Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1299
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1299, 671 aa
1>>>pF1KA1299 671 - 671 aa - 671 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6073+/-0.000743; mu= 6.9622+/- 0.045
mean_var=196.1899+/-40.306, 0's: 0 Z-trim(116.2): 42 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.091566
statistics sampled from 16813 (16853) to 16813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.518), width: 16
Scan time: 5.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32424.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 ( 671) 4610 621.2 1.4e-177
CCDS53997.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 ( 683) 4327 583.9 2.6e-166
CCDS53996.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 ( 756) 4316 582.4 7.7e-166
CCDS76851.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 ( 335) 2320 318.5 9.6e-87
CCDS78264.1 SH2B2 gene_id:10603|Hs108|chr7 ( 675) 587 89.8 1.4e-17
CCDS76602.1 SH2B3 gene_id:10019|Hs108|chr12 ( 373) 528 81.8 1.9e-15
CCDS9153.1 SH2B3 gene_id:10019|Hs108|chr12 ( 575) 528 81.9 2.7e-15
>>CCDS32424.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 (671 aa)
initn: 4610 init1: 4610 opt: 4610 Z-score: 3301.4 bits: 621.2 E(32554): 1.4e-177
Smith-Waterman score: 4610; 100.0% identity (100.0% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDGCHPDASCTLMPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDGCHPDASCTLMPF
610 620 630 640 650 660
670
pF1KA1 GASDCVTDHLP
:::::::::::
CCDS32 GASDCVTDHLP
670
>>CCDS53997.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 (683 aa)
initn: 4451 init1: 4322 opt: 4327 Z-score: 3099.3 bits: 583.9 E(32554): 2.6e-166
Smith-Waterman score: 4337; 94.3% identity (95.9% similar) in 684 aa overlap (1-670:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KA1 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQG--------------REQAGSHAGVCEG
::::::::::::::::::::::::::::::::: : .:::. :. .:
CCDS53 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGEQSRSAGEEVPVHPRSEAGSRLGAMRG
610 620 630 640 650 660
650 660 670
pF1KA1 DGCHPDASCTLMPFGASDCVTDHLP
: . . : :: : .: ....
CCDS53 --CAREMDATPMP-PAPSCPSERVTV
670 680
>>CCDS53996.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 (756 aa)
initn: 4312 init1: 4312 opt: 4316 Z-score: 3090.8 bits: 582.4 E(32554): 7.7e-166
Smith-Waterman score: 4316; 99.2% identity (99.4% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNGAPSPEDGASPSSPPLPPPPPPSWREFCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLSPPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGGPLAVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKPKLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAGTVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAGVGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDGCHPDASCTLMPF
:::::::::::::::::::::::::::::::: : . ::
CCDS53 LEHFRVHPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQ--EPTTSHDPPQPPEPPSWTDPPQPGAE
610 620 630 640 650
670
pF1KA1 GASDCVTDHLP
CCDS53 EASRAPEVAAAAAAAAKERQEKEKAGGGGVPEELVPVVELVPVVELEEAIAPGSEAQGAG
660 670 680 690 700 710
>>CCDS76851.1 SH2B1 gene_id:25970|Hs108|chr16 (335 aa)
initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 1670.8 bits: 318.5 E(32554): 9.6e-87
Smith-Waterman score: 2320; 100.0% identity (100.0% similar) in 335 aa overlap (337-671:1-335)
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EFFVPPKASRPRLSIPCSSITDVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVDAQHVKA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVDAQHVKA
10 20 30
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 WVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPSQDLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 WVSDIQECLSPGPCPATSPRPMTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPSQDLLLG
40 50 60 70 80 90
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEEGPPTGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PSESNDRLSQGAYGGLSDRPSASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEEGPPTGT
100 110 120 130 140 150
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQLVLTGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VHPLSAPYPPLDTPETATGSFLFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQLVLTGGT
160 170 180 190 200 210
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 GSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDMLEHFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GSHGVFLVRQSETRRGEYVLTFNFQGKAKHLRLSLNEEGQCRVQHLWFQSIFDMLEHFRV
220 230 240 250 260 270
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDGCHPDASCTLMPFGASDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HPIPLESGGSSDVVLVSYVPSSQRQQGREQAGSHAGVCEGDGCHPDASCTLMPFGASDCV
280 290 300 310 320 330
670
pF1KA1 TDHLP
:::::
CCDS76 TDHLP
>>CCDS78264.1 SH2B2 gene_id:10603|Hs108|chr7 (675 aa)
initn: 1085 init1: 576 opt: 587 Z-score: 429.2 bits: 89.8 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 1243; 41.1% identity (60.8% similar) in 628 aa overlap (1-625:44-558)
10 20
pF1KA1 MNGA-PSPEDGASPSSPPLPPPPP-PSWRE
:::: :.: .: :.: : : :.::.
CCDS78 QDPLWPLSSQQWSSAHYSEPAAGGCDGTEAMNGAGPGPAAAA-----PVPVPVPVPDWRQ
20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 FCESHARAAALDFARRFRLYLASHPQYAGPGAEAAFSRRFAELFLQHFEAEVARASGSLS
::: ::.:::.:::..: .: ..: : : : :.:::.:: ::. : :: :.
CCDS78 FCELHAQAAAVDFAHKFCRFLRDNPAYDTPDAGASFSRHFAANFLDVFGEEVRRVL----
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 PPILAPLSPGAEISPHDLSLESCRVGG-PLAVLGPSRSSEDLAGPLPSSVSSSSTTSSKP
. .: . :: .: . . : ... : : ::::::. :. ...:
CCDS78 --VAGPTTRGAAVSAEAMEPELADTSALKAAPYGHSRSSEDV----------STHAATKA
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 KLKKRFSLRSVGRSVRGSVRGILQWRGTVDPPSSAGPLETSSGPPVLGGNSNSNSSGGAG
...: ::::... : .:: . . :.. .: ..:.: .:.
CCDS78 RVRKGFSLRNMSLCVVDGVRDMWHRRASPEPDAAAAP-RTAE------------------
180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 TVGRGLVSDGTSPGERWTHRFERLRLSRGGGALKDGAGMVQREELLSFMGAEEAAPDPAG
: ..::. :::::: .: . . .::: : :: :..::
CCDS78 ------------PRDKWTR---RLRLSRTLAAKVELVD-IQREGALRFMVADDAA-----
220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 VGRGGGVAGPPSGGGGQPQWQKCRLLLRSEGEGGGGSRLEFFVPPKASRPRLSIPCSSIT
.:.::. :::::::::: .. . :::::::::::::..::: :.:
CCDS78 -----------AGSGGSAQWQKCRLLLR-RAVAEERFRLEFFVPPKASRPKVSIPLSAII
260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DVRTTTALEMPDRENTFVVKVEGPSEYIMETVDAQHVKAWVSDIQECLSPGPCPATSPRP
.:::: ::::...::::.:::. .:::.::.:. . ..::.::: :..:: : .
CCDS78 EVRTTMPLEMPEKDNTFVLKVENGAEYILETIDSLQKHSWVADIQGCVDPGD----SEED
310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 MTLPLAPGTSFLTRENTDSLELSCLNHSESLPSQDLLLGPSESNDRLSQGAYGGLSDRPS
: . : . .: . : :: :. . .:: : :.. : :
CCDS78 TELSCTRGGCLASRVASCSCEL--LTDAVDLPR------PPETT------AVG-------
360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 ASISPSSASIAASHFDSMELLPPELPPRIPIEEGPPTGTVHPLSAPYPPLDTPETATGSF
: ..: : . . . : ..:.: .. : .: . . ::
CCDS78 -------AVVTAPHSRGRDAVRESLI-HVPLET-----FLQTLESPGGS-GSDSNNTGEQ
400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 LFQGEPEGGEGDQPLSGYPWFHGMLSRLKAAQLVLTGGTGSHGVFLVRQSETRRGEYVLT
. .::. : . :: :::::: :::.:::::::.:: .::.:..:::::: ::::::
CCDS78 GAETDPEA-EPELELSDYPWFHGTLSRVKAAQLVLAGGPRNHGLFVIRQSETRPGEYVLT
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
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::::::::::::::: .:::.::::::::..:::.::..::::::::::.:..: :::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]