Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1193
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1193, 545 aa
1>>>pF1KA1193 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2104+/-0.000865; mu= 6.3902+/- 0.052
mean_var=174.8094+/-35.450, 0's: 0 Z-trim(113.2): 41 B-trim: 137 in 1/52
Lambda= 0.097004
statistics sampled from 13856 (13895) to 13856 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32855.1 MIER2 gene_id:54531|Hs108|chr19 ( 545) 3729 534.0 1.8e-151
CCDS75248.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 550) 1019 154.7 2.6e-37
CCDS78011.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 555) 1016 154.3 3.5e-37
CCDS3973.2 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 ( 549) 1006 152.9 9.2e-37
CCDS41347.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 433) 1000 152.0 1.4e-36
CCDS53327.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 450) 1000 152.0 1.4e-36
CCDS53328.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 470) 1000 152.0 1.4e-36
CCDS53325.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 486) 1000 152.0 1.5e-36
CCDS41348.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 512) 1000 152.0 1.6e-36
CCDS53329.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 529) 1000 152.0 1.6e-36
CCDS53326.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 565) 1000 152.1 1.7e-36
CCDS53330.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 ( 370) 962 146.6 4.8e-35
>>CCDS32855.1 MIER2 gene_id:54531|Hs108|chr19 (545 aa)
initn: 3729 init1: 3729 opt: 3729 Z-score: 2833.1 bits: 534.0 E(32554): 1.8e-151
Smith-Waterman score: 3729; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFNLAEILSQNYSVRGEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFNLAEILSQNYSVRGEC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGYEASDPISDRESEGGDVAPNLPDMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGYEASDPISDRESEGGDVAPNLPDMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LDKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADEDREPGSSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADEDREPGSSAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLSNLHLNRHCEKIYENEDQLLWDPSVLPEREVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLSNLHLNRHCEKIYENEDQLLWDPSVLPEREVEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFNVKVIRDGLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFNVKVIRDGLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 AWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYDYFAQQTRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYDYFAQQTRLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RRKYVPSGTTDADQDLDGSDPDGPGRPRPEQDTLTGMRTDPLSVDGTAGGLDEPGVASDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RRKYVPSGTTDADQDLDGSDPDGPGRPRPEQDTLTGMRTDPLSVDGTAGGLDEPGVASDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAPEPDASPRLAVDFALPKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAPEPDASPRLAVDFALPKEL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PLISSHVDLSGDPEETVAPAQVALSVTEFGLIGIGDVNPFLAAHPTCPAPGLHSEPLSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLISSHVDLSGDPEETVAPAQVALSVTEFGLIGIGDVNPFLAAHPTCPAPGLHSEPLSHC
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NVMTC
:::::
CCDS32 NVMTC
>>CCDS75248.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (550 aa)
initn: 900 init1: 601 opt: 1019 Z-score: 783.3 bits: 154.7 E(32554): 2.6e-37
Smith-Waterman score: 1073; 39.5% identity (63.5% similar) in 554 aa overlap (31-535:9-550)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRGE
.. : :..: ::.:. ::.: ..:. .
CCDS75 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERT
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 CEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGYEASDPI---SDRESEGGDVAPNL
:: . . : . . . . ::...:::.:::: . : :. .: ...: .:
CCDS75 LEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADEL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 PDMTLDKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADEDREPG
::::::::.::::::::..:: ::::::::::::::::.::.:: : : :.:
CCDS75 PDMTLDKEEIAKDLLSGDDEE-TQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKE--
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 SSASSDTEEDS--LPANKCKKEIMVGPQFQADLSNLHLNRH--CEKIYENEDQLLWDPSV
: :.: :: : . .::::.: :.::.. .:... ::.::::::::: :.:
CCDS75 -SEVEDVETDSGNSPED-LRKEIMIGLQYQAEIPP-YLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFNV
. : .:.:.: .. : : .. : ..:.:::::::.::: :..::..: :
CCDS75 VLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYDY
:. ..:. ::.:::::.:::.. . ::.::::: ::::::.:.::: .::.:::::::::
CCDS75 KASQEGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KA1 FAQQTRLGRRKYVPS-GTTD-ADQDLDGSDPDG---------PGRPRPEQDTLTGMRTDP
::::::.:...: :.:: :. .: .. : .::.: : .. ..
CCDS75 FAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440
pF1KA1 LSVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPC---SFQQLDESPAVPLSHRP---------PA-
. : :: : . .::. :.. : :: : ..: ..: : :.
CCDS75 TASDLTA--LTN-SVATVCDPTDV--NCLDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSN
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KA1 -------LADPASYQ----PAVTAPEPDASP--RLAVDFALPK----ELPLISSHVDLSG
: . . :. : : . : :: . .:.:. :. . . ::. .
CCDS75 GESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFEN
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KA1 DPEETVAPAQVALSVTEFGLIGIGDVNPFLAAHPTCPAPGLHSEPLSHCNVMTC
.. .. :..:.::..:: .. ...: :..:: .::::
CCDS75 HTHH-ITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHALHQHAALHSE
510 520 530 540 550
>>CCDS78011.1 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 900 init1: 601 opt: 1016 Z-score: 781.0 bits: 154.3 E(32554): 3.5e-37
Smith-Waterman score: 1070; 39.6% identity (63.6% similar) in 550 aa overlap (34-535:17-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 ASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRGECEE
: :..: ::.:. ::.: ..:. . ::
CCDS78 MAEASFGSSSPVCFIPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERTLEE
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KA1 ASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGYEASDPI---SDRESEGGDVAPNLPDM
. . : . . . . ::...:::.:::: . : :. .: ...: .::::
CCDS78 EEMMDEGKNFSSEIEDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADELPDM
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 TLDKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADEDREPGSSA
:::::.::::::::..:: ::::::::::::::::.::.:: : : :.: :
CCDS78 TLDKEEIAKDLLSGDDEE-TQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKE---SE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 SSDTEEDSLPANK-CKKEIMVGPQFQADLSNLHLNRH--CEKIYENEDQLLWDPSVLPER
:.: :: . . .::::.: :.::.. .:... ::.::::::::: :.:. :
CCDS78 VEDVETDSGNSPEDLRKEIMIGLQYQAEIPP-YLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDVVLES
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 EVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFNVKVIR
.:.:.: .. : : .. : ..:.:::::::.::: :..::..: : :. .
CCDS78 KVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNGKASQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 DGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYDYFAQQ
.:. ::.:::::.:::.. . ::.::::: ::::::.:.::: .::.:::::::::::::
CCDS78 EGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDYFAQQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA1 TRLGRRKYVPS-GTTD-ADQDLDGSDPDG---------PGRPRPEQDTLTGMRTDPLSVD
::.:...: :.:: :. .: .. : .::.: : .. .. . :
CCDS78 TRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSFTASD
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440
pF1KA1 GTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPC---SFQQLDESPAVPLSHRP---------PA-----
:: : . .::. :.. : :: : ..: ..: : :.
CCDS78 LTA--LTN-SVATVCDPTDV--NCLDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSNGESD
410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KA1 ---LADPASYQ----PAVTAPEPDASP--RLAVDFALPK----ELPLISSHVDLSGDPEE
: . . :. : : . : :: . .:.:. :. . . ::. . ..
CCDS78 CFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFENHTHH
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KA1 TVAPAQVALSVTEFGLIGIGDVNPFLAAHPTCPAPGLHSEPLSHCNVMTC
.. :..:.::..:: .. ...: :..:: .::::
CCDS78 -ITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHALHQHAALHSE
520 530 540 550
>>CCDS3973.2 MIER3 gene_id:166968|Hs108|chr5 (549 aa)
initn: 816 init1: 368 opt: 1006 Z-score: 773.5 bits: 152.9 E(32554): 9.2e-37
Smith-Waterman score: 1060; 39.5% identity (63.4% similar) in 554 aa overlap (31-535:9-549)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRGE
.. : :..: ::.:. ::.: ..:. .
CCDS39 MAEASFGSSSPVGSLSSEDHDFDPTAEMLVHDYDDERT
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 CEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGYEASDPI---SDRESEGGDVAPNL
:: . . : . . . . ::...:::.:::: . : :. .: ...: .:
CCDS39 LEEEEMMDEGKNFSSEIEDLEKEGTMPLEDLLAFYGYEPTIPAVANSSANSSPSELADEL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 PDMTLDKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADEDREPG
::::::::.::::::::..:: ::::::::::::::::.::.:: : : :.:
CCDS39 PDMTLDKEEIAKDLLSGDDEE-TQSSADDLTPSVTSHETSDFFPRPLRSNTACDGDKE--
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 SSASSDTEEDS--LPANKCKKEIMVGPQFQADLSNLHLNRH--CEKIYENEDQLLWDPSV
: :.: :: : . .::::.: :.::.. .:... ::.::::::::: :.:
CCDS39 -SEVEDVETDSGNSPED-LRKEIMIGLQYQAEIPP-YLGEYDGNEKVYENEDQLLWCPDV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFNV
. : .:.:.: .. : : .. : ..:.:::::::.::: :..::..: :
CCDS39 VLESKVKEYLVETSLRTGSEKIMDRISAGTHTRDNEQALYELLKCNHNIKEAIERYCCNG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYDY
:. .:. ::.:::::.:::.. . ::.::::: ::::::.:.::: .::.:::::::::
CCDS39 KA-SQGMTAWTEEECRSFEHALMLFGKDFHLIQKNKVRTRTVAECVAFYYMWKKSERYDY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KA1 FAQQTRLGRRKYVPS-GTTD-ADQDLDGSDPDG---------PGRPRPEQDTLTGMRTDP
::::::.:...: :.:: :. .: .. : .::.: : .. ..
CCDS39 FAQQTRFGKKRYNHHPGVTDYMDRLVDETEALGGTVNASALTSNRPEPIPDQQLNILNSF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440
pF1KA1 LSVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPC---SFQQLDESPAVPLSHRP---------PA-
. : :: : . .::. :.. : :: : ..: ..: : :.
CCDS39 TASDLTA--LTN-SVATVCDPTDV--NCLDDSFPPLGNTPRGQVNHVPVVTEELLTLPSN
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KA1 -------LADPASYQ----PAVTAPEPDASP--RLAVDFALPK----ELPLISSHVDLSG
: . . :. : : . : :: . .:.:. :. . . ::. .
CCDS39 GESDCFNLFETGFYHSELNPMNMCSEESERPAKRLKMGIAVPESFMNEVSVNNLGVDFEN
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KA1 DPEETVAPAQVALSVTEFGLIGIGDVNPFLAAHPTCPAPGLHSEPLSHCNVMTC
.. .. :..:.::..:: .. ...: :..:: .::::
CCDS39 HTHH-ITSAKMAVSVADFGSLSANETNGFISAHALHQHAALHSE
510 520 530 540
>>CCDS41347.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (433 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 770.4 bits: 152.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1005; 43.6% identity (68.3% similar) in 413 aa overlap (26-420:3-409)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVV-SMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRG
::...... : : ::.:. :..: .... .
CCDS41 MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDER
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ECEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGD
:: . . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS41 TLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGED
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KA1 VAPNLPDMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSR
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : .
CCDS41 DEDADNDDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKY
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FLADEDREPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQ
: .. . : :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.::
CCDS41 FDTNSEVE----EESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQ
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLWDPSVLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEAL
::::: ::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::
CCDS41 LLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEAL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RRLRFNVKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWK
::::::::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::
CCDS41 RRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWK
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 KSERYDYFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPL
::::::.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. ..
CCDS41 KSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSE
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAP
. :::.. .. ::.:.:
CCDS41 KEDGTVSTANQNGVSSNGPGILQMLLPVHFSAISSRANAFLK
400 410 420 430
>>CCDS53327.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (450 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 770.2 bits: 152.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1001; 43.3% identity (68.3% similar) in 413 aa overlap (26-420:20-426)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVV-SMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRG
.:...... : : ::.:. :..: .... .
CCDS53 MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDER
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ECEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGD
:: . . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS53 TLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGED
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KA1 VAPNLPDMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSR
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : .
CCDS53 DEDADNDDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FLADEDREPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQ
: .. . : :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.::
CCDS53 FDTNSEVE----EESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQ
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLWDPSVLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEAL
::::: ::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::
CCDS53 LLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEAL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RRLRFNVKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWK
::::::::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::
CCDS53 RRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 KSERYDYFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPL
::::::.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. ..
CCDS53 KSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSE
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAP
. :::.. .. ::.:.:
CCDS53 KEDGTVSTANQNGVSSNGPGILQMLLPVHFSAISSRANAFLK
410 420 430 440 450
>>CCDS53328.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 769.9 bits: 152.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1001; 43.3% identity (68.3% similar) in 413 aa overlap (26-420:20-426)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVV-SMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRG
.:...... : : ::.:. :..: .... .
CCDS53 MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDER
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ECEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGD
:: . . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS53 TLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGED
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KA1 VAPNLPDMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSR
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : .
CCDS53 DEDADNDDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FLADEDREPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQ
: .. . : :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.::
CCDS53 FDTNSEVE----EESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQ
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLWDPSVLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEAL
::::: ::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::
CCDS53 LLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEAL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RRLRFNVKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWK
::::::::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::
CCDS53 RRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 KSERYDYFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPL
::::::.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. ..
CCDS53 KSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSE
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAP
. :::.. .. ::.:.:
CCDS53 KEDGTVSTANQNGVSSNGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGILQMLLPVHFSAISSRANAF
410 420 430 440 450 460
>>CCDS53325.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (486 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 769.7 bits: 152.0 E(32554): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1000; 44.3% identity (68.2% similar) in 402 aa overlap (36-420:67-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 SLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVVSMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRGECEEAS
: : ::.:. :..: .... . ::
CCDS53 RTWLRTNWLRFNADKTDVMLPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDERTLEEEE
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110
pF1KA1 RCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGDVAPNLP
. . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS53 MMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGEDDEDADN
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSRFLADED
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : . : .. .
CCDS53 DDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKYFDTNSE
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 REPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQLLWDPS
: :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.:::::::
CCDS53 VEE----ESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQLLWDPE
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEALRRLRFN
::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::::::::
CCDS53 YLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEALRRLRFN
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWKKSERYD
::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::::::::
CCDS53 VKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWKKSERYD
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400
pF1KA1 YFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPLSVDGTA
.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. .. . :::.
CCDS53 FFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSEKEDGTV
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 GGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAPEPDASP
. .. ::.:.:
CCDS53 STANQNGVSSNGPGILQMLLPVHFSAISSRANAFLK
460 470 480
>>CCDS41348.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (512 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 769.4 bits: 152.0 E(32554): 1.6e-36
Smith-Waterman score: 1005; 43.6% identity (68.3% similar) in 413 aa overlap (26-420:3-409)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVV-SMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRG
::...... : : ::.:. :..: .... .
CCDS41 MAEPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDER
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ECEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGD
:: . . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS41 TLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGED
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KA1 VAPNLPDMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSR
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : .
CCDS41 DEDADNDDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKY
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FLADEDREPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQ
: .. . : :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.::
CCDS41 FDTNSEVE----EESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQ
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLWDPSVLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEAL
::::: ::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::
CCDS41 LLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEAL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RRLRFNVKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWK
::::::::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::
CCDS41 RRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWK
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 KSERYDYFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPL
::::::.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. ..
CCDS41 KSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSE
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAP
. :::.. .. ::.:.:
CCDS41 KEDGTVSTANQNGVSSNGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGGNKKPLHADMDTNGYETDNL
400 410 420 430 440 450
>>CCDS53329.1 MIER1 gene_id:57708|Hs108|chr1 (529 aa)
initn: 936 init1: 717 opt: 1000 Z-score: 769.2 bits: 152.0 E(32554): 1.6e-36
Smith-Waterman score: 1001; 43.3% identity (68.3% similar) in 413 aa overlap (26-420:20-426)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAEASSLGRQSPRVVSCLEHSLCPGEPGLQTTAVV-SMGSGDHQFN-LAEILSQNYSVRG
.:...... : : ::.:. :..: .... .
CCDS53 MFMFNWFTDCLWTLFLSNYQPSVESSSPGGSATSDDHEFDPSADMLVHDFDDER
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 ECEEASRCPDKPKEELEKDFISQSNDMPFDELLALYGY-------EASDPISDRESEGGD
:: . . : . ... .:::. :::.:::: : .. ..: :: :
CCDS53 TLEEEEMMEGETNFSSEIEDLAREGDMPIHELLSLYGYGSTVRLPEEDEEEEEEEEEGED
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KA1 VAPNLPDMTL-----DKEQIAKDLLSGEEEEETQSSADDLTPSVTSHEASDLFPNRSGSR
: . .::. :: :. .:.::::: :: . ::.:..:.... : .
CCDS53 DEDADNDDNSGCSGENKEENIKD--SSGQEDETQSSNDDPSQSVASQDAQEIIRPRRCKY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FLADEDREPGSSASSDTEEDSLPANKCKKEIMVGPQFQADLS-NLHLNRHCEKIYENEDQ
: .. . : :. .:: .:.. ::::::: .:::.. .. .. ::.:::.::
CCDS53 FDTNSEVE----EESEEDEDYIPSEDWKKEIMVGSMFQAEIPVGICRYKENEKVYENDDQ
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LLWDPSVLPEREVEEFLYRAVKRRWHEMAGPQLPEGEAVKDSEQALYELVKCNFNVEEAL
::::: ::: .: :: : .: : . .::: .::.::::::::::::..::::
CCDS53 LLWDPEYLPEDKVIIFLKDASRRTGDEKGVEAIPEGSHIKDNEQALYELVKCNFDTEEAL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RRLRFNVKVIRDGLCAWSEEECRNFEHGFRVHGKNFHLIQANKVRTRSVGECVEYYYLWK
::::::::. :. : .:.::::::::.:....::.:::::::::::::::::: .::.::
CCDS53 RRLRFNVKAAREELSVWTEEECRNFEQGLKAYGKDFHLIQANKVRTRSVGECVAFYYMWK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 KSERYDYFAQQTRLGRRKY-VPSGTTD-ADQDLDGSDPDGPGR-PRPEQDTLTGMRTDPL
::::::.::::::.:..:: . :.:: :. :: :. . .: : : . .. ..
CCDS53 KSERYDFFAQQTRFGKKKYNLHPGVTDYMDRLLDESESAASSRAPSPPPTASNSSNSQSE
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 SVDGTAGGLDEPGVASDGLPSSEPGPCSFQQLDESPAVPLSHRPPALADPASYQPAVTAP
. :::.. .. ::.:.:
CCDS53 KEDGTVSTANQNGVSSNGPGEILNKEEVKVEGLHINGPTGGNKKPLHADMDTNGYETDNL
410 420 430 440 450 460
545 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:17:11 2016 done: Thu Nov 3 05:17:12 2016
Total Scan time: 3.620 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]