Result of FASTA (omim) for
pF1KA1145
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1145, 446 aa
1>>>pF1KA1145 446 - 446 aa - 446 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7887+/-0.000461; mu= 7.3593+/- 0.029
mean_var=180.0829+/-36.040, 0's: 0 Z-trim(114.3): 51 B-trim: 46 in 1/53
Lambda= 0.095574
statistics sampled from 24018 (24069) to 24018 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 8.930
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016861429 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 463) 1239 183.5 9.8e-46
XP_016861430 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 463) 1239 183.5 9.8e-46
XP_011510885 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 463) 1239 183.5 9.8e-46
XP_011510886 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 463) 1239 183.5 9.8e-46
XP_006713616 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 470) 1239 183.6 1e-45
XP_011510884 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 474) 1239 183.6 1e-45
XP_006713615 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 480) 1239 183.6 1e-45
XP_016861427 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_016861428 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_011510882 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_011510883 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_016861424 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_016861425 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_016861426 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_006713613 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_016861423 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
NP_001121696 (OMIM: 616242) transmembrane and coil ( 539) 1239 183.6 1.1e-45
XP_006713607 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_016861421 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_016861422 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_011510881 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_011510878 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_011510875 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_011510874 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_016861420 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_006713606 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
NP_001017395 (OMIM: 616242) transmembrane and coil ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
XP_006713605 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembra ( 653) 1239 183.7 1.3e-45
NP_001192130 (OMIM: 300092) testis-specific protei ( 410) 275 50.6 9.3e-06
NP_001577 (OMIM: 300092) testis-specific protein T ( 410) 275 50.6 9.3e-06
XP_011529420 (OMIM: 300092) PREDICTED: testis-spec ( 413) 275 50.6 9.3e-06
XP_011529419 (OMIM: 300092) PREDICTED: testis-spec ( 413) 275 50.6 9.3e-06
XP_011529418 (OMIM: 300092) PREDICTED: testis-spec ( 472) 275 50.6 1e-05
>>XP_016861429 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (463 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 942.0 bits: 183.5 E(85289): 9.8e-46
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:22-463)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKILKVTEQIKI
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XP_016 MKIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIE
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XP_016 AQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA1 QNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL---TPPVFVF
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XP_016 QNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATHSAAGAVV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKYGSDDECSSG
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XP_016 SKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGSEEDCSSA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 TSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQ
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XP_016 TSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSR
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XP_016 YQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERAR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFMTVILVCVST
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XP_016 DIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAVLLVFVST
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KA1 IAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_016 VANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
420 430 440 450 460
>>XP_016861430 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (463 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 942.0 bits: 183.5 E(85289): 9.8e-46
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:22-463)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKILKVTEQIKI
.: ... : :: : ...: . :.:::::.::::::
XP_016 MKIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIE
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XP_016 AQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA1 QNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL---TPPVFVF
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XP_016 QNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATHSAAGAVV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKYGSDDECSSG
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XP_016 SKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGSEEDCSSA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 TSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQ
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XP_016 TSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSR
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XP_016 YQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERAR
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350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFMTVILVCVST
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XP_016 DIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAVLLVFVST
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KA1 IAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_016 VANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
420 430 440 450 460
>>XP_011510885 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (463 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 942.0 bits: 183.5 E(85289): 9.8e-46
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:22-463)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKILKVTEQIKI
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XP_011 MKIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 EQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIE
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XP_011 AQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA1 QNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL---TPPVFVF
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XP_011 QNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATHSAAGAVV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKYGSDDECSSG
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XP_011 SKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGSEEDCSSA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 TSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQ
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XP_011 TSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSR
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XP_011 YQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERAR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFMTVILVCVST
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XP_011 DIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAVLLVFVST
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KA1 IAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_011 VANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
420 430 440 450 460
>>XP_011510886 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (463 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 942.0 bits: 183.5 E(85289): 9.8e-46
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:22-463)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKILKVTEQIKI
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XP_011 MKIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKI
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 EQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYHRKLREIE
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XP_011 AQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVE
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120 130 140 150 160
pF1KA1 QNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL---TPPVFVF
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XP_011 QNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATHSAAGAVV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 NKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKYGSDDECSSG
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XP_011 SKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGSEEDCSSA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 TSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLAEDIEALKVQ
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XP_011 TSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 FKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKVAYQAYERSR
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XP_011 YQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERAR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFMTVILVCVST
:::::::.:::::::.::.::.::..: . ...:. :::. ::..:: :.:.:: :::
XP_011 DIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAVLLVFVST
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KA1 IAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
.:. : :.::.: . ..:.: :...:.. :.:: .. .::.. ::
XP_011 VANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
420 430 440 450 460
>>XP_006713616 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (470 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 942.0 bits: 183.6 E(85289): 1e-45
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:29-470)
10 20 30 40
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKILK
.: ... : :: : ...: . :.:::::
XP_006 MEPSLSSETIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 VTEQIKIEQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQYH
.:::::: ::.:: ::::::::.:.::::::.::::::::::::::..: :::::::.::
XP_006 LTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYH
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pF1KA1 RKLREIEQNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL---
:::::.:::: :. ::. ..:.:..:::. .: . . ..: :.:. . :
XP_006 RKLREVEQNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATH
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 TPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKYGS
. : .: ::.:.:::::::::::: .::.:::: . . ...: : ... ..:::::
XP_006 SAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KA1 DDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLAED
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XP_006 EEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEES
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 IEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKVAY
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XP_006 FETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAY
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340 350 360 370 380 390
pF1KA1 QAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFMTV
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XP_006 QSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVMAV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KA1 ILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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10 20 30 40
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pF1KA1 EDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKV
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pF1KA1 AYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFM
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pF1KA1 TVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_011 AVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
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10 20 30 40
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pF1KA1 YHRKLREIEQNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL-
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170 180 190 200 210 220
pF1KA1 --TPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKY
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XP_006 THSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKY
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230 240 250 260 270
pF1KA1 GSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLA
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XP_006 GSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLE
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280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKV
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XP_006 ESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKI
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340 350 360 370 380 390
pF1KA1 AYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFM
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XP_006 AYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVM
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400 410 420 430 440
pF1KA1 TVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_006 AVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
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Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:98-539)
10 20 30 40
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKI
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XP_016 CLPGEEGTAERIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKI
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XP_016 LKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEH
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pF1KA1 YHRKLREIEQNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL-
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XP_016 YHRKLREVEQNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQA
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pF1KA1 --TPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKY
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XP_016 THSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKY
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pF1KA1 GSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLA
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XP_016 GSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLE
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pF1KA1 EDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKV
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XP_016 ESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKI
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pF1KA1 AYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFM
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XP_016 AYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVM
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pF1KA1 TVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_016 AVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
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10 20 30 40
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKI
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XP_016 CLPGEEGTAERIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKI
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XP_016 LKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEH
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XP_016 YHRKLREVEQNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQA
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pF1KA1 --TPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKY
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XP_016 THSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKY
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pF1KA1 GSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLA
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XP_016 GSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLE
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKV
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XP_016 ESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKI
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 AYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFM
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XP_016 AYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVM
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400 410 420 430 440
pF1KA1 TVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_016 AVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
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>>XP_011510882 (OMIM: 616242) PREDICTED: transmembrane a (539 aa)
initn: 1234 init1: 674 opt: 1239 Z-score: 941.2 bits: 183.6 E(85289): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1398; 53.1% identity (80.5% similar) in 446 aa overlap (15-446:98-539)
10 20 30 40
pF1KA1 MNTLSLPLNIRRGGSDTNLNFDVPDGILDFHKVKLTADSLKQKI
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XP_011 CLPGEEGTAERIERLEVSSLAQTSSAVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKI
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 LKVTEQIKIEQTSRDGNVAEYLKLVNNADKQQAGRIKQVFEKKNQKSAHSIAQLQKKLEQ
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XP_011 LKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLANSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEH
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pF1KA1 YHRKLREIEQNGASRSSKDISKDHLKDIHRSLKDAHVK-SRTAPHCMESSKSGMPGVSL-
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XP_011 YHRKLREVEQNGIPRQPKDV----FRDMHQGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQA
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 --TPPVFVFNKSREFANLIRNKFGSADNIAHLKNSLEEFRPEASARAYGGSATIVNKPKY
. : .: ::.:.:::::::::::: .::.:::: . . ...: : ... ..:::
XP_011 THSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNIPNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKY
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270
pF1KA1 GSDDECSSGTSGSADSNGNQSFGAGGAS-----TLDSQGK-LAVILEELREIKDTQAQLA
::...:::.::::. .:.. . : ::: ::: :.. . ..:.:..::..:::.:
XP_011 GSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASSSKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLE
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 EDIEALKVQFKREYGFISQTLQEERYRYERLEDQLHDLTDLHQHETANLKQELASIEEKV
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XP_011 ESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCERLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKI
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 AYQAYERSRDIQEALESCQTRISKLELHQQEQQALQTD---TVNAKVLLGRCINVILAFM
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XP_011 AYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQQQQQVVQLEGLENATARNLLGKLINILLAVM
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440
pF1KA1 TVILVCVSTIAKFVSPMMKSRCHILGTFFAVTLLAIFCKNWDHILCAIERMII-PR
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XP_011 AVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFSTLFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR
490 500 510 520 530
446 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:37:23 2016 done: Wed Nov 2 20:37:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]