FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1305, 1898 aa
1>>>pF1KA1305 1898 - 1898 aa - 1898 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3030+/-0.00128; mu= -4.1141+/- 0.075
mean_var=340.0969+/-71.055, 0's: 0 Z-trim(110.4): 59 B-trim: 273 in 1/51
Lambda= 0.069546
statistics sampled from 11545 (11584) to 11545 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 6.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45090.1 NYNRIN gene_id:57523|Hs108|chr14 (1898) 12924 1312.7 0
CCDS32058.1 KHNYN gene_id:23351|Hs108|chr14 ( 678) 879 103.8 2.3e-21
CCDS45479.1 N4BP1 gene_id:9683|Hs108|chr16 ( 896) 684 84.4 2.2e-15
>>CCDS45090.1 NYNRIN gene_id:57523|Hs108|chr14 (1898 aa)
initn: 12924 init1: 12924 opt: 12924 Z-score: 7022.0 bits: 1312.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12924; 100.0% identity (100.0% similar) in 1898 aa overlap (1-1898:1-1898)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLLSGGDPPAQEWFMVQTKSKPRVQRQRLQVQRIFRVKLNAFQSRPDTPYFWLQLEGPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MLLSGGDPPAQEWFMVQTKSKPRVQRQRLQVQRIFRVKLNAFQSRPDTPYFWLQLEGPRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 NMGKAKEYLKGLCSPELWKEVRYPPILHCAFLGAQGLFLDCLCWSTLAYLVPGPPGSLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NMGKAKEYLKGLCSPELWKEVRYPPILHCAFLGAQGLFLDCLCWSTLAYLVPGPPGSLMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GGLTESFIMTQNWLEELVGRLRWGPAPLLTPRGIWEAEVTRAFGALVWIRGDQHAGDLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGLTESFIMTQNWLEELVGRLRWGPAPLLTPRGIWEAEVTRAFGALVWIRGDQHAGDLLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LPPAVQELLLSLVRDAAGKEDIIEWLSRFGISDSHSDPEVLICPPQQQKEAPAMVSVGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPPAVQELLLSLVRDAAGKEDIIEWLSRFGISDSHSDPEVLICPPQQQKEAPAMVSVGES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PGPFVDMGTLQNRGPENSKRLSSLGATGSLITAQSTPQEAANQLVRVGSNNQDGMDSAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPFVDMGTLQNRGPENSKRLSSLGATGSLITAQSTPQEAANQLVRVGSNNQDGMDSAQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EGTVQATSSQDSTNHTQALLKQRQVQKIEDKLLFQPPVSALGVCPPWKAWTPGPAFGPLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EGTVQATSSQDSTNHTQALLKQRQVQKIEDKLLFQPPVSALGVCPPWKAWTPGPAFGPLW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PGAIAATFWRINELHSLHLAWLLSQACFNFPFWQRPLGPIQLKLPGQNPLPLNLEWKQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGAIAATFWRINELHSLHLAWLLSQACFNFPFWQRPLGPIQLKLPGQNPLPLNLEWKQKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LAPLPSAESPAGRPDGGLGGEAALQNCPRPEISPKVTSLLVVPGSSDVKDKVSSDLPQIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LAPLPSAESPAGRPDGGLGGEAALQNCPRPEISPKVTSLLVVPGSSDVKDKVSSDLPQIG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PPLTSTPQLQAGGEPGDQGSMQLDFKGLEEGPAPVLPTGQGKPVAQGGLTDQSVPGAQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPLTSTPQLQAGGEPGDQGSMQLDFKGLEEGPAPVLPTGQGKPVAQGGLTDQSVPGAQTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PETLKVPMAAAVPKAENPSRTQVPSAAPKLPTSRMMLAVHTEPAAPEVPLAPTKPTAQLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PETLKVPMAAAVPKAENPSRTQVPSAAPKLPTSRMMLAVHTEPAAPEVPLAPTKPTAQLM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ATAQKTVVNQPVLVAQVEPTTPKTPQAQKMPVAKTSPAGPKTPKAQAGPAATVSKAPAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATAQKTVVNQPVLVAQVEPTTPKTPQAQKMPVAKTSPAGPKTPKAQAGPAATVSKAPAAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KAPAAPKVPVTPRVSRAPKTPAAQKVPTDAGPTLDVARLLSEVQPTSRASVSLLKGQGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAPAAPKVPVTPRVSRAPKTPAAQKVPTDAGPTLDVARLLSEVQPTSRASVSLLKGQGQA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GRQGPQSSGTLALSSKHQFQMEGLLGAWEGAPRQPPRHLQANSTVTSFQRYHEALNTPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRQGPQSSGTLALSSKHQFQMEGLLGAWEGAPRQPPRHLQANSTVTSFQRYHEALNTPFE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LNLSGEPGNQGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQFFWNRGHREVTVFVPTWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LNLSGEPGNQGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQFFWNRGHREVTVFVPTWQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LKKNRRVRESHFLTKLHSLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGIIVTNEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LKKNRRVRESHFLTKLHSLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGIIVTNEQI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 HILMNSSKKLMVKDRLLPFTFAGNLFMVPDDPLGRDGPTLDEFLKKPNRLDTDIGNFLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HILMNSSKKLMVKDRLLPFTFAGNLFMVPDDPLGRDGPTLDEFLKKPNRLDTDIGNFLKV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 WKTLPPSSASVTELSDDADSGPLESLPNMEEVREEKEERQDEEQRQGQGTQKAAEEDDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WKTLPPSSASVTELSDDADSGPLESLPNMEEVREEKEERQDEEQRQGQGTQKAAEEDDLD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SSLASVFRVECPSLSEEILRCLSLHDPPDGALDIDLLPGAASPYLGIPWDGKAPCQQVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSLASVFRVECPSLSEEILRCLSLHDPPDGALDIDLLPGAASPYLGIPWDGKAPCQQVLA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 HLAQLTIPSNFTALSFFMGFMDSHRDAIPDYEALVGPLHSLLKQKPDWQWDQEHEEAFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLAQLTIPSNFTALSFFMGFMDSHRDAIPDYEALVGPLHSLLKQKPDWQWDQEHEEAFLA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LKRALVSALCLMAPNSQLPFRLEVTVSHVALTAILHQEHSGRKHPIAYTSKPLLPDEESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LKRALVSALCLMAPNSQLPFRLEVTVSHVALTAILHQEHSGRKHPIAYTSKPLLPDEESQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 GPQSGGDSPYAVAWALKHFSRCIGDTPVVLDLSYASRTTADPEVREGRRVSKAWLIRWSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPQSGGDSPYAVAWALKHFSRCIGDTPVVLDLSYASRTTADPEVREGRRVSKAWLIRWSL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 LVQDKGKRALELALLQGLLGENRLLTPAASMPRFFQVLPPFSDLSTFVCIHMSGYCFYRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVQDKGKRALELALLQGLLGENRLLTPAASMPRFFQVLPPFSDLSTFVCIHMSGYCFYRE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 DEWCAGFGLYVLSPTSPPVSLSFSCSPYTPTYAHLAAVACGLERFGQSPLPVVFLTHCNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DEWCAGFGLYVLSPTSPPVSLSFSCSPYTPTYAHLAAVACGLERFGQSPLPVVFLTHCNW
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 IFSLLWELLPLWRARGFLSSDGAPLPHPSLLSYIISLTSGLSSLPFIYRTSYRGSLFAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IFSLLWELLPLWRARGFLSSDGAPLPHPSLLSYIISLTSGLSSLPFIYRTSYRGSLFAVT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 VDTLAKQGAQGGGQWWSLPKDVPAPTVSPHAMGKRPNLLALQLSDSTLADIIARLQAGQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VDTLAKQGAQGGGQWWSLPKDVPAPTVSPHAMGKRPNLLALQLSDSTLADIIARLQAGQK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 LSGSSPFSSAFNSLSLDKESGLLMFKGDKKPRVWVVPTQLRRDLIFSVHDIPLGAHQRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSGSSPFSSAFNSLSLDKESGLLMFKGDKKPRVWVVPTQLRRDLIFSVHDIPLGAHQRPE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 ETYKKLRLLGWWPGMQEHVKDYCRSCLFCIPRNLIGSELKVIESPWPLRSTAPWSNLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ETYKKLRLLGWWPGMQEHVKDYCRSCLFCIPRNLIGSELKVIESPWPLRSTAPWSNLQIE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 VVGPVTISEEGHKHVLIVADPNTRWVEAFPLKPYTHTAVAQVLLQHVFARWGVPVRLEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VVGPVTISEEGHKHVLIVADPNTRWVEAFPLKPYTHTAVAQVLLQHVFARWGVPVRLEAA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 QGPQFARHVLVSCGLALGAQVASLSRDLQFPCLTSSGAYWEFKRALKEFIFLHGKKWAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QGPQFARHVLVSCGLALGAQVASLSRDLQFPCLTSSGAYWEFKRALKEFIFLHGKKWAAS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 LPLLHLAFRASSTDATPFKVLTGGESRLTEPLWWEMSSANIEGLKMDVFLLQLVGELLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPLLHLAFRASSTDATPFKVLTGGESRLTEPLWWEMSSANIEGLKMDVFLLQLVGELLEL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 HWRVADKASEKAENRRFKRESQEKEWNVGDQVLLLSLPRNGSSAKWVGPFYIGDRLSLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HWRVADKASEKAENRRFKRESQEKEWNVGDQVLLLSLPRNGSSAKWVGPFYIGDRLSLSL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890
pF1KA1 YRIWGFPTPEKLGCIYPSSLMKAFAKSGTPLSFKVLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YRIWGFPTPEKLGCIYPSSLMKAFAKSGTPLSFKVLEQ
1870 1880 1890
>>CCDS32058.1 KHNYN gene_id:23351|Hs108|chr14 (678 aa)
initn: 1457 init1: 644 opt: 879 Z-score: 497.0 bits: 103.8 E(32554): 2.3e-21
Smith-Waterman score: 1065; 32.3% identity (47.7% similar) in 948 aa overlap (5-949:5-596)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLLSGGDPPAQEWFMVQTKSKPRVQRQRLQVQRIFRVKLNAF-QSRPDTPYFWLQLEGPR
:. : . . : :..... .:..:. .:.::: : .... .. ::.:..:::::::.
CCDS32 MPTWGARPASPDRFAVSAEAENKVREQQPHVERIFSVGVSVLPKDCPDNPHIWLQLEGPK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ENMGKAKEYLKGLCSPELWKEVRYPPILHCAFLGAQGLFLDCLCWSTLAYLVPGPPGSLM
:: ..::::::::::::: :..::: ::: ::::::.::::: ::: :.::: :::::
CCDS32 ENASRAKEYLKGLCSPELQDEIHYPPKLHCIFLGAQGFFLDCLAWSTSAHLVPRAPGSLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 VGGLTESFIMTQNWLEELVGRLRWGPAPLLTPRGIWEAEVTRAFGALVWIRGDQHAGDLL
..::::.:.:.:. .:::. :: : .: . . . : : :.::. :: : ::
CCDS32 ISGLTEAFVMAQSRVEELAERLSWDFTPGPSSGASQCTGVLRDFSALLQSPGDAHREALL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 QLPPAVQELLLSLVRDAAGKEDIIEWLSRFGISDSHSDPEVLICPPQQQKEAPAMVSVGE
::: :::: :::::..: : :.
CCDS32 QLPLAVQEELLSLVQEA---------------------------------------SSGQ
190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 SPGPFVDMGTLQNRGPENSKRLSSLGATGSLITAQSTPQEAANQLVRVGSNNQDGMDSAQ
.:: .. : : ...:. :: : ::. . :: .:
CCDS32 GPGALA----------------SWEGRSSALLGAQC-------QGVRAPPS--DGRESL-
210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 EEGTVQATSSQDSTNHTQALLKQRQVQKIEDKLLFQPPVSALGVCPPWKAWTPGPAFGPL
. :.. . . . . : :. :. : : ::
CCDS32 DTGSMGPGDCRGARGDTYAVEKE-------------------G----------GKQGGPR
240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 WPGAIAATFWRINELHSLHLAWLLSQACFNFPFWQRPLGPIQLKLPGQNPLPLNLEWKQK
.. : :. .:::.. : ..
CCDS32 ------------------EMDWG----------WK--------ELPGEEA------W-ER
270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 ELAPLPSAESPAGRPDGGLGGEAALQNCPRPEISPKVTSLLVVPGSSDVKDKVSSDLPQI
:.: :.. :: . :.: :
CCDS32 EVALRPQSV-------GGGARESA---------------------------------PLK
290 300
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GPPLTSTPQLQAGGEPGDQGSMQLDFKGLEEGPAPVLPTGQGKPVAQGGLTDQSVPGAQT
: : : :: .: :: :.
CCDS32 GKAL-----------------------GKEE-------------IALGG-------GG--
310
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 VPETLKVPMAAAVPKAENPSRTQVPSAAPKLPTSRMMLAVHTEPAAPEVPLAPTKPTAQL
. :: :: : :.
CCDS32 -------------------------------------FCVHREP-----------PGAH-
320
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 MATAQKTVVNQPVLVAQVEPTTPKTPQAQKMPVAKTSPAGPKTPKAQAGPAATVSKAPAA
: ::. :. ... .
CCDS32 ---------------------------------------GSCHRAAQSRGASLLQRLHNG
330 340 350
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SKAPAAPKVPVTPRVSRAPKTPAAQKVPTDAGPTLDVARLLSEVQPTSRASVSLLKGQGQ
. .: :.:: : ::. : : : ::. .:.. : ::.
CCDS32 NASP--PRVPSPPP---APEPPWHCGDRGDCGDRGDVG---------DRGD----KQQGM
360 370 380 390
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 AGRQGPQSSGTLALSSKHQFQMEGLLGAWEGAPRQPPRHLQANSTVTSFQRYHEALNTPF
: .::: :. : .... ::. ::..:::. ::
CCDS32 ARGRGPQ---------------------WK-------RGARGGNLVTGTQRFKEALQDPF
400 410 420
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 ELNLSGEPGNQGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQFFWNRGHREVTVFVPTW
: :.. ::. ::..:::::.:::::::::.:: ::::.:::.::.::::..::::: :
CCDS32 TLCLANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGLQHYFSSRGIAIAVQYFWDRGHRDITVFVPQW
430 440 450 460 470 480
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 QLKKNRRVRESHFLTKLHSLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETDGIIVTNEQ
...:. .::::::: ::.::..::.:::.. .::.:..:: :::::::::::::::.:.:
CCDS32 RFSKDAKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQ
490 500 510 520 530 540
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 IHILMNSSKKLM--VKDRLLPFTFAGNLFMVPDDPLGRDGPTLDEFLKKPNRLDTDIGNF
.. : . :.: : ...:::::::.:::::::::::::.::::::::::: :
CCDS32 FRDLAEESEKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPARTQGSSKAQ
550 560 570 580 590 600
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 LKVWKTLPPSSASVTELSDDADSGPLESLPNMEEVREEKEERQDEEQRQGQGTQKAAEED
CCDS32 HPSRGFAEHGKQQQGREEEKGSGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQREPYCR
610 620 630 640 650 660
>>CCDS45479.1 N4BP1 gene_id:9683|Hs108|chr16 (896 aa)
initn: 947 init1: 511 opt: 684 Z-score: 389.5 bits: 84.4 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 773; 26.6% identity (52.6% similar) in 944 aa overlap (14-946:10-773)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLLSGGDPPAQEWFMVQTKSKPRVQRQRLQVQRIFRVKLNAFQS----RPDTPYFWLQLE
: . ... ....: ... .: :.: .. . .: .::::
CCDS45 MAARAVLDEFTAPAEKAELLEQSRGRIEGLFGVSLAVLGALGAEEPLPARIWLQLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GPRENMGKAKEYLKGLCSPELWKEVRYPPILHCAFLGAQGLFLDCLCWSTLAYLVPGPPG
: .: . .::::.::.: ::: .. :: .:: :.::..::: : .: : : :
CCDS45 GAQEAVHSAKEYIKGICEPELEERECYPKDMHCIFVGAESLFLKSLIQDTCADLCILDIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SLMVGGLTESFIMTQNWLEELVGRLRWGPAPLLTPRGIWEAEVTRAFGALVWIRGDQHAG
: . : .:. .:... ....: .: . : : . :.:: : : .: ..:...
CCDS45 LLGIRGSAEAVVMARSHIQQFV-KLFENKENL--PSSQKESEVKREFKQFVEAHADNYTM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 DLLQLPPAVQELLLSLVRDAAGKEDIIEWLSRFGISDSHSDPEVLICPPQQQKEAPAMVS
::: :: .... ::.:.. :.:...: .: ::. .:: :
CCDS45 DLLILPTSLKKELLTLTQ---GEENLFE----------TGDDEVIEMRDSQQTE------
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VGESPGPFVDMGTLQNRGPENSKRLSSLGATGSLITAQSTPQEAANQLVRVGSNNQDGMD
:. :.::. :..
CCDS45 -------FT--------------------------------QNAAT-----------GLN
220
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 SAQEEGTVQATSSQDSTNHTQALLKQRQ-VQKIEDKLLFQPPVSALGVCPPWKAWTPGPA
...: ..: . . . . .. : :: . : . .::.: .. :. : .: .
CCDS45 ISRDETVLQEEARNKAGTPVSELTKQMDTVLSSSPDVLFDP-IN--GLTPDEEALS----
230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 FGPLWPGAIAATFWRINELHSLHLAWLLSQACFNFPFWQRPLGPIQLKLPGQNPLPLNLE
. :... . : .. :.. :. : : : . : :.
CCDS45 ------NERICQKRRFSDSEERH-----TKKQFSLENVQE--GEI---LHDAKTLAGNV-
280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 WKQKELAPLP--SAESPAGRPDGGLGGEAALQNCPRPEISPKVTSLLVVPGSSDVKDKVS
.: : ::.: :: .. . : . :. . .. :... .::
CCDS45 -----IADLSDSSADSENLSPD-------IKETTEEMEYNILVNFFKTMGYSQEIVEKV-
330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SDLPQIGPPLTSTPQLQAGGEPGDQGSMQLDFKGLEEGPAPVLPTGQGKPVAQGGLTDQS
. :: .. : : .. .: : : . . : : .: .: .. .
CCDS45 --IKVYGP--STEPLLLLEEIEKENKRFQEDR---EFSAGTVYPE-TNKTKNKGVYSSTN
370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 VPGAQTVPETLKVPMAAAVPKAENPSRTQVPSAAPKLPTSRMMLAVHTEPAAPEVPLAPT
....:. . : . . . .:.: . : . ..: .:
CCDS45 ELTTDSTPKKTQ----AHTQQNMVEKFSQLPFKVEAKPCTSNC-RINT------FRTVPI
420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 KPTAQLMATAQKTVVNQPVLVAQVEPTTPKTPQAQKMPVAKTSPAGPKTPKAQAGPAATV
. .. .. :. . : : :.: . : : :.: .:: . :
CCDS45 EQKHEVWGSNQNYICN----------TDPETDGLS--P----SVASP-SPKE----VNFV
470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SKAPAASKAPAAPKVPVTPR--VSRAPKTPAAQKVPTDAGPTLDVARLLSEVQPTSRASV
:.. .. . :.::. :. . . :. : .:.. . . :: .: :. .
CCDS45 SRGASSHQ----PRVPLFPENGLHQQPE-PL---LPNNMKSACE-KRLGCCSSPHSKPNC
510 520 530 540 550
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 SLLKGQGQAGRQGPQSSGTLALSSKHQFQMEGLLGAWEGAPRQPPRHLQANSTVTSFQRY
: :. : : : . . : : :. .:.::. ::.
CCDS45 STLS---------PPMPLPQLLPSVTDARSAG-----------PSDHI--DSSVTGVQRF
560 570 580 590
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 HEALNTPFELNLSGEPGNQGLRRVVIDGSSVAMVHGLQHFFSCRGIAMAVQFFWNRGHRE
...:. :..:.:..::: :...:::::.::..:::..::::::::.::..::. :.:.
CCDS45 RDTLKIPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRN
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 VTVFVPTWQLKKNRRVRESHFLTKLHSLKMLSITPSQLENGKKITTYDYRFMVKLAEETD
.::::: :. ... : :.::::.:. : .::.::... :..:...: ::...::..:
CCDS45 ITVFVPQWRTRRDPNVTEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIASHDDRFLLHLADKTG
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940
pF1KA1 GIIVTNEQIHILMNSSK--KLMVKDRLLPFTFAGNLFMVPDDPLGRDGPTLDEFLKKPNR
::::::.... ..: : . .. ::: .::.:..::::::::::.:: :.:::.:
CCDS45 GIIVTNDNFREFVNESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLGRSGPRLEEFLQKEVC
720 730 740 750 760 770
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 LDTDIGNFLKVWKTLPPSSASVTELSDDADSGPLESLPNMEEVREEKEERQDEEQRQGQG
CCDS45 LRDMQPLLSALPNVGMFDPSFRVPGTQAASTSHQPPTRIQGAPSSHWLPQQPHFPLLPAL
780 790 800 810 820 830
1898 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 10:43:05 2016 done: Sun Nov 6 10:43:06 2016
Total Scan time: 6.330 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]