Result of FASTA (omim) for
pF1KA1065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1065, 641 aa
1>>>pF1KA1065 641 - 641 aa - 641 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8580+/-0.000422; mu= -11.2126+/- 0.026
mean_var=345.5358+/-72.212, 0's: 0 Z-trim(121.1): 44 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.068997
statistics sampled from 37144 (37188) to 37144 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.436), width: 16
Scan time: 12.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo s ( 641) 4239 436.1 1.8e-121
NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo s ( 584) 2533 266.3 2.2e-70
NP_001096134 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform c [Hom ( 356) 2357 248.6 2.8e-65
NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens] ( 632) 1064 120.1 2.5e-26
XP_011525182 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 575) 974 111.1 1.1e-23
NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Hom ( 575) 974 111.1 1.1e-23
NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Hom ( 576) 973 111.0 1.2e-23
XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 576) 973 111.0 1.2e-23
XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 973 111.0 1.3e-23
XP_016882212 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 973 111.0 1.3e-23
XP_016882211 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 550) 944 108.1 8.7e-23
NP_037465 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform c [Homo s ( 550) 944 108.1 8.7e-23
XP_011525183 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 551) 944 108.1 8.7e-23
XP_016882214 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 611) 944 108.1 9.5e-23
NP_001123543 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform a [Hom ( 662) 944 108.1 1e-22
NP_055481 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 iso ( 625) 559 69.8 3.3e-11
NP_001182484 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 ( 643) 558 69.7 3.6e-11
NP_001182485 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 ( 625) 544 68.3 9.3e-11
XP_016865577 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 468) 533 67.1 1.6e-10
XP_016865576 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 518) 533 67.2 1.7e-10
XP_011533003 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 536) 533 67.2 1.8e-10
>>NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo sapie (641 aa)
initn: 4239 init1: 4239 opt: 4239 Z-score: 2301.7 bits: 436.1 E(85289): 1.8e-121
Smith-Waterman score: 4239; 99.8% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_055 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KA1 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
610 620 630 640
>>NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo sapie (584 aa)
initn: 2533 init1: 2533 opt: 2533 Z-score: 1384.5 bits: 266.3 E(85289): 2.2e-70
Smith-Waterman score: 3695; 91.0% identity (91.1% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
:::::::::::::::::::
NP_683 HSEQEYGKAGGSPASYHGS-----------------------------------------
190
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 ----------------TSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_683 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASS
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640
pF1KA1 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_683 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
550 560 570 580
>>NP_001096134 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform c [Homo sa (356 aa)
initn: 2357 init1: 2357 opt: 2357 Z-score: 1293.0 bits: 248.6 E(85289): 2.8e-65
Smith-Waterman score: 2357; 99.7% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (286-641:1-356)
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRD
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRD
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 TVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSASTNQTNPWGGPAAPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSASTNQTNPWGGPAAPAST
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 SDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTT
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTT
100 110 120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 KPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPDPFESQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPDPFESQPL
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 TVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQ
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPA
280 290 300 310 320 330
620 630 640
pF1KA1 MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
340 350
>>NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens] (632 aa)
initn: 1205 init1: 929 opt: 1064 Z-score: 593.8 bits: 120.1 E(85289): 2.5e-26
Smith-Waterman score: 1392; 42.7% identity (60.6% similar) in 714 aa overlap (1-640:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::..:::.::::.:::::::::::::::::::: ::::.::::::.:.:::.:.:.:.
NP_060 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.:::: :::::::::::::::::.::::::::.:::::...::::::::::::::::::
NP_060 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.::::: ::..:::::::::. ::..::::::::: . :.::.:. :.:
NP_060 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSR---------R
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
..: .:... :::.::..:
NP_060 YGE-DYSRSRGSPSSYNSS-----------------------------------------
180
250 260 270 280 290
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQE--ERLR
..::: .:.::::::::::::::::::::::::: ::. .
NP_060 ---------------SSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKPVPPASH
190 200 210 220 230
300 310 320
pF1KA1 RGDDLRLQMALEESR------------------------------RDTVKIPKKKEHGSL
: .::.::.::. :: :. . .:.:.
NP_060 RDEDLQLQLALRLSRQEHEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370
pF1KA1 PQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQK--AEPWG-PSASTNQT---NPWGGPAAP---------
.:...::: : . :. .: . . :.:: :. : . :: : :
NP_060 TSQSSILDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTV
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KA1 ASTSDPWPSFGTKPAASIDPWG----VPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDA
: :.:: : .: .::: .:.: : ..:::: .. : . . ..:
NP_060 LSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGRTPVLPAG------PPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADP
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WGA-VSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSL---PS---QN
::: . :. . ...:. :.. . . . . : ..: .. .: :: ..
NP_060 WGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQ
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KA1 NGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR--KTPESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLN
::: :: .. : : ..::. :: .::::::::.:. :::::::: : :.. :
NP_060 NGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRN
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 PFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLR-GSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAV-ASMT
:::. : : : :.::: ...: ::::.: :::.:: . :: : . ::. ::.
NP_060 PFLT-GLSAPS-PTNPFGAGEPGRPTLNQMRTGSPALGLAG--GPVGAPLGSMTYSASLP
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KA1 ---SAAPQPALGATGSSLTPLGPA-----MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:..: .. :. : . : .. .:.: : : ::: ::::
NP_060 LPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQ-TGT-NPFL
590 600 610 620 630
>>XP_011525182 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (575 aa)
initn: 1627 init1: 934 opt: 974 Z-score: 545.9 bits: 111.1 E(85289): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 1540; 47.1% identity (63.9% similar) in 656 aa overlap (1-600:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
XP_011 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
XP_011 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
XP_011 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRP
: . .. :..: :. :::: .:.:: :.
XP_011 ------------PEAEQAWPQSS-----------GE-EELQL---------QLALAMSKE
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRR
..: :: :. . :.. ::::::..::: ..:::.::
XP_011 EAD--QP-----------------------PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRR
200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---P
:::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
XP_011 GDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAP
240 250 260 270 280
360 370 380 390
pF1KA1 SASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGA
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
XP_011 MAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPA
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 TAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK---
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
XP_011 PAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAGGF
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KA1 ----DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPLT
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..:
XP_011 DTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPP
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-
.:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. :
XP_011 AATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVT
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGA
:::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
XP_011 NPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KA1 TGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
XP_011 FLL
>>NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Homo sa (575 aa)
initn: 1627 init1: 934 opt: 974 Z-score: 545.9 bits: 111.1 E(85289): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 1540; 47.1% identity (63.9% similar) in 656 aa overlap (1-600:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
NP_001 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
NP_001 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRP
: . .. :..: :. :::: .:.:: :.
NP_001 ------------PEAEQAWPQSS-----------GE-EELQL---------QLALAMSKE
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRR
..: :: :. . :.. ::::::..::: ..:::.::
NP_001 EAD--QP-----------------------PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRR
200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---P
:::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
NP_001 GDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAP
240 250 260 270 280
360 370 380 390
pF1KA1 SASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGA
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
NP_001 MAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPA
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 TAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK---
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
NP_001 PAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAGGF
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KA1 ----DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPLT
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..:
NP_001 DTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPP
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 VASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-
.:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. :
NP_001 AATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVT
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGA
:::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
NP_001 NPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KA1 TGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
NP_001 FLL
>>NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Homo sa (576 aa)
initn: 1527 init1: 934 opt: 973 Z-score: 545.4 bits: 111.0 E(85289): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 1538; 47.0% identity (63.8% similar) in 657 aa overlap (1-600:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
NP_001 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
NP_001 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRP
: . .. :..: :. :::: .:.:: :.
NP_001 ------------PEAEQAWPQSS-----------GE-EELQL---------QLALAMSKE
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRR
..: :: :. . :.. ::::::..::: ..:::.::
NP_001 EAD--QP-----------------------PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRR
200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---P
:::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
NP_001 GDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAP
240 250 260 270 280
360 370 380 390
pF1KA1 SASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGA
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
NP_001 MAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPA
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 TAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK---
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
NP_001 PAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KA1 -----DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPL
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..:
NP_001 FDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPP
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 TVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV
.:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. :
NP_001 PAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 -NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALG
:::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
NP_001 TNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTN
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KA1 ATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
NP_001 PFLL
>>XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (576 aa)
initn: 1527 init1: 934 opt: 973 Z-score: 545.4 bits: 111.0 E(85289): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 1538; 47.0% identity (63.8% similar) in 657 aa overlap (1-600:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
XP_005 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
XP_005 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
XP_005 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRP
: . .. :..: :. :::: .:.:: :.
XP_005 ------------PEAEQAWPQSS-----------GE-EELQL---------QLALAMSKE
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRR
..: :: :. . :.. ::::::..::: ..:::.::
XP_005 EAD--QP-----------------------PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRR
200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---P
:::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
XP_005 GDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAP
240 250 260 270 280
360 370 380 390
pF1KA1 SASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGA
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
XP_005 MAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPA
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 TAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK---
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
XP_005 PAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KA1 -----DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPL
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..:
XP_005 FDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPP
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 TVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV
.:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. :
XP_005 PAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 -NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALG
:::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
XP_005 TNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTN
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KA1 ATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
XP_005 PFLL
>>XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (636 aa)
initn: 1527 init1: 934 opt: 973 Z-score: 544.8 bits: 111.0 E(85289): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 1538; 47.0% identity (63.8% similar) in 657 aa overlap (1-600:61-629)
10 20 30
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSN
:.:::.::::::::.:::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 DPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMVWKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSE
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::..::::::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 RVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKT
::.:::.::..:.::::::::.::::::::.:::::.:::::::.::.::. :::.::::
XP_016 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRT
::..::.::. .: . ::. : : . .. :..:
XP_016 KEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----------------PEAEQAWPQSS-------
220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KA1 GAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRPNGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQAR
:. :::: .:.:: :. ..: ::
XP_016 ----GE-EELQL---------QLALAMSKEEAD--QP-----------------------
250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLP
:. . :.. ::::::..::: ..:::.:::::::::::.:::.:.: :.
XP_016 PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRRGDDLRLQMAIEESKRET---------GG-K
270 280 290 300 310
330 340 350 360 370
pF1KA1 QQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---PSASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW--
....:.:: :.. . .:: ..::: : :.. : .::::: .: . .:::
XP_016 EESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGG
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KA1 ----PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAW
:. : .::: :.:::: : : : . . :::..:. . .: ::: :
XP_016 PAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPW
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA1 G-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK--------DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---L
: . . : :. . ::: :.::.:: :::. :. : .. :
XP_016 TPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELEL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KA1 PSQNNGTTSPDPFE------------SQPLTVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDS
. . . :: :. ..: .:. :. .:::::::::::::::.:::
XP_016 LAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570
pF1KA1 LVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTST
::.::.: : :.. :::: :.:::. : :::: : ::::::: ::: :.
XP_016 LVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQAT
.. : :::. : : . : :
XP_016 TYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNPFLL
610 620 630
>>XP_016882212 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform (636 aa)
initn: 1527 init1: 934 opt: 973 Z-score: 544.8 bits: 111.0 E(85289): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 1538; 47.0% identity (63.8% similar) in 657 aa overlap (1-600:61-629)
10 20 30
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSN
:.:::.::::::::.:::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 DPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMVWKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSE
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::..::::::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 RVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKT
::.:::.::..:.::::::::.::::::::.:::::.:::::::.::.::. :::.::::
XP_016 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRT
::..::.::. .: . ::. : : . .. :..:
XP_016 KEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----------------PEAEQAWPQSS-------
220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KA1 GAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRPNGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQAR
:. :::: .:.:: :. ..: ::
XP_016 ----GE-EELQL---------QLALAMSKEEAD--QP-----------------------
250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLP
:. . :.. ::::::..::: ..:::.:::::::::::.:::.:.: :.
XP_016 PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRRGDDLRLQMAIEESKRET---------GG-K
270 280 290 300 310
330 340 350 360 370
pF1KA1 QQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---PSASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW--
....:.:: :.. . .:: ..::: : :.. : .::::: .: . .:::
XP_016 EESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGG
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KA1 ----PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAW
:. : .::: :.:::: : : : . . :::..:. . .: ::: :
XP_016 PAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPW
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA1 G-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK--------DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---L
: . . : :. . ::: :.::.:: :::. :. : .. :
XP_016 TPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELEL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KA1 PSQNNGTTSPDPFE------------SQPLTVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDS
. . . :: :. ..: .:. :. .:::::::::::::::.:::
XP_016 LAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570
pF1KA1 LVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTST
::.::.: : :.. :::: :.:::. : :::: : ::::::: ::: :.
XP_016 LVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQAT
.. : :::. : : . : :
XP_016 TYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNPFLL
610 620 630
641 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:19:45 2016 done: Fri Nov 4 01:19:47 2016
Total Scan time: 12.090 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]