Result of FASTA (omim) for
pF1KA1150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1150, 593 aa
1>>>pF1KA1150 593 - 593 aa - 593 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0284+/-0.000358; mu= 3.0958+/- 0.022
mean_var=194.0161+/-41.607, 0's: 0 Z-trim(121.4): 16 B-trim: 2479 in 2/56
Lambda= 0.092078
statistics sampled from 37812 (37846) to 37812 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16
Scan time: 12.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065750 (OMIM: 614998,615074) transcriptional re ( 593) 3881 527.9 3.6e-149
XP_005245421 (OMIM: 614998,615074) PREDICTED: tran ( 593) 3881 527.9 3.6e-149
NP_060130 (OMIM: 614997) transcriptional repressor ( 633) 826 122.1 5.6e-27
XP_011526407 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 634) 810 120.0 2.5e-26
NP_001287875 (OMIM: 614997) transcriptional repres ( 634) 810 120.0 2.5e-26
XP_016882395 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 609) 808 119.7 2.9e-26
XP_016882400 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 542) 416 67.6 1.2e-10
XP_016882398 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 594) 416 67.6 1.3e-10
XP_016882397 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 594) 416 67.6 1.3e-10
XP_016882392 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 685) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882399 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 685) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882394 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 685) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882393 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 685) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882391 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 704) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882396 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 704) 416 67.7 1.5e-10
XP_016882390 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcripti ( 660) 414 67.4 1.7e-10
>>NP_065750 (OMIM: 614998,615074) transcriptional repres (593 aa)
initn: 3881 init1: 3881 opt: 3881 Z-score: 2799.0 bits: 527.9 E(85289): 3.6e-149
Smith-Waterman score: 3881; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PSPDIIVLSDNEASSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PSPDIIVLSDNEASSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VLLKKLRQSQLQKENVVQKTPVVQNAASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VLLKKLRQSQLQKENVVQKTPVVQNAASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGLVRTTTPNMNPAINYQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGLVRTTTPNMNPAINYQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSCASLLRVEPFVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSCASLLRVEPFVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QQAALSPTTAPAVSSVSKQETIMRHHTLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QQAALSPTTAPAVSSVSKQETIMRHHTLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA1 VPGGLLGMPGVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VPGGLLGMPGVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
550 560 570 580 590
>>XP_005245421 (OMIM: 614998,615074) PREDICTED: transcri (593 aa)
initn: 3881 init1: 3881 opt: 3881 Z-score: 2799.0 bits: 527.9 E(85289): 3.6e-149
Smith-Waterman score: 3881; 100.0% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PSPDIIVLSDNEASSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSPDIIVLSDNEASSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VLLKKLRQSQLQKENVVQKTPVVQNAASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLLKKLRQSQLQKENVVQKTPVVQNAASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGLVRTTTPNMNPAINYQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGLVRTTTPNMNPAINYQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSCASLLRVEPFVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSCASLLRVEPFVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QQAALSPTTAPAVSSVSKQETIMRHHTLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QQAALSPTTAPAVSSVSKQETIMRHHTLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA1 VPGGLLGMPGVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VPGGLLGMPGVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
550 560 570 580 590
>>NP_060130 (OMIM: 614997) transcriptional repressor p66 (633 aa)
initn: 834 init1: 393 opt: 826 Z-score: 605.3 bits: 122.1 E(85289): 5.6e-27
Smith-Waterman score: 1237; 41.1% identity (61.8% similar) in 655 aa overlap (4-581:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
:::.: : ::.:. .::: .:..::: .:: .:: : .
NP_060 MTEEACRTRSQKRALERDPTEDDVESKKIKMERG-------LLA----SDL-NTDGD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
.. : . :.: .: :: . : :. ..: :::: . .:. . :
NP_060 MRV-TPEPGAG------PTQGLLRATEATAMAMGRGEGLVGDGPVDMRTSHSDMKSERRP
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KA1 PSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEAR
::::.::::::: :::: .. :: .. : . .. :::...::::..:::::::.
NP_060 PSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVALKETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAK
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KA1 LVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------------PVV---QNA---------------ASI
:::::::::::.::: ..:: :.: :: .:.
NP_060 LVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPN
. : .. :::. ::: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:.
NP_060 IPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGT
.:.:::: . ::.:... :: . .: :: . . :..:: .. : .
NP_060 -VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLLVNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 VNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEF
: : . :: :. ::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::.::
NP_060 VASVVTSAESP------ASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEF
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IYMVGLEEVVQSVIDSQGK-SCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTS
::.::::::::.....::. : :..: ::..::::.:::: .:..::.: :.::.:::.
NP_060 IYLVGLEEVVQNLLETQGRMSAATVLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMTT
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KA1 NQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQ------AALSPTTAP--AVSSVSK-
:::::::.:::.::: :::::::::::::::: :: : ::.:: ....: :
NP_060 NQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQGTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIKP
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KA1 -QETIMRHHTLRQAP-----QPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM----
.. .: :. : .:.:.:: :. :..: .:. .:.:. .. ..
NP_060 RRKLAFRSGEARDWSNGAVLQASSQLSRGSATTPRGVLHTFSPSPKLQNSASATALVSRT
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580
pF1KA1 ----------------------P---GVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPR
: : ..:... ... ::. : .::::::::::::
NP_060 GRHSERTVSAGKGSATSNWKKTPLSTGGTLAFVSPSLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPPR
570 580 590 600 610 620
590
pF1KA1 SISQSISGQK
NP_060 SIPQSATWK
630
>>XP_011526407 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcriptional (634 aa)
initn: 1129 init1: 381 opt: 810 Z-score: 593.8 bits: 120.0 E(85289): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 1225; 41.0% identity (61.7% similar) in 656 aa overlap (4-581:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
:::.: : ::.:. .::: .:..::: .:: .:: : .
XP_011 MTEEACRTRSQKRALERDPTEDDVESKKIKMERG-------LLA----SDL-NTDGD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
.. : . :.: .: :: . : :. ..: :::: . .:. . :
XP_011 MRV-TPEPGAG------PTQGLLRATEATAMAMGRGEGLVGDGPVDMRTSHSDMKSERRP
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KA1 PSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEAR
::::.::::::: :::: .. :: .. : . .. :::...::::..:::::::.
XP_011 PSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVALKETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAK
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KA1 LVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------------PVV---QNA---------------ASI
:::::::::::.::: ..:: :.: :: .:.
XP_011 LVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPN
. : .. :::. ::: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:.
XP_011 IPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGT
.:.:::: . ::.:... :: . .: :: . . :..:: .. : .
XP_011 -VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLLVNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 VNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEF
: : . :: :. ::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::.::
XP_011 VASVVTSAESP------ASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEF
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IYMVGLEEVVQSVIDSQ-GK-SCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMT
::.::::::::.....: :. : :..: ::..::::.:::: .:..::.: :.::.:::
XP_011 IYLVGLEEVVQNLLETQAGRMSAATVLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMT
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KA1 SNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQ------AALSPTTAP--AVSSVSK
.:::::::.:::.::: :::::::::::::::: :: : ::.:: ....: :
XP_011 TNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQGTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIK
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KA1 --QETIMRHHTLRQAP-----QPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM---
.. .: :. : .:.:.:: :. :..: .:. .:.:. .. ..
XP_011 PRRKLAFRSGEARDWSNGAVLQASSQLSRGSATTPRGVLHTFSPSPKLQNSASATALVSR
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580
pF1KA1 -----------------------P---GVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPP
: : ..:... ... ::. : .::::::::::::
XP_011 TGRHSERTVSAGKGSATSNWKKTPLSTGGTLAFVSPSLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPP
570 580 590 600 610 620
590
pF1KA1 RSISQSISGQK
XP_011 RSIPQSATWK
630
>>NP_001287875 (OMIM: 614997) transcriptional repressor (634 aa)
initn: 1129 init1: 381 opt: 810 Z-score: 593.8 bits: 120.0 E(85289): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 1225; 41.0% identity (61.7% similar) in 656 aa overlap (4-581:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
:::.: : ::.:. .::: .:..::: .:: .:: : .
NP_001 MTEEACRTRSQKRALERDPTEDDVESKKIKMERG-------LLA----SDL-NTDGD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
.. : . :.: .: :: . : :. ..: :::: . .:. . :
NP_001 MRV-TPEPGAG------PTQGLLRATEATAMAMGRGEGLVGDGPVDMRTSHSDMKSERRP
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KA1 PSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEAR
::::.::::::: :::: .. :: .. : . .. :::...::::..:::::::.
NP_001 PSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVALKETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAK
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KA1 LVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------------PVV---QNA---------------ASI
:::::::::::.::: ..:: :.: :: .:.
NP_001 LVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPN
. : .. :::. ::: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:.
NP_001 IPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGT
.:.:::: . ::.:... :: . .: :: . . :..:: .. : .
NP_001 -VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLLVNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 VNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEF
: : . :: :. ::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::.::
NP_001 VASVVTSAESP------ASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEF
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 IYMVGLEEVVQSVIDSQ-GK-SCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMT
::.::::::::.....: :. : :..: ::..::::.:::: .:..::.: :.::.:::
NP_001 IYLVGLEEVVQNLLETQAGRMSAATVLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMT
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KA1 SNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQ------AALSPTTAP--AVSSVSK
.:::::::.:::.::: :::::::::::::::: :: : ::.:: ....: :
NP_001 TNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQGTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIK
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540
pF1KA1 --QETIMRHHTLRQAP-----QPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM---
.. .: :. : .:.:.:: :. :..: .:. .:.:. .. ..
NP_001 PRRKLAFRSGEARDWSNGAVLQASSQLSRGSATTPRGVLHTFSPSPKLQNSASATALVSR
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580
pF1KA1 -----------------------P---GVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPP
: : ..:... ... ::. : .::::::::::::
NP_001 TGRHSERTVSAGKGSATSNWKKTPLSTGGTLAFVSPSLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPP
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590
pF1KA1 RSISQSISGQK
NP_001 RSIPQSATWK
630
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
:::.: : ::.:. .::: .:..: ::: .:: .:: : .
XP_016 MTEEACRTRSQKRALERDPTEDDVESKKIK------MER-GLLA----SDL-NTDGD
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pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLT
.. : . :.: .: :: . : :. ..: :::: . .:. . :
XP_016 MRV-TPEPGAG------PTQGLLRATEATAMAMGRGEGLVGDGPVDMRTSHSDMKSERRP
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pF1KA1 PSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEAR
::::.::::::: :::: .. :: .. : . .. :::...::::..:::::::.
XP_016 PSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVALKETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAK
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pF1KA1 LVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------------PVV---QNA---------------ASI
:::::::::::.::: ..:: :.: :: .:.
XP_016 LVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 VQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPN
. : .. :::. ::: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:.
XP_016 IPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGT
.:.:::: . ::.:... :: . .: :: . . :..:: .. : .
XP_016 -VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLLVNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTS
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pF1KA1 VNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEF
: : . :: :. ::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::.::
XP_016 VASVVTSAESP------ASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEF
340 350 360 370 380
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pF1KA1 IYMVGLEEVVQSVIDSQ-GK-SCASLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMT
::.::::::::.....: :. : :..: ::..::::.:::: .:..::.: :.::.:::
XP_016 IYLVGLEEVVQNLLETQAGRMSAATVLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMT
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 SNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQAALSPTTAPAVSSVSKQETIMRHH
.:::::::.:::.::: :::::::::::::::: ::. :::: ... . : :
XP_016 TNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQG-----TAPA--QAKAEPTAAPHP
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pF1KA1 TLRQAPQPQSSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM------------------
.:.:: .:.:.:: :. :..: .:. .:.:. .. ..
XP_016 VLKQA---SSQLSRGSATTPRGVLHTFSPSPKLQNSASATALVSRTGRHSERTVSAGKGS
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pF1KA1 --------P---GVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
: : ..:... ... ::. : .:::::::::::::::: :: .
XP_016 ATSNWKKTPLSTGGTLAFVSPSLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPPRSIPQSATWK
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pF1KA1 SPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARLVLLKKLRQSQLQKE
.::::..:::::::.:::::::::::.:::
XP_016 MIKQLKEELRLEEAKLVLLKKLRQSQIQKE
10 20 30
200 210 220
pF1KA1 NVVQKT------------PVV---QNA---------------ASIVQPSPAHVGQQGLSK
..:: :.: :: .:.. : .. :::. ::
XP_016 ATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSVIPPPLVRGGQQASSK
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pF1KA1 LPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGL
: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:. .:.:::: . ::
XP_016 LGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS-VQIQGQR-IIQQGL
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pF1KA1 VRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMT
.:... :: . .: :: . . :..:: .. : .: : . ::
XP_016 IRVANVPNTSLLVNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTSVASVVTSAESP----
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pF1KA1 DAANSQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVID
:. ::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::.::::.::::::::....
XP_016 --ASRQAAAKLALRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEFIYLVGLEEVVQNLLE
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410
pF1KA1 SQGKSC-----------------------------------------------------A
.:: : :
XP_016 TQGPHCGRDFEPCWRHLLTPPRAPSLAPCLVLAPLTLAMGWTCARRCAVVTRASGRMSAA
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pF1KA1 SLLRVEPFVCAQCRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQ
..: ::..::::.:::: .:..::.: :.::.:::.:::::::.:::.::: :::::::
XP_016 TVLSREPYMCAQCKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMTTNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQ
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pF1KA1 QEQEIEQRLQQQ------AALSPTTAP--AVSSVSK--QETIMRHHTLRQAP-----QPQ
::::::::: :: : ::.:: ....: : .. .: :. : .
XP_016 QEQEIEQRLLQQGTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIKPRRKLAFRSGEARDWSNGAVLQAS
380 390 400 410 420 430
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pF1KA1 SSLQRGIPTSARSMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM--------------------------P
:.:.:: :. :..: .:. .:.:. .. .. :
XP_016 SQLSRGSATTPRGVLHTFSPSPKLQNSASATALVSRTGRHSERTVSAGKGSATSNWKKTP
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 ---GVNIAYLNTGIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
: ..:... ... ::. : .::::::::::::
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pF1KA1 DNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLTPSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERL
: ::::.::::::: :::: .. :
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150 160 170 180 190 200
pF1KA1 KAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARLVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------
: .. : . .. :::...::::..:::::::.:::::::::::.::: ..::
XP_016 KETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAKLVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGS
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 ------PVV---QNA---------------ASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEP
:.: :: .:.. : .. :::. ::: . ..: : :
XP_016 TVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSVIPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMP
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.: : ::. ..: : .:.. :. .:. .:.:::: . ::.:... :: .
XP_016 PLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS-VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLL
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 INYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPGTVNRVSSPLPSPSAMTDAANSQAAAKLA
.: :: . . :..:: .. : .: : . :: :. :::::::
XP_016 VNI-PQPTPASLKGTTATSA-----QANSTPTSVASVVTSAESP------ASRQAAAKLA
220 230 240 250 260
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pF1KA1 LRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSC------
:::::::::::::::::::: ..:::::::.::::.::::::::.....:: :
XP_016 LRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEFIYLVGLEEVVQNLLETQGPHCGRDFEP
270 280 290 300 310 320
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pF1KA1 -----------------------------------------------ASLLRVEPFVCAQ
:..: ::..:::
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pF1KA1 CRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQ
:.:::: .:..::.: :.::.:::.:::::::.:::.::: :::::::::::::::: ::
XP_016 CKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMTTNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQ
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pF1KA1 ------AALSPTTAP--AVSSVSK--QETIMRHHTLRQAP-----QPQSSLQRGIPTSAR
: ::.:: ....: : .. .: :. : .:.:.:: :. :
XP_016 GTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIKPRRKLAFRSGEARDWSNGAVLQASSQLSRGSATTPR
450 460 470 480 490 500
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pF1KA1 SMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM--------------------------P---GVNIAYLNT
..: .:. .:.:. .. .. : : ..:...
XP_016 GVLHTFSPSPKLQNSASATALVSRTGRHSERTVSAGKGSATSNWKKTPLSTGGTLAFVSP
510 520 530 540 550 560
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pF1KA1 GIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
... ::. : .::::::::::::
XP_016 SLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPPRSIPQSATWK
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>>XP_016882397 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcriptional (594 aa)
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Smith-Waterman score: 1054; 39.6% identity (58.5% similar) in 593 aa overlap (118-581:5-583)
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pF1KA1 DNRTAGRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRLTPSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERL
: ::::.::::::: :::: .. :
XP_016 MKSERRPPSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVAL
10 20 30
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pF1KA1 KAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEARLVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------
: .. : . .. :::...::::..:::::::.:::::::::::.::: ..::
XP_016 KETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEAKLVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGS
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 ------PVV---QNA---------------ASIVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEP
:.: :: .:.. : .. :::. ::: . ..: : :
XP_016 TVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGSVIPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMP
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 QNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAPNPAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPA
.: : ::. ..: : .:.. :. .:. .:.:::: . ::.:... :: .
XP_016 PLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVPS-VQIQGQR-IIQQGLIRVANVPNTSLL
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.: :: . . :..:: .. : .: : . :: :. :::::::
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220 230 240 250 260
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pF1KA1 LRKQLEKTLLEIPPPKPPAPLLHFLPSAANSEFIYMVGLEEVVQSVIDSQGKSC------
:::::::::::::::::::: ..:::::::.::::.::::::::.....:: :
XP_016 LRKQLEKTLLEIPPPKPPAPEMNFLPSAANNEFIYLVGLEEVVQNLLETQGPHCGRDFEP
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pF1KA1 -----------------------------------------------ASLLRVEPFVCAQ
:..: ::..:::
XP_016 CWRHLLTPPRAPSLAPCLVLAPLTLAMGWTCARRCAVVTRASGRMSAATVLSREPYMCAQ
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pF1KA1 CRTDFTPHWKQEKNGKILCEQCMTSNQKKALKAEHTNRLKNAFVKALQQEQEIEQRLQQQ
:.:::: .:..::.: :.::.:::.:::::::.:::.::: :::::::::::::::: ::
XP_016 CKTDFTCRWREEKSGAIMCENCMTTNQKKALKVEHTSRLKAAFVKALQQEQEIEQRLLQQ
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pF1KA1 ------AALSPTTAP--AVSSVSK--QETIMRHHTLRQAP-----QPQSSLQRGIPTSAR
: ::.:: ....: : .. .: :. : .:.:.:: :. :
XP_016 GTAPAQAKAEPTAAPHPVLKQVIKPRRKLAFRSGEARDWSNGAVLQASSQLSRGSATTPR
450 460 470 480 490 500
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pF1KA1 SMLSNFAQAPQLSVPGGLLGM--------------------------P---GVNIAYLNT
..: .:. .:.:. .. .. : : ..:...
XP_016 GVLHTFSPSPKLQNSASATALVSRTGRHSERTVSAGKGSATSNWKKTPLSTGGTLAFVSP
510 520 530 540 550 560
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pF1KA1 GIGGHKGPSLADRQREYLLDMIPPRSISQSISGQK
... ::. : .::::::::::::
XP_016 SLAVHKSSSAVDRQREYLLDMIPPRSIPQSATWK
570 580 590
>>XP_016882392 (OMIM: 614997) PREDICTED: transcriptional (685 aa)
initn: 1143 init1: 381 opt: 416 Z-score: 310.4 bits: 67.7 E(85289): 1.5e-10
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pF1KA1 MDRMTEDALRLNLLKRSLDPADERDDVLAKRLKMEGHEAMERLKMLALLKRKDLANLEVP
::.. ::: .:..::: .:: : ....:
XP_016 MTEEACRTRSQKRALERDPTE--DDVESKKIKMERG-------LLASDLNTD-GDMRV-
10 20 30 40
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pF1KA1 HELPTKQDGSGVKGYEEKLNGNLRPHGDNRTA-GRPGKENINDEPVDMSARRSEPERGRL
: . :.: .: :: . : :: :. ..: :::: . .:. . :
XP_016 ----TPEPGAG------PTQGLLRATEATAMAMGR-GEGLVGDGPVDMRTSHSDMKSERR
50 60 70 80 90
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pF1KA1 TPSPDIIVLSDNEA-SSPRSSSRMEERLKAANLEMFKGKGIEERQQLIKQLRDELRLEEA
::::.::::::: :::: .. :: .. : . .. :::...::::..:::::::
XP_016 PPSPDVIVLSDNEQPSSPRVNGLTTVALKETSTEALMKSSPEERERMIKQLKEELRLEEA
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KA1 RLVLLKKLRQSQLQKENVVQKT------------PVV---QNA---------------AS
.:::::::::::.::: ..:: :.: :: .:
XP_016 KLVLLKKLRQSQIQKEATAQKPTGSVGSTVTTPPPLVRGTQNIPAGKPSLQTSSARMPGS
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 IVQPSPAHVGQQGLSKLPSRPGAQGVEPQNLRTLQGHSVIRSATNTTLPHMLMSQRVIAP
.. : .. :::. ::: . ..: : : .: : ::. ..: : .:.. :. .:
XP_016 VIPPPLVRGGQQASSKLGPQASSQVVMPPLVRGAQQIHSIRQHSSTGPPPLLLAPRASVP
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 NPAQLQGQRGPPKPGLVRTTT-PNMNPAINYQPQSSSSVPCQRTTSSAIYMNLASHIQPG
. .:.:::: . ::.:... :: . .: :: . . :..:: .. :
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