Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1065, 641 aa
1>>>pF1KA1065 641 - 641 aa - 641 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6874+/-0.00106; mu= -4.3772+/- 0.063
mean_var=280.9107+/-57.897, 0's: 0 Z-trim(113.1): 31 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.076523
statistics sampled from 13763 (13789) to 13763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 3.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11203.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 ( 641) 4239 481.6 1.5e-135
CCDS11204.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 ( 584) 2533 293.2 6.7e-79
CCDS42277.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 ( 356) 2357 273.6 3.2e-73
CCDS11570.1 EPN3 gene_id:55040|Hs108|chr17 ( 632) 1064 131.0 4.7e-30
CCDS46199.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 576) 973 121.0 4.6e-27
CCDS46200.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 550) 944 117.8 4.1e-26
CCDS46198.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 ( 662) 944 117.8 4.8e-26
CCDS13998.1 ENTHD1 gene_id:150350|Hs108|chr22 ( 607) 716 92.6 1.7e-18
CCDS47330.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 625) 559 75.3 2.8e-13
CCDS56389.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 643) 558 75.2 3.1e-13
CCDS56388.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 ( 625) 544 73.6 8.9e-13
>>CCDS11203.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 (641 aa)
initn: 4239 init1: 4239 opt: 4239 Z-score: 2547.3 bits: 481.6 E(32554): 1.5e-135
Smith-Waterman score: 4239; 99.8% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KA1 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
610 620 630 640
>>CCDS11204.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 (584 aa)
initn: 2533 init1: 2533 opt: 2533 Z-score: 1530.0 bits: 293.2 E(32554): 6.7e-79
Smith-Waterman score: 3695; 91.0% identity (91.1% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
:::::::::::::::::::
CCDS11 HSEQEYGKAGGSPASYHGS-----------------------------------------
190
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ----------------TSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSAST
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 NQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASS
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQ
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFL
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQP
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640
pF1KA1 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
550 560 570 580
>>CCDS42277.1 EPN2 gene_id:22905|Hs108|chr17 (356 aa)
initn: 2357 init1: 2357 opt: 2357 Z-score: 1428.1 bits: 273.6 E(32554): 3.2e-73
Smith-Waterman score: 2357; 99.7% identity (100.0% similar) in 356 aa overlap (286-641:1-356)
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRD
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 TVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSASTNQTNPWGGPAAPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWGPSASTNQTNPWGGPAAPAST
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 SDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTT
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTT
100 110 120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 KPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPDPFESQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPDPFESQPL
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 TVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TVASSKPSSARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQ
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 VNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VNQPQPLTLNQLRGSPVLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPA
280 290 300 310 320 330
620 630 640
pF1KA1 MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
340 350
>>CCDS11570.1 EPN3 gene_id:55040|Hs108|chr17 (632 aa)
initn: 1205 init1: 929 opt: 1064 Z-score: 653.0 bits: 131.0 E(32554): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 1392; 42.7% identity (60.6% similar) in 714 aa overlap (1-640:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
::::..:::.::::.:::::::::::::::::::: ::::.::::::.:.:::.:.:.:.
CCDS11 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.:::: :::::::::::::::::.::::::::.:::::...::::::::::::::::::
CCDS11 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.::::: ::..:::::::::. ::..::::::::: . :.::.:. :.:
CCDS11 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSR---------R
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
..: .:... :::.::..:
CCDS11 YGE-DYSRSRGSPSSYNSS-----------------------------------------
180
250 260 270 280 290
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQE--ERLR
..::: .:.::::::::::::::::::::::::: ::. .
CCDS11 ---------------SSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKPVPPASH
190 200 210 220 230
300 310 320
pF1KA1 RGDDLRLQMALEESR------------------------------RDTVKIPKKKEHGSL
: .::.::.::. :: :. . .:.:.
CCDS11 RDEDLQLQLALRLSRQEHEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370
pF1KA1 PQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQK--AEPWG-PSASTNQT---NPWGGPAAP---------
.:...::: : . :. .: . . :.:: :. : . :: : :
CCDS11 TSQSSILDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTV
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KA1 ASTSDPWPSFGTKPAASIDPWG----VPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDA
: :.:: : .: .::: .:.: : ..:::: .. : . . ..:
CCDS11 LSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGRTPVLPAG------PPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADP
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WGA-VSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSL---PS---QN
::: . :. . ...:. :.. . . . . : ..: .. .: :: ..
CCDS11 WGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQ
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KA1 NGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR--KTPESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLN
::: :: .. : : ..::. :: .::::::::.:. :::::::: : :.. :
CCDS11 NGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRN
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 PFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLR-GSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAV-ASMT
:::. : : : :.::: ...: ::::.: :::.:: . :: : . ::. ::.
CCDS11 PFLT-GLSAPS-PTNPFGAGEPGRPTLNQMRTGSPALGLAG--GPVGAPLGSMTYSASLP
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KA1 ---SAAPQPALGATGSSLTPLGPA-----MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
:..: .. :. : . : .. .:.: : : ::: ::::
CCDS11 LPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQ-TGT-NPFL
590 600 610 620 630
>>CCDS46199.1 EPN1 gene_id:29924|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 1527 init1: 934 opt: 973 Z-score: 599.3 bits: 121.0 E(32554): 4.6e-27
Smith-Waterman score: 1538; 47.0% identity (63.8% similar) in 657 aa overlap (1-600:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS46 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
CCDS46 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
CCDS46 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLA-SRP
: . .. :..: :. :::: .:.:: :.
CCDS46 ------------PEAEQAWPQSS-----------GE-EELQL---------QLALAMSKE
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 NGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRR
..: :: :. . :.. ::::::..::: ..:::.::
CCDS46 EAD--QP-----------------------PSCGPEDDAQLQLALSLSREEHDKEERIRR
200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---P
:::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
CCDS46 GDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAP
240 250 260 270 280
360 370 380 390
pF1KA1 SASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGA
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
CCDS46 MAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPA
290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 TAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK---
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
CCDS46 PAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KA1 -----DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPL
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..:
CCDS46 FDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPP
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 TVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV
.:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. :
CCDS46 PAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KA1 -NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALG
:::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
CCDS46 TNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTN
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KA1 ATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
CCDS46 PFLL
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
:.:::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS46 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:::::::::::::::::.::..::::::::::.:::.::..:.::::::::.::::::::
CCDS46 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
.:::::.:::::::.::.::. :::.::::::..::.::. .: . ::. :
CCDS46 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP-----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
:::
CCDS46 -------------------PEA--------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
::: ::.:::::::::::::::.: :.::::.:::
CCDS46 -------------------------EQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQEERIRRG
180 190 200
310 320 330 340 350
pF1KA1 DDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---PS
::::::::.:::.:.: :. ....:.:: :.. . .:: ..::: :
CCDS46 DDLRLQMAIEESKRET---------GG-KEESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAPM
210 220 230 240 250
360 370 380 390 400
pF1KA1 ASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW------PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGAT
:.. : .::::: .: . .::: :. : .::: :.:::: : :
CCDS46 AAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGPAPTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPAP
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450
pF1KA1 AQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG-AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK----
: . . :::..:. . .: ::: : : . . : :. . :::
CCDS46 AAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAGGFD
320 330 340 350 360 370
460 470 480 490
pF1KA1 ---DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LPSQNNGTTSPDPFE------------SQPLTV
:.::.:: :::. :. : .. : . . . :: :. ..: .
CCDS46 TEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELLAGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPA
380 390 400 410 420 430
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSLVTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-N
:. :. .:::::::::::::::.:::::.::.: : :.. :::: :.:::. : :
CCDS46 ATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTN
440 450 460 470 480 490
560 570 580 590 600
pF1KA1 PFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTSF----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGAT
::: : ::::::: ::: :. .. : :::. : : . : :
CCDS46 PFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPTYISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNPF
500 510 520 530 540
610 620 630 640
pF1KA1 GSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
CCDS46 LL
550
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10 20 30
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSN
:.:::.::::::::.:::::::::::::::
CCDS46 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 DPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMVWKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSE
::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::..::::::::
CCDS46 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 RVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKT
::.:::.::..:.::::::::.::::::::.:::::.:::::::.::.::. :::.::::
CCDS46 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 KERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRT
::..::.::. .: . ::. : :::
CCDS46 KEKLAQTATA-SSAAV----GSGPP------------------------PEA--------
270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 GAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPNGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARP
::: :
CCDS46 -------------------------------------------------------EQAWP
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQ
:.:::::::::::::::.: :.::::.:::::::::::.:::.:.: :. .
CCDS46 QSSGEEELQLQLALAMSKEEADQEERIRRGDDLRLQMAIEESKRET---------GG-KE
290 300 310 320 330
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pF1KA1 QTTLLDLMDALPSSGPAAQKAEPWG---PSASTNQT-----NPWGGPAAPASTSDPW---
...:.:: :.. . .:: ..::: : :.. : .::::: .: . .:::
CCDS46 ESSLMDLADVFTAPAPAPT-TDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPA-ADPWGGP
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 ---PSFGT--KPAA----SIDPWGVPTGATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWG
:. : .::: :.:::: : : : . . :::..:. . .: ::: :
CCDS46 APTPASGDPWRPAAPAGPSVDPWG-GTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWT
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470
pF1KA1 -AVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIK--------DDFSEFDNLRTSKKTAESVTS---LP
: . . : :. . ::: :.::.:: :::. :. : .. :
CCDS46 PAPAFSDPW---GGSPAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSGSSAGELELL
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520
pF1KA1 SQNNGTTSPDPFE------------SQPLTVASSKPSS-ARKTPESFLGPNAALVNLDSL
. . . :: :. ..: .:. :. .:::::::::::::::.::::
CCDS46 AGEVPARSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAALVDLDSL
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570
pF1KA1 VTRPAP-P--AQSLNPFLAPGAPATSAPV-NPFQVNQPQPLTLNQLRGSPVL---GTSTS
:.::.: : :.. :::: :.:::. : :::: : ::::::: ::: :. .
CCDS46 VSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRLSPVPPVPGAPPT
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 F----GPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQATG
. : :::. : : . : :
CCDS46 YISPLGGGPGLPPM----MPPGPPAPNTNPFLL
640 650 660
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
..:::.::.:.:::.::::::::::::::::::::: .:.:::.:....::::.:.
CCDS13 MAFRRQVKNFVKNYSDAEIKVREATSNDPWGPSSSLMLDISDLTFNTISLSEIMNML
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
:.::::::::::::::.:::.:::::.::..: :.:::.. .:::::::.::. :::::
CCDS13 WHRLNDHGKNWRHVYKSLTLMDYLIKNGSKKVIQHCREGFCNLQTLKDFQHIDEAGKDQG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA1 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVAT----GMGS-NQITFGRGSSQP
.::::::...:: :: : :: : .:..: .. .:: :..: .. :
CCDS13 YYIREKSKQVITLLMDEPLLCKEREVACRTRQRTSHSILFSKRQLGSSNSLTACTSAPTP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQ----SEELQPLSQRHPFLP
..:.:... . : : . .. .:.: .: . : :.: :: . : .
CCDS13 DISASEKKYKLPKFG-RLHNKRNVCKAGLKQEHCQDVHLPTETMLSQETLPL-KIHGWKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA1 HLGLASRPNGDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSE---LEQARP--QTSGEEELQLQLALAM
: . . : : : :: : . : : .:. . :: . . .:.
CCDS13 TEDLMTFLDDDPELPLL-------ATPPSIVSPITCLSEAEEVCNLSGADAVP---TLSE
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SREVAEQEERL-RRGDDLRLQMALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPSSG
. .... : .:.: . . . : . .. : .:. .. .: : .. : ::
CCDS13 NSPSGQRDVSLDKRSDGIFTNTVTE----NLLETPLEKQSAAEGLKT--LTILPACWSS-
290 300 310 320 330
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pF1KA1 PAAQKAEPWGPSASTNQTNPWGGPAAPASTSDPWPSFGTKPAASIDPWGVPTGATAQSVP
: : .:. ..... : . : ::: .. . :::
CCDS13 ----KEEFISPDLRVSKSDSTFHNQASVETLCLSPSFKIFDRVKEIVINKAYQKPAQSSI
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KA1 KNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTTKP--VSVSGSFELFSN-LNG----TIKDDF
. .: . .:.:.. :: ... .: ..: .: : .:.: : : :.. .
CCDS13 QMDDKILKTTTRVSTASEGAS-SFSPLSMSSPDLASPEKSAHLLSPILAGPSFWTLSHQQ
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SEFDNLRTSKKTAESVTSLPSQNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPS---SARKT----PES
... :::. :. :. : .: : :.. :.. . :. ::.:. :
CCDS13 LSSTSFKDEDKTAKLHHSFASR--GPVSSDVEENDSLNLLGILPNNSDSAKKNISHISSS
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 FLGPNAALVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQLRGSP
: . . :.:... :: . : : : .. ..
CCDS13 HWG-EFSTQNVDQFIPLSCSGFQSTKDF--PQEPEAKNSISVLLREVKRAIARLHEDLST
520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 VLGTSTSFGPGPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGIPPSAAQ
CCDS13 VIQELNVINNILMSMSLNSSQISQSSQVPQSSEGSSDQI
570 580 590 600
>>CCDS47330.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 (625 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEI
:.: :::: : ::::::..::::::..:: ::: :. : :.
CCDS47 MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 MSMVWKR-LNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRD
:.:.:.: :.:. ::::.:::.: :: :::..:::::. . ::.:. ...:......:.
CCDS47 MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQP
:::::::.:.: :.:: . .:..::. :: .: :.:.... :..:...
CCDS47 GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYV----GVSSDSV---------
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGL
:: : . .:: :. . .:: . .. :: .::
CCDS47 --------------GGFRYSERYDPE----PKSK------WDEEWDKNKSAFPFSDKLGE
170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KA1 ASRPNGDWSQPCLT-CDRAARATSPRVSSELEQARPQTSG---------EEELQLQLALA
: :. . .. : : ::. :. .. . : ::: .
CCDS47 LSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIH
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 MSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDT--VKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPS
... . : .: . . : . . : : .. ::.. . ..::
CCDS47 ITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASPDQNASTHTPQSS----VKTSVPS
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KA1 SGPAAQKAEPW-GPSASTNQTNP-WGGPA--APASTSDPWPSFGTKPAASID--PWGVPT
: ... .. . : : ::. . .:: : . :..: .:: : ... : :.. .
CCDS47 SKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFPSQVTATSGNGDFGDWSAFN
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GATAQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGAVSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDD
: . : .... .....::: . ...: : : ..:.: .:: .: :. .
CCDS47 QAPSGPVASSGEFFGSASQPAVELVSGSQSALG-----PPPAASNSSDLF-DLMGSSQAT
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 FSEFDNLRTSKKTAESV-TSLPSQNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSSARKTPESFLGPN
.. ... : ....: .:: . .:: .. . : .. : .. :.
CCDS47 MTSSQSMNFSMMSTNTVGLGLPMS----------RSQNTDMV--QKSVSKTLPSTWSDPS
440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 AALVNLDSLVT--RPAPPAQ-SLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLT-LNQLRGSPV
. ..::.:. .:. : : ::: .. : :. ::.. ..: :.
CCDS47 VN-ISLDNLLPGMQPSKPQQPSLNTMIQ-------------QQNMQQPMNVMTQSFGAVN
490 500 510 520
580 590 600 610 620
pF1KA1 LGTSTSFGP-GPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLG--P----AMMNMVGSVGI
:.. ... : : .... . : . :. :. : ..::: : .::.: ..:.
CCDS47 LSSPSNMLPVRPQTNALIGGPMPMSMPNVMTGTMG--MAPLGNTPMMNQSMMGMNMNIGM
530 540 550 560 570 580
630 640
pF1KA1 PPSAAQATGTTNPFLL
.. :::
CCDS47 SAAGMGLTGTMGMGMPNIAMTSGTVQPKQDAFANFANFSK
590 600 610 620
>>CCDS56389.1 CLINT1 gene_id:9685|Hs108|chr5 (643 aa)
initn: 562 init1: 320 opt: 558 Z-score: 351.0 bits: 75.2 E(32554): 3.1e-13
Smith-Waterman score: 667; 27.9% identity (55.7% similar) in 663 aa overlap (12-635:16-613)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEI
:.: :::: : ::::::..::::::..:: ::: :. : :.
CCDS56 MLNMWKVRELVDKATNVVMNYSEIESKVREATNDDPWGPSGQLMGEIAKATFMYEQFPEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 MSMVWKR-LNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRD
:.:.:.: :.:. ::::.:::.: :: :::..:::::. . ::.:. ...:......:.
CCDS56 MNMLWSRMLKDNKKNWRRVYKSLLLLAYLIRNGSERVVTSAREHIYDLRSLENYHFVDEH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GKDQGINVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQP
:::::::.:.: :.:: . .:..::. :: .: :.:.... :..:...
CCDS56 GKDQGINIRQKVKELVEFAQDDDRLREERKKAKKNKDKYV----GVSSDSV---------
130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 NLSTSHSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGL
:: : . .:: :. . .:: . .. :: .::
CCDS56 --------------GGFRYSERYDPE----PKSK------WDEEWDKNKSAFPFSDKLGE
170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KA1 ASRPNGDWSQPCLT-CDRAARATSPRVSSELEQARPQTSG---------EEELQLQLALA
: :. . .. : : ::. :. .. . : ::: .
CCDS56 LSDKIGSTIDDTISKFRRKDREDSPERCSDSDEEKKARRGRSPKGEFKDEEETVTTKHIH
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 MSREVAEQEERLRRGDDLRLQMALEESRRDT--VKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDALPS
... . : .: . . : . . : : .. ::.. . ..::
CCDS56 ITQATETTTTRHKRTANPSKTIDLGAAAHYTGDKASPDQNASTHTPQSS----VKTSVPS
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KA1 SGPAAQKAEPW-GPSASTNQTNP-WGGPA--APASTSDPWPSFGTKPAASID--PWGVPT
: ... .. . : : ::. . .:: : . :..: .:: : ... : :.. .
CCDS56 SKSSGDLVDLFDGTSQSTGGSADLFGGFADFGSAAASGSFPSQVTATSGNGDFGDWSAFN
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