Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1124, 1711 aa
1>>>pF1KA1124 1711 - 1711 aa - 1711 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.1007+/-0.00143; mu= -31.8038+/- 0.084
mean_var=737.3424+/-159.505, 0's: 0 Z-trim(111.6): 449 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.047232
statistics sampled from 12098 (12535) to 12098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.385), width: 16
Scan time: 5.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 11304 787.5 0
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 4390 316.3 5.7e-85
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 2820 209.3 8.8e-53
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 2021 154.9 2.1e-36
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1695 132.4 4.2e-30
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1695 132.4 4.8e-30
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1695 132.4 4.8e-30
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1676 131.1 1.2e-29
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1521 120.6 1.8e-26
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 1508 119.9 6.2e-26
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 1487 118.5 1.7e-25
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1378 111.1 4e-23
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1365 110.2 7.5e-23
>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711 aa)
initn: 11304 init1: 11304 opt: 11304 Z-score: 4185.2 bits: 787.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11304; 99.9% identity (100.0% similar) in 1711 aa overlap (1-1711:1-1711)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWAK
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CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 FREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 IGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 IGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRALSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRALSN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVVRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVVRQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 EKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 KEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQMESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQMESE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LEALKVKQGGRGAGATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LEALKVKQGGRGAGATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEVH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 DSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTAEN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQALAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQALAS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 KMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEELRKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEELRKV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 KDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASEQQEDMARPPQRPSAVPLPTTQALALAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 AHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASEQQEDMARPPQRPSAVPLPTTQALALAG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 PKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 QSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKSTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKSTQPG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 VIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENEN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 EKKKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAVGLEE
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 EKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAVGLEE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGSFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGSFDI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 KLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQCLA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 VLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEYLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEYLLC
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 FSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQTIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQTIGL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 RRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFSGAVLNVPDTSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKV
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CCDS99 RRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFSGAVLNVPDTSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 PEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVPPSQEERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVPPSQEERP
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 GPAPTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLRSMSDPDQDFDKEPDSDSTKHSTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GPAPTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLRSMSDPDQDFDKEPDSDSTKHSTPS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710
pF1KA1 NSSNPSGPPSPNSPHRSQLPLEGLEQPACDT
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 NSSNPSGPPSPNSPHRSQLPLEGLEQPACDT
1690 1700 1710
>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa)
initn: 6269 init1: 2496 opt: 4390 Z-score: 1638.9 bits: 316.3 E(32554): 5.7e-85
Smith-Waterman score: 7062; 60.8% identity (83.4% similar) in 1749 aa overlap (1-1710:1-1718)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWR-NESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWA
::..:::..:::..:::: . : . .:::::::.:.::: ::..: :::.: . :.::::
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 KPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETA
::::. ::.:.::::::::.:::::::::::::::.::.....:::::::::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 CFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARF
::::::::::::: .:::.:::::::.:.::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 YIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGT
:..:::.::::.::::::::::::::.:.:.::::::::::::::. .::::::::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER
::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 FQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIP
::::..::::::.:::::.:::::::.::::::::::::: :: :..:.:::: ::::::
CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 DVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIM
.::::.:::::::::: :.:.: .:: .::.::: ::::.:::.:. .:::. :.
CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSS-RAL
..: : .::: :...: :::::::.:::::::::::::::::::::.:. :. .
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVV
....: :::.:.::::.:......:..::.:::.. :.::: .:. ..... ::: ...
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 RQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQL
.::.:.:.:.::.::::::.:.::::::: :::::.::: :.:::..::..::::..:..
CCDS15 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 RDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQME
::::::.... :::...:::.::.:. .::::.. . .:::::.:::::.::.. ::.:
CCDS15 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SELEALKVKQGGRGAGA-TLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKK
.:::.:: :: . . :. ..::::::.:.:..:::: .:::::: .::. :. :.::.::
CCDS15 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 EVHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLT
:.::::..::::.:::..:::::::..:: ..: :: . .:..::::...: .::::::
CCDS15 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 AENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQA
.: .:: .. ..:. .:.:::.:..::: ::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS15 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 LASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEEL
:::::::::::::.::::.:. : ::.:: ::::::::::::::.::::::: .::::
CCDS15 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 RKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNT
::: .:. : :::::: :: ::: :.: : : :: .:.. :.. : : :.. ..::
CCDS15 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEE-LRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNT
910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 APLAHDLTFRTSSASEQETQAPKPEASPSMSVAASEQQEDMARPPQRPSAVPLPTTQALA
: : :.: ... : .:.. : :... .:
CCDS15 PTDALD-QFETVDST------PLSVHTPTL------------RKKGCPGSTGFP------
960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 LAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPI
:: :.::: .:::..::.: .:::::::::::: .::::.:.::..: . :: .::.
CCDS15 ---PKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 PPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKST
::::.: :::.: :.::::::.:::..:::.::::::::: :.::: ::::::. :::..
CCDS15 PPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKAS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 QPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTE
::.:. :::.:.::.:::::::::::::::.:.::::::::::: :.: .. :.:.:..
CCDS15 QPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLAD
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 NENEKKKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAVG
.::::.::::.: :..::.::..:.. :.:: :::::.:::::. .:::.: .:::.:
CCDS15 TENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KA1 LEEGLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGS
::::.:..::.: :.:..: ::.::::: : ...: .. :::.::.:.: :.::: : .
CCDS15 NEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETD
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KA1 FDIKLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQ
: :: :::::: .... ..... ::: ::.:: .::::. ..: ::::.:: .: .::
CCDS15 F-YKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQ
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 CLAVLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEY
.:.. ..::::. ::: ..:.:.: .... :: .:.:...: .::.::::. :.::
CCDS15 WMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEY
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA1 LLCFSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQT
::::. .:.:.: ::::.: ::::::: : .: . ...:::: .::.::: .:::.::
CCDS15 LLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQT
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KA1 IGLRRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFS-GAVLNVPDTSDNSKKQMLRT-RSKRR
. :...::::.::.::::. : ::::::.:.. : : ::.:::::.:::.:. .:::
CCDS15 LPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRR
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA1 FVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVP--
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CCDS15 YSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQE
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1620 1630 1640 1650
pF1KA1 -----------PS-QEERPGP-----APTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLR
:: . :: : : ..:. . ..: .. :::: . :.
CCDS15 SRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMP
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KA1 SMSD--------------PDQDFDKEPDSDSTKHSTPSNSSNPSGPPSPNSPHRSQ-LPL
: :. : .::: : :::: .::: ::::: :.:::: ::.... : :
CCDS15 SPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGE-DSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSL
1660 1670 1680 1690 1700
1710
pF1KA1 EGLEQPACDT
:. .. . :
CCDS15 ESTDRGSWDP
1710
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CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
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pF1KA1 KPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETA
::::. ::.:.::::::::.:::::::::::::::.::.....:::::::::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
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pF1KA1 CFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARF
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CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
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pF1KA1 YIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGT
:..:::.::::.::::::::::::::.:.:.::::::::::::::. .::::::::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
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240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER
::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
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CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
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pF1KA1 DVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIM
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CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
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pF1KA1 QSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSS-RAL
..: : .::: :...: :::::::.:::::::::::::::::::::.:. :. .
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
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pF1KA1 SNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVV
....: :::.:.::::.:......:..::.:::.. :.::: .:. ..... ::: ...
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
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pF1KA1 RQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQL
.::.:.:.:
CCDS15 QQEREDLNK---------------------------------------------------
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pF1KA1 RDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQME
.:: :. . .:::::.:::::.::.. ::.:
CCDS15 ------LEVHTEAL------------------------AAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
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.:::.:: :: . . :. ..::::::.:.:..:::: .:::::: .::. :. :.::.::
CCDS15 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
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pF1KA1 EVHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLT
:.::::..::::.:::..:::::::..:: ..: :: . .:..::::...: .::::::
CCDS15 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
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pF1KA1 AENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQA
.: .:: .. ..:. .:.:::.:..::: ::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS15 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
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:::::::::::::.::::.:. : ::.:: ::::::::::::::.::::::: .::::
CCDS15 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
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pF1KA1 RKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNT
::: .:. : :::::: :: ::: :.: : : :: .:.. :.. : : :.. ..::
CCDS15 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEE-LRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNT
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: : :.: ... : .:.. : :... .:
CCDS15 PTDALD-QFETVDST------PLSVHTPTL------------RKKGCPGSTGFP------
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:: :.::: .:::..::.: .:::::::::::: .::::.:.::..: . :: .::.
CCDS15 ---PKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPV
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::::.: :::.: :.::::::.:::..:::.::::::::: :.::: ::::::. :::..
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::.:. :::.:.::.:::::::::::::::.:.::::::::::: :.: .. :.:.:..
CCDS15 QPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLAD
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.::::.::::.: :..::.::..:.. :.:: :::::.:::::. .:::.: .:::.:
CCDS15 TENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALG
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pF1KA1 LEEGLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGS
::::.:..::.: :.:..: ::.::::: : ...: .. :::.::.:.: :.::: : .
CCDS15 NEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETD
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pF1KA1 FDIKLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQ
: :: :::::: .... ..... ::: ::.:: .::::. ..: ::::.:: .: .::
CCDS15 F-YKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQ
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pF1KA1 CLAVLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEY
.:.. ..::::. ::: ..:.:.: .... :: .:.:...: .::.::::. :.::
CCDS15 WMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEY
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pF1KA1 LLCFSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQT
::::. .:.:.: ::::.: ::::::: : .: . ...:::: .::.::: .:::.::
CCDS15 LLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQT
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pF1KA1 IGLRRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFS-GAVLNVPDTSDNSKKQMLRT-RSKRR
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CCDS15 LPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRR
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pF1KA1 FVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVP--
. :.::::::.:::::::::::.:.:.:::::::::.::::::::.:.: :::.. :
CCDS15 YSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KA1 -----------PS-QEERPGP-----APTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLR
:: . :: : : ..:. . ..: .. :::: . :.
CCDS15 SRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1660 1670 1680 1690 1700
pF1KA1 SMSD--------------PDQDFDKEPDSDSTKHSTPSNSSNPSGPPSPNSPHRSQ-LPL
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CCDS15 SPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGE-DSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1710
pF1KA1 EGLEQPACDT
:. .. . :
CCDS15 ESTDRGSWDP
1630
>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESAL--SVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEW
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CCDS31 MERRLRALEQLA-----RGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSW
10 20 30 40 50
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pF1KA1 AKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAET
:.::.. :::..:.:.::::.:::::::::::.::....: .:.:::.:.::::::::::
CCDS31 ASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAET
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 ACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMAR
:::::::::::.:: .:.:.::::::::..::::::::.:::::::::.:::.:: ..:.
CCDS31 ACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQ
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pF1KA1 FYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVG
::..:::::: :.::: :::::.::::::::::::::::::::::..: .: :.::::::
CCDS31 FYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 TPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEE
::::::::::::::.: :.:::.::::::::: ::.:.:::::::::::::::::::::.
CCDS31 TPDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHED
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 RFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYI
..::: : :: :.:::..:.: .:.:::..:..::..: ::::..:: . . ::::
CCDS31 HLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYI
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 PDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSI
:.. .: ::::::::::.: . ::: :: .::: ::::.:::.:. : : ..:
CCDS31 PELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSGS-HSPESS----
360 370 380 390 400
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pF1KA1 MQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRAL
: : ::... :::::.::::: :: .::. .
CCDS31 ------------------SEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQE------ALHAPT---
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pF1KA1 SNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVV
.:...: .:.. :.. :: ..:.: ..: : :. : : .
CCDS31 ----DHRELEQLRKEVQTLRD------RLPEMLRDKASLSQ--TDGPP--AGSPGQDSDL
450 460 470 480
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pF1KA1 RQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQL
::: ..::..:.:. :..: .:: :. :.. ::...: .:: : .: . .: ::
CCDS31 RQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQL
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 RDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQME
:: ..: ....:. . . : .:..: .. . :.:. . . :.
CCDS31 ----EEARAAQRELEAQVSSLSRQVT---QLQGQWEQRLEESSQAKTI--HTA-------
550 560 570 580 590
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pF1KA1 SELEALKVKQGGRGAGATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKE
:: ... .:: :: .
CCDS31 SETNGMGPPEGG---------PQEAQ----------------------------------
600
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 VHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTA
:.::. :...::... .: . :::. ... ::..:.
CCDS31 ----------LRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQE-----------ENRRLSR
610 620 630 640
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pF1KA1 ENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQAL
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CCDS31 ATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQGLQE
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pF1KA1 TSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPG
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CCDS46 EAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATC
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CCDS12 PIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSC
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pF1KA1 PDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHT------GFS-GLHLPFIGFTFTTESCFSD
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CCDS12 PDFEGATDTCNFDLVEDGL--TAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY---SCMAL
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420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RGSLKSIMQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSL
: : .: ...:: . ... .:: : . :. : :
CCDS12 R--------------DSEVPGPT--PMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEV---
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CCDS12 -AVPAAVPAAEAEAEVT-LRELQEALEEEVLTRQSLSREME---AIRTDNQNFASQLREA
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pF1KA1 EKQHRVVRQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQK
: ..: .. . ..:....
CCDS12 EARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGP
510 520 530 540 550 560
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: .: ...:: . ... .:: : . :. : : . :. ..
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pF1KA1 DKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVVRQEKE
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.:....
CCDS46 QLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPA
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CCDS11 SRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRS
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pF1KA1 ETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDM
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CCDS11 ARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTA
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CCDS11 VGTPDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNH
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pF1KA1 EERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEG--LNWENIRNLE
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CCDS11 KNSLTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTV
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CCDS11 APVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTY-----YSNRRY
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CCDS11 LSSANPNDNRTSS-NADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIM
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CCDS11 KELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLE
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CCDS11 D----LKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLES
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CCDS11 LKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTK----A
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CCDS11 RLTDKHQS-IEEAKSVAMCEMEKKL---KEE---REAREKAENRVVQIEKQCS-----ML
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CCDS11 DVDLKQSQQKLEHLTGNKER---MEDEVKNLTLQLEQES------NKRLLLQNELKTQAF
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CCDS11 EADNLKGLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTL
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pF1KA1 ASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQ--KLDMSARLEL-QSALEAEIRAKQLVQE
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CCDS11 YKTQVKELKE----EIEEKNRENLKKIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEE
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CCDS11 QYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEE
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CCDS11 EYKLEKEEEISNLKAAFEKNINT-----ERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQ-
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CCDS11 YGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSNP----SMVLDI-DKLFHVRPVTQGDVYRAETE
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]