Result of FASTA (omim) for
pF1KA1132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1132, 2053 aa
1>>>pF1KA1132 2053 - 2053 aa - 2053 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6034+/-0.00069; mu= -17.0811+/- 0.043
mean_var=584.9156+/-123.028, 0's: 0 Z-trim(118.7): 637 B-trim: 1467 in 1/52
Lambda= 0.053031
statistics sampled from 31193 (31851) to 31193 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 20.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesi (2113) 13696 1064.9 0
XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1977) 12245 953.9 0
XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (2065) 12245 953.9 0
XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1626) 10873 848.8 0
XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1543) 10300 805.0 0
XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1344) 8459 664.1 2.9e-189
XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1270) 8444 662.9 6.2e-189
XP_011541227 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1264) 8425 661.5 1.7e-188
NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesi (2012) 8229 646.6 7.9e-184
NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adh (1994) 8206 644.9 2.6e-183
XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndro (1776) 7145 563.6 6.6e-159
XP_011523218 (OMIM: 607217) PREDICTED: protein sid (1142) 1071 98.8 3.6e-19
XP_011531733 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1015) 795 77.6 7.5e-13
XP_011531727 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_011531729 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_016861273 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_011531732 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_011531731 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_011531728 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_011531730 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
NP_001193884 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a (1026) 795 77.6 7.6e-13
NP_783200 (OMIM: 607280) contactin-4 isoform a pre (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_016861272 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_016861271 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1026) 795 77.6 7.6e-13
XP_016861275 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 789 77.2 1e-12
XP_006713067 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 789 77.2 1e-12
XP_016861274 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 789 77.2 1e-12
XP_016861276 (OMIM: 607280) PREDICTED: contactin-4 (1025) 789 77.2 1e-12
XP_016857926 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (4976) 779 76.9 6e-12
XP_011508340 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (5518) 779 77.0 6.5e-12
NP_114141 (OMIM: 603075,608548) hemicentin-1 precu (5635) 779 77.0 6.6e-12
XP_011507621 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1347) 755 74.7 7.8e-12
XP_011507622 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1443) 755 74.7 8.3e-12
NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028) 735 73.1 1.8e-11
XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 735 73.1 1.8e-11
XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 735 73.1 1.8e-11
XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 735 73.1 1.8e-11
XP_011507613 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1359) 738 73.4 1.9e-11
XP_016856226 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1133) 731 72.8 2.4e-11
XP_011507627 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1190) 731 72.8 2.5e-11
XP_011507624 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1274) 731 72.8 2.7e-11
XP_011507620 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1460) 731 72.9 3e-11
NP_001153803 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 2 (1189) 728 72.6 3e-11
XP_011507626 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1195) 728 72.6 3e-11
XP_005245046 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1266) 728 72.6 3.1e-11
XP_011507623 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1285) 728 72.6 3.2e-11
XP_016860311 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (33101) 764 76.4 5.8e-11
NP_596869 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (33423) 764 76.4 5.8e-11
XP_016860310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34087) 764 76.4 5.9e-11
XP_016860309 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34088) 764 76.4 5.9e-11
>>NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesion m (2113 aa)
initn: 13696 init1: 13696 opt: 13696 Z-score: 5681.5 bits: 1064.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13696; 100.0% identity (100.0% similar) in 2053 aa overlap (1-2053:61-2113)
10 20 30
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
700 710 720 730 740 750
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
760 770 780 790 800 810
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
880 890 900 910 920 930
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
940 950 960 970 980 990
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
1960 1970 1980 1990 2000 2010
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
2020 2030 2040 2050 2060 2070
2020 2030 2040 2050
pF1KA1 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
2080 2090 2100 2110
>>XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1977 aa)
initn: 12245 init1: 12245 opt: 12245 Z-score: 5082.0 bits: 953.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13033; 99.3% identity (99.4% similar) in 1973 aa overlap (93-2053:5-1977)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAV
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTPCSSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAV
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
XP_011 FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230
pF1KA1 YISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVT------------DPAESIPTILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
XP_011 YISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTILD
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 GFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSG
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 TYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYR
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRI
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 VSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHM
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIG
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 YPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVH
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 VAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEF
520 530 540 550 560 570
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pF1KA1 MSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLN
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 CSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQAS
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 NGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVID
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 PDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDP
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 PELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIV
820 830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 DLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAP
880 890 900 910 920 930
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 KKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFN
940 950 960 970 980 990
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 RAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIF
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 WSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 PGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFY
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 RIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 CNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 FDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKD
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 VFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTH
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA1 INSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELR
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 MRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KA1 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KA1 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQD
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KA1 TDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNE
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KA1 NADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAF
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KA1 FRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLP
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KA1 QRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEM
1900 1910 1920 1930 1940 1950
2040 2050
pF1KA1 STSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::
XP_011 STSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1960 1970
>>XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (2065 aa)
initn: 12245 init1: 12245 opt: 12245 Z-score: 5081.7 bits: 953.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13662; 99.4% identity (99.4% similar) in 2065 aa overlap (1-2053:1-2065)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_011 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KA1 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVT------------DPAESIPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
XP_011 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTED
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRW
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 YRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 RIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTIS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 HMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRV
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 IGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 VHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGV
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 LNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQ
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 ASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTV
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 IDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPP
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 DPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQAN
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 IVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWK
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 APKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 FNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 IFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 DVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA1 FYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA1 LPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA1 GGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEW
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA1 KDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 THINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 LRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVAL
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XP_011 LRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVAL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA1 LFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIED
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XP_011 LFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIED
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 KEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNP
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XP_011 KEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 VSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 QDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA1 NENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KA1 AFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTAT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 LPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLL
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2030 2040 2050
pF1KA1 EMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
2050 2060
>>XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1626 aa)
initn: 10873 init1: 10873 opt: 10873 Z-score: 4515.9 bits: 848.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10873; 100.0% identity (100.0% similar) in 1626 aa overlap (428-2053:1-1626)
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTN
10 20 30
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 QYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAV
40 50 60 70 80 90
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 AGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSV
100 110 120 130 140 150
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 LIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVI
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 ISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPN
220 230 240 250 260 270
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 NQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHV
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 LEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERP
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 IIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDR
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XP_011 IIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDR
400 410 420 430 440 450
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pF1KA1 GLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQST
460 470 480 490 500 510
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 RNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQP
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XP_011 RNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQP
520 530 540 550 560 570
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 VTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLK
580 590 600 610 620 630
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 KFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRS
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XP_011 KFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRS
640 650 660 670 680 690
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 TLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGV
700 710 720 730 740 750
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 RSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPA
760 770 780 790 800 810
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 PSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGG
820 830 840 850 860 870
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 TVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAED
880 890 900 910 920 930
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 SGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFV
940 950 960 970 980 990
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 LQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 EPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVF
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 LTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGC
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHI
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 DIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLI
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 DMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTV
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 TESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFIS
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 DSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSD
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 YCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPH
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 PGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPH
1540 1550 1560 1570 1580 1590
2020 2030 2040 2050
pF1KA1 TKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1600 1610 1620
>>XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1543 aa)
initn: 10300 init1: 10300 opt: 10300 Z-score: 4279.2 bits: 805.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10300; 100.0% identity (100.0% similar) in 1543 aa overlap (511-2053:1-1543)
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
10 20 30
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 DALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQ
40 50 60 70 80 90
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVS
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPK
160 170 180 190 200 210
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKS
220 230 240 250 260 270
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 MFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIA
280 290 300 310 320 330
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 TKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKA
340 350 360 370 380 390
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 RSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSI
400 410 420 430 440 450
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 RMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIR
460 470 480 490 500 510
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSE
520 530 540 550 560 570
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 INATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWG
580 590 600 610 620 630
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAV
640 650 660 670 680 690
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQ
700 710 720 730 740 750
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 YLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPA
760 770 780 790 800 810
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 VKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLV
820 830 840 850 860 870
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 QVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSF
880 890 900 910 920 930
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 KLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNL
940 950 960 970 980 990
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 QGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 NETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKR
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 LKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 TIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHST
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 RNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 TESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMST
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 PSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPC
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 PVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPP
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 AGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQK
1480 1490 1500 1510 1520 1530
2050
pF1KA1 QGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::
XP_011 QGAGAYSKSYTLV
1540
>>XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1344 aa)
initn: 8445 init1: 8445 opt: 8459 Z-score: 3518.9 bits: 664.1 E(85289): 2.9e-189
Smith-Waterman score: 8459; 95.7% identity (97.1% similar) in 1339 aa overlap (719-2053:16-1344)
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 PPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILP
:. . ::.. .. :: ..:
XP_011 MDYAFPDAPQSKLMSPNPLMKHSS------DFPPVHVAGAATECS
10 20 30
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 NSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISK----SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGH
::: : . . .:. : ..::: . .: ..:::::::::::::::::
XP_011 NSS----PVTVTSRNPRICSHHITVIANISKYHLYAALLQDHVPAMITSHPNTTIAIKGH
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pF1KA1 AKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVF
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 FSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEY
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 KNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEA
220 230 240 250 260 270
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 APDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKA
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pF1KA1 TGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITS
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pF1KA1 DVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYS
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pF1KA1 VQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKY
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pF1KA1 TIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIFCSSPGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEP
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pF1KA1 AGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHT
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pF1KA1 NGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWI
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pF1KA1 PGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSG
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pF1KA1 RISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWA
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pF1KA1 WQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQG
820 830 840 850 860 870
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pF1KA1 EGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDT
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pF1KA1 PVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSL
940 950 960 970 980 990
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pF1KA1 HHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA1 DWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DWRTVGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KA1 QHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKN
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pF1KA1 VAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KA1 TLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPP
1240 1250 1260 1270 1280 1290
2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 APSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1300 1310 1320 1330 1340
>>XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1270 aa)
initn: 8444 init1: 8444 opt: 8444 Z-score: 3513.0 bits: 662.9 E(85289): 6.2e-189
Smith-Waterman score: 8444; 99.9% identity (100.0% similar) in 1267 aa overlap (787-2053:4-1270)
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 VLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGER
.:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MESVPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGER
10 20 30
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
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pF1KA1 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
160 170 180 190 200 210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 KKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPR
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pF1KA1 STLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDG
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pF1KA1 VRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
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pF1KA1 APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFG
460 470 480 490 500 510
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pF1KA1 GTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAE
520 530 540 550 560 570
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pF1KA1 DSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGF
580 590 600 610 620 630
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 VLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHG
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pF1KA1 REPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEV
700 710 720 730 740 750
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pF1KA1 FLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIG
760 770 780 790 800 810
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pF1KA1 CPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLH
820 830 840 850 860 870
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 IDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPL
880 890 900 910 920 930
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 IDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVT
940 950 960 970 980 990
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 VTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFI
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 SDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 DYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 HPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
2020 2030 2040 2050
pF1KA1 HTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1240 1250 1260 1270
>>XP_011541227 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1264 aa)
initn: 8425 init1: 8425 opt: 8425 Z-score: 3505.2 bits: 661.5 E(85289): 1.7e-188
Smith-Waterman score: 8425; 100.0% identity (100.0% similar) in 1264 aa overlap (790-2053:1-1264)
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 EDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPII
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPII
10 20 30
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 IRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGL
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pF1KA1 IQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRN
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pF1KA1 ISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSG
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pF1KA1 YYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQ
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pF1KA1 YSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREP
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pF1KA1 SFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVKKLFTIGCPV
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pF1KA1 ILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDI
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pF1KA1 PRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDM
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pF1KA1 SDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVTE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDS
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XP_011 SSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYC
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pF1KA1 NLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPG
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pF1KA1 APAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTK
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pF1KA1 MGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
1240 1250 1260
>>NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesion m (2012 aa)
initn: 4634 init1: 2654 opt: 8229 Z-score: 3421.3 bits: 646.6 E(85289): 7.9e-184
Smith-Waterman score: 8253; 59.8% identity (82.7% similar) in 2067 aa overlap (1-2053:1-2012)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWY
::... : :..:. .. ::. .:::::: :::.:.:.:..:..::::::: : ..::::
NP_001 MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWY
10 20 30 40 50
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pF1KA1 LATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVK
::::..::::: ::::: :::::..:: ::.:...:::: :.::::: .::::: ....:
NP_001 LATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIK
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pF1KA1 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHG
::.:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::.. .::.:: :
NP_001 AVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTG
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pF1KA1 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAG
.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :.:::.: :.::::: ... ::
NP_001 ALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAG
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pF1KA1 HTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
. ::::: : :.: : :::::. :: ..:. : .::: : ..: :::.:.:::.: .
NP_001 QRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRY
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pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEA
:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. . . :::: :.. : .
NP_001 GTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKN
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 ISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVN
. : :...:.:.. :: .::::::. . .:::.. ..::::::.:.:.::::::.
NP_001 VRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 PGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDG
:.: :::: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .:. :.:...:..:... :.:::
NP_001 PAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDG
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pF1KA1 GVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::::::::::::
NP_001 GVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
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pF1KA1 DALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLI
.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::::.:::::.:
NP_001 NSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFI
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:::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::.. .: :::.::..
NP_001 QPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
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pF1KA1 SLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPP
:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .::::..::: :
NP_001 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
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pF1KA1 KVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISK
..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::
NP_001 TIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSK
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pF1KA1 SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAI
::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: .
NP_001 SMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLV
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pF1KA1 ATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVK
.::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.:::::::::::::.::..::
NP_001 STKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVK
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pF1KA1 ARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYS
::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::
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pF1KA1 IRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVI
::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.::::::::.::::.:
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pF1KA1 RGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSS
::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.:::: :::::::::.
NP_001 RGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQ
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pF1KA1 EINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEW
:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .:::.:.:.:::.:. .:::
NP_001 EIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGEL
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pF1KA1 GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKA
::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::::: .. .:::::::::::.::
NP_001 GEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKA
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pF1KA1 VPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRG
. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. ::.:.::... ::: .:.:.
NP_001 AAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRN
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pF1KA1 QQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPA
.:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.::::::::::. :::..::::.
NP_001 RQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KA1 PAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNL
::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::::.: :.:. : : ::.::
NP_001 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNL
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pF1KA1 LVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSER
:::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..:::: ::::.: . :: :::
NP_001 QVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSER
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:..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.::. ::.:..::
NP_001 SYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRL
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:: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .: .:.:::::::.::.::::
NP_001 NLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSA
1500 1510 1520 1530 1540 1550
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pF1KA1 GCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.: .. . : .::.
NP_001 GCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLL
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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pF1KA1 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
.::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : : :.::::::.:::::...
NP_001 VVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERD
1620 1630 1640 1650 1660 1670
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pF1KA1 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
.. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..
NP_001 TMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTT
1680 1690 1700 1710 1720 1730
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pF1KA1 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVT-ESDSYSASLSQ
:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . . .: ::::::.: ::
NP_001 RRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQ
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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pF1KA1 DTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTN
:::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::
NP_001 DTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTN
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pF1KA1 ENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEA
: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::: :: . : .:: : . .
NP_001 EYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMD-
1860 1870 1880 1890 1900
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pF1KA1 FFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATL
:. . : : .. :.:. :: :.: .:: : .: :.
NP_001 FLLNRGG-------P---GTSRDLSLG---QA---CLEP-QKSRTLKRP-------TVLE
1910 1920 1930 1940
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