FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1361, 1001 aa
1>>>pF1KA1361 1001 - 1001 aa - 1001 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.7878+/-0.00142; mu= -27.4474+/- 0.084
mean_var=634.0338+/-135.383, 0's: 0 Z-trim(111.4): 575 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.050935
statistics sampled from 11747 (12353) to 11747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 4.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 6612 502.0 2.4e-141
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 4382 338.1 4.7e-92
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 3775 293.5 1.2e-78
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 2466 197.4 1.3e-49
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 2310 185.9 3.9e-46
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 2310 186.0 4.2e-46
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 809 75.4 3.2e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 799 74.6 4.8e-13
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 799 74.7 4.9e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 786 73.7 1.1e-12
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 785 73.7 1.1e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 794 74.5 1.2e-12
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 780 73.2 1.2e-12
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 764 72.1 2.8e-12
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 737 70.3 2e-11
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 737 70.3 2e-11
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 721 69.1 4.2e-11
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 721 69.1 4.2e-11
>>CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001 aa)
initn: 6612 init1: 6612 opt: 6612 Z-score: 2651.0 bits: 502.0 E(32554): 2.4e-141
Smith-Waterman score: 6612; 100.0% identity (100.0% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ASSQSSSVNSLPDVSDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDPRTRASDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASSQSSSVNSLPDVSDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDPRTRASDPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKEELNENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHFQAEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKEELNENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHFQAEEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQDLVREELNKRQTQKDLEHAMLLRQHESMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQDLVREELNKRQTQKDLEHAMLLRQHESMQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ELEFRHLNTIQKMRCELIRLQHQTELTNQLEYNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSLKSKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELEFRHLNTIQKMRCELIRLQHQTELTNQLEYNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSLKSKEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELELLNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELELLNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQAREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNLSPEAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQAREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNLSPEAF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 SHSYPGASGWSHNPTGGPGPHWGHPMGGPPQAWGHPMQGGPQPWGHPSGPMQGVPRGSSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHSYPGASGWSHNPTGGPGPHWGHPMGGPPQAWGHPMQGGPQPWGHPSGPMQGVPRGSSM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KA1 GVRNSPQALRRTASGGRTEQGMSRSTSVTSQISNGSHMSYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVRNSPQALRRTASGGRTEQGMSRSTSVTSQISNGSHMSYT
970 980 990 1000
>>CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 (898 aa)
initn: 4457 init1: 2304 opt: 4382 Z-score: 1766.1 bits: 338.1 E(32554): 4.7e-92
Smith-Waterman score: 4382; 73.6% identity (91.2% similar) in 900 aa overlap (6-900:2-897)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
: : :::::::.::.:.:::.:: :.::::::::::::: ...:.:::::::::
CCDS91 MRKGVLKDPEIADLFYKDDPEELFIGLHEIGHGSFGAVYFATNAHTSEVVAIKKMS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
:::::. ::::::.::::::...::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS91 YSGKQTHEKWQDILKEVKFLRQLKHPNTIEYKGCYLKEHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
::::::::::::::::.::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KPLQEVEIAAITHGALHGLAYLHSHALIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDIWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
.:::::::::.: :: ::: :::::::.:::: :::.: :: :.:: ::::::::::::
CCDS91 DSPTLQSNEWTDSFRRFVDYCLQKIPQERPTSAELLRHDFVRRDRPLRVLIDLIQRTKDA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
::::::::::::::.::::..::: :.::.::...::.. . ..:.:::.::::::.:
CCDS91 VRELDNLQYRKMKKILFQETRNGPLNESQEDEEDSEHGTSLNREMDSLGSNHSIPSMSVS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KA1 ASSQSSSVNSLPDVSDDKS-ELDMMEGDH-TVMSNSSVIHLKPEEENYREE---GDPRTR
..::::::::. .: :..: :: ::. :. :. :.:::.: : .. :.: ::::
CCDS91 TGSQSSSVNSMQEVMDESSSELVMMHDDESTINSSSSVVH-KKDHVFIRDEAGHGDPRP-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 ASDPQSPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQ
.:. .:. . ::::::.::::..:::::::..::::..:::::::::::::::::
CCDS91 --EPRPTQSVQSQALHYRNRERFATIKSASLVTRQIHEHEQENELREQMSGYKRMRRQHQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 KQLMTLENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKK
:::..::::::::::::::.:.:..::. :: . :.::: ::. : .:::::: . .:::
CCDS91 KQLIALENKLKAEMDEHRLKLQKEVETHANNSSIELEKLAKKQVAIIEKEAKVAAADEKK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 FQQHIQAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKEELNENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHF
:::.: :::::.:..::::::..::. ::..:::.::..::::::::: .::.:::.::
CCDS91 FQQQILAQQKKDLTTFLESQKKQYKICKEKIKEEMNEDHSTPKKEKQERISKHKENLQHT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 QAEEEANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQDLVREELNKRQTQKDLEHAMLLRQ
::::::.:: .:: : . .:: :::.... ::..::. .::::::..:::..:::::.:.
CCDS91 QAEEEAHLLTQQRLYYDKNCRFFKRKIMIKRHEVEQQNIREELNKKRTQKEMEHAMLIRH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 HESMQELEFRHLNTIQKMRCELIRLQHQTELTNQLEYNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSL
:: .:::.:.:.:.::.: .:::::::::: :::::::::::::.::::::.:::::.:
CCDS91 DESTRELEYRQLHTLQKLRMDLIRLQHQTELENQLEYNKRRERELHRKHVMELRQQPKNL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 KSKELQIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQY
:. :.:::::::::::.::.:::::.:: ::.:::.:::..:: ::.:::::::::::::
CCDS91 KAMEMQIKKQFQDTCKVQTKQYKALKNHQLEVTPKNEHKTILKTLKDEQTRKLAILAEQY
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 DHSINEMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELELLNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELE
..:::::...::::::::::::::.:..:::::.:::::::::::::.::::.:::..::
CCDS91 EQSINEMMASQALRLDEAQEAECQALRLQLQQEMELLNAYQSKIKMQTEAQHERELQKLE
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 QRVSLRRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQAREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNL
:::::::: ::::::::. :::.::.:::..::::: ::::.:: ::.:.::.:.: ..
CCDS91 QRVSLRRAHLEQKIEEELAALQKERSERIKNLLERQEREIETFDMESLRMGFGNLVTLDF
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 SPEAFSHSYPGASGWSHNPTGGPGPHWGHPMGGPPQAWGHPMQGGPQPWGHPSGPMQGVP
: .
CCDS91 PKEDYR
>>CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (853 aa)
initn: 3960 init1: 3734 opt: 3775 Z-score: 1525.3 bits: 293.5 E(32554): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 5331; 85.2% identity (85.2% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-853)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MPSTNRAGSLKDPEIAELFFKEDPEKLFTDLREIGHGSFGAVYFARDVRTNEVVAIKKMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YSGKQSTEKWQDIIKEVKFLQRIKHPNSIEYKGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KPLQEVEIAAITHGALQGLAYLHSHTMIHRDIKAGNILLTEPGQVKLADFGSASMASPAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ESPTLQSNEWSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLIDLIQRTKDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQSIPSMSIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ASSQSSSVNSLPDVSDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDPRTRASDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASSQSSSVNSLPDVSDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDPRTRASDPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMRRQHQKQLMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 LENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LENKLKAEMDEHRLRLDKDLETQRNNFAAEMEKLIKKHQAAMEKEAKVMSNEEKKFQQHI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKEELNENQSTPKKEKQEWLSKQKENIQHFQAEEE
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QAQQKKELNSFLESQKREYKLRKEQLKE--------------------------------
550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ANLLRRQRQYLELECRRFKRRMLLGRHNLEQDLVREELNKRQTQKDLEHAMLLRQHESMQ
CCDS56 ------------------------------------------------------------
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ELEFRHLNTIQKMRCELIRLQHQTELTNQLEYNKRRERELRRKHVMEVRQQPKSLKSKEL
::::
CCDS56 --------------------------------------------------------SKEL
570
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QIKKQFQDTCKIQTRQYKALRNHLLETTPKSEHKAVLKRLKEEQTRKLAILAEQYDHSIN
580 590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELELLNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EMLSTQALRLDEAQEAECQVLKMQLQQELELLNAYQSKIKMQAEAQHDRELRELEQRVSL
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQAREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNLSPEAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RRALLEQKIEEEMLALQNERTERIRSLLERQAREIEAFDSESMRLGFSNMVLSNLSPEAF
700 710 720 730 740 750
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CCDS13 VPVESDL-----QEIIKEISIMQQCDSPHVVKYYGSYFKNTDLWIVMEYCGAGSVSDIIR
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CCDS13 LRNKTLTEDEIATILQSTLKGLEYLHFMRKIHRDIKAGNILLNTEGHAKLADFGVAGQLT
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CCDS13 DTMAKRNTVIGTPFWMAPEVI---QEIGYNCVADIWSLGITAIEMAEGKPPYADIHPMRA
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pF1KA1 LYHIAQNESPTLQSNE-WSDYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEELLKHIFVLRERPETVLID
.. : : ::... : ::: : .:: .:: : :..: :. .::.: :: . ..: :
CCDS13 IFMIPTNPPPTFRKPELWSDNFTDFVKQCLVKSPEQRATATQLLQHPFVRSAKGVSILRD
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 LIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKLLFQEAHNGPAVEAQEEEEEQDHGVGRTGTVNSVGSNQ
::... :. :.:. :. . : . ::.:.: :. : .::...
CCDS13 LINEAMDV----------KLKRQESQQREVDQDDEENSEEDEMDSGT----MVRAVGDEM
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pF1KA1 SIPSMSISASSQSSSVNSLPDVSDDKSELDMMEGDHTVMSNSSVIHLKPEEENYREEGDP
. .. . ::......:. :.: : :. :. ... .. :.:. :::
CCDS13 G--TVRV-ASTMTDGANT------------MIEHDDTLPSQLGTMVINAEDEE--EEGTM
340 350 360 370 380
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pF1KA1 RTRASDPQSPPQVSRHKSHYRNREHFATIRTASLVTRQMQEHEQDSELREQMSGYKRMR-
. : : : .....:. : . . . .. .: .. : . :. ..
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.. ::.:..:. .. :..: : . ...:. . .: ...:
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.: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]