Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1111
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1111, 1060 aa
1>>>pF1KA1111 1060 - 1060 aa - 1060 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3770+/-0.000944; mu= 8.8049+/- 0.057
mean_var=179.8049+/-36.271, 0's: 0 Z-trim(110.9): 25 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.095647
statistics sampled from 11957 (11977) to 11957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 4.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55420.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1060) 7083 990.5 0
CCDS14355.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1024) 6846 957.8 0
CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX ( 878) 4593 646.8 5.8e-185
CCDS55418.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX ( 948) 3166 450.0 1.2e-125
CCDS35069.1 PHF2 gene_id:5253|Hs108|chr9 (1096) 2069 298.6 4.8e-80
CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7 ( 941) 2044 295.1 4.7e-79
CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265) 644 102.0 8.5e-21
CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162) 643 101.9 8.7e-21
CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336) 644 102.0 8.8e-21
>>CCDS55420.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1060 aa)
initn: 7083 init1: 7083 opt: 7083 Z-score: 5289.9 bits: 990.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7083; 100.0% identity (100.0% similar) in 1060 aa overlap (1-1060:1-1060)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MNRSRAIVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MNRSRAIVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 MCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 IFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 QQNVGKTSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQNVGKTSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ERKGKESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ERKGKESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 GSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 AWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 RVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 TPQLVTSSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TPQLVTSSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KA1 SVGSQSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVGSQSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
1030 1040 1050 1060
>>CCDS14355.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1024 aa)
initn: 6846 init1: 6846 opt: 6846 Z-score: 5113.4 bits: 957.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6846; 100.0% identity (100.0% similar) in 1024 aa overlap (37-1060:1-1024)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 IVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGG
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGG
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFK
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIE
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVT
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQS
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060
pF1KA1 NQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
1000 1010 1020
>>CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (878 aa)
initn: 5724 init1: 4589 opt: 4593 Z-score: 3434.2 bits: 646.8 E(32554): 5.8e-185
Smith-Waterman score: 5692; 96.8% identity (97.3% similar) in 884 aa overlap (37-919:1-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 IVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEG----------
640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ILDLLKASRQVGGPDYA-ALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTG
:.. : : . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 --------YQTATPAPAQGASEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTG
690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACF
740 750 760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 KDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASI
800 810 820 830 840 850
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 ETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLV
::::::::::::::
CCDS55 ETGLAAAAAKLAQQVKKMKLSLTDSG
860 870
>>CCDS55418.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (948 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 IVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVE---------
400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
CCDS55 ------------------------------------------------------------
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 --------------------------------FNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESPLA
450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLGKEKA
470 480 490 500 510 520
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGG
530 540 550 560 570 580
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGG
590 600 610 620 630 640
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFK
650 660 670 680 690 700
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIE
710 720 730 740 750 760
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVT
770 780 790 800 810 820
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQS
830 840 850 860 870 880
1030 1040 1050 1060
pF1KA1 NQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
890 900 910 920 930 940
>>CCDS35069.1 PHF2 gene_id:5253|Hs108|chr9 (1096 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 IVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
::.:::::.::::::::::::::: :.:::
CCDS35 MATVPVYCVCRLPYDVTRFMIECDACKDWF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKG---KPVKTGSPTF
::::::::::.: :::.::::::: :: : .::.: : : .. :::..:: :
CCDS35 HGSCVGVEEEEAPDIDIYHCPNCEKTHGKSTLKKKRTWHK-HGPGQAPDVKPVQNGSQLF
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDV
..::::::: :...:. . :.:::. ..::..:. :::: ::::::...:.:.: : ::
CCDS35 IKELRSRTFPSAEDVVARVPGSQLTLGYMEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDV
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 EHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETP
:.::: .. .:: :::.: :::::: .:: :::: .:..:::: .:::::::.:..:: :
CCDS35 ENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFY
::.::::::: ::.. .. .:.: ::::. :.::::::::: ::.:.::::::::: ::
CCDS35 DIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFY
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDC
::::..::..:.: : :.::..::::.::::::::: ::::::::::.:::.:.::::::
CCDS35 LIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVDKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDC
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRR
:::.:.:::::..:::..:::.:.::. ..: .:::::: :::.:::.:. :.: ... .
CCDS35 LAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSLTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGK
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 HPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQ--
. .::.:.: :: :::.::.:.:: .::::.:: . :::::::.:::: :. .
CCDS35 QLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KA1 ----QNVGKTSNIFGLQRI--FPAGSIPLTRP-------AHSTSVSMSRLSLPSKNGSKK
..:...... .: : . : : : ... . . .. ::: .
CCDS35 RPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATPPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPP
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KA1 KGLKP----KELFKK--AERKGKESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQAL------KTGSFQK
: :: : : : ...:::.: . . .:.......:: : :. :
CCDS35 KPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASPTIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATK
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KA1 AKFNITGACLNDSDDDSPDLDLD-------------GNESPLALLMSNGSTKRVKS-LSK
. ... . . ..: :.. : .: .:: . : :: :.
CCDS35 SVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAG
570 580 590 600 610 620
630 640 650
pF1KA1 SRRTKIAKKVDKARLMAEQVME-----------------------DEFDLDSDD-ELQID
.. .:.. . .. .:.. .... ::.. ::: ::.::
CCDS35 NKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFGALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKID
630 640 650 660 670 680
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 ERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDE-------DMV
: ..: . :: .. : :. : .: . : ..:: :
CCDS35 EFPIRRKKNA---PKRDLSFLLDKKAVLPTPVTKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTK
690 700 710 720 730 740
720 730 740 750 760
pF1KA1 EGVEGKLG--NGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQS
: .... .::.:.::::::.::..::. .: .. :::::::::::::: :::::.
CCDS35 PGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYNPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQA
750 760 770 780 790 800
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 SSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEE
:.: ::. : .:: ..::: .. :. .:. .: .. ::: .:: : .. ..
CCDS35 SDSC-----LQTTWGAGQ--AKGSSLAAHGARKNGGGSGKSAGKRLLKRAAKNSVDLDDY
810 820 830 840 850
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 EENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTL
:: ::: : :::::..:.:::::::.:.: .::: ::.:.:::::.:: ::: :..
CCDS35 EE-----EQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGSDDAPYSPTARVGPSV
860 870 880 890 900 910
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 PKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDS--
:.:::::::::::::::::::::::::.::: ::..::: :.: : .. .: . :
CCDS35 PRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRK-LTPNTTSPSTSTSIS
920 930 940 950 960 970
950 960 970 980 990
pF1KA1 ---NLSLTVPAPTVAA--TPQLVTSSSPLPP-----PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAF
. . :.:: :. : :: ....: ::: :. :.::::::::: ..:
CCDS35 AGTTSTSTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPPESHSSSLADHEYTA-AGTF
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 GMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGK
:::.:.. ::::::::::::::
CCDS35 TGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKGMATAKQRLGKILKIHRNG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7 (941 aa)
initn: 2245 init1: 1635 opt: 2044 Z-score: 1532.8 bits: 295.1 E(32554): 4.7e-79
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20 30 40 50 60 70
pF1KA1 GRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
CCDS43 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KA1 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
CCDS43 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS43 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS43 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS43 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
CCDS43 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
CCDS43 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .: ..: ::
CCDS43 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIE---EEN-GK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 TSNIFGLQRIFPAGSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKE
. : ::.. : :: : : :..: :: ..
CCDS43 PVKSQG---------IPIVCP-----VSRSSNEATSPYHSRRK-----------MRKLRD
490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDS-----DDDSPDLDLDGN
.. :. . .... .....:: . . .: .. :: . . .: . ..
CCDS43 HNVRTPS---NLDILELHTREVLKRLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERL
.. : ::..:: . :..: .: :.. :.. :.. . ...:.:
CCDS43 DNDLRLLLTNGR------IIKDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESS
580 590 600 610 620
670 680 690 700 710
pF1KA1 G-----KEKATLIIRPKFPR---KL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVE
: .:.. . : : .: :.. :: .. .. : .. .::.:.
CCDS43 GVEGVEHEESQKPLNGFFTRVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESS
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KA1 GVEGK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANL
: : : .: . .... ..:. :.. . . : :.: ::.: :::::: ::.:
CCDS43 GDEKKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGL
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 QSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESE
. :. ..:. .:. : . :: : :: . : .:.. . .::
CCDS43 HYSTC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTE--
750 760 770 780 790
830 840 850 860 870 880
pF1KA1 EEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTP
:: :.. :. : . . :.
CCDS43 ---------------------------------DPDLRTSSWIKQ-FDTSRFHPQ-----
800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KA1 TLPKQDRPVR-EGTRVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRP-Q
: .... .: ::. : :..:...:. .. . ... . :
CCDS43 DLSRSQKCIRKEGSSEIS-----------------QRVQSRNYVDSSG--SSLQNGKYMQ
820 830 840 850 860
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 DSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRS
.:::. ... :. :.. : : .: :. : :. : : :: .
CCDS43 NSNLT--------SGACQI--SNGSLSPERPVGET-SFSVPLHP-TKRP----------A
870 880 890
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 TTPMAPGVFLTQRRPSVGSQSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
..: : . :::: .:::::::.::::::::.:::..:::
CCDS43 SNP-----------PPI---SNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
900 910 920 930 940
>>CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265 aa)
initn: 995 init1: 644 opt: 644 Z-score: 486.9 bits: 102.0 E(32554): 8.5e-21
Smith-Waterman score: 981; 47.3% identity (75.7% similar) in 296 aa overlap (126-407:42-335)
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 SIMKKRRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEEN
.:::. ... . . :.... :.....
CCDS41 RPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQLYQG--DFVHAMEGKDFNYEYVQRE
20 30 40 50 60
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]