Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1119
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1119, 1849 aa
1>>>pF1KA1119 1849 - 1849 aa - 1849 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6209+/-0.00186; mu= -5.5217+/- 0.109
mean_var=368.9768+/-79.387, 0's: 0 Z-trim(104.2): 153 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.066769
statistics sampled from 7689 (7807) to 7689 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 5.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 12048 1177.3 0
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 7521 741.2 8.5e-213
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 5180 515.7 6.4e-145
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 3968 398.9 8.6e-110
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 2044 213.6 5.8e-54
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 2044 213.6 5.9e-54
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 2014 210.7 4.3e-53
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1972 206.7 7.1e-52
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1948 204.4 3.5e-51
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1907 200.4 5.4e-50
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1903 200.0 7.2e-50
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1877 197.5 4e-49
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1862 196.1 1.2e-48
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1835 193.5 6.7e-48
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 1705 181.0 3.9e-44
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 1705 181.0 4e-44
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1666 177.0 3.5e-43
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 1653 176.0 1.3e-42
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1641 174.6 1.8e-42
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 1636 174.3 4e-42
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1628 173.4 4.3e-42
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 1621 172.9 1.1e-41
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 1563 167.3 5.1e-40
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 1554 166.4 9.4e-40
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 1552 166.2 1.1e-39
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1533 164.2 2.3e-39
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 1492 160.4 5.9e-38
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 1486 159.9 8.8e-38
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1447 155.9 8e-37
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1447 156.1 1.3e-36
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1447 156.2 1.3e-36
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1444 155.8 1.5e-36
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1419 153.6 1.2e-35
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 1353 146.9 4.1e-34
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1335 145.3 2.2e-33
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 1317 143.4 4.5e-33
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 1276 139.6 1.1e-31
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1220 134.0 2.6e-30
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1220 134.0 2.7e-30
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 1212 133.5 8e-30
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1190 131.1 2.1e-29
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1190 131.2 2.1e-29
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1190 131.2 2.1e-29
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 1183 130.5 3.3e-29
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1052 117.6 1.1e-25
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1041 116.8 4.1e-25
CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285) 930 106.2 8.4e-22
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 924 105.6 1.2e-21
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 876 100.9 2.6e-20
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 726 86.4 4.7e-16
>>CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848 aa)
initn: 6942 init1: 6942 opt: 12048 Z-score: 6290.6 bits: 1177.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12048; 99.9% identity (99.9% similar) in 1849 aa overlap (1-1849:1-1848)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QDVIYAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QDVIYTYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ATVGGSASETNIEEKVLASSPIMEAIGNAKTTRNDNSSRFGKYIQIGFDKRYHIIGANMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATVGGSASETNIEEKVLASSPIMEAIGNAKTTRNDNSSRFGKYIQIGFDKRYHIIGANMR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TYLLEKSRVVFQADDERNYHIFYQLCAAAGLPEFKELALTSAEDFFYTSQGGDTSIEGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TYLLEKSRVVFQADDERNYHIFYQLCAAAGLPEFKELALTSAEDFFYTSQGGDTSIEGVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DAEDFEKTRQAFTLLGVKESHQMSIFKIIASILHLGSVAIQAERDGDSCSISPQDVYLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAEDFEKTRQAFTLLGVKESHQMSIFKIIASILHLGSVAIQAERDGDSCSISPQDVYLSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 FCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NKALHTSLKQHSFIGVLDIYGFETFEVNSFEQFCINYANEKLQQQFNSHVFKLEQEEYMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NKALHTSLKQHSFIGVLDIYGFETFEVNSFEQFCINYANEKLQQQFNSHVFKLEQEEYMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EQIPWTLIDFYDNQPCIDLIEAKLGILDLLDEECKVPKGTDQNWAQKLYDRHSSSQHFQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EQIPWTLIDFYDNQPCIDLIEAKLGILDLLDEECKVPKGTDQNWAQKLYDRHSSSQHFQK
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pF1KA1 PRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEKNRDTVYEEQINILKASKFPLVADLFHDDKDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEKNRDTVYEEQINILKASKFPLVADLFHDDKDPVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ATTPGKGSSSKISVRSARPPMKVSNKEHKKTVGHQFRTSLHLLMETLNATTPHYVRCIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATTPGKGSSSKISVRSARPPMKVSNKEHKKTVGHQFRTSLHLLMETLNATTPHYVRCIKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 NDEKLPFHFDPKRAVQQLRACGVLETIRISAAGYPSRWAYHDFFNRYRVLVKKRELANTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NDEKLPFHFDPKRAVQQLRACGVLETIRISAAGYPSRWAYHDFFNRYRVLVKKRELANTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KKAICRSVLENLIKDPDKFQFGRTKIFFRAGQVAYLEKLRADKFRTATIMIQKTVRGWLQ
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pF1KA1 KVKYHRLKGATLTLQRYCRGHLARRLAEHLRRIRAAVVLQKHYRMQRARQAYQRVRRAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVKYHRLKGATLTLQRYCRGHLARRLAEHLRRIRAAVVLQKHYRMQRARQAYQRVRRAAV
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pF1KA1 VIQAFTRAMFVRRTYRQVLMEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VIQAFTRAMFVRRTYRQVLMEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKAR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQLQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVE
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pF1KA1 RLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDAHSREKDELRKRVADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDAHSREKDELRKRVADL
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pF1KA1 EQENALLKDEKEQLNNQILCQSKDEFAQNSVKENLLMKKELEEERSRYQNLVKEYSQLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EQENALLKDEKEQLNNQILCQSKDEFAQNSVKENL-MKKELEEERSRYQNLVKEYSQLEQ
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pF1KA1 RYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEKA
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pF1KA1 AMDMTVFLKLQKRVRELEQERKKLQVQLEKREQQDSKKVQAEPPQTDIDLDPNADLAYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AMDMTVFLKLQKRVRELEQERKKLQVQLEKREQQDSKKVQAEPPQTDIDLDPNADLAYNS
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pF1KA1 LKRQELESENKKLKNDLNELRKAVADQATQNNSSHGSPDSYSLLLNQLKLAHEELEVRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKRQELESENKKLKNDLNELRKAVADQATQNNSSHGSPDSYSLLLNQLKLAHEELEVRKE
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pF1KA1 EVLILRTQIVSADQRRLAGRNAEPNINARSSWPNSEKHVDQEDAIEAYHGVCQTNSKTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVLILRTQIVSADQRRLAGRNAEPNINARSSWPNSEKHVDQEDAIEAYHGVCQTNSKTED
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pF1KA1 WGYLNEDGELGLAYQGLKQVARLLEAQLQAQSLEHEEEVEHLKAQLEALKEEMDKQQQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGYLNEDGELGLAYQGLKQVARLLEAQLQAQSLEHEEEVEHLKAQLEALKEEMDKQQQTF
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pF1KA1 CQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQDLEA
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pF1KA1 AQALAQSERKRHELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALLIRNLVTDLKPQMLSGTVPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AQALAQSERKRHELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALLIRNLVTDLKPQMLSGTVPC
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 LPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKHNDDFEMTSFWLSNTCRLLHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKHNDDFEMTSFWLSNTCRLLHC
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 LKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVS
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 AMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIIL
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 QVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEP
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 LIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQA
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1810 1820 1830 1840
pF1KA1 QLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
1800 1810 1820 1830 1840
>>CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855 aa)
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Smith-Waterman score: 7689; 62.8% identity (85.1% similar) in 1872 aa overlap (1-1849:1-1855)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
:...:::.. .:::::::.:::.:::: :::: ::: : :.::. ::: .: . ..::
CCDS42 MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
::::::::::::::::::::::::::::.:::..:. ::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QDVIYAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
.:.: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
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CCDS42 ATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMR
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pF1KA1 KAQLEALKEEMDKQQQTFCQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNER
......:::: ..::: . :.: : :::..: ..:.::.::::::::: : .:: .:. :
CCDS45 RGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITRLTNENLDLMEQLEKQDKTVR
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA1 KLKKQLKIYMKKAQDLEAAQALAQSERKR-HELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALL
:::::::.. :: .::..: : . : : :.. ::::::::::::.:::: :
CCDS45 KLKKQLKVFAKKIGELEVGQMENISPGQIIDEPIRPVNIPRKEKDFQGMLEYKKEDEQKL
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 IRNLVTDLKPQMLS-GTVPCLPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKH
..::. .:::. .. . .: ::::::.::.::::: ::: ::.::::::::.:::::::.
CCDS45 VKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQKVRSLLTSTINSIKKVLKKR
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 NDDFEMTSFWLSNTCRLLHCLKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSI
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CCDS45 GDDFETVSFWLSNTCRFLHCLKQYSGEEGFMKHNTSRQNEHCLTNFDLAEYRQVLSDLAI
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KA1 QIYQQLIKIAEGVLQPMIVSAMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIR
::::::... :..:::::::.:::.:.:::.::::::: :::.::.:: ...: :..:.:
CCDS45 QIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLRKRTSSIAD-EGTYTLDSILR
1590 1600 1610 1620 1630
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pF1KA1 QMNAFHTVMCDQGLDPEIILQVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQL
:.:.::.:::..:.:::.: :: ::.::.:.:.::::::::::.:::: :::.:::.:::
CCDS45 QLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIIGAITLNNLLLRKDMCSWSKGMQIRYNVSQL
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pF1KA1 EEWLRGRNLHQSGAVQTMEPLIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLY
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CCDS45 EEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAICSMCNALTTAQIVKVLNLY
1700 1710 1720 1730 1740 1750
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pF1KA1 TPLNEFEERVTVAFIRTIQAQLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPAC
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CCDS45 TPVNEFEERVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPVTFPFNPSSLALETIQIPAS
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 LNLEFLNEV
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CCDS45 LGLGFISRV
1820
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CCDS42 PLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRIRFAESKLIYTYSGIILVAMNPYKQLPIYG
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CCDS42 ATVSKSGSNAHVEDKVLASNPITEAVGNAKTTRNDNSSRFGKYTEISFDEQNQIIGANMS
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CCDS42 TYLLEKSRVVFQSENERNYHIFYQLCASAQQSEFKHLKLGSAEEFNYTRMGGNTVIEGVN
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pF1KA1 FCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHI
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CCDS42 FCELLGLESGRVAQWLCNRKIVTSSETVVKPMTRPQAVNARDALAKKIYAHLFDFIVERI
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CCDS42 NQALQFSGKQHTFIGVLDIYGFETFDVNSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMK
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CCDS42 EDIPWTLIDFYDNQPVIDLIEAKMGILELLDEECLLPHGTDENWLQKLYNNFVNRNPLFE
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CCDS42 PNDEKLPFEFDSKRIVQQLRACGVLETIRISAQSYPSRWTYIEFYSRYGILMTKQELSFS
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CCDS42 DKKEVCKVVLHRLIQDSNQYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRLDKLRQSCVMVQKHMRGWL
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pF1KA1 QKVKYHRLKGATLTLQRYCRGHLARR---LAEHLRRIRAAVVLQKHYRMQRARQAYQRVR
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CCDS42 QRKKFLRERRAALIIQQYFRGQQTVRKAITAVALKEAWAAIIIQKHCRGYLVRSLYQLIR
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:....::..:....:: ::..: ::::. .::..:.:.:::.:: .: :.
CCDS42 MATITMQAYSRGFLARRRYRKMLEEHKAVILQKYARAWLARRRFQSIR----------RF
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...: . .: .:. .. ::: :.... ... :: :. : . :... :.
CCDS42 EKEIELLQAQK--IDVEKHVQSQKR--EMREKMSEITKQLL--ESYDIEDVRSRLSVEDL
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CCDS42 -INHLQKLFREENDINES----IRHEVT-----RLTSENMMIPDFKQQISELEKQK---Q
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CCDS42 LIDKIQEMQEASDHLKKQF------ETESEVKCNFRQEASRLTLENRDLEEELDMKDRVI
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CCDS42 KKLQDQVKTLSKTIGKANDVHSSSG--------------------PKEYLGMLQYKREDE
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CCDS42 AKLIQNLILDLKPRGVVVNMIPGLPAHILFMCVRYADSLNDANMLKSLMNSTINGIKQVV
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..:.::.:.: : : .::.:: .::: ::.::.::.::::.::::::. : :. : . .
CCDS42 VAIRIYHQFIIIMEKNIQPIIVPGMLEYESLQGISGLKPTGFRKRSSSIDDTDG-YTMTS
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CCDS42 VLQQLSYFYTTMCQNGLDPELVRQAVKQLFFLIGAVTLNSLFLRKDMCSCRKGMQIRCNI
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pF1KA1 SQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEPLIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKIL
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CCDS42 SYLEEWLKDKNLQNSLAKETLEPLSQAAWLLQVKKTTDSDAKEIYERCTSLSAVQIIKIL
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pF1KA1 NLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQAQLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHI
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CCDS42 NSYTPIDDFEKRVTPSFVRKVQALLNSREDSSQLMLDTKYLFQVTFPFTPSPHALEMIQI
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1840
pF1KA1 PACLNLEFLNEV
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CCDS42 PSSFKLGFLNRL
1740
>>CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938 aa)
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10 20 30 40
pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRL
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CCDS10 QLSDDEKFLFVDKNFINSPVAQADWAAKRLVWVPSEKQGFEAASI-KEEKGDEVVVELVE
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pF1KA1 EDETILEYPIDVQRNQLPFLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTY
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CCDS10 NGKKVTVGKDDIQKM------NPPKFSKVEDMAELTCLNEASVLHNLRERYF-SGLIYTY
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pF1KA1 CGIVLVAINPYEQLPIYGQDVIYAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVS
:. :..:::..::::.. .. :.:.. .: :::.:.:. ::..: .:...:::. .
CCDS10 SGLFCVVVNPYKHLPIYSEKIVDMYKGKKRHEMPPHIYAIADTAYRSMLQDREDQSILCT
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:::::::: ..: ...:.:.:..: ..:.: :...: ..::.::.:::::..::
CCDS10 GESGAGKTENTKKVIQYLAVVASSHKGKKDTSITGELEKQLLQANPILEAFGNAKTVKND
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CCDS10 NSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAIRQARDERTFHIFYYMIAGAKEKMRS
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pF1KA1 ELALTSAEDFFYTSQGGDTSIEGVDDAEDFEKTRQAFTLLGVKESHQMSIFKIIASILHL
.: : . ... . :.: . : ...: : :..: .:....: .: .:.::.:...:.:.:
CCDS10 DLLLEGFNNYTFLSNGF-VPIPAAQDDEMFQETVEAMAIMGFSEEEQLSILKVVSSVLQL
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:..... ::. :. :. :... .. :.:.:.. ... . . .. . .. :... .
CCDS10 GNIVFKKERNTDQASM-PDNTAAQKVCHLMGINVTDFTRSILTPRIKVGRDVVQKAQTKE
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:. : .:::: : .:: ::. ..:::: . .: ::.:.::: ::: ::::::::.:
CCDS10 QADFAVEALAKATYERLFRWILTRVNKALDKTHRQGASFLGILDIAGFEIFEVNSFEQLC
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CCDS10 INYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIELIERPNNPPGVLALL
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:::: ::.::.....:: ...: .::::.. ..: : :.:.: ::.: ....: ::
CCDS10 DEECWFPKATDKSFVEKLCTEQGSHPKFQKPKQLKDKTEFSIIHYAGKVDYNASAWLTKN
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: . .. ..:.::. .::::..: : : . .:.. .:. : . ..:
CCDS10 MDPLNDNVTSLLNASSDKFVADLWKDVDRIV-----GLDQMAKMT-ESSLPSASKTKKGM
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.:::. .. .: :: :: :::..:::: :: :: ..: ...::: :::: ::
CCDS10 FRTVGQLYKEQLGKLMTTLRNTTPNFVRCIIPNHEKRSGKLDAFLVLEQLRCNGVLEGIR
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pF1KA1 EALKEEMDKQQQTFCQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENL-----DLKELVEKLEKNE
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CCDS11 EAEAREKETKALSLARALEEALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSK
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CCDS11 RALEQQVEEMRTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLL
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CCDS11 IKQ-VRELEAELEDERKQRALAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQ
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CCDS13 GVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNW
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. : . . : .: .:: . . . ... ::. .:. :.. : .
CCDS13 QWWRLFTKVKPL-----LQVSRQEEEMMAKEEELVK-------VRE--KQLAAENRLTEM
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CCDS13 ETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETEL-CAEAEELRARLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEER
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pF1KA1 L-NVGMENKVVQLQ-RKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVERLKKELVHYQQSP---
.. :.: .: . ....:: .: .. ..:.. : ....:..: . ...
CCDS13 CQHLQAEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEEQIILEDQNCKL
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pF1KA1 GEDTSL---RLQEEVESLRTELQRAHSERKI----------LEDAHSRE---KDELRKRV
... .: :. : . .: : ....: :. ::. :: ..::.:
CCDS13 AKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTR
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:: ... :.:. .:. :: . : ..:.. . . . . .::: .. . .:. .
CCDS13 RKLEGDSTDLSDQIAELQAQI-AELKMQLAKKEEELQAALAR-VEEEAAQKNMALKKIRE
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pF1KA1 LEQRYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGL
::.. ..:.... .. :: ..... . . ...: :. :: :. .:.
CCDS13 LESQISELQEDL----ESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKT-ELEDTLDSTAAQQELR-
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CCDS13 SKREQEVNILKKT------LEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLE
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.: ::.: .: :... : .. .: : : . . . ::. ::.:
CCDS13 KA---KQTLENERGELANEVKVLLQGKGD------SEH----KRKKVEAQLQ----ELQV
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pF1KA1 RKEEVLILRTQIVSADQRRLAGRNAE-PNINARSSWPNSEKHVDQED--AIEAYHGVCQT
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CCDS13 KFNEGERVRTEL--AD--KVTKLQVELDNVTGLLSQSDSKSSKLTKDFSALES-----QL
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CCDS96 KRENKNLQEEISDL--TEQLGSSGKTIHELEKVRKQLEAEKMELQSALE---EAEASLEH
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CCDS96 EEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHLRVVDSLQTSLDAETRSRNEALR
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pF1KA1 LSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVSAMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYC
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CCDS96 VERRNNLLQAELEELRAVVEQTERSRKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMDAD
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pF1KA1 LEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIILQVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLR
CCDS96 LSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDL
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pF1KA1 PPMKVSNKEHKKTVGHQFRTSLHLLMETLNATTPHYVRCIKPNDEKLPFHFDPKRAVQQL
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CCDS11 -----------QTVSALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHELVLHQL
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pF1KA1 RACGVLETIRISAAGYPSRWAYHDFFNRYRVLVKKR--ELANTDKKAICRSVLENLIKDP
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CCDS11 RCNGVLEGIRICRKGFPSRILYGDFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLASIDIDH
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CCDS11 TQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDEKLAQIITRTQAVCRGFLMRVEYQKMLQRREAL--
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.: . .: . . .. .. .... .. . .. :.. . : :. ...
CCDS11 FCIQYNVRAFMN----VKHWPWMKLFFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFQKTKDELAKSE
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CCDS11 AKRKELEEKMVTLLKEKNDLQLQVQSEADSLADAEERCE-QLIKNKIQLEAKIKEVTERA
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pF1KA1 EHLKRLNVGMENKVVQLQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVERLKKELVHY-QQS
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CCDS11 EEEEEINAELTAK----KRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEM
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pF1KA1 PGEDTSL-RLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDA---HSREKDELRKRVADLE----QEN
: : .. .:..: ..:. :.. .. . :: .. : .:...: ::: ::.
CCDS11 AGLDETIAKLSKEKKALQETHQQTLDDLQAEEDKVNILTKAKTKLEQQVDDLEGSLEQEK
990 1000 1010 1020 1030 1040
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