Result of FASTA (omim) for
pF1KA1226
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1226, 704 aa
1>>>pF1KA1226 704 - 704 aa - 704 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4325+/-0.00049; mu= 19.4518+/- 0.030
mean_var=73.2147+/-14.522, 0's: 0 Z-trim(108.3): 29 B-trim: 20 in 1/49
Lambda= 0.149891
statistics sampled from 16349 (16361) to 16349 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 9.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065777 (OMIM: 611530) neurolysin, mitochondrial ( 704) 4666 1019.2 0
XP_006714724 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, ( 681) 4523 988.3 0
XP_005248616 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, ( 686) 3229 708.5 2.2e-203
XP_016865162 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, ( 663) 3086 677.5 4.3e-194
NP_003240 (OMIM: 601117) thimet oligopeptidase [Ho ( 689) 2999 658.7 2.1e-188
XP_011526530 (OMIM: 601117) PREDICTED: thimet olig ( 480) 2198 485.4 2.1e-136
XP_011533399 (OMIM: 602241) PREDICTED: mitochondri ( 651) 632 146.9 2.4e-34
NP_005923 (OMIM: 602241) mitochondrial intermediat ( 713) 631 146.7 3e-34
XP_011533400 (OMIM: 602241) PREDICTED: mitochondri ( 621) 505 119.4 4.3e-26
>>NP_065777 (OMIM: 611530) neurolysin, mitochondrial [Ho (704 aa)
initn: 4666 init1: 4666 opt: 4666 Z-score: 5451.6 bits: 1019.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4666; 100.0% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-704)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KA1 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
670 680 690 700
>>XP_006714724 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, mit (681 aa)
initn: 4523 init1: 4523 opt: 4523 Z-score: 5284.7 bits: 988.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4523; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (24-704:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700
pF1KA1 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
640 650 660 670 680
>>XP_005248616 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, mit (686 aa)
initn: 3222 init1: 3222 opt: 3229 Z-score: 3772.4 bits: 708.5 E(85289): 2.2e-203
Smith-Waterman score: 4486; 97.4% identity (97.4% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-686)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGRPSLLRHDE------------------TDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700
pF1KA1 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
650 660 670 680
>>XP_016865162 (OMIM: 611530) PREDICTED: neurolysin, mit (663 aa)
initn: 3079 init1: 3079 opt: 3086 Z-score: 3605.5 bits: 677.5 E(85289): 4.3e-194
Smith-Waterman score: 4343; 97.4% identity (97.4% similar) in 681 aa overlap (24-704:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MIARCLLAVRSLRRVGGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEELIVQTKQVYDAVGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASTEADKRLSRFDIEMSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEQVQNEIKSMKKRMSELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWD
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPV
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGRPSLLRHDE------------------TDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVD
460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEY
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKYCSEILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPE
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700
pF1KA1 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
620 630 640 650 660
>>NP_003240 (OMIM: 601117) thimet oligopeptidase [Homo s (689 aa)
initn: 3024 init1: 2996 opt: 2999 Z-score: 3503.6 bits: 658.7 E(85289): 2.1e-188
Smith-Waterman score: 2999; 64.8% identity (86.9% similar) in 657 aa overlap (46-702:22-678)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 GGSRILLRMTLGREVMSPLQAMSSYTVAGRNVLRWDLSPEQIKTRTEELIVQTKQVYDAV
: :::::: .::. ::.::: :::.::: :
NP_003 MKPPAACAGDMADAASPCSVVNDLRWDLSAQQIEERTRELIEQTKRVYDQV
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 GMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRAASTEADKRLSRFDIE
: .:.:.::. :.::::::: : :.:..:::::::: .:..:.:::::::.::.::.:
NP_003 GTQEFEDVSYESTLKALADVEVTYTVQRNILDFPQHVSPSKDIRTASTEADKKLSEFDVE
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 MSMRGDIFERIVHLQETCDLGKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHLPEQVQNEIKSMKKRM
:::: :...::: ::: . ...::: ::::. ::.:.:::::::...:..:: .::..
NP_003 MSMREDVYQRIVWLQEKVQKDSLRPEAARYLERLIKLGRRNGLHLPRETQENIKRIKKKL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 SELCIDFNKNLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYKITLKYPHYFPVMKKC
: :::::::::::: ::: :. :::.::.::..:::: .: : :.:::::::::..:::
NP_003 SLLCIDFNKNLNEDTTFLPFTLQELGGLPEDFLNSLEKMEDGKLKVTLKYPHYFPLLKKC
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 CIPETRRRMEMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHADFVLEMNTAKSTSRV
.:::::..: ::: :::::: ::..:. ::.. ..:::. ::::.::::: ::... :
NP_003 HVPETRRKVEEAFNCRCKEENCAILKELVTLRAQKSRLLGFHTHADYVLEMNMAKTSQTV
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 TAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWDLYYYMTQTEELKYSI
..:::.:.:::::::: :: ::.::. ::. ::. .::.: :::. :::.:.:: .: .
NP_003 ATFLDELAQKLKPLGEQERAVILELKRAECERRGLPFDGRIRAWDMRYYMNQVEETRYCV
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 DQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTLYTVKDKATGEVLGQF
::..::::::..:::.:::. :::::::.:.. : .:...: :::..: :.:::.:.:
NP_003 DQNLLKEYFPVQVVTHGLLGIYQELLGLAFHHEEGASAWHEDVRLYTARDAASGEVVGKF
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 YLDLYPREGKYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPVAGRPSLLRHDEVRTY
:::::::::::.:::::::::::: ::::..:.::.:.::..:.: ::::.::::.::
NP_003 YLDLYPREGKYGHAACFGLQPGCLRQDGSRQIAIAAMVANFTKPTADAPSLLQHDEVETY
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 FHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVDSLRRLSKHYKDGSPI
::::::::::.:.:..:: ::::.:: ::::.::::::::::. . : :.:.::. :: .
NP_003 FHEFGHVMHQLCSQAEFAMFSGTHVERDFVEAPSQMLENWVWEQEPLLRMSRHYRTGSAV
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 ADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEYAKYCSEILGVAATPG
.:::::. :: .::::..::::::.::::.:::.:. : : :::. :.::::: ::::
NP_003 PRELLEKLIESRQANTGLFNLRQIVLAKVDQALHTQTDADPAEEYARLCQEILGVPATPG
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 TNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEVGMKYRNLILKPGGS
:::::::::::::::.::::::::::.:::::.. ::.::..: .::: ::. ::.::::
NP_003 TNMPATFGHLAGGYDAQYYGYLWSEVYSMDMFHTRFKQEGVLNSKVGMDYRSCILRPGGS
600 610 620 630 640 650
680 690 700
pF1KA1 LDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
:. ::. :: :.:.: :::.:.::.
NP_003 EDASAMLRRFLGRDPKQDAFLLSKGLQVGGCEPEPQVC
660 670 680
>>XP_011526530 (OMIM: 601117) PREDICTED: thimet oligopep (480 aa)
initn: 2202 init1: 2174 opt: 2198 Z-score: 2569.7 bits: 485.4 E(85289): 2.1e-136
Smith-Waterman score: 2198; 65.4% identity (87.4% similar) in 468 aa overlap (235-702:2-469)
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 NLNEDDTFLVFSKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYKITLKYPHYFPVMKKCCIPETRRRM
.: : :.:::::::::..::: .:::::..
XP_011 MEDGKLKVTLKYPHYFPLLKKCHVPETRRKV
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 EMAFNTRCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHADFVLEMNTAKSTSRVTAFLDDLSQ
: ::: :::::: ::..:. ::.. ..:::. ::::.::::: ::... :..:::.:.:
XP_011 EEAFNCRCKEENCAILKELVTLRAQKSRLLGFHTHADYVLEMNMAKTSQTVATFLDELAQ
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 KLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWDLYYYMTQTEELKYSIDQEFLKEYF
::::::: :: ::.::. ::. ::. .::.: :::. :::.:.:: .: .::..:::::
XP_011 KLKPLGEQERAVILELKRAECERRGLPFDGRIRAWDMRYYMNQVEETRYCVDQNLLKEYF
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 PIEVVTEGLLNTYQELLGLSFEQMTDAHVWNKSVTLYTVKDKATGEVLGQFYLDLYPREG
:..:::.:::. :::::::.:.. : .:...: :::..: :.:::.:.::::::::::
XP_011 PVQVVTHGLLGIYQELLGLAFHHEEGASAWHEDVRLYTARDAASGEVVGKFYLDLYPREG
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 KYNHAACFGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPVAGRPSLLRHDEVRTYFHEFGHVMH
::.:::::::::::: ::::..:.::.:.::..:.: ::::.::::.:::::::::::
XP_011 KYGHAACFGLQPGCLRQDGSRQIAIAAMVANFTKPTADAPSLLQHDEVETYFHEFGHVMH
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 QICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVDSLRRLSKHYKDGSPIADDLLEKLV
:.:.:..:: ::::.:: ::::.::::::::::. . : :.:.::. :: . .:::::.
XP_011 QLCSQAEFAMFSGTHVERDFVEAPSQMLENWVWEQEPLLRMSRHYRTGSAVPRELLEKLI
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSLDAASEYAKYCSEILGVAATPGTNMPATFGH
:: .::::..::::::.::::.:::.:. : : :::. :.::::: :::::::::::::
XP_011 ESRQANTGLFNLRQIVLAKVDQALHTQTDADPAEEYARLCQEILGVPATPGTNMPATFGH
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 LAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEVGMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHN
::::::.::::::::::.:::::.. ::.::..: .::: ::. ::.:::: :. ::.
XP_011 LAGGYDAQYYGYLWSEVYSMDMFHTRFKQEGVLNSKVGMDYRSCILRPGGSEDASAMLRR
400 410 420 430 440 450
690 700
pF1KA1 FLKREPNQKAFLMSRGLHAP
:: :.:.: :::.:.::.
XP_011 FLGRDPKQDAFLLSKGLQVGGCEPEPQVC
460 470 480
>>XP_011533399 (OMIM: 602241) PREDICTED: mitochondrial i (651 aa)
initn: 516 init1: 272 opt: 632 Z-score: 737.6 bits: 146.9 E(85289): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 660; 26.8% identity (56.4% similar) in 605 aa overlap (105-696:59-632)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 VGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRAASTEADKRLSRFDI
. :: . . . : :. :: . .. .
XP_011 LVDRACSTPPGPQTVLIFDELSDSLCRVADLADFVKIAHPEPAFREAAEEACRSIGTMVE
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 EMSMRGDIFERIVHLQETCDL-GKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHLPEQVQNEIKSMKK
... :... . .: : .. ::.:: : . . .:.:: : .:
XP_011 KLNTNVDLYQSLQKLLADKKLVDSLDPETRRVAELFMFDFEISGIHLD-------KEKRK
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240
pF1KA1 RMSELCIDFNKNLNEDDTFLV---F-SKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYKITLKYPHYF
: .: . : :. ..:::. : .: : ::. . .. .. : .: . :
XP_011 RAVDLNV---KILDLSSTFLMGTNFPNKIEKHLLPEHIRRNFTSAGD---HIIIDGLH--
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVMKKCCIPETRRRMEMAFNT---RCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHADFVLEM
. :. .. . :. .: :..:: : .:::.:::: . .:.
XP_011 AESPDDLVREAAYKIFLYPNAGQLKC-------LEELLSSRDLLAKLVGYSTFSHRALQG
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWDLYYYMT
. ::. : ::. ::.::. . :.: ..: : . .... :: ::
XP_011 TIAKNPETVMQFLEKLSDKLSERTLKDFEMIRGMKMKLNPQ-----NSEVMPWDPPYYSG
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSF--EQMTDAHVWNKSVTLYTVK
. .:.:. . .: . . ::: ..:::.:. :: . ..::...: .:
XP_011 VIRAERYNIEPSLYCPFFSLGACMEGLNILLNRLLGISLYAEQPAKGEVWSEDVRKLAVV
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAAC-FGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPVAGR
.. : .:: .: :.. : : : : : .. : : ::. .. :..:..:. . .
XP_011 HESEG-LLGYIYCDFFQRADK-PHQDCHFTIRGGRLKEDGDYQLPVVVLMLNLPRSSRSS
370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVDSLR
:.:: . ... :::.::.::.. ..: . . .:: :::.:::: ..: .. : .
XP_011 PTLLTPSMMENLFHEMGHAMHSMLGRTRYQHVTGTRCPTDFAEVPSILMEYFANDYRVVN
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSL-DAASEYAK
....::. :.:. ... .: :. : .. :. . .:: : . : ..... :
XP_011 QFARHYQTGQPLPKNMVSRLCESKKVCAAADMQLQVFYATLDQIYHGKHPLRNSTTDILK
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 YCSE-ILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEV
.: . :. .:.: :.::.: : ..::.:: :.. . .. :: .. . : .
XP_011 ETQEKFYGLPYVPNTAWQLRFSHLVG-YGARYYSYLMSRAVASMVWKECFLQDPF-NRAA
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700
pF1KA1 GMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
: .:: .: ::. . : :....:.. :. :.
XP_011 GERYRREMLAHGGGREPMLMVEGMLQKCPSVDDFVSALVSDLDLDFETFLMDSE
600 610 620 630 640 650
>>NP_005923 (OMIM: 602241) mitochondrial intermediate pe (713 aa)
initn: 515 init1: 271 opt: 631 Z-score: 735.9 bits: 146.7 E(85289): 3e-34
Smith-Waterman score: 659; 26.8% identity (56.2% similar) in 605 aa overlap (105-696:121-694)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 VGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRAASTEADKRLSRFDI
. :: . . . : :. :: . .. .
NP_005 LVDRACSTPPGPQTVLIFDELSDSLCRVADLADFVKIAHPEPAFREAAEEACRSIGTMVE
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 EMSMRGDIFERIVHLQETCDL-GKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHLPEQVQNEIKSMKK
... :... . .: : .. ::.:: : . . .:.:: : .:
NP_005 KLNTNVDLYQSLQKLLADKKLVDSLDPETRRVAELFMFDFEISGIHLD-------KEKRK
160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KA1 RMSELCIDFNKNLNEDDTFLV---F-SKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYKITLKYPHYF
: .: . : :. ..:::. : .: : ::. . .. .. : .: . :
NP_005 RAVDLNV---KILDLSSTFLMGTNFPNKIEKHLLPEHIRRNFTSAGD---HIIIDGLH--
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVMKKCCIPETRRRMEMAFNT---RCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHADFVLEM
. :. .. . :. .: :..:: : .:::.:::: . .:.
NP_005 AESPDDLVREAAYKIFLYPNAGQLKC-------LEELLSSRDLLAKLVGYSTFSHRALQG
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWDLYYYMT
. ::. : ::. ::.::. . :.: ..: : . .... :: ::
NP_005 TIAKNPETVMQFLEKLSDKLSERTLKDFEMIRGMKMKLNPQ-----NSEVMPWDPPYYSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSF--EQMTDAHVWNKSVTLYTVK
. .:.:. . .: . . ::: ..:::.:. :: . ..::...: .:
NP_005 VIRAERYNIEPSLYCPFFSLGACMEGLNILLNRLLGISLYAEQPAKGEVWSEDVRKLAVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAAC-FGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPVAGR
.. : .:: .: :.. : : : : : .. : : ::. .. :..:..:. . .
NP_005 HESEG-LLGYIYCDFFQRADK-PHQDCHFTIRGGRLKEDGDYQLPVVVLMLNLPRSSRSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVDSLR
:.:: ... :::.::.::.. ..: . . .:: :::.:::: ..: .. : .
NP_005 PTLLTPGMMENLFHEMGHAMHSMLGRTRYQHVTGTRCPTDFAEVPSILMEYFANDYRVVN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSL-DAASEYAK
....::. :.:. ... .: :. : .. :. . .:: : . : ..... :
NP_005 QFARHYQTGQPLPKNMVSRLCESKKVCAAADMQLQVFYATLDQIYHGKHPLRNSTTDILK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 YCSE-ILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEV
.: . :. .:.: :.::.: : ..::.:: :.. . .. :: .. . : .
NP_005 ETQEKFYGLPYVPNTAWQLRFSHLVG-YGARYYSYLMSRAVASMVWKECFLQDPF-NRAA
610 620 630 640 650
670 680 690 700
pF1KA1 GMKYRNLILKPGGSLDGMDMLHNFLKREPNQKAFLMSRGLHAP
: .:: .: ::. . : :....:.. :. :.
NP_005 GERYRREMLAHGGGREPMLMVEGMLQKCPSVDDFVSALVSDLDLDFETFLMDSE
660 670 680 690 700 710
>>XP_011533400 (OMIM: 602241) PREDICTED: mitochondrial i (621 aa)
initn: 449 init1: 260 opt: 505 Z-score: 589.5 bits: 119.4 E(85289): 4.3e-26
Smith-Waterman score: 533; 26.3% identity (55.4% similar) in 525 aa overlap (105-616:121-616)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 VGMLGIEEVTYENCLQALADVEVKYIVERTMLDFPQHVSSDKEVRAASTEADKRLSRFDI
. :: . . . : :. :: . .. .
XP_011 LVDRACSTPPGPQTVLIFDELSDSLCRVADLADFVKIAHPEPAFREAAEEACRSIGTMVE
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 EMSMRGDIFERIVHLQETCDL-GKIKPEARRYLEKSIKMGKRNGLHLPEQVQNEIKSMKK
... :... . .: : .. ::.:: : . . .:.:: : .:
XP_011 KLNTNVDLYQSLQKLLADKKLVDSLDPETRRVAELFMFDFEISGIHLD-------KEKRK
160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KA1 RMSELCIDFNKNLNEDDTFLV---F-SKAELGALPDDFIDSLEKTDDDKYKITLKYPHYF
: .: . : :. ..:::. : .: : ::. . .. .. : .: . :
XP_011 RAVDLNV---KILDLSSTFLMGTNFPNKIEKHLLPEHIRRNFTSAGD---HIIIDGLHAE
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVMKKCCIPETRRRMEMAFNT---RCKEENTIILQQLLPLRTKVAKLLGYSTHADFVLEM
. :. .. . :. .: :..:: : .:::.:::: . .:.
XP_011 S--PDDLVREAAYKIFLYPNAGQLKC-------LEELLSSRDLLAKLVGYSTFSHRALQG
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NTAKSTSRVTAFLDDLSQKLKPLGEAEREFILNLKKKECKDRGFEYDGKINAWDLYYYMT
. ::. : ::. ::.::. . :.: ..: : . .... :: ::
XP_011 TIAKNPETVMQFLEKLSDKLSERTLKDFEMIRGMKMKLNPQ-----NSEVMPWDPPYYSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QTEELKYSIDQEFLKEYFPIEVVTEGLLNTYQELLGLSF--EQMTDAHVWNKSVTLYTVK
. .:.:. . .: . . ::: ..:::.:. :: . ..::...: .:
XP_011 VIRAERYNIEPSLYCPFFSLGACMEGLNILLNRLLGISLYAEQPAKGEVWSEDVRKLAVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DKATGEVLGQFYLDLYPREGKYNHAAC-FGLQPGCLLPDGSRMMAVAALVVNFSQPVAGR
.. : .:: .: :.. : : : : : .. : : ::. .. :..:..:. . .
XP_011 HESEG-LLGYIYCDFFQRADK-PHQDCHFTIRGGRLKEDGDYQLPVVVLMLNLPRSSRSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PSLLRHDEVRTYFHEFGHVMHQICAQTDFARFSGTNVETDFVEVPSQMLENWVWDVDSLR
:.:: . ... :::.::.::.. ..: . . .:: :::.:::: ..: .. : .
XP_011 PTLLTPSMMENLFHEMGHAMHSMLGRTRYQHVTGTRCPTDFAEVPSILMEYFANDYRVVN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 RLSKHYKDGSPIADDLLEKLVASRLVNTGLLTLRQIVLSKVDQSLHTNTSL-DAASEYAK
....::. :.:. ... .: :. : .. :. . .:: : . : ..... :
XP_011 QFARHYQTGQPLPKNMVSRLCESKKVCAAADMQLQVFYATLDQIYHGKHPLRNSTTDILK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 YCSE-ILGVAATPGTNMPATFGHLAGGYDGQYYGYLWSEVFSMDMFYSCFKKEGIMNPEV
.: . :. .:.:
XP_011 ETQEKFYGLPYVPNTAVQEA
610 620
704 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:23:53 2016 done: Fri Nov 4 01:23:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]