Result of FASTA (omim) for
pF1KA1115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1115, 881 aa
1>>>pF1KA1115 881 - 881 aa - 881 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8793+/-0.000433; mu= -12.2738+/- 0.027
mean_var=499.3446+/-101.927, 0's: 0 Z-trim(123.1): 101 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.057395
statistics sampled from 42304 (42408) to 42304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 16.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055746 (OMIM: 610875) serine/threonine-protein ( 881) 5897 503.5 1.8e-141
XP_006718676 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 873) 2145 192.8 6e-48
XP_016873452 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 873) 2145 192.8 6e-48
NP_001157633 (OMIM: 610879) serine/threonine-prote ( 873) 2145 192.8 6e-48
NP_001157632 (OMIM: 610879) serine/threonine-prote ( 879) 2135 192.0 1.1e-47
XP_016873451 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 879) 2135 192.0 1.1e-47
XP_011543442 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 879) 2135 192.0 1.1e-47
XP_006718671 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 883) 2124 191.1 2e-47
XP_011543439 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 889) 2111 190.0 4.3e-47
XP_011543440 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 889) 2111 190.0 4.3e-47
XP_011543437 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 889) 2111 190.0 4.3e-47
XP_011543438 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 889) 2111 190.0 4.3e-47
XP_016873453 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 873) 1837 167.3 2.9e-40
XP_016873454 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 873) 1837 167.3 2.9e-40
XP_006718675 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 877) 1830 166.7 4.3e-40
NP_001157634 (OMIM: 610879) serine/threonine-prote ( 867) 1828 166.6 4.8e-40
XP_016873455 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 867) 1828 166.6 4.8e-40
XP_006718677 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 867) 1828 166.6 4.8e-40
XP_011543443 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 872) 1820 165.9 7.6e-40
XP_016873457 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 862) 1818 165.7 8.4e-40
XP_016873456 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 862) 1818 165.7 8.4e-40
XP_011543441 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 883) 1816 165.6 9.6e-40
XP_016873459 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 856) 1804 164.6 1.9e-39
XP_016873458 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 856) 1804 164.6 1.9e-39
XP_016873469 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 782) 1716 157.2 2.7e-37
XP_016873467 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 788) 1706 156.4 4.9e-37
XP_016873466 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 788) 1706 156.4 4.9e-37
XP_006718684 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 827) 1700 155.9 7.1e-37
XP_016873464 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 833) 1700 155.9 7.2e-37
XP_006718690 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 601) 1695 155.4 7.5e-37
XP_006718681 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 844) 1694 155.4 1e-36
NP_001157635 (OMIM: 610879) serine/threonine-prote ( 844) 1694 155.4 1e-36
XP_016873461 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 850) 1694 155.4 1e-36
XP_016873462 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 850) 1694 155.4 1e-36
XP_016873460 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 850) 1694 155.4 1e-36
XP_011543444 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 860) 1694 155.5 1e-36
XP_016873463 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 844) 1686 154.8 1.6e-36
XP_011543445 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 854) 1686 154.8 1.6e-36
XP_016873468 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 786) 1401 131.2 1.9e-29
XP_016873470 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 765) 1375 129.0 8.5e-29
NP_001157636 (OMIM: 610879) serine/threonine-prote ( 791) 1350 126.9 3.7e-28
XP_006718687 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 793) 1350 126.9 3.7e-28
NP_060782 (OMIM: 610879) serine/threonine-protein ( 793) 1350 126.9 3.7e-28
XP_006718685 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 803) 1350 126.9 3.7e-28
XP_006718686 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 803) 1350 126.9 3.7e-28
XP_016873465 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 805) 1350 126.9 3.7e-28
XP_011543447 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 838) 1350 127.0 3.8e-28
XP_016873472 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 630) 1283 121.3 1.4e-26
XP_016873471 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/thre ( 753) 1265 119.9 4.6e-26
NP_001229827 (OMIM: 610877) serine/threonine-prote ( 959) 1265 120.0 5.5e-26
>>NP_055746 (OMIM: 610875) serine/threonine-protein phos (881 aa)
initn: 5897 init1: 5897 opt: 5897 Z-score: 2660.8 bits: 503.5 E(85289): 1.8e-141
Smith-Waterman score: 5897; 100.0% identity (100.0% similar) in 881 aa overlap (1-881:1-881)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHTSSHLDTLLEREDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLDFLLQPPHLQAMVAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MFWKFDLHTSSHLDTLLEREDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLDFLLQPPHLQAMVAW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 VTQEPPDSGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRLYGFLQSTGSLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VTQEPPDSGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRLYGFLQSTGSLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASFFSKVMGILINRKTDQLVSFLRKKDDFVDLLLQHIGTSAIMDLLLRLLTCVERPQLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASFFSKVMGILINRKTDQLVSFLRKKDDFVDLLLQHIGTSAIMDLLLRLLTCVERPQLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVVNWLNEEKIVQRLIEQIHPSKDENQHSNASQSLCDIIRLSREQMIQVQDSPEPDQLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DVVNWLNEEKIVQRLIEQIHPSKDENQHSNASQSLCDIIRLSREQMIQVQDSPEPDQLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLEKQETIEQLLSNMFEGEQSQSVIVSGIQVLLTLLEPRRPRSESVTVNSFFSSVDGQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TLEKQETIEQLLSNMFEGEQSQSVIVSGIQVLLTLLEPRRPRSESVTVNSFFSSVDGQLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLAQGALESTVSSVGALHALRPRLSCFHQLLLEPPKLEPLQMTWGMLAPPLGNTRLHVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLAQGALESTVSSVGALHALRPRLSCFHQLLLEPPKLEPLQMTWGMLAPPLGNTRLHVVK
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 LLASALSANDAALTHELLALDVPNTMLDLFFHYVFNNFLHAQVEGCVSTMLSLGPPPDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLASALSANDAALTHELLALDVPNTMLDLFFHYVFNNFLHAQVEGCVSTMLSLGPPPDSS
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 PETPIQNPVVKHLLQQCRLVERILTSWEENDRVQCAGGPRKGYMGHLTRVAGALVQNTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PETPIQNPVVKHLLQQCRLVERILTSWEENDRVQCAGGPRKGYMGHLTRVAGALVQNTEK
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pF1KA1 GPNAEQLRQLLKELPSEQQEQWEAFVSGPLAETNKKNMVDLVNTHHLHSSSDDEDDRLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPNAEQLRQLLKELPSEQQEQWEAFVSGPLAETNKKNMVDLVNTHHLHSSSDDEDDRLKE
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pF1KA1 FNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTANITFSLNAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTANITFSLNAD
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 DENPNANLLEICYKDRIQQFDDDEEEEDEEEAQGSGESDGEDGAWQGSQLARGARLGQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DENPNANLLEICYKDRIQQFDDDEEEEDEEEAQGSGESDGEDGAWQGSQLARGARLGQPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 GVRSGGSTDSEDEEEEDEEEEEDEEGIGCAARGGATPLSYPSPGPQPPGPSWTATFDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GVRSGGSTDSEDEEEEDEEEEEDEEGIGCAARGGATPLSYPSPGPQPPGPSWTATFDPVP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TDAPTSPRVSGEEELHTGPPAPQGPLSVPQGLPTQSLASPPARDALQLRSQDPTPPSAPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TDAPTSPRVSGEEELHTGPPAPQGPLSVPQGLPTQSLASPPARDALQLRSQDPTPPSAPQ
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790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EATEGSKVTEPSAPCQALVSIGDLQATFHGIRSAPSSSDSATRDPSTSVPASGAHQPPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EATEGSKVTEPSAPCQALVSIGDLQATFHGIRSAPSSSDSATRDPSTSVPASGAHQPPQT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KA1 TEGEKSPEPLGLPQSQSAQALTPPPIPNGSAPEGPASPGSQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TEGEKSPEPLGLPQSQSAQALTPPPIPNGSAPEGPASPGSQ
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>>XP_006718676 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/threonin (873 aa)
initn: 2227 init1: 1344 opt: 2145 Z-score: 981.8 bits: 192.8 E(85289): 6e-48
Smith-Waterman score: 2517; 46.6% identity (71.8% similar) in 914 aa overlap (1-875:1-872)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHTSSHLDTLLEREDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLDFLLQPPHLQAMVAW
::::::::.:::.::::::::..: ::.::::::::::. ::::..:::. :. .:..
XP_006 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
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pF1KA1 VTQEPPDSGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRLYGFLQSTGSLNPLL
. .:::.. .:..:::::...::.::::: :.:: :: ::::: .::.:: . . :::::
XP_006 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
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pF1KA1 ASFFSKVMGILINRKTDQLVSFLRKKDDFVDLLLQHIGTSAIMDLLLRLLTCVERPQLRQ
:::::::..:::.:: .:.:.::.:: :::::...:::::::::::::::::.: :: ::
XP_006 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
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pF1KA1 DVVNWLNEEKIVQRLIEQIHPSKDENQHSNASQSLCDIIRLSREQMIQVQDSPEPDQLLA
::.::::::::.:::.: .:::..:..:::::::::.:.::::.::.:.:.: ::: :::
XP_006 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 TLEKQETIEQLLSNMFEGEQSQSVIVSGIQVLLTLLEPRRPRSESVTVNSFFSSVDGQLE
:::::: :::::::.:. :...:.:::.::.:::::: ::: . .:..:
XP_006 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRP------------TFEGHIE
250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KA1 LLAQGALESTVS-SVGALHALRPRLSCFHQLLLEPPKLEPLQMTWGMLAPPLGNTRLHVV
. : .:. : . ..:.:.: ::. ::.::::::: .. :::.: ::.:::::.:.
XP_006 ICPPGMSHSACSVNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVI
290 300 310 320 330 340
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pF1KA1 KLLASALSANDAALTHELLALDVPNTMLDLFFHYVFNNFLHAQVEGCVSTMLSLGPPPDS
.:..: :..: .... .:. :. ...:..::.:..:::::.::: :.. .:. : ..
XP_006 RLISSLLQTNTSSINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILA--SPFEN
350 360 370 380 390 400
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pF1KA1 SPETPI-------QNPVVKHLLQQCRLVERILTSWEENDRVQCAGGPRKGYMGHLTRVAG
. .. : .: ..:::.:.:.:.:::: .:: :.. : :: :.::::::::.:.
XP_006 TENATITDQDSTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIAN
410 420 430 440 450 460
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pF1KA1 ALVQNTEKGPNAEQLRQLLKELPSEQQEQWEAFVSGPLAETNKKNMVDLVNTHHLHSSSD
.:..:.::::. ..::.:.::.: .:.::.: .. :.::::.: ::::.: :.:::::
XP_006 CIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSD
470 480 490 500 510 520
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pF1KA1 DEDDRLKEFNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTAN
:: : .:: .: ... ::::: :.:::.::: :::.::::::.:..:.. :. ::....
XP_006 DEID-FKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSD
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 ITFSLNADDENPNANLLEICYKDRIQQFDDDEEEEDEEEAQGSGESDGEDGAWQGSQLAR
:.:.::.. :. : :.: : :.::::::: : :: :: :. ...:
XP_006 INFTLNTN-ESGNIALFEACCKERIQQFDD-------------GGSDEED-IWEEKHIAF
590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 GARLGQPPGVR--SGGSTDSEDEEEEDEEEEEDEEGIGCAARGGATPLSYPSPGPQPPGP
: . : :.:::::: : : :::. . .. : .. .: :
XP_006 -----TPESQRRSSSGSTDSE--ESTDSEEEDGAKQDLFEPSSANTEDKMEVDLSEP--P
640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KA1 SWTATFD-PV------PTDAPTSPRVSGEEELHTGPPAPQGPLSVPQGLPTQ-SLAS-PP
.:.:.:: :. : :. : : :: . : . . ..: :. :: : :
XP_006 NWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSP
690 700 710 720 730 740
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pF1KA1 ARDALQLRSQDPTPPSA------PQEA--------TEGSKVTEPSAPCQALVSIGDLQAT
.. . . .:: ::: :. : ..: . .: . : : .. :
XP_006 VEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTETVMNGGMKET
750 760 770 780 790 800
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 FHGIRSAPS-----SSDSATRDPSTSVPASGAHQPPQTTEGE-KSPEPLGLPQSQSAQAL
. .: . .:. . . : .. . :.. :.:.:.. .:.: :.:. :
XP_006 LSLTVDAKTETAVFKSEEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEAKCAAPRP---PSSSPEQRT
810 820 830 840 850
870 880
pF1KA1 TPPPIPNGSAPEGPASPGSQ
: :. .. .::
XP_006 GQPSAPGDTSVNGPV
860 870
>>XP_016873452 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/threonin (873 aa)
initn: 2227 init1: 1344 opt: 2145 Z-score: 981.8 bits: 192.8 E(85289): 6e-48
Smith-Waterman score: 2517; 46.6% identity (71.8% similar) in 914 aa overlap (1-875:1-872)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHTSSHLDTLLEREDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLDFLLQPPHLQAMVAW
::::::::.:::.::::::::..: ::.::::::::::. ::::..:::. :. .:..
XP_016 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 VTQEPPDSGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRLYGFLQSTGSLNPLL
. .:::.. .:..:::::...::.::::: :.:: :: ::::: .::.:: . . :::::
XP_016 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
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pF1KA1 SPGSQ
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XP_006 SDACLLLLRTGQPSAPGDTSVNGPV
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>>XP_011543439 (OMIM: 610879) PREDICTED: serine/threonin (889 aa)
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XP_011 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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XP_011 ICPPGMSHSACSVNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVI
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XP_011 CIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSD
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pF1KA1 DEDDRLKEFNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTAN
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XP_011 DEID-FKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSD
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pF1KA1 ITFSLNADDENPNANLLEICYKDRIQQFDDDEEEEDEEEAQGSGESDGEDGAWQGSQLAR
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XP_011 INFTLNTN-ESGNIALFEACCKERIQQFDD-------------GGSDEED-IWEEKHIAF
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XP_011 -----TPESQRRSSSGSTDSE--ESTDSEEEDGAKQDLFEPSSANTEDKMEVDLSEPP--
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XP_011 NWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSP
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pF1KA1 ARDALQLRSQDPTPPSAP----QEATEGSKVTEPSAPCQALVSIGDLQATFHGIRSAPSS
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XP_011 VEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGEEDAESTD-KVTETVMNGGMKE
750 760 770 780 790 800
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pF1KA1 SDSATRDPSTSVPASGAHQPPQTTEGEKSPEPLGLPQS-----QSAQALTPPPIPNGSAP
. : : : .: . . ::. : . .. ..:.: : : .:.:
XP_011 TLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEAKCAAPRPPSSSP
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pF1KA1 EGPASPGSQ
: ::
XP_011 EQSASDACLLLLRTGQPSAPGDTSVNGPV
870 880
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