414) 2792 621.1 6e-178
CCDS12370.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 ( 407) 1449 326.7 2.5e-89
CCDS10377.1 ARRDC4 gene_id:91947|Hs108|chr15 ( 418) 1396 315.1 8.1e-86
CCDS32956.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 ( 402) 1203 272.7 4.3e-73
CCDS72876.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 ( 391) 946 216.4 3.8e-56
CCDS81368.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 ( 336) 926 212.0 6.9e-55
CCDS7049.1 ARRDC1 gene_id:92714|Hs108|chr9 ( 433) 324 80.1 4.6e-15
>>CCDS34202.1 ARRDC3 gene_id:57561|Hs108|chr5 (414 aa)
initn: 2792 init1: 2792 opt: 2792 Z-score: 3308.3 bits: 621.1 E(32554): 6e-178
Smith-Waterman score: 2792; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
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CCDS34 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQRRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQRRN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KA1 NLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
370 380 390 400 410
>>CCDS12370.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 (407 aa)
initn: 1434 init1: 951 opt: 1449 Z-score: 1717.2 bits: 326.7 E(32554): 2.5e-89
Smith-Waterman score: 1449; 53.6% identity (78.9% similar) in 412 aa overlap (1-411:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
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CCDS12 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRLRARGRAHVHWT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
:::.:::.:::::.:.:.:: .:. :.. :..: :. ::::. :::.::
CCDS12 ESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLA----PDTGET--TTLPPGRHEFLFSFQLPP
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKT
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CCDS12 T-LVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKM
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CCDS12 ARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGAR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMD
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CCDS12 KQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KA1 LFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTE-EQRR
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CCDS12 LLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NNLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
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CCDS12 LGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNP-LLGDMRPRCMTC
360 370 380 390 400
>>CCDS10377.1 ARRDC4 gene_id:91947|Hs108|chr15 (418 aa)
initn: 1418 init1: 1271 opt: 1396 Z-score: 1654.2 bits: 315.1 E(32554): 8.1e-86
Smith-Waterman score: 1396; 52.2% identity (77.0% similar) in 408 aa overlap (4-409:15-413)
10 20 30 40
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKI
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CCDS10 MGGEAGCAAAVGAEGRVKSLGLVFE---DERKGCYSSGETVAGHVLLEASEPVALRALRL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 HARGHAKVRWTESR--NAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHS
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CCDS10 EAQGRATAAWGPSTCPRASASTAALAVFSE-VEYLNVRLSL----REPPAGE-GIILLQP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GRHEYAFSFELPQTPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTP
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CCDS10 GKHEFPFRFQLPSEPLVTSFTGKYGSIQYCVRAVLERPKVPDQSVKRELQVVSHVDVNTP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 SLLSPQAGTKEKTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAA
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CCDS10 ALLTPVLKTQEKMVGCWFFTSGPVSLSAKIERKGYCNGEAIPIYAEIENCSSRLIVPKAA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 IYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEY
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CCDS10 IFQTQTYLASGKTKTIRHMVANVRGNHIASGSTDTWNGKTLKIPPVTPSILDCCIIRVDY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPP
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CCDS10 SLAVYIHIPGAKKLMLELPLVIGTIPYNGFGSRNSSIASQFSMDMSWLTLTLPEQPEAPP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 SYAEVVTEEQRRNNLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADD
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CCDS10 NYADVVSEEEFSRHIPPYPQPPNCEGEVCCPVFACIQEFRFQPPPLYSEVDPHPSDVEES
360 370 380 390 400 410
410
pF1KA1 RPSCPSR
.:
CCDS10 QPVSFIL
>>CCDS32956.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 (402 aa)
initn: 1289 init1: 951 opt: 1203 Z-score: 1425.8 bits: 272.7 E(32554): 4.3e-73
Smith-Waterman score: 1324; 51.9% identity (76.9% similar) in 389 aa overlap (24-411:21-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
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CCDS32 MRSGGVRSFALELARGPGGAYRGGERLCGRVLLEAAAPLRVRALEVKARGGAATHWL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
:.:..: : : ...:. :. ....:. :: .. :. ::::. :::.::
CCDS32 EGRSVGVN-AVSSDYAAAETYLRRRQLLL---RDTGETT----TLPPGRHEFLFSFQLPP
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKT
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CCDS32 T-LVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKM
:.:. : .::::::.:::::::: : .::::.: :.: :.:.::. :::.:.:.:
CCDS32 ARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGAR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMD
:. . .::.: :: .. :. :.:. :.::::.:::: : ...:.:.: : :::::.
CCDS32 KQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KA1 LFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTE-EQRR
:.:.::::::::::::::::.:::.:. :. ..: .::::::::: :.:::.. :.
CCDS32 LLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NNLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
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CCDS32 LGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNP-LLGDMRPRCMTC
350 360 370 380 390 400
>>CCDS72876.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 1038 init1: 672 opt: 946 Z-score: 1121.5 bits: 216.4 E(32554): 3.8e-56
Smith-Waterman score: 1049; 42.1% identity (70.8% similar) in 401 aa overlap (1-399:2-383)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRW
... :.::. . : :: . ::.::. :.::: .:: :::...: : : ::: :
CCDS72 MVMFKKIKSFEVVF---NDPE-KVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRILACGVAKVLW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 TESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSG-RHEYAFSFEL
. :: :. . ::. ..: :. .:. ..:. . .. : ..:: :.:::
CCDS72 MQ----GS-----QQCKQTSEYLRYEDTLL--LEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFEL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 PQTPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKE
:: ::.:::.:..: : ::::: : :: . ::.: : . .:.:::.:..: .. ::
CCDS72 PQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVVDLVDVNTPDLMAPVSAKKE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKG
: . : : .: .:.::.:.:::. :. :.: :..:: ::.::::::: ... :.:
CCDS72 KKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 KMKEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGA
. : . : ....::. . :: .: :: :.. . :::: :.:.::::::..::..::.
CCDS72 QTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYSLLIYVSVPGS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MDLFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQR
..:.::::::. ..:::::..:. : .:.:..:..:. ::::: : .:. :..:
CCDS72 KKVILDLPLVIGS--RSGLSSRTSSMASRTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDVIPEDHR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 RNNLAPVSAC-DDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
.. :.. ::.. . ..:.: : ::.:.::: :.:.::
CCDS72 LES--PTTPLLDDMDGSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCILNNNVQ
350 360 370 380 390
>>CCDS81368.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 (336 aa)
initn: 932 init1: 672 opt: 926 Z-score: 1098.9 bits: 212.0 E(32554): 6.9e-55
Smith-Waterman score: 926; 45.5% identity (75.0% similar) in 292 aa overlap (109-399:41-328)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 VEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQTPLATSFEGRHGSVRYWV
..:: :.::::: ::.:::.:..: : :::
CCDS81 CILSVTASLMATRFSFPSGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWV
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 KAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKTLCCWFCTSGPISLSAKIE
:: : :: . ::.: : . .:.:::.:..: .. ::: . : : .: .:.::.:.
CCDS81 KAFLDRPSQPTQETKKNFEVVDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARID
80 90 100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 RKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKMKEVKQLVANLRGESLSSG
:::. :. :.: :..:: ::.::::::: ... :.:. : . : ....::. . ::
CCDS81 RKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISG
140 150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 KTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMDLFLNLPLVIGTIPLHPFG
.: :: :.. . :::: :.:.::::::..::..::. ..:.::::::. ..
CCDS81 TCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYSLLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGS--RSGLS
200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 SRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTEEQRRNNLAPVSAC-DDFERALQG
:::::..:. : .:.:..:..:. ::::: : .:. :..: . .:.. ::.. . ..
CCDS81 SRTSSMASRTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDVIPEDHRLE--SPTTPLLDDMDGSQDS
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410
pF1KA1 PLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
:.: : ::.:.::: :.:.::
CCDS81 PIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCILNNNVQ
310 320 330
>>CCDS7049.1 ARRDC1 gene_id:92714|Hs108|chr9 (433 aa)
initn: 102 init1: 71 opt: 324 Z-score: 383.8 bits: 80.1 E(32554): 4.6e-15
Smith-Waterman score: 361; 25.5% identity (54.6% similar) in 416 aa overlap (3-413:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
.:.:. . :: :. . : ::: :. ..: : ... . . ..... : :
CCDS70 MGRVQLFEIS---LSHGRV-VYSPGEPLAGTVRVRLGAPLPFRAIRVTCIGSCGV---
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
:: : .. : ::: . : ...: .. .:.: . :.: ::
CCDS70 ------SNKANDTAWVVEEGYFNSSLSL---------ADKG--SLPAGEHSFPFQFLLPA
60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KA1 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPV-KLKKEFTVFEHIDINT-PSLLSPQAGTKE
: ::::: :.. . :.: .: : . : . : .. ...:. :.. .:....
CCDS70 TA-PTSFEGPFGKIVHQVRAAIHTPRFSKDHKCSLVFYILSPLNLNSIPDIEQPNVASAT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KTLCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPK-AAIYQTQAFYAK
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CCDS70 KKFSYKLVKTGSVVLTASTDLRGYVVGQALQLHADVENQSGKDTSPVVASLLQKVSYKAK
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