Result of FASTA (omim) for
pF1KA1301
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1301, 1572 aa
1>>>pF1KA1301 1572 - 1572 aa - 1572 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8831+/-0.000503; mu= 1.9988+/- 0.031
mean_var=240.8088+/-49.929, 0's: 0 Z-trim(116.9): 277 B-trim: 625 in 1/56
Lambda= 0.082649
statistics sampled from 28104 (28393) to 28104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 15.990
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011513528 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1437) 3869 476.1 9.5e-133
XP_011513527 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1480) 3869 476.1 9.8e-133
XP_011513525 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1586) 3869 476.1 1e-132
XP_011513524 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1586) 3869 476.1 1e-132
XP_011513526 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1586) 3869 476.1 1e-132
XP_016867375 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1606) 3869 476.1 1e-132
NP_055867 (OMIM: 610384) E3 ubiquitin-protein liga (1606) 3869 476.1 1e-132
XP_011513522 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1607) 3869 476.1 1e-132
XP_016867374 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1607) 3869 476.1 1e-132
XP_005249722 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1607) 3869 476.1 1e-132
XP_006715734 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1607) 3869 476.1 1e-132
XP_006715733 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1608) 3869 476.1 1e-132
XP_016867373 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1638) 3869 476.1 1.1e-132
XP_016867371 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1639) 3869 476.1 1.1e-132
XP_016867372 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1639) 3869 476.1 1.1e-132
XP_016867376 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1605) 3794 467.1 5.1e-130
XP_016867378 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1572) 3791 466.8 6.5e-130
NP_001273988 (OMIM: 610384) E3 ubiquitin-protein l (1572) 3791 466.8 6.5e-130
XP_006715736 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1573) 3791 466.8 6.5e-130
XP_016867377 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1604) 3791 466.8 6.6e-130
XP_016867379 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquiti (1356) 1859 236.4 1.3e-60
NP_001138442 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1526 196.5 7.7e-49
NP_001138443 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1526 196.5 7.7e-49
XP_005266720 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 922) 1526 196.6 8.3e-49
NP_001138441 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 947) 1526 196.6 8.5e-49
NP_056092 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein liga ( 955) 1526 196.6 8.6e-49
NP_001138438 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1400 181.5 2.6e-44
XP_016881168 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 854) 1400 181.5 2.6e-44
NP_001138437 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1400 181.5 2.6e-44
NP_001138436 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1400 181.5 2.6e-44
XP_005266717 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 942) 1400 181.5 2.8e-44
NP_001138440 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 967) 1400 181.5 2.9e-44
NP_001138439 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 975) 1400 181.6 2.9e-44
NP_001316141 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l ( 753) 1363 177.1 5e-43
XP_011519929 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 827) 1363 177.1 5.4e-43
XP_011519927 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1363 177.1 5.5e-43
XP_011519928 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1363 177.1 5.5e-43
XP_011519926 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 875) 1363 177.1 5.7e-43
NP_006145 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein liga ( 900) 1363 177.1 5.8e-43
NP_940682 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein liga (1247) 1363 177.2 7.6e-43
NP_001271269 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l (1302) 1363 177.2 7.8e-43
NP_001271268 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l (1303) 1363 177.2 7.9e-43
NP_001271267 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l (1319) 1363 177.2 7.9e-43
XP_016881169 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 750) 1317 171.6 2.2e-41
XP_016881166 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 838) 1317 171.6 2.5e-41
XP_016881165 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 856) 1312 171.0 3.8e-41
XP_016881170 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 684) 1302 169.8 7.2e-41
XP_006722488 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 772) 1302 169.8 7.9e-41
XP_006722487 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 790) 1302 169.8 8.1e-41
XP_006722493 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 872) 1302 169.8 8.8e-41
>>XP_011513528 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1437 aa)
initn: 4248 init1: 2983 opt: 3869 Z-score: 2504.2 bits: 476.1 E(85289): 9.5e-133
Smith-Waterman score: 5040; 58.0% identity (75.5% similar) in 1450 aa overlap (181-1572:31-1437)
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 RATTPCITVKNPAVMMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLK
::.:.::.:::..:.:::::::::::::::
XP_011 MAALAEHKDDCISKEIFKSIGADETVQGQGSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLK
10 20 30 40 50 60
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 MSIQPGKKSSFPTCAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKS
.::::::.: ::. :::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.:::::::
XP_011 ISIQPGKHSIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKS
70 80 90 100 110 120
280 290 300 310 320
pF1KA1 RPIIKRFLGKLTIPVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--E
:::::::::::..::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: .
XP_011 RPIIKRFLGKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPAD
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DA----SPEAVGTILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTP
: : : .. . . .:. . : : . : :. . : : ..: :. ::
XP_011 DEEISLSTEPESAQIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPG
190 200 210 220 230
390 400 410 420 430
pF1KA1 KHSFRTSSTLEIDTEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER---
..:.. : : .. .: .... : .. .. : .... . :.. .:.
XP_011 NQSIELSRPAE-EAAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDL
240 250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 ---------SMGASPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIM
: .: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ..
XP_011 GEEASALLLEDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQ
300 310 320 330 340 350
500 510 520 530 540
pF1KA1 FSRASRADDGSLTSQTKLEDNPVENEEASTHEAASFEDKPEN----LPELAES--SLPAG
. ::: . ... . :: . :. : . . :.. . : .: : .:
XP_011 L-RAS------VKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGG
360 370 380 390 400
550 560 570 580
pF1KA1 PAPEEGEGGPEPQPSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SG
: :: .:. : . : :.: : .::: .:.. :: ::. ::
XP_011 SAAEEEDGAEEESTLKD--SSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSG
410 420 430 440 450 460
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 GSRRAVSETESLDQGSEPSQVS-SETEPSDPA--RTESVSEASTRPEGESDLECADSSCN
: .... . : ..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..::
XP_011 GHFPSLANGAAQDGDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCY
470 480 490 500 510 520
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 ESVTTQLSSVDTRCSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGS
: . : . : .. :: ::: :.: .: : . . .: . :
XP_011 SSSCYSASCYSPSC--YNGNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFES
530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 LP-VVQVPSGEDEGPGAESATVPDQEELGEVWQRRGSLEGAAAAAESPPQEEGSAGEAQG
.: .: : . : . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .:
XP_011 VPDSMQSP---ELDPESTNGAGPWQDELAAP---SGHVERSPEGLESPV--AGPSNRREG
580 590 600 610 620 630
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 TCEGATAQEEGATGGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFY
: .. ::. .:::.: . .: .:: ::::::::::::::.::
XP_011 ECP-------------ILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGRVFY
640 650 660 670
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 VDHVNRTTTWQRPTAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN-----
::::::::::::::: .:. ..::.:::::::::::::.:.::...:: ::...
XP_011 VDHVNRTTTWQRPTAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCE
680 690 700 710 720 730
890 900 910 920 930
pF1KA1 -AIDGAG------EEADFHQASADFRRENILPHSTSRSRITLLLQSPPVKFLISPEFFTV
: :.: ::. :.: :.:::. : .:. .:::::::: :::. .::::::
XP_011 QAPAGGGGGGGSDSEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTV
740 750 760 770 780 790
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 LHSNPSAYRMFTNNTCLKHMITKVRRDTHHFERYQHNRDLVGFLNMFANKQLELPRGWEM
::.: ::::.::..::::::: :::::...:::::::::::.:.::::. .::::::::.
XP_011 LHANYSAYRVFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEI
800 810 820 830 840 850
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 KHDHQGKAFFVDHNSRTTTFIDPRLPLQSSRPTSALVHRQHLTRQRSHSAGEVGEDSRHA
: :.:::.::::::::.:::::::.:::..: . :.::::: : ::.::::..: ::.
XP_011 KTDQQGKSFFVDHNSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNR
860 870 880 890 900 910
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 GPPVLPRPSSTFNTVSRPQYQ-DMVPVAYNDKIVAFLRQPNIFEILQERQPDLTRNHSLR
: .: ::. .. .. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.::
XP_011 GASLLARPGHSLVAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLR
920 930 940 950 960 970
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 EKIQFIRTEGTPGLVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSP
:::..:::::. :: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::
XP_011 EKIHYIRTEGNHGLEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSP
980 990 1000 1010 1020 1030
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 QNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQ
::::: :::.::::.::.:::::::::::::::.::.::::::.::::::::::: .:::
XP_011 QNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQ
.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::
XP_011 VMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQ
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 ISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEE
::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::
XP_011 ISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 FHQSLQWMKDNDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKW
:::::::::::.: ::::::::::::::::.:::::: :::: ::::::::::::::::
XP_011 FHQSLQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKW
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 RIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYH
:.:::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_011 RVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYH
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 DNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKIT
:.:.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::: ::::.:::::::
XP_011 DGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKIT
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1540 1550 1560 1570
pF1KA1 ALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 SLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
1400 1410 1420 1430
>>XP_011513527 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1480 aa)
initn: 4387 init1: 2983 opt: 3869 Z-score: 2504.0 bits: 476.1 E(85289): 9.8e-133
Smith-Waterman score: 5189; 57.9% identity (75.6% similar) in 1497 aa overlap (135-1572:28-1480)
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 FWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITVKNPAV
: :::::::::.::::::::: .:::: :.
XP_011 MRATTASYIYRTLKETNCDAKRLSLMAETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTVKNSAA
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 -MMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKKSSFPT
.. . : . ..:. ::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.: ::.
XP_011 PIFKSIGADETVQGQ-GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKHSIFPA
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 CAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFLGKLTI
:::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.::::::::::::::::::..
XP_011 LPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFLGKLSM
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330
pF1KA1 PVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--EDA----SPEAVGT
::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: .: : : ..
XP_011 PVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLSTEPESA
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 ILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSSTLEID
. . .:. . : : . : :. . : : ..: :. :: ..:.. : : .
XP_011 QIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSRPAE-E
240 250 260 270 280 290
400 410 420 430 440
pF1KA1 TEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER------------SMGA
. .: .... : .. .. : .... . :.. .:. :
XP_011 AAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALLLEDGE
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 SPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRADDGSLT
.: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ... ::: .
XP_011 APASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL-RAS------VK
360 370 380 390 400
510 520 530 540 550
pF1KA1 SQTKLEDNPVENEEASTHEAASFEDKPEN----LPELAES--SLPAGPAPEEGEGGPEPQ
... . :: . :. : . . :.. . : .: : .: : :: .:. : .
XP_011 RKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDGAEEES
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600
pF1KA1 PSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSETESLD
: :.: : .::: .:.. :: ::. ::: .... . :
XP_011 TLKD--SSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLANGAAQD
470 480 490 500 510 520
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pF1KA1 QGSEPSQVS-SETEPSDPA--RTESVSEASTRPEGESDLECADSSCNESVTTQLSSVDTR
..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..:: : . : .
XP_011 GDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCYSSSCYSASCYSPS
530 540 550 560 570 580
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pF1KA1 CSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGSLP-VVQVPSGEDE
: . . :: ::: :.: .: : . . .: . :.: .: : .
XP_011 CYN--GNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSP---EL
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pF1KA1 GPGAESATVPDQEELGEVWQRRGSLEGAAAAAESPPQEEGSAGEAQGTCEGATAQEEGAT
: . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .: :
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pF1KA1 GGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFYVDHVNRTTTWQRP
.. ::. .:::.: . .: .:: ::::::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 ---ILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGRVFYVDHVNRTTTWQRP
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pF1KA1 TAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN------AIDGAG------
:: .:. ..::.:::::::::::::.:.::...:: ::... : :.:
XP_011 TAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCEQAPAGGGGGGGSD
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pF1KA1 EEADFHQASADFRRENILPHSTSRSRITLLLQSPPVKFLISPEFFTVLHSNPSAYRMFTN
::. :.: :.:::. : .:. .:::::::: :::. .::::::::.: ::::.::.
XP_011 SEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAYRVFTS
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.::::::: :::::...:::::::::::.:.::::. .::::::::.: :.:::.:::::
XP_011 STCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKSFFVDH
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pF1KA1 NSRTTTFIDPRLPLQSSRPTSALVHRQHLTRQRSHSAGEVGEDSRHAGPPVLPRPSSTFN
:::.:::::::.:::..: . :.::::: : ::.::::..: ::. : .: ::. ..
XP_011 NSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARPGHSLV
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.. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..:::::. :
XP_011 AAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTEGNHG
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pF1KA1 LVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQRANARA
: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: :::.:::
XP_011 LEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRASARA
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pF1KA1 PAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNK
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XP_011 PSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNK
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pF1KA1 LYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHE
:::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:: :
XP_011 LYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVENHLE
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pF1KA1 WFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNDI
:::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::.:
XP_011 WFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNNI
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pF1KA1 HDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESL
::::::::::::::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.:::::::::.:
XP_011 TDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEAL
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pF1KA1 VRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWFWAAV
:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:.:::::::::
XP_011 VRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAV
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pF1KA1 ERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLD
::::::::::::::::::::.::::::.:::::: ::::.:::::::.::::::::::::
XP_011 ERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLD
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pF1KA1 LPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
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XP_011 LPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
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pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPENMTLQRANSDTDLVTSESRSS
::: .:. : ..: .::. .:...... ... ...:. :..::::::::.:::.
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pF1KA1 LTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDENSPANFWDSKNRGVTGTQKGQ
: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: ::: :: : :::::.:...::
XP_011 LMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDEVLSENFLDYKNRGVNGSHRGQ
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pF1KA1 IVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITVKNPAV-MMGAEGMEGGASGNL
:.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .:::: :. .. . : . ..:.
XP_011 IIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTVKNSAAPIFKSIGADETVQGQ-
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pF1KA1 HSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKKSSFPTCAHHGQERRSTIISNT
::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.: ::. :::::::: ::.::
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pF1KA1 TNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFLGKLTIPVQRLLERQAIGDQML
.::::. :..:: .: :::::::.::::::::::::::::::..::::::::.::::...
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pF1KA1 SYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--EDA----SPEAVGTILGVNSVNGDLGSPSD
::.::::::.::::: :::. :.:::.: .: : : .. . . .:. . : :
XP_011 SYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLSTEPESAQIQDSPMNNLMESGSG
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XP_011 E---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSRPAE-EAAVITEAGDQGMVSVG
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: .:. .:::::::: :::. .::::::::.: ::::.::..::::::: :::::..
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1570
pF1KA1 AVEETSTFGLE
:::::::::::
XP_011 AVEETSTFGLE
1580
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pF1KA1 DEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSSTLEIDTEELTSTSSRTSPPRG
. : :. . : : ..: :. :: ..:.. : : .. .: .... :
XP_011 E---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSRPAE-EAAVITEAGDQGMVSVG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KA1 RQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER------------SMGASPKLRSSFPTDTRLNA
.. .. : .... . :.. .:. : .: . : . . ..
XP_011 -PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALLLEDGEAPASTKEEPLEEEATT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 MLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRADDGSLTSQTKLEDNPVENEEAS
. . .::..: :.. : :.::. : ... :: :. ... . :: . :.
XP_011 QSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL----RA---SVKRKSRPCSLPVSELETV
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
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: . . :.. . : .: : .: : :: .:. : . : :.: : .::
XP_011 IASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDGAEEESTLKD--SSEKDGLSEV
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610
pF1KA1 D----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSETESLDQGSEPSQVS-SETEPS
: .:.. :: ::. ::: .... . : ..:: : :.. :
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620 630 640 650 660 670
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. . :. . . : :. : ..:: : . : . : . . :: ::
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650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
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: :.: .: : . . .: . :.: .: : . : . ... : :.::.
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: .: . . ::: : ... .: : .. ::. .:::
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.: . .: .:: ::::::::::::::.::::::::::::::::: .:. ..::.:::
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::::::::::.:.::...:: ::... : :.: ::. :.: :.:::.
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: .:. .:::::::: :::. .::::::::.: ::::.::..::::::: :::::..
XP_011 SLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAYRVFTSSTCLKHMILKVRRDAR
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pF1KA1 HFERYQHNRDLVGFLNMFANKQLELPRGWEMKHDHQGKAFFVDHNSRTTTFIDPRLPLQS
.:::::::::::.:.::::. .::::::::.: :.:::.::::::::.:::::::.:::.
XP_011 NFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKSFFVDHNSRATTFIDPRIPLQN
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.: . :.::::: : ::.::::..: ::. : .: ::. .. .. : :.: . .:.::
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:::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..:::::. :: .:: :::::.::::
XP_011 NDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTEGNHGLEKLSCDADLVILLSL
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pF1KA1 FEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQRANARAPAPYKRDFEAKLRNFY
:::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: :::.::::.::.:::::::::::
XP_011 FEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRASARAPSPYRRDFEAKLRNFY
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pF1KA1 RKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDLQRNKLYVTFVGEEGLDYSGP
::::.::.::::::.::::::::::: .:::.:.::::.:::::::::::::::::::::
XP_011 RKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKELQRNKLYVTFVGEEGLDYSGP
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pF1KA1 SREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQ
:::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::
XP_011 SREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVENHLEWFRFSGRILGLALIHQ
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pF1KA1 YLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNDIHDILDLTFTVNEEVFG
:::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::.: :::::::::::::::
XP_011 YLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMKDNNITDILDLTFTVNEEVFG
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pF1KA1 QITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYEVVDARLVSVF
:.:::::: :::: :::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::.::::::
XP_011 QVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVF
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pF1KA1 DARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVT
:::::::::::::::::.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::
XP_011 DARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVT
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pF1KA1 GTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCFNRLDLPPYPSFSMLYEKLLT
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XP_011 GTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCFNRLDLPPYPSYSMLYEKLLT
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1570
pF1KA1 AVEETSTFGLE
:::::::::::
XP_011 AVEETSTFGLE
1580
>>XP_011513526 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1586 aa)
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pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPENMTLQRANSDTDLVTSESRSS
::: .:. : ..: .::. .:...... ... ...:. :..::::::::.:::.
XP_011 MASPSRNSQSRRRCKEP-LRYSYNPDQFHNMDLRGGPHDGVTIPRSTSDTDLVTSDSRST
10 20 30 40 50
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pF1KA1 LTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDENSPANFWDSKNRGVTGTQKGQ
: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: ::: :: : :::::.:...::
XP_011 LMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDEVLSENFLDYKNRGVNGSHRGQ
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pF1KA1 IVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITVKNPAV-MMGAEGMEGGASGNL
:.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .:::: :. .. . : . ..:.
XP_011 IIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTVKNSAAPIFKSIGADETVQGQ-
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pF1KA1 HSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKKSSFPTCAHHGQERRSTIISNT
::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.: ::. :::::::: ::.::
XP_011 GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKHSIFPALPHHGQERRSKIIGNT
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pF1KA1 TNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFLGKLTIPVQRLLERQAIGDQML
.::::. :..:: .: :::::::.::::::::::::::::::..::::::::.::::...
XP_011 VNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFLGKLSMPVQRLLERHAIGDRVV
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pF1KA1 SYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--EDA----SPEAVGTILGVNSVNGDLGSPSD
::.::::::.::::: :::. :.:::.: .: : : .. . . .:. . : :
XP_011 SYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLSTEPESAQIQDSPMNNLMESGSG
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XP_011 -PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALLLEDGEAPASTKEEPLEEEATT
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pF1KA1 MLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRADDGSLTSQTKLEDNPVENEEAS
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XP_011 DTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLANGAAQDGDTHPSTGSESDSSPR
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pF1KA1 SREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQ
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XP_011 QVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVDSRLVSVF
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XP_011 DARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNNEQRLRLLQFVT
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1570
pF1KA1 AVEETSTFGLE
:::::::::::
XP_011 AVEETSTFGLE
1580
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10 20 30
pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPE
::: .:. : ..: .::. .:...... ... .
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..:. :..::::::::.:::.: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: :::
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pF1KA1 NSPANFWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITV
:: : :::::.:...:::.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .::
XP_016 VLSENFLDYKNRGVNGSHRGQIIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTV
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pF1KA1 KNPAV-MMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKK
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XP_016 KNSAAPIFKSIGADETVQGQ-GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKH
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SSFPTCAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFL
: ::. :::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.:::::::::::::::
XP_016 SIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GKLTIPVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVHEDA-----SPE
:::..::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: : : :
XP_016 GKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPDDEEISLSTE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 AVGTILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSST
.. . . .:. . : : . : :. . : : ..: :. :: ..:.. :
XP_016 PESAQIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSRP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA1 LEIDTEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER------------
: .. .: .... : .. .. : .... . :.. .:.
XP_016 AE-EAAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALLL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 SMGASPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRADD
: .: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ... ::
XP_016 EDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL----RA--
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 GSLTSQTKLEDNPVENEEASTHEAASFEDKPEN----LPELAES--SLPAGPAPEEGEGG
:. ... . :: . :. : . . :.. . : .: : .: : :: .:.
XP_016 -SVKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDGA
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KA1 PEPQPSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSET
: . : :.: : .::: .:.. :: ::. ::: ....
XP_016 EEESTLKD--SSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLANG
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 ESLDQGSEPSQVS-SETEPSDPA--RTESVSEASTRPEGESDLECADSSCNESVTTQLSS
. : ..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..:: : . :
XP_016 AAQDGDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCYSSSCYSASC
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VDTRCSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGSLP-VVQVPS
. : . . :: ::: :.: .: : . . .: . :.: .: :
XP_016 YSPSCYN--GNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSP-
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 GEDEGPGAESATVPDQEELGEVWQRRGSLEGAAAAAESPPQEEGSAGEAQGTCEGATAQE
. : . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .: :
XP_016 --ELDPESTNGAGPWQDELAAP---SGHVERSPEGLESPVA--GPSNRREGECP------
760 770 780 790 800
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 EGATGGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFYVDHVNRTTT
.. ::. .:::.: . .: .:: ::::::::::::::.:::::::::::
XP_016 -------ILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGRVFYVDHVNRTTT
810 820 830 840 850
840 850 860 870 880
pF1KA1 WQRPTAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN------AIDGAG--
:::::: .:. ..::.:::::::::::::.:.::...:: ::... : :.:
XP_016 WQRPTAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCEQAPAGGGGG
860 870 880 890 900 910
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 ----EEADFHQASADFRRENILPHSTSRSRITLLLQSPPVKFLISPEFFTVLHSNPSAYR
::. :.: :.:::. : .:. .:::::::: :::. .::::::::.: ::::
XP_016 GGSDSEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAYR
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950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 MFTNNTCLKHMITKVRRDTHHFERYQHNRDLVGFLNMFANKQLELPRGWEMKHDHQGKAF
.::..::::::: :::::...:::::::::::.:.::::. .::::::::.: :.:::.:
XP_016 VFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKSF
980 990 1000 1010 1020 1030
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 FVDHNSRTTTFIDPRLPLQSSRPTSALVHRQHLTRQRSHSAGEVGEDSRHAGPPVLPRPS
:::::::.:::::::.:::..: . :.::::: : ::.::::..: ::. : .: ::.
XP_016 FVDHNSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARPG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 STFNTVSRPQYQ-DMVPVAYNDKIVAFLRQPNIFEILQERQPDLTRNHSLREKIQFIRTE
.. .. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..::::
XP_016 HSLVAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 GTPGLVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQRA
:. :: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: :::
XP_016 GNHGLEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRA
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 NARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDL
.::::.::.:::::::::::::::.::.::::::.::::::::::: .:::.:.::::.:
XP_016 SARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKEL
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA1 QRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVD
:::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 QRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVE
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA1 NHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMK
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
XP_016 NHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMK
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA1 DNDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQ
::.: ::::::::::::::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.:::::::
XP_016 DNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQ
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA1 TESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWF
::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:.:::::
XP_016 TEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWF
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 WAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCF
::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::: ::::.:::::::.::::::::
XP_016 WAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCF
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1550 1560 1570
pF1KA1 NRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 NRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
1580 1590 1600
>>NP_055867 (OMIM: 610384) E3 ubiquitin-protein ligase H (1606 aa)
initn: 4822 init1: 2983 opt: 3869 Z-score: 2503.5 bits: 476.1 E(85289): 1e-132
Smith-Waterman score: 5633; 57.1% identity (75.8% similar) in 1630 aa overlap (1-1572:22-1606)
10 20 30
pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPE
::: .:. : ..: .::. .:...... ... .
NP_055 MLLHLCSVKNLYQNRFLGLAAMASPSRNSQSRRRCKEP-LRYSYNPDQFHNMDLRGGPHD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 NMTLQRANSDTDLVTSESRSSLTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDE
..:. :..::::::::.:::.: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: :::
NP_055 GVTIPRSTSDTDLVTSDSRSTLMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDE
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100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NSPANFWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITV
:: : :::::.:...:::.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .::
NP_055 VLSENFLDYKNRGVNGSHRGQIIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTV
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KNPAV-MMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKK
:: :. .. . : . ..:. ::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.
NP_055 KNSAAPIFKSIGADETVQGQ-GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKH
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SSFPTCAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFL
: ::. :::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.:::::::::::::::
NP_055 SIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GKLTIPVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVHEDA-----SPE
:::..::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: : : :
NP_055 GKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPDDEEISLSTE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 AVGTILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSST
.. . . .:. . : : . : :. . : : ..: :. :: ..:.. :
NP_055 PESAQIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSRP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA1 LEIDTEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER------------
: .. .: .... : .. .. : .... . :.. .:.
NP_055 AE-EAAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALLL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 SMGASPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRADD
: .: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ... ::
NP_055 EDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL----RA--
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pF1KA1 GSLTSQTKLEDNPVENEEASTHEAASFEDKPEN----LPELAES--SLPAGPAPEEGEGG
:. ... . :: . :. : . . :.. . : .: : .: : :: .:.
NP_055 -SVKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDGA
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KA1 PEPQPSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSET
: . : :.: : .::: .:.. :: ::. ::: ....
NP_055 EEESTLKD--SSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLANG
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 ESLDQGSEPSQVS-SETEPSDPA--RTESVSEASTRPEGESDLECADSSCNESVTTQLSS
. : ..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..:: : . :
NP_055 AAQDGDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCYSSSCYSASC
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660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VDTRCSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGSLP-VVQVPS
. : . . :: ::: :.: .: : . . .: . :.: .: :
NP_055 YSPSCYN--GNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSP-
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720 730 740 750 760 770
pF1KA1 GEDEGPGAESATVPDQEELGEVWQRRGSLEGAAAAAESPPQEEGSAGEAQGTCEGATAQE
. : . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .: :
NP_055 --ELDPESTNGAGPWQDELAAP---SGHVERSPEGLESPVA--GPSNRREGECP------
760 770 780 790 800
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pF1KA1 EGATGGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFYVDHVNRTTT
.. ::. .:::.: . .: .:: ::::::::::::::.:::::::::::
NP_055 -------ILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGRVFYVDHVNRTTT
810 820 830 840 850
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pF1KA1 WQRPTAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN------AIDGAG--
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NP_055 WQRPTAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCEQAPAGGGGG
860 870 880 890 900 910
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 ----EEADFHQASADFRRENILPHSTSRSRITLLLQSPPVKFLISPEFFTVLHSNPSAYR
::. :.: :.:::. : .:. .:::::::: :::. .::::::::.: ::::
NP_055 GGSDSEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAYR
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950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 MFTNNTCLKHMITKVRRDTHHFERYQHNRDLVGFLNMFANKQLELPRGWEMKHDHQGKAF
.::..::::::: :::::...:::::::::::.:.::::. .::::::::.: :.:::.:
NP_055 VFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKSF
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pF1KA1 FVDHNSRTTTFIDPRLPLQSSRPTSALVHRQHLTRQRSHSAGEVGEDSRHAGPPVLPRPS
:::::::.:::::::.:::..: . :.::::: : ::.::::..: ::. : .: ::.
NP_055 FVDHNSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARPG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 STFNTVSRPQYQ-DMVPVAYNDKIVAFLRQPNIFEILQERQPDLTRNHSLREKIQFIRTE
.. .. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..::::
NP_055 HSLVAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRTE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 GTPGLVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQRA
:. :: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: :::
NP_055 GNHGLEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQRA
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1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 NARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKDL
.::::.::.:::::::::::::::.::.::::::.::::::::::: .:::.:.::::.:
NP_055 SARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKEL
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1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA1 QRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVD
:::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.
NP_055 QRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFVE
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA1 NHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMK
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
NP_055 NHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWMK
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pF1KA1 DNDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQ
::.: ::::::::::::::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.:::::::
NP_055 DNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQ
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pF1KA1 TESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRWF
::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:.:::::
NP_055 TEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRWF
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pF1KA1 WAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTCF
::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::: ::::.:::::::.::::::::
NP_055 WAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTCF
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1550 1560 1570
pF1KA1 NRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_055 NRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
1580 1590 1600
>>XP_011513522 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1607 aa)
initn: 4815 init1: 2983 opt: 3869 Z-score: 2503.5 bits: 476.1 E(85289): 1e-132
Smith-Waterman score: 5625; 57.0% identity (75.8% similar) in 1631 aa overlap (1-1572:22-1607)
10 20 30
pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPE
::: .:. : ..: .::. .:...... ... .
XP_011 MLLHLCSVKNLYQNRFLGLAAMASPSRNSQSRRRCKEP-LRYSYNPDQFHNMDLRGGPHD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 NMTLQRANSDTDLVTSESRSSLTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDE
..:. :..::::::::.:::.: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: :::
XP_011 GVTIPRSTSDTDLVTSDSRSTLMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NSPANFWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITV
:: : :::::.:...:::.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .::
XP_011 VLSENFLDYKNRGVNGSHRGQIIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KNPAV-MMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKK
:: :. .. . : . ..:. ::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.
XP_011 KNSAAPIFKSIGADETVQGQ-GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKH
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SSFPTCAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFL
: ::. :::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.:::::::::::::::
XP_011 SIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GKLTIPVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--EDA----SP
:::..::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: .: :
XP_011 GKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLST
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EAVGTILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSS
: .. . . .:. . : : . : :. . : : ..: :. :: ..:.. :
XP_011 EPESAQIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA1 TLEIDTEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER-----------
: .. .: .... : .. .. : .... . :.. .:.
XP_011 PAE-EAAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -SMGASPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRAD
: .: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ... ::
XP_011 LEDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL----RA-
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500 510 520 530 540 550
pF1KA1 DGSLTSQTKLEDNPVENEEASTHEAASFEDKPEN----LPELAES--SLPAGPAPEEGEG
:. ... . :: . :. : . . :.. . : .: : .: : :: .:
XP_011 --SVKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDG
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590
pF1KA1 GPEPQPSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSE
. : . : :.: : .::: .:.. :: ::. ::: ....
XP_011 AEEESTLKD--SSEKDGLSEVDTVAADPSALEEDREEPEGATPGTAHPGHSGGHFPSLAN
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 TESLDQGSEPSQVS-SETEPSDPA--RTESVSEASTRPEGESDLECADSSCNESVTTQLS
. : ..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..:: : . :
XP_011 GAAQDGDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCYSSSCYSAS
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SVDTRCSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGSLP-VVQVP
. : . . :: ::: :.: .: : . . .: . :.: .: :
XP_011 CYSPSCYN--GNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSP
710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 SGEDEGPGAESATVPDQEELGEVWQRRGSLEGAAAAAESPPQEEGSAGEAQGTCEGATAQ
. : . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .: :
XP_011 ---ELDPESTNGAGPWQDELAAP---SGHVERSPEGLESPVA--GPSNRREGECP-----
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780 790 800 810 820 830
pF1KA1 EEGATGGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFYVDHVNRTT
.. ::. .:::.: . .: .:: ::::::::::::::.::::::::::
XP_011 --------ILHNSQPVSQLPSLRPEHHHYPTIDEPLPPNWEARIDSHGRVFYVDHVNRTT
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pF1KA1 TWQRPTAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN------AIDGAG-
::::::: .:. ..::.:::::::::::::.:.::...:: ::... : :.:
XP_011 TWQRPTAAATPDGMRRSGSIQQMEQLNRRYQNIQRTIATERSEEDSGSQSCEQAPAGGGG
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890 900 910 920 930 940
pF1KA1 -----EEADFHQASADFRRENILPHSTSRSRITLLLQSPPVKFLISPEFFTVLHSNPSAY
::. :.: :.:::. : .:. .:::::::: :::. .::::::::.: :::
XP_011 GGGSDSEAESSQSSLDLRREGSLSPVNSQ-KITLLLQSPAVKFITNPEFFTVLHANYSAY
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pF1KA1 RMFTNNTCLKHMITKVRRDTHHFERYQHNRDLVGFLNMFANKQLELPRGWEMKHDHQGKA
:.::..::::::: :::::...:::::::::::.:.::::. .::::::::.: :.:::.
XP_011 RVFTSSTCLKHMILKVRRDARNFERYQHNRDLVNFINMFADTRLELPRGWEIKTDQQGKS
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 FFVDHNSRTTTFIDPRLPLQSSRPTSALVHRQHLTRQRSHSAGEVGEDSRHAGPPVLPRP
::::::::.:::::::.:::..: . :.::::: : ::.::::..: ::. : .: ::
XP_011 FFVDHNSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARP
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pF1KA1 SSTFNTVSRPQYQ-DMVPVAYNDKIVAFLRQPNIFEILQERQPDLTRNHSLREKIQFIRT
. .. .. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..:::
XP_011 GHSLVAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRT
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pF1KA1 EGTPGLVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQR
::. :: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: ::
XP_011 EGNHGLEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQR
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pF1KA1 ANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKD
:.::::.::.:::::::::::::::.::.::::::.::::::::::: .:::.:.::::.
XP_011 ASARAPSPYRRDFEAKLRNFYRKLEAKGFGQGPGKIKLIIRRDHLLEGTFNQVMAYSRKE
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1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA1 LQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFV
::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFV
1280 1290 1300 1310 1320 1330
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pF1KA1 DNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWM
.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::
XP_011 ENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWM
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1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA1 KDNDIHDILDLTFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQ
:::.: ::::::::::::::::.:::::: :::: :::::::::::::::::.::::::
XP_011 KDNNITDILDLTFTVNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQ
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA1 QTESLVRGFYEVVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTEYRGGYHDNHIVIRW
:::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:.::::
XP_011 QTEALVRGFYEVVDSRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTEYRGGYHDGHLVIRW
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1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 FWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGPRRFCVEKWGKITALPRAHTC
:::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::: ::::.:::::::.:::::::
XP_011 FWAAVERFNNEQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITSLPRAHTC
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1550 1560 1570
pF1KA1 FNRLDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
:::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_011 FNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
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>>XP_016867374 (OMIM: 610384) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (1607 aa)
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10 20 30
pF1KA1 MASSAREHLLFVRRRNPQMRYTLSPENLQSLAAQSSMPE
::: .:. : ..: .::. .:...... ... .
XP_016 MLLHLCSVKNLYQNRFLGLAAMASPSRNSQSRRRCKEP-LRYSYNPDQFHNMDLRGGPHD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 NMTLQRANSDTDLVTSESRSSLTASMYEYTLGQAQNLIIFWDIKEEVDPSDWIGLYHIDE
..:. :..::::::::.:::.: .: :..:..:.:.: :::::::: .::::.: :::
XP_016 GVTIPRSTSDTDLVTSDSRSTLMVSSSYYSIGHSQDLVIHWDIKEEVDAGDWIGMYLIDE
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pF1KA1 NSPANFWDSKNRGVTGTQKGQIVWRIEPGPYFMEPEIKICFKYYHGISGALRATTPCITV
:: : :::::.:...:::.:.:. . ::.::: :::::::::.::::::::: .::
XP_016 VLSENFLDYKNRGVNGSHRGQIIWKIDASSYFVEPETKICFKYYHGVSGALRATTPSVTV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KNPAV-MMGAEGMEGGASGNLHSRKLVSFTLSDLRAVGLKKGMFFNPDPYLKMSIQPGKK
:: :. .. . : . ..:. ::.:.::.:::..:.:::::::::::::::.::::::.
XP_016 KNSAAPIFKSIGADETVQGQ-GSRRLISFSLSDFQAMGLKKGMFFNPDPYLKISIQPGKH
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SSFPTCAHHGQERRSTIISNTTNPIWHREKYSFFALLTDVLEIEIKDKFAKSRPIIKRFL
: ::. :::::::: ::.::.::::. :..:: .: :::::::.:::::::::::::::
XP_016 SIFPALPHHGQERRSKIIGNTVNPIWQAEQFSFVSLPTDVLEIEVKDKFAKSRPIIKRFL
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280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GKLTIPVQRLLERQAIGDQMLSYNLGRRLPADHVSGYLQFKVEVTSSVH--EDA----SP
:::..::::::::.::::...::.::::::.::::: :::. :.:::.: .: :
XP_016 GKLSMPVQRLLERHAIGDRVVSYTLGRRLPTDHVSGQLQFRFEITSSIHPADDEEISLST
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pF1KA1 EAVGTILGVNSVNGDLGSPSDDEDMPGSHHDSQVCSNGP--VSEDSAADGTPKHSFRTSS
: .. . . .:. . : : . : :. . : : ..: :. :: ..:.. :
XP_016 EPESAQIQDSPMNNLMESGSGE---PRSEAPESSESWKPEQLGEGSVPDGPGNQSIELSR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KA1 TLEIDTEELTSTSSRTSPPRGRQDSLNDYLDAIEHNGHSRPGTATCSER-----------
: .. .: .... : .. .. : .... . :.. .:.
XP_016 PAE-EAAVITEAGDQGMVSVG-PEGAGELLAQVQKDIQPAPSAEELAEQLDLGEEASALL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -SMGASPKLRSSFPTDTRLNAMLHIDSDEEDHEFQQDLGYPSSLEEEGGLIMFSRASRAD
: .: . : . . ... . .::..: :.. : :.::. : ... ::
XP_016 LEDGEAPASTKEEPLEEEATTQSRAGREEEEKE-QEEEGDVSTLEQGEGRLQL----RA-
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XP_016 --SVKRKSRPCSLPVSELETVIASACGDPETPRTHYIRIHTLLHSMPSAQGGSAAEEEDG
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560 570 580 590
pF1KA1 GPEPQPSADQGSAELCGSQEVD----QPTS---------GADTGTSDA--SGGSRRAVSE
. : . : :.: : .::: .:.. :: ::. ::: ....
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. : ..:: : :.. : . . :. . . : :. : ..:: : . :
XP_016 GAAQDGDTHPSTGSESDSSPRQGGDHSCEGCDASCCSPSCYSS-SCYSTSCYSSSCYSAS
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660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SVDTRCSSLESARFPETPAFSSQEEEDGACAAEPTSSGPAEGSQESVCTAGSLP-VVQVP
. : . . :: ::: :.: .: : . . .: . :.: .: :
XP_016 CYSPSCYN--GNRFASHTRFSSV---DSAKISESTVFSSQDDEEEENSAFESVPDSMQSP
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. : . ... : :.::. : .: . . ::: : ... .: :
XP_016 ---ELDPESTNGAGPWQDELAAP---SGHVERSPEGLESPVA--GPSNRREGECP-----
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pF1KA1 EEGATGGSQANGHQPLRSLPSVRQDVSRYQRVDEALPPNWEARIDSHGRIFYVDHVNRTT
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pF1KA1 TWQRPTAPPAPQVLQRSNSIQQMEQLNRRYQSIRRTMTNERPEENTN------AIDGAG-
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XP_016 FFVDHNSRATTFIDPRIPLQNGRLPNHLTHRQHLQRLRSYSAGEASEVSRNRGASLLARP
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pF1KA1 SSTFNTVSRPQYQ-DMVPVAYNDKIVAFLRQPNIFEILQERQPDLTRNHSLREKIQFIRT
. .. .. : :.: . .:.:::::::::::::::::.::::::.:.:::.:::::..:::
XP_016 GHSLVAAIRSQHQHESLPLAYNDKIVAFLRQPNIFEMLQERQPSLARNHTLREKIHYIRT
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pF1KA1 EGTPGLVRLSSDADLVMLLSLFEEEIMSYVPPHALLHPSYCQSPRGSPVSSPQNSPGTQR
::. :: .:: :::::.:::::::::::::: .: .::.: ::: :: :::::::: ::
XP_016 EGNHGLEKLSCDADLVILLSLFEEEIMSYVPLQAAFHPGYSFSPRCSPCSSPQNSPGLQR
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pF1KA1 ANARAPAPYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFNQIMGYSRKD
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pF1KA1 LQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFV
::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQRNKLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLLSQELFNPYYGLFEYSANDTYTVQISPMSAFV
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pF1KA1 DNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDLSDLEYLDEEFHQSLQWM
.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::
XP_016 ENHLEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRLPCDLSDLEYLDEEFHQSLQWM
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:::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 FNRLDLPPYPSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE
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