Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1144, 477 aa
1>>>pF1KA1144 477 - 477 aa - 477 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7016+/-0.000976; mu= 14.8712+/- 0.058
mean_var=70.1522+/-14.423, 0's: 0 Z-trim(104.1): 126 B-trim: 86 in 2/47
Lambda= 0.153128
statistics sampled from 7594 (7742) to 7594 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 3168 709.5 1.9e-204
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 1703 385.9 5.3e-107
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 1002 231.0 2.3e-60
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 989 228.2 1.8e-59
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 960 221.7 1.4e-57
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 944 218.2 1.7e-56
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 864 200.6 5.7e-51
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 861 200.0 8.5e-51
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 812 189.0 8.5e-48
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 756 176.7 5e-44
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 662 155.9 9.1e-38
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 645 152.1 1.1e-36
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 644 151.9 1.5e-36
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 633 149.5 7.1e-36
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 625 147.7 2.5e-35
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 616 145.7 1e-34
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 605 143.4 7.1e-34
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 594 140.9 3.4e-33
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 568 135.2 2e-31
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 568 135.2 2.1e-31
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 545 130.1 6.9e-30
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 541 129.2 1.2e-29
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 446 108.2 2.2e-23
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 435 105.8 1.4e-22
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 370 91.4 2.9e-18
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 370 91.4 2.9e-18
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 347 86.3 8.1e-17
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 283 72.3 2.1e-12
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 268 69.0 2.5e-11
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 263 67.8 3.2e-11
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 263 67.8 3.6e-11
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 264 68.1 4.1e-11
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 264 68.1 4.6e-11
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 264 68.1 4.7e-11
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 255 65.9 8.6e-11
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa)
initn: 3168 init1: 3168 opt: 3168 Z-score: 3783.8 bits: 709.5 E(32554): 1.9e-204
Smith-Waterman score: 3168; 100.0% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (1-477:1-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
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CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA1 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
430 440 450 460 470
>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa)
initn: 1723 init1: 798 opt: 1703 Z-score: 2034.5 bits: 385.9 E(32554): 5.3e-107
Smith-Waterman score: 1703; 56.4% identity (82.2% similar) in 450 aa overlap (15-462:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGE-IRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELC
.: : . .::::::. . . ::::::.::::.:: :::.:::::::
CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC
:::. ...:.:::::: :: :::.::.::::::: ::::::: ::::::::::.::::::
CCDS16 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWLALDN
: :. :: : ... ::..: . :: :::.: : .. ::: .:..:...:. ..:
CCDS16 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 PGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEIVEHFGIAWFT
:.: . .....: :. ::..::..::..:. .:: :.. . :: .: :: :::::
CCDS16 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVD---DPVLEGVEIACIAWFT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLANLGRVAQVLRL
::..:.:.:: ::.:: ::.::..::.::: ::.:. : . . :.:.:.:.:::
CCDS16 GELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIENMGKVVQILRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 MRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEG-L
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CCDS16 MRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYR
..:: ::::::.:::::::::. : : :::: ::.::. :::::.::::.::::::..:.
CCDS16 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
.::... . : : . .:.: :.:: ::........::...
CCDS16 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE
420 430 440 450 460 470
CCDS16 DNEDICNTTSLENCTAK
480 490
>>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa)
initn: 862 init1: 358 opt: 1002 Z-score: 1197.2 bits: 231.0 E(32554): 2.3e-60
Smith-Waterman score: 1003; 38.6% identity (69.4% similar) in 438 aa overlap (8-428:51-476)
10 20 30
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR
:.: .... :: ::::: . : :: :
CCDS10 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC
:: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.: : .. : .::: .. :.:
CCDS10 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND
..::..:. ::::.: .. :: . ::.: .: . .:.. . : .
CCDS10 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS
.:.. : .. .:... .:: .. ..::. :::: : . ...:....::.. ..
CCDS10 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV
::. .. . ::: . .:::..:. ::. : : .::.. ::.::...: :.:..:.
CCDS10 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KA1 VNLVVESTPT----------LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSY
:. : : : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :..
CCDS10 VS---EEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCT
320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 KEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGT
.: :::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. : ..::: .::: .:::::::::.:: .
CCDS10 REFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRS
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 TAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVP
. :...: . ::.:::....: : ::. ::: : ..:.::.. .:
CCDS10 VPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECE
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KA1 SVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
CCDS10 LLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
490 500 510
>>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa)
initn: 1008 init1: 301 opt: 989 Z-score: 1181.3 bits: 228.2 E(32554): 1.8e-59
Smith-Waterman score: 989; 39.2% identity (67.8% similar) in 416 aa overlap (19-424:99-507)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
. .:::: . .: : ::.::::::
CCDS64 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
:: : :::::.. :..:::.: .: : .:: .: : :. :: : .:. ::
CCDS64 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
:. . :: .. :. : .:. : . .. .. .: .. : .: : :
CCDS64 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYG-PQ--
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR
::.:: ...: :: ...... : :. :.... ::.. ..: ..::. : : :
CCDS64 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E
.: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :... . .
CCDS64 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330
pF1KA1 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG
:....:.:.:::: ::::::::::::::::::..: ::. :..:: :::....:
CCDS64 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG
: ::...:..:.. . ...::: ::::.::..::::::. : : :.. : :: :
CCDS64 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
:.. .::....:::: .: . : :
CCDS64 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP
490 500 510 520 530 540
>>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa)
initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1147.1 bits: 221.7 E(32554): 1.4e-57
Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472)
10 20 30 40
pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
: :::::.: : :: .:: ::::.:
CCDS13 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
: . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. ::
CCDS13 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
:: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .:
CCDS13 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG
160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
. :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. ..
CCDS13 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
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CCDS13 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
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290 300 310 320 330
pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
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CCDS13 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
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340 350 360 370 380 390
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CCDS13 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS
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400 410 420 430 440 450
pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
::.:::....:.: ::. ::. : . ::
CCDS13 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
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50 60 70 80 90 100
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220 230 240 250 260 270
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CCDS13 AAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFY
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280 290 300 310 320 330
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.::...... .. ...::.:.::.:::::::.::::::::::::::::::.::.:::
CCDS13 LTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVG
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340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLT
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400 410 420 430 440
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CCDS13 ASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSIDGVSEASL
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450 460 470
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CCDS13 ETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
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10 20 30 40
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CCDS62 VEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTS
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CCDS13 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
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CCDS13 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
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CCDS13 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE
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470
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CCDS13 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE
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CCDS18 DYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCC
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CCDS18 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGR
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CCDS18 EPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGE
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CCDS18 NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIF
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CCDS18 SALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSG
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CCDS18 IVLLALPITFIYHSFVQCYHELK-FRSARYSRSLSTEFLN
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CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY
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CCDS16 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL
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CCDS16 KFLDDCCK-SHLSEK----REELEEIARRVQLI--LDDLGV---DAAE------GRWRRC
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CCDS16 QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLEN
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CCDS16 VETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTN
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CCDS16 VQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYT
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CCDS16 MEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHP
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pF1KA1 IFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPS
:.:.: ..: .:. ::.: .
CCDS16 IINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSC
410 420 430 440 450 460
477 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:36:43 2016 done: Wed Nov 2 20:36:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]