Result of FASTA (omim) for
pF1KA1342
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1342, 425 aa
1>>>pF1KA1342 425 - 425 aa - 425 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5617+/-0.000472; mu= 10.7922+/- 0.029
mean_var=117.2881+/-24.182, 0's: 0 Z-trim(111.9): 306 B-trim: 850 in 1/52
Lambda= 0.118426
statistics sampled from 20308 (20680) to 20308 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 7.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065834 (OMIM: 600103) synaptotagmin-4 [Homo sap ( 425) 2787 487.9 2.1e-137
XP_005245071 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagm ( 430) 1514 270.4 6.3e-72
NP_689493 (OMIM: 608741) synaptotagmin-11 [Homo sa ( 431) 1496 267.3 5.3e-71
XP_016856248 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagm ( 434) 1496 267.3 5.3e-71
NP_001238994 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 478) 798 148.1 4.6e-35
XP_011543642 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 484) 798 148.1 4.6e-35
XP_011543641 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 528) 798 148.1 4.9e-35
NP_001287702 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 447) 792 147.0 8.8e-35
XP_011543643 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 453) 792 147.0 8.9e-35
NP_004191 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isoform 2 ( 403) 788 146.3 1.3e-34
XP_011543645 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 409) 788 146.3 1.3e-34
XP_005274442 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 611) 785 145.9 2.6e-34
XP_011543640 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 617) 785 145.9 2.6e-34
XP_005274441 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 642) 785 146.0 2.7e-34
XP_011543639 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 648) 785 146.0 2.7e-34
XP_005274440 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 686) 785 146.0 2.8e-34
XP_011543637 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 692) 785 146.0 2.8e-34
XP_005274444 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 449) 782 145.3 2.9e-34
XP_011543638 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 651) 783 145.6 3.4e-34
XP_006718799 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 293) 775 144.0 4.8e-34
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 765 142.4 1.9e-33
NP_995320 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sap ( 425) 763 142.1 2.6e-33
NP_001257734 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo ( 425) 763 142.1 2.6e-33
XP_016855860 (OMIM: 607718) PREDICTED: synaptotagm ( 443) 763 142.1 2.7e-33
XP_006723403 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 385) 762 141.9 2.7e-33
NP_001284703 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isofor ( 382) 760 141.5 3.5e-33
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 757 141.0 5e-33
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 757 141.0 5e-33
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 757 141.0 5e-33
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 757 141.0 5e-33
XP_016855802 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 419) 757 141.0 5.3e-33
NP_796376 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 [H ( 419) 757 141.0 5.3e-33
NP_001129976 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 ( 419) 757 141.0 5.3e-33
XP_016855799 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 476) 757 141.1 5.8e-33
XP_016855800 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 754 140.5 7.6e-33
XP_016855801 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 754 140.5 7.6e-33
XP_011507494 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 754 140.5 7.6e-33
XP_016855798 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 479) 754 140.6 8.4e-33
NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 744 138.8 2.5e-32
XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 744 138.8 2.5e-32
NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 744 138.8 2.5e-32
XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 744 138.8 2.5e-32
NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 744 138.8 2.5e-32
XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 743 138.6 2.8e-32
XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 743 138.6 2.8e-32
NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 743 138.6 2.8e-32
NP_783860 (OMIM: 613528) synaptotagmin-9 [Homo sap ( 491) 734 137.2 9.1e-32
XP_011518206 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 492) 734 137.2 9.1e-32
XP_011518204 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 535) 734 137.2 9.8e-32
XP_011518203 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 564) 734 137.2 1e-31
>>NP_065834 (OMIM: 600103) synaptotagmin-4 [Homo sapiens (425 aa)
initn: 2787 init1: 2787 opt: 2787 Z-score: 2587.8 bits: 487.9 E(85289): 2.1e-137
Smith-Waterman score: 2787; 100.0% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLKGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSDLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVPKNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPSDLEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ATPKLFLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVVNIKEARGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQIQELALHF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLCYQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLCYQST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNELFVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 DIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGGEHWKEICDYPRRQIAKWH
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VLCDG
:::::
NP_065 VLCDG
>>XP_005245071 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagmin-1 (430 aa)
initn: 1460 init1: 1162 opt: 1514 Z-score: 1412.3 bits: 270.4 E(85289): 6.3e-72
Smith-Waterman score: 1514; 53.3% identity (79.7% similar) in 433 aa overlap (1-424:1-429)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
:: ::. : :: :.:.:...: :: ::. :.: ::.... :..:.:::::.:.::
XP_005 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
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XP_005 GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
XP_005 CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
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XP_005 TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
.:.:.::: .::::::::::.::::..::.:.. : ::. ..:.:::::..: .::::
XP_005 LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNA
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XP_005 VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSDPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLNP
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pF1KA1 VFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICDY
.::: :..::: . : :::.::::.: .: ..:::.:.:.::: .. ..:.:::.:.:.
XP_005 IFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCES
360 370 380 390 400 410
420
pF1KA1 PRRQIAKWHVLCDG
::. .:::: : .
XP_005 PRKPVAKWHSLSEY
420 430
>>NP_689493 (OMIM: 608741) synaptotagmin-11 [Homo sapien (431 aa)
initn: 1123 init1: 825 opt: 1496 Z-score: 1395.7 bits: 267.3 E(85289): 5.3e-71
Smith-Waterman score: 1496; 53.0% identity (79.5% similar) in 434 aa overlap (1-424:1-430)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
:: ::. : :: :.:.:...: :: ::. :.: ::.... :..:.:::::.:.::
NP_689 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
:..::::.:..:::. .. :. :. . .: .: . : . : :.: :
NP_689 GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
NP_689 CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
.:.::.:::.::.:.. :::::::::::.:.:.::::::::::::.::::::::::::.:
NP_689 TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
.:.:.::: .::::::::::.::::..::.:.. : ::. ..:.:::::..: .::::
NP_689 LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS-DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPN
.:: :: ... .:::::::::::: :..::: .::::::.:...:::.:::::::::: :
NP_689 VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGNPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKCTLN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 AVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKEICD
.::: :..::: . : :::.::::.: .: ..:::.:.:.::: .. ..:.:::.:.:.
NP_689 PIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWREVCE
360 370 380 390 400 410
420
pF1KA1 YPRRQIAKWHVLCDG
::. .:::: : .
NP_689 SPRKPVAKWHSLSEY
420 430
>>XP_016856248 (OMIM: 608741) PREDICTED: synaptotagmin-1 (434 aa)
initn: 1446 init1: 825 opt: 1496 Z-score: 1395.6 bits: 267.3 E(85289): 5.3e-71
Smith-Waterman score: 1496; 52.9% identity (78.9% similar) in 437 aa overlap (1-424:1-433)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSL--FAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHVLK
:: ::. : :: :.:.:...: :: ::. :.: ::.... :..:.:::::.:.::
XP_016 MAEITNIRPSFDVSPVVAGLIGASVLVVCVSVTVFVWSCCHQQAEKKQKNPPYKFIHMLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GVDIYPENLNSKKKFGADDKNEVKNKPAVP--KNSLHLDLEKRDLNGNFPKTNLKPGSPS
:..::::.:..:::. .. :. :. . .: .: . : . : :.: :
XP_016 GISIYPETLSNKKKIIKVRRD--KDGPGREGGRRNLLVDAAEAGLLSR-DKDPRGPSSGS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DLENATPKL----FLEGEKESVSPESLKSSTSLTSEEKQEKLGTLFFSLEYNFERKAFVV
... :. :.. :..: :. :: .: :.. ::.: ::..::: .::.::
XP_016 CIDQLPIKMDYGEELRSPITSLTPGESKT-TSPSSPEEDVMLGSLTFSVDYNFPKKALVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NIKEARGLPAMDEQSMTSDPYIKMTILPEKKHKVKTRVLRKTLDPAFDETFTFYGIPYTQ
.:.::.:::.::.:.. :::::::::::.:.:.::::::::::::.::::::::::::.:
XP_016 TIQEAHGLPVMDDQTQGSDPYIKMTILPDKRHRVKTRVLRKTLDPVFDETFTFYGIPYSQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IQELALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELL
.:.:.::: .::::::::::.::::..::.:.. : ::. ..:.:::::..: .::::
XP_016 LQDLVLHFLVLSFDRFSRDDVIGEVMVPLAGVDPSTGKVQLTRDIIKRNIQKCISRGELQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KA1 ISLCYQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLS----DPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKC
.:: :: ... .:::::::::::: :..::: :::::::.:...:::.:::::::::
XP_016 VSLSYQPVAQRMTVVVLKARHLPKMDITGLSGRAPDPYVKVNVYYGRKRIAKKKTHVKKC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 TPNAVFNELFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGA-AAEGTGGEHWKE
: : .::: :..::: . : :::.::::.: .: ..:::.:.:.::: .. ..:.:::.:
XP_016 TLNPIFNESFIYDIPTDLLPDISIEFLVIDFDRTTKNEVVGRLILGAHSVTASGAEHWRE
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KA1 ICDYPRRQIAKWHVLCDG
.:. ::. .:::: : .
XP_016 VCESPRKPVAKWHSLSEY
420 430
>>NP_001238994 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isoform 1 (478 aa)
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10 20 30 40 50 60
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70 80 90 100 110 120
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: : :... :. : :.: : .:. .: :: .: : . . :.
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pF1KA1 VLCDG
:
XP_011 QLKA
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XP_011 YGDPRLSLNGTLLSGAKVAAAAGLAVEREGRLGEKPAPVPPPGE-DALRSGGAAPSEPGS
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:.. : ..:::.: :..: ::::::: :.. ::. :::: . : . : .::: :.::
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. . :. . .:.. : : : . .: ..:.:: . ::. :::......:
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. . :.. .:..:::::.: :::: :::. ..:.. . . . .: :..:::::
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:: : .. : :.. .: .. ..:... .: . : .: .: .. .
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:.: : .:. .: :: .: : . . :. . .:.. : : : . .:
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..:.:: . ::. :::......:.: .:. ::: : : ::::..:. .::.::::
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..:.: ::.:.: ..::: : :.:: .. . :.. .:..:::::.: :::: :::. ..
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:.. . . . .: :..:::::.::::. ..:.. : ..:::.: :..: :::
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.:::.. :. . : : .:::.. ::. .:.:: :
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pF1KA1 MAPITTSREEFDEIPTVVGIFSAFGLVFTVSLFAWICCQRKSSKSNKTPPYKFVHV
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NP_004 YRDPEAASPGAPSRDVLLVSAIITVSLSVTVVLCGLCHW--CQRKLGKR-----YKNSLE
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:. .. . :: . ... : :: .. : . ..: . :.... :
NP_004 TVGTPDSGRGRSEKKAIKLPAGGKAVNTAPVPGQTPHDESDRR----TEPRSSV-----S
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:: :. : .: .:: : .. . ..:.:: . ::. :::......:.: .
NP_004 DLVNS-----LTSEMLMLSPGSEEDEAHEGC--SRENLGRIQFSVGYNFQESTLTVKIMK
110 120 130 140 150
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:. ::: : : ::::..:. .::.::::..:.: ::.:.: ..::: : :.:: .. .
NP_004 AQELPAKDF-SGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEKVVQR
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pF1KA1 ALHFTILSFDRFSRDDIIGEVLIPLSGIELSEGKMLMNREIIKRNVRKSSGRGELLISLC
:.. .:..:::::.: :::: :::. ..:.. . . . .: :..:::::.:::
NP_004 ILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKD--LKPCSDGSGSRGELLLSLC
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 YQSTTNTLTVVVLKARHLPKSDVSGLSDPYVKVNLYHAKKRISKKKTHVKKCTPNAVFNE
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pF1KA1 LFVFDIPCEGLEDISVEFLVLDSERGSRNEVIGQLVLGAAAEGTGG-EHWKEICDYPRRQ
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NP_004 SFAFDIPTEKLRETTIIITVMDKDKLSRNDVIGKIYLSWKS-GPGEVKHWKDMIARPRQP
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pF1KA1 IAKWHVLCDG
.:.:: :
NP_004 VAQWHQLKA
400
425 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:00:51 2016 done: Wed Nov 2 21:00:53 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]