Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1121
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1121, 1353 aa
1>>>pF1KA1121 1353 - 1353 aa - 1353 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8337+/-0.00129; mu= 8.9631+/- 0.078
mean_var=289.5804+/-59.472, 0's: 0 Z-trim(109.9): 40 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.075368
statistics sampled from 11168 (11184) to 11168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 4.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46858.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1353) 8958 989.3 0
CCDS2899.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1314) 5708 635.9 2.2e-181
CCDS2898.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1274) 4510 505.6 3.4e-142
CCDS55158.1 CADPS2 gene_id:93664|Hs108|chr7 (1296) 4409 494.7 7e-139
CCDS47691.1 CADPS2 gene_id:93664|Hs108|chr7 (1255) 4288 481.5 6.3e-135
>>CCDS46858.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1353 aa)
initn: 8958 init1: 8958 opt: 8958 Z-score: 5279.8 bits: 989.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8958; 99.9% identity (100.0% similar) in 1353 aa overlap (1-1353:1-1353)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEENQKDAENVGRLITPAKKLEDTIRLAELVIEVLQQNEEHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEENQKDAENVGRLITPAKKLEDTIRLAELVIEVLQQNEEHH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 AEPHVDKGEAFAWWSDLMVEHAETFLSLFAVDMDAALEVQPPDTWDSFPLFQLLNDFLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AEPHVDKGEAFAWWSDLMVEHAETFLSLFAVDMDAALEVQPPDTWDSFPLFQLLNDFLRT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 DYNLCNGKFHKHLQDLFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFERESWEPVKSLTSNLPNVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DYNLCNGKFHKHLQDLFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFERESWEPVKSLTSNLPNVNL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 PNVNLPKVPNLPVNIPLGIPQMPTFSAPSWMAAIYDADNGSGTSEDLFWKLDALQTFIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PNVNLPKVPNLPVNIPLGIPQMPTFSAPSWMAAIYDADNGSGTSEDLFWKLDALQTFIRD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 LHWPEEEFGKHLEQRLKLMASDMIESCVKRTRIAFEVKLQKTSRSTDFRVPQSICTMFNV
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CCDS46 LHWPEEEFGKHLEQRLKLMASDMIESCVKRTRIAFEVKLQKTSRSTDFRVPQSICTMFNV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 MVDAKAQSTKLCSMEMGQEHQYHSKIDELIEETVKEMITLLVAKFVTILEGVLAKLSRYD
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CCDS46 MVDAKAQSTKLCSMEMGQEHQYHSKIDELIEETVKEMITLLVAKFVTILEGVLAKLSRYD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 EGTLFSSFLSFTVKAASKYVDVPKPGMDVADAYVTFVRHSQDVLRDKVNEEMYIERLFDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGTLFSSFLSFTVKAASKYVDVPKPGMDVADAYVTFVRHSQDVLRDKVNEEMYIERLFDQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 WYNSSMNVICTWLTDRMDLQLHIYQLKTLIRVVKKTYRDFRLQGVLDSTLNSKTYETIRN
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WYNSSMNVICTWLTDRMDLQLHIYQLKTLIRMVKKTYRDFRLQGVLDSTLNSKTYETIRN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350
pF1KA1 RLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
1330 1340 1350
>>CCDS2899.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1314 aa)
initn: 7807 init1: 5708 opt: 5708 Z-score: 3370.1 bits: 635.9 E(32554): 2.2e-181
Smith-Waterman score: 8349; 94.0% identity (94.5% similar) in 1370 aa overlap (1-1353:1-1314)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ILHPTPNSPKQSEWHKMTVSKNCPDQDLKIKLAVRMDKPQNMKHSGYLWAIGKNVWKRWK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KRFFVLVQVSQYTFAMCSYREKKAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGRAFFNAVKEGD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARNG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 VRGCHRHLCYLRDLLERAENGAMIDPTLLHYSFAFCASHVHGNRPDGIGTVTVEEKERFE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 EIKERLRVLLENQITHFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPQEEVKTVIRK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KA1 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEENQKDA-----------------ENVGRLITPAKKLEDTI
:::::::::::::::::::: .... .::::::::::::::::
CCDS28 CLEQAALVNYSRLSEYAKIEGKKREMYEHPVFCLASQVMDLTIQNVGRLITPAKKLEDTI
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 RLAELVIEVLQQNEEHHAEPHVDKGEAFAWWSDLMVEHAETFLSLFAVDMDAALEVQPPD
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RLAELVIEVLQQNEEHHAE-------AFAWWSDLMVEHAETFLSLFAVDMDAALEVQPPD
910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 TWDSFPLFQLLNDFLRTDYNLCNGKFHKHLQDLFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TWDSFPLFQLLNDFLRTDYNLCNGKFHKHLQDLFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHRGFERE
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 SWEPVKSLTSNLPNVNLPNVNLPKVPNLPVNIPLGIPQMPTFSAPSWMAAIYDADNGSGT
::::: .:::::
CCDS28 SWEPV-------------------------------------------------NNGSGT
1020
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 SEDLFWKLDALQTFIRDLHWPEEEFGKHLEQRLKLMASDMIESCVKRTRIAFEVKLQKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 SEDLFWKLDALQTFIRDLHWPEEEFGKHLEQRLKLMASDMIESCVKRTRIAFEVKLQKTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 RSTDFRVPQSICTMFNVMVDAKAQSTKLCSMEMGQEHQYHSKIDELIEETVKEMITLLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RSTDFRVPQSICTMFNVMVDAKAQSTKLCSMEMGQEHQYHSKIDELIEETVKEMITLLVA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 KFVTILEGVLAKLSRYDEGTLFSSFLSFTVKAASKYVDVPKPGMDVADAYVTFVRHSQDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KFVTILEGVLAKLSRYDEGTLFSSFLSFTVKAASKYVDVPKPGMDVADAYVTFVRHSQDV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA1 LRDKVNEEMYIERLFDQWYNSSMNVICTWLTDRMDLQLHIYQLKTLIRVVKKTYRDFRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS28 LRDKVNEEMYIERLFDQWYNSSMNVICTWLTDRMDLQLHIYQLKTLIRMVKKTYRDFRLQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 GVLDSTLNSKTYETIRNRLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 GVLDSTLNSKTYETIRNRLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS2898.1 CADPS gene_id:8618|Hs108|chr3 (1274 aa)
initn: 6613 init1: 4510 opt: 4510 Z-score: 2666.2 bits: 505.6 E(32554): 3.4e-142
Smith-Waterman score: 8213; 94.0% identity (94.2% similar) in 1353 aa overlap (1-1353:1-1274)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 AGGGGGSGASSGGGAGGLQPSSRAGGGRPSSPSPSVVSEKEKEELERLQKEEEERKKRLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LYVFVMRCIAYPFNAKQPTDMARRQQKISKQQLQTVKDRFQAFLNGETQIMADEAFMNAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 FDAIYRGEEDPRKQQARMTASAASELILSKEQLYEMFQNILGIKKFEHQLLYNACQLDNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DEQAAQIRRELDGRLQMADQIARERKFPKFVSKEMENMYIEELKSSVNLLMANLESMPVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KGGEFKLQKLKRSHNASIIDMGEESENQLSKSDVVLSFSLEVVIMEVQGLKSLAPNRIVY
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 CTMEVEGGEKLQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVKVKLFTESTGVLALEDKELGRV
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CCDS28 QKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEM-----------------GWFSPGQVFVLDEYCARNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS28 MVDAKAQSTKLCSMEMGQEHQYHSKIDELIEETVKEMITLLVAKFVTILEGVLAKLSRYD
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CCDS28 RLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
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pF1KA1 DTVIFASDDEQDRILWVQAMYRATGQSHKPVPPTQVQKLNAKGGNVPQLDAPISQFYADR
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pF1KA1 AQKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARN
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.: :::::::::::..:.:::::::::::::::::::::::.:.:.::: :. : .
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:::: :::::.::.:. ::.:..:. ::: ..:.. :::.::::::::::::: :.
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::::::.::..:::::::::::::.:.:::::: :::.::::.:..::.:.: :.:::::
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:.:::: ::::::... :::.:::::::.::...:::.:.:::.:::..:::::.:::::
CCDS55 VLVDAKKQSTKLCALDGGQEQQYHSKIDDLIDNSVKEIISLLVSKFVSVLEGVLSKLSRY
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pF1KA1 NRLTVEEATASVSEGGGLQGISMKDSDEEDEEDD
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CCDS55 RRLTVEEATASVSEGGGLQGITMKDSDEEEEG
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>>CCDS47691.1 CADPS2 gene_id:93664|Hs108|chr7 (1255 aa)
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pF1KA1 MLDPSSSEEESDEIVEEESGKEVLGSAPSGARLSPSRTSEGSAGSAGLGGGGAGAGAGVG
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CCDS47 ------------------------GAARSVSPSPSVLSEG-RDEPQRQLDDEQERRIRLQ
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pF1KA1 QSYYEVFLKSDRVARMVQSGGCSANDSREVFKKHIEKRVRSLPEIDGLSKETVLSSWMAK
.::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::.::
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CCDS47 KGGPEFKLQKLKRSQNSAFLDIGDENEIQLSKSDVVLSFTLEIVIMEVQGLKSVAPNRIV
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pF1KA1 AQKHGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQRLTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARN
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CCDS47 FQKHGMDEFISANPCKLDHAFLFRILQRQTLDHRLNDSYSCLGWFSPGQVFVLDEYCARY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]