Result of FASTA (omim) for
pF1KA1144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1144, 477 aa
1>>>pF1KA1144 477 - 477 aa - 477 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4173+/-0.000425; mu= 16.7074+/- 0.026
mean_var=79.6517+/-15.915, 0's: 0 Z-trim(110.9): 268 B-trim: 205 in 1/52
Lambda= 0.143707
statistics sampled from 18923 (19312) to 18923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 7.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated c ( 477) 3168 667.2 2.8e-191
XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated c ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gate ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium v ( 491) 1703 363.5 7.7e-100
NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated c ( 519) 1002 218.1 4.5e-56
NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage- ( 545) 989 215.5 3e-55
XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527106 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527107 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527108 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527103 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
NP_002228 (OMIM: 603788) potassium voltage-gated c ( 513) 960 209.4 1.9e-53
XP_011527104 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium v ( 513) 960 209.4 1.9e-53
NP_001309728 (OMIM: 602905) potassium voltage-gate ( 526) 944 206.1 1.9e-52
NP_002242 (OMIM: 602905) potassium voltage-gated c ( 526) 944 206.1 1.9e-52
XP_016883335 (OMIM: 602905) PREDICTED: potassium v ( 527) 944 206.1 1.9e-52
NP_004761 (OMIM: 607738) potassium voltage-gated c ( 911) 864 189.7 2.9e-47
XP_011527101 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 861 189.1 4.2e-47
NP_004966 (OMIM: 600397,616056) potassium voltage- ( 858) 861 189.1 4.2e-47
XP_006723847 (OMIM: 600397,616056) PREDICTED: pota ( 858) 861 189.1 4.2e-47
NP_579875 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 436) 812 178.7 2.9e-44
NP_002227 (OMIM: 603787) potassium voltage-gated c ( 494) 756 167.1 9.8e-41
XP_016869470 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 682 151.9 5.1e-36
XP_016869471 (OMIM: 607738) PREDICTED: potassium v ( 666) 682 151.9 5.1e-36
XP_016856702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
XP_011539702 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
XP_011539700 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
XP_011539698 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
NP_004965 (OMIM: 176262,616366) potassium voltage- ( 499) 662 147.6 7.3e-35
XP_011539701 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
XP_011539699 (OMIM: 176262,616366) PREDICTED: pota ( 499) 662 147.6 7.3e-35
NP_758847 (OMIM: 606767) potassium voltage-gated c ( 425) 645 144.1 7.4e-34
NP_005540 (OMIM: 602420) potassium voltage-gated c ( 511) 644 143.9 9.9e-34
NP_114092 (OMIM: 176268) potassium voltage-gated c ( 456) 633 141.6 4.4e-33
XP_011524222 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 625 140.0 1.4e-32
NP_036415 (OMIM: 605696) potassium voltage-gated c ( 466) 625 140.0 1.4e-32
XP_016881194 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 625 140.0 1.4e-32
XP_011524220 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 466) 625 140.0 1.4e-32
XP_016881193 (OMIM: 605696) PREDICTED: potassium v ( 509) 625 140.0 1.5e-32
NP_000208 (OMIM: 160120,176260) potassium voltage- ( 495) 616 138.1 5.4e-32
NP_002224 (OMIM: 176266) potassium voltage-gated c ( 653) 605 135.9 3.2e-31
NP_002223 (OMIM: 176263) potassium voltage-gated c ( 575) 594 133.6 1.4e-30
XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 568 128.2 5.4e-29
XP_006710693 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 636) 568 128.2 6.5e-29
NP_751948 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 636) 568 128.2 6.5e-29
NP_004971 (OMIM: 605411,607346,616399) potassium v ( 655) 568 128.2 6.6e-29
XP_005270908 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 655) 568 128.2 6.6e-29
>>NP_065748 (OMIM: 602906) potassium voltage-gated chann (477 aa)
initn: 3168 init1: 3168 opt: 3168 Z-score: 3555.1 bits: 667.2 E(85289): 2.8e-191
Smith-Waterman score: 3168; 100.0% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA1 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
430 440 450 460 470
>>XP_011531127 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium volta (491 aa)
initn: 1723 init1: 798 opt: 1703 Z-score: 1913.4 bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
.: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
XP_011 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
:::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
XP_011 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
: :. :: : ... ::..: . :: :::.: : .. ::: .:..:...:. ..:
XP_011 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
:.: . .....: :. ::..::..::..:. .:: :.. . :: .: :: :::::
XP_011 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
::..:.:.:: ::.:: ::.::..::.::: ::.:. : . . :.:.:.:.:::
XP_011 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
:::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
XP_011 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
XP_011 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
.::... . : : . .:.: :.:: ::........::...
XP_011 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
420 430 440 450 460 470
XP_011 DNEDICNTTSLENCTAK
480 490
>>NP_002243 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated chann (491 aa)
initn: 1723 init1: 798 opt: 1703 Z-score: 1913.4 bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
.: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
NP_002 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
:::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
NP_002 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
: :. :: : ... ::..: . :: :::.: : .. ::: .:..:...:. ..:
NP_002 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
:.: . .....: :. ::..::..::..:. .:: :.. . :: .: :: :::::
NP_002 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
::..:.:.:: ::.:: ::.::..::.::: ::.:. : . . :.:.:.:.:::
NP_002 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
:::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
NP_002 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
NP_002 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
.::... . : : . .:.: :.:: ::........::...
NP_002 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
420 430 440 450 460 470
NP_002 DNEDICNTTSLENCTAK
480 490
>>NP_001269357 (OMIM: 603888) potassium voltage-gated ch (491 aa)
initn: 1723 init1: 798 opt: 1703 Z-score: 1913.4 bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
.: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
NP_001 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
:::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
NP_001 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
: :. :: : ... ::..: . :: :::.: : .. ::: .:..:...:. ..:
NP_001 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
:.: . .....: :. ::..::..::..:. .:: :.. . :: .: :: :::::
NP_001 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
::..:.:.:: ::.:: ::.::..::.::: ::.:. : . . :.:.:.:.:::
NP_001 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
:::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
NP_001 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
NP_001 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
.::... . : : . .:.: :.:: ::........::...
NP_001 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
420 430 440 450 460 470
NP_001 DNEDICNTTSLENCTAK
480 490
>>XP_016859548 (OMIM: 603888) PREDICTED: potassium volta (491 aa)
initn: 1723 init1: 798 opt: 1703 Z-score: 1913.4 bits: 363.5 E(85289): 7.7e-100
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
.: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
XP_016 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
:::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
XP_016 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
: :. :: : ... ::..: . :: :::.: : .. ::: .:..:...:. ..:
XP_016 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
:.: . .....: :. ::..::..::..:. .:: :.. . :: .: :: :::::
XP_016 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
::..:.:.:: ::.:: ::.::..::.::: ::.:. : . . :.:.:.:.:::
XP_016 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
:::::::::::::.:::::::::..::.:::::::.::::::::::. :..::... . :
XP_016 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
XP_016 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
.::... . : : . .:.: :.:: ::........::...
XP_016 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
420 430 440 450 460 470
XP_016 DNEDICNTTSLENCTAK
480 490
>>NP_758857 (OMIM: 607603) potassium voltage-gated chann (519 aa)
initn: 862 init1: 358 opt: 1002 Z-score: 1127.6 bits: 218.1 E(85289): 4.5e-56
Smith-Waterman score: 1003; 38.6% identity (69.4% similar) in 438 aa overlap (8-428:51-476)
10 20 30
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR
:.: .... :: ::::: . : :: :
NP_758 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC
:: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.: : .. : .::: .. :.:
NP_758 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND
..::..:. ::::.: .. :: . ::.: .: . .:.. . : .
NP_758 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS
.:.. : .. .:... .:: .. ..::. :::: : . ...:....::.. ..
NP_758 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV
::. .. . ::: . .:::..:. ::. : : .::.. ::.::...: :.:..:.
NP_758 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KA1 VNLVVESTPT----------LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSY
:. : : : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :..
NP_758 VS---EEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCT
320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 KEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGT
.: :::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. : ..::: .::: .:::::::::.:: .
NP_758 REFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRS
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 TAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVP
. :...: . ::.:::....: : ::. ::: : ..:.::.. .:
NP_758 VPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECE
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KA1 SVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
NP_758 LLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
490 500 510
>>NP_598004 (OMIM: 607604,610356) potassium voltage-gate (545 aa)
initn: 1008 init1: 301 opt: 989 Z-score: 1112.8 bits: 215.5 E(85289): 3e-55
Smith-Waterman score: 989; 39.2% identity (67.8% similar) in 416 aa overlap (19-424:99-507)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
. .:::: . .: : ::.::::::
NP_598 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
:: : :::::.. :..:::.: .: : .:: .: : :. :: : .:. ::
NP_598 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
:. . :: .. :. : .:. : . .. .. .: .. : .: : :
NP_598 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYG-PQ--
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR
::.:: ...: :: ...... : :. :.... ::.. ..: ..::. : : :
NP_598 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E
.: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :... . .
NP_598 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330
pF1KA1 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG
:....:.:.:::: ::::::::::::::::::..: ::. :..:: :::....:
NP_598 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG
: ::...:..:.. . ...::: ::::.::..::::::. : : :.. : :: :
NP_598 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
:.. .::....:::: .: . : :
NP_598 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP
490 500 510 520 530 540
>>XP_011527105 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta (513 aa)
initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1080.6 bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
: :::::.: : :: .:: ::::.:
XP_011 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
: . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_011 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
:: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .:
XP_011 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
. :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. ..
XP_011 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
::: ..::..:.. :. ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. ..
XP_011 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
. : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::.
XP_011 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
: :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
XP_011 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
::.:::....:.: ::. ::. : . ::
XP_011 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
450 460 470 480 490 500
>>XP_011527102 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta (513 aa)
initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1080.6 bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
: :::::.: : :: .:: ::::.:
XP_011 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
: . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_011 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
:: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .:
XP_011 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
. :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. ..
XP_011 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
::: ..::..:.. :. ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. ..
XP_011 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
. : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::.
XP_011 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
: :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
XP_011 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
::.:::....:.: ::. ::. : . ::
XP_011 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
450 460 470 480 490 500
>>XP_006723848 (OMIM: 603788) PREDICTED: potassium volta (513 aa)
initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1080.6 bits: 209.4 E(85289): 1.9e-53
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
: :::::.: : :: .:: ::::.:
XP_006 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
: . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. ::
XP_006 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
:: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .:
XP_006 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
. :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. ..
XP_006 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
::: ..::..:.. :. ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. ..
XP_006 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
. : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::.
XP_006 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
: :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
XP_006 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
::.:::....:.: ::. ::. : . ::
XP_006 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
450 460 470 480 490 500
477 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:36:44 2016 done: Wed Nov 2 20:36:45 2016
Total Scan time: 7.610 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]