Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1256, 1670 aa
1>>>pF1KA1256 1670 - 1670 aa - 1670 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.7503+/-0.00168; mu= -28.7167+/- 0.100
mean_var=710.6761+/-152.110, 0's: 0 Z-trim(111.3): 162 B-trim: 372 in 1/52
Lambda= 0.048110
statistics sampled from 12149 (12271) to 12149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 4.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670) 11010 781.2 0
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697) 7225 518.5 7.6e-146
CCDS46230.1 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1249) 4127 303.4 3.2e-81
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1716) 3835 283.2 5.2e-75
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1721) 3802 280.9 2.6e-74
CCDS82661.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1149) 1640 130.7 2.7e-29
CCDS82665.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1144) 1615 129.0 9.1e-29
CCDS82663.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1215) 1386 113.1 5.8e-24
CCDS33546.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1220) 1386 113.1 5.8e-24
CCDS82666.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1178) 1379 112.6 7.9e-24
>>CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670 aa)
initn: 11010 init1: 11010 opt: 11010 Z-score: 4151.8 bits: 781.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11010; 99.9% identity (100.0% similar) in 1670 aa overlap (1-1670:1-1670)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
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CCDS17 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 GKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 LGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKTLL
1630 1640 1650 1660 1670
>>CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697 aa)
initn: 6972 init1: 6972 opt: 7225 Z-score: 2731.9 bits: 518.5 E(32554): 7.6e-146
Smith-Waterman score: 10946; 98.4% identity (98.4% similar) in 1697 aa overlap (1-1670:1-1697)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLK---------------------------ELRETYNTQQLA
::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS17 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKCGNMDDSVLQCLLSLLSCLNNLFLLLKELRETYNTQQLA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 EDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKL
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pF1KA1 ALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 ALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGK
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pF1KA1 LYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLV
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1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 KLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS17 KLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQA
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1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 RSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNC
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1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 QFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTG
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1660 1670
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:::::::::::::::::
CCDS17 EVWVRFDLQLFEQKTLL
1690
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CCDS46 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
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CCDS46 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
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CCDS46 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
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CCDS46 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
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CCDS46 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
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CCDS46 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
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CCDS46 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
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CCDS46 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
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CCDS46 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKCGNMDDSVLQCLLSLLSCLNNLFLLLKELRETYNTQQLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
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CCDS46 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
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pF1KA1 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
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pF1KA1 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
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pF1KA1 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
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pF1KA1 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
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CCDS46 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
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pF1KA1 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
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pF1KA1 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
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pF1KA1 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
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pF1KA1 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::: . .: :
CCDS46 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVRRLLLASSRGICCLS
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1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD
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pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
:::.:::.:: .::: .:.::::::::::.::::: ::::
CCDS82 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLA
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pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
.::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :. : ::::
CCDS82 QIWALADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVAISSAPA-FGMG
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pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLP-
.. :.: :: .::. : . : . : .. . ::.... : ::. .:::::
CCDS82 GIA--SMP-PLTAVAPVPMGSIPVVG--MSPTLVSS--VPTAAVPPLANGAPPVIQPLPA
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pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
. . ..:::..::.: : ....:::::. :..: : ..::
CCDS82 FAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLNTKLQKAQSF-DVASVP------------P---VAEW
180 190 200 210
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pF1KA1 AVPQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLK
:::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.:
CCDS82 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
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pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
:::::::::: :.: .::::: .:::: .::::: .:. :. :..: :: .
CCDS82 AEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISVISSTSVDQRLPEEPVL
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pF1KA1 QEEEPQ--KKLPVTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQ
..:. : ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
CCDS82 EDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAEQERKE
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 RELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQ
:: :::: :.::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::: :::
CCDS82 RERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ
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pF1KA1 ELLNQKNREQEEIVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDK
:::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: . ::. :.: .:
CCDS82 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNK
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 QCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTP-DSGVSLLHKKSLE
. .:.: :: .:::.::: :. : :.::::.::...:..: .. :: :.: :..::
CCDS82 SRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTL--KRALE
520 530 540 550 560 570
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
.:: :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: ::: .. .. .: : :
CCDS82 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
580 590 600 610 620 630
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
: ::: .:: ..: .:: :.:.. ... : :....:.: .. ..:.:: : .:...
CCDS82 EQERKIIELEKQK---EEAQRRAQE-RDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
640 650 660 670 680
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
. ::. .: : : : ...: :: : :. .: :::::
CCDS82 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
690 700 710 720 730 740
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
:::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:
CCDS82 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
750 760 770 780 790 800
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
. .: .:: :: : ...... :. : .::. :.:. :: ..
CCDS82 PVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWA
810 820 830 840 850 860
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pF1KA1 SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNF
. .::: .. : ..:::: ... :: ::. :::. ::.:.:::: : :::::::::
CCDS82 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKR--------EEPEALYAAV
.:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: : : : : .: ..
CCDS82 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPIRKSTSMDSGSSESPASLKRVA
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pF1KA1 NKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPS
. :.. :::.::.: : : : ::::: .:. ::::.:::.::::..::..:.:::
CCDS82 S--PAAKPVVSGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWTGTVGDKAGVFPS
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pF1KA1 NYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWW
:::. ::.:. :.:.:.:. .:::::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::
CCDS82 NYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWW
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pF1KA1 QGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNED
.::::::::::: :::::..::::.:.. . ::. : :::::.::::.:.:.:
CCDS82 EGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDD
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pF1KA1 ELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQ
::.:.:::.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: .
CCDS82 ELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLT
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pF1KA1 PIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSN
: :::::::::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: :
CCDS82 PTERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCN
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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pF1KA1 TKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTD
::::::::::: .::::::.::::::.:.: ::: :::::: :::::::.:::::: :
CCDS82 IKLLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPD
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pF1KA1 FKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALER
::::.:.:: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.
CCDS82 FKEFVKRLAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEK
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 AEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.
CCDS82 AEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKA
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KA1 KSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPT
::::::.::::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.::::::::::::::::::
CCDS82 KSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPT
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA1 DPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQK
:::.:::.:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::.
CCDS82 DPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQR
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 TSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFI
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1660 1670
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1710
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CCDS33 VRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSN
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pF1KA1 GEVWVRFDLQLFEQKTLL
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pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
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CCDS82 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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CCDS82 PFESRSHDEITIQPGDIVMVKGEWVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEV
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pF1KA1 ---------NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDY
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CCDS82 PAPVKPVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDN
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CCDS82 WDAWAAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKD
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CCDS82 NHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISG-------P------IRK-
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pF1KA1 PTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYV
:.... : :: :..: . .
CCDS82 --STSMDSG---------SSESPASL------------------------------KRVA
980 990
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pF1KA1 KPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGE
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CCDS82 SP--------AAKPVVSGE--EIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGE
1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KA1 LQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNEDELS
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CCDS82 LQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDDELA
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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CCDS82 FNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQ
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CCDS33 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLA
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CCDS33 GIA--SMP-PLTAVAPVPMGSIPVVG--MSPTLVSS--VPTAAVPPLANGAPPVIQPLPA
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CCDS33 FAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLNTKLQKAQSF-DVASVP------------P---VAEW
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pF1KA1 AVPQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLK
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CCDS33 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]