Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1002, 840 aa
1>>>pF1KA1002 840 - 840 aa - 840 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5302+/-0.00117; mu= -16.6658+/- 0.070
mean_var=446.1822+/-94.049, 0's: 0 Z-trim(115.0): 70 B-trim: 151 in 1/51
Lambda= 0.060718
statistics sampled from 15507 (15570) to 15507 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 5.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 976) 5689 513.2 8.7e-145
CCDS81704.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 ( 966) 4631 420.5 6.9e-117
CCDS81703.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (1010) 3749 343.3 1.3e-93
CCDS58823.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 813) 1239 123.3 1.7e-27
CCDS58824.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 793) 972 99.9 1.8e-20
CCDS63026.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 ( 971) 922 95.6 4.4e-19
CCDS2177.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1099) 895 93.3 2.5e-18
CCDS2661.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 ( 812) 888 92.6 3e-18
CCDS63024.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1044) 877 91.7 7.2e-18
CCDS63025.1 R3HDM1 gene_id:23518|Hs108|chr2 (1100) 877 91.7 7.5e-18
>>CCDS8937.2 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (976 aa)
initn: 5689 init1: 5689 opt: 5689 Z-score: 2712.8 bits: 513.2 E(32554): 8.7e-145
Smith-Waterman score: 5689; 100.0% identity (100.0% similar) in 840 aa overlap (1-840:137-976)
10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 CPSDKEEEKSTKDVSEKEDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEA
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTK
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 ASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQ
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTP
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQY
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 PNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 PNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLL
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAG
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 VPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVV
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 VMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSP
710 720 730 740 750 760
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 TQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLH
770 780 790 800 810 820
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 GQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKL
830 840 850 860 870 880
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 FTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNAS
890 900 910 920 930 940
820 830 840
pF1KA1 LRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
950 960 970
>>CCDS81704.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (966 aa)
initn: 4625 init1: 4625 opt: 4631 Z-score: 2212.0 bits: 420.5 E(32554): 6.9e-117
Smith-Waterman score: 5531; 97.9% identity (97.9% similar) in 840 aa overlap (1-840:145-966)
10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CPSDKEEEKSTKDVSEKEDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIR-----
240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 -------------GNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTK
290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 ASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASSFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQ
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQQQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTP
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 LISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQY
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 PNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLL
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAG
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 VPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVV
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 VMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSP
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 TQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQFPRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLH
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 GQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKL
820 830 840 850 860 870
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 FTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNAS
880 890 900 910 920 930
820 830 840
pF1KA1 LRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
940 950 960
>>CCDS81703.1 R3HDM2 gene_id:22864|Hs108|chr12 (1010 aa)
initn: 3722 init1: 3722 opt: 3749 Z-score: 1794.2 bits: 343.3 E(32554): 1.3e-93
Smith-Waterman score: 5599; 96.1% identity (96.1% similar) in 872 aa overlap (3-840:139-1010)
10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SDKEEEKSTKDVSEKEDKDKNKEKIPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNPRD
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVIINK
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 TSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEAFS
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKAS
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SFSGISILTRGDSIGSSKGGSAGRISRPGMALGAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQ
350 360 370 380 390 400
280 290
pF1KA1 QQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQ----------------------------------
::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQQQQLPALPPTPQQQPPLNNHMISQPVPALQPSPQPVQFSPSSCPQVLLPVSPPQQYNM
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTS
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SHAPPTQQVLPPQGYMQPPQQIQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPS
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPV
590 600 610 620 630 640
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGS
650 660 670 680 690 700
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 EQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVVVMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSPSGPGVVVMQLNVPNGPQPPQNPSMVQWSHCKYYS
710 720 730 740 750 760
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 MDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPVTSPTQSPAPSPVTSLSSVCTGLSPLPVLTQF
770 780 790 800 810 820
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PRPGGPAQGDGRYSLLGQPLQYNLSICPPLLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSA
830 840 850 860 870 880
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 STDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 STDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDN
890 900 910 920 930 940
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 SGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGTAENGRHSDLAALYTIVAVFPSPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERAS
950 960 970 980 990 1000
840
pF1KA1 SQ
::
CCDS81 SQ
1010
>>CCDS58823.1 ARPP21 gene_id:10777|Hs108|chr3 (813 aa)
initn: 1474 init1: 733 opt: 1239 Z-score: 607.3 bits: 123.3 E(32554): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 1639; 45.4% identity (67.1% similar) in 654 aa overlap (1-524:132-776)
10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
:::.: ::::::::::::::::.::::.:
CCDS58 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.:::
CCDS58 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140
pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT--GQNG-YLNDIRLS
::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..:::. .:.. .... ::
CCDS58 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQSVCSQESLFVENSRLL
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 KEA-FSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSRQSSTDSELK-SLEPRPWSSTDSDGSVRSMR
... . . ..:.::.:::::.: .:::.:::::...::: : . : :::::::.: :...
CCDS58 EDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLK
290 300 310 320 330 340
210 220 230
pF1KA1 PPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKG---------------GSAGRISR-----------
: .::..::.::..:::::: .:... ::.: .::
CCDS58 PAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSAGSSGSLSRTHPPLQSTPLV
350 360 370 380 390 400
240
pF1KA1 -----------------------------------------PGMAL-------------G
:: : :
CCDS58 SGVAAGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDG
410 420 430 440 450 460
250 260 270 280 290
pF1KA1 APEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQ----QLPALPPTPQQQPPLNNHMI-----
.: . : ::.: .:. . .::: ::: : . :: ::. :: .. .
CCDS58 TPAIYNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQPPQQQPSPQPQQQVQPPQPQMAGPLVTQSVQGLQA
470 480 490 500 510 520
300 310 320
pF1KA1 -SQA-------------------------DDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADP-SAALFQT
::. ::... ::::.::::.: :. .: :. .. .
CCDS58 SSQSVQYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPS
530 540 550 560 570 580
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 PLISQHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPP-TQQVL-PP---QGYMQ--PPQQIQV
:. : :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. :
CCDS58 SLMPQPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGS--GPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQMPV
590 600 610 620 630
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 SYYPPGQYPNSN-QQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGV
::: ::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.:::
CCDS58 YYYPSGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGV
640 650 660 670 680 690
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 QQP-QNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQ
::: :.:.....:. : .:...:.: . :::::. . ::.. : .:::...: .:
CCDS58 QQPPQSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLP-NQ
700 710 720 730 740 750
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 SVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYS
. ::.:::.:.::: .. ::. ::
CCDS58 AGQGSLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRLIGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVK
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10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
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CCDS58 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS
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pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.:::
CCDS58 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII
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pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSKEA
::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..:::. :.:.
CCDS58 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQS---------VCSQES
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160 170 180 190 200
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. . ::::.: .:::.:::::...::: : . : :::::::.: :...: .:
CCDS58 LFVEN-------RGNRDGSGRTSGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLKPAMT
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:..::.::..:::::: .:... ::.: .::
CCDS58 KTASFGGITVLTRGDSTSSTRSTGKLSKAGSESSSSAGSSGSLSRTHPPLQSTPLVSGVA
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240
pF1KA1 -------------------------------------PGMAL-------------GAPEV
:: : :.: .
CCDS58 AGSPGCVPYPENGIGGQVAPSSTSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDGTPAI
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pF1KA1 CNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQ----QLPALPPTPQQQPPLNNHMI------SQA
: ::.: .:. . .::: ::: : . :: ::. :: .. . ::.
CCDS58 YNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQPPQQQPSPQPQQQVQPPQPQMAGPLVTQSVQGLQASSQS
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pF1KA1 -------------------------DDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADP-SAALFQTPLIS
::... ::::.::::.: :. .: :. .. . :.
CCDS58 VQYPAVSFPPQHLLPVSPTQHFPMRDDVATQFGQMTLSRQSSGETPEPPSGPVYPSSLMP
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pF1KA1 QHPQQTSFIMASTGQPLPTSNYSTSSHAPP-TQQVL-PP---QGYMQ--PPQQIQVSYYP
: :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. : :::
CCDS58 QPAQQPSYVIASTGQQLPTGGFSGS--GPPISQQVLQPPPSPQGFVQQPPPAQMPVYYYP
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390 400 410 420 430 440
pF1KA1 PGQYPNSN-QQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQP-
::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.::::::
CCDS58 SGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGVQQPP
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pF1KA1 QNQGLLSSQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQG
:.:.....:. : .:...:.: . :::::. . ::.. : .:::...: .:. ::
CCDS58 QSQNVINNQQ---GTPVQSVMVSYPTMSSYQVPMTQGSQGLPQQSYQQPIMLP-NQAGQG
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pF1KA1 GLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQYSGVSP
.:::.:.::: .. ::. ::
CCDS58 SLPATGMPVYCNVTPPTPQNNLRLIGPHCPSSTVPVMSASCRTNCASMSNAGWQVKF
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10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
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CCDS63 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP
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pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::::::::::::.::..:.. :::: :::::::::::::::::.::::::.::.::.
CCDS63 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV
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pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT---------------
:::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.::::
CCDS63 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE
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.:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:.
CCDS63 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH
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::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: :::: : ::
CCDS63 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSK--SIGR
310 320 330 340 350
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pF1KA1 ISRPGMAL----GAPEVCNQVTSSQSVRGLLPCTAQQQQQQQQQQLPALPPTPQQQPPLN
.:. :. . :.: : : ..: ::. .: : : :: ::: :
CCDS63 LSKTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQ----------PPLPAPPQQ--PAA
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::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::...::...
CCDS63 NHIFSQQDNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSGYIMTAAPPPHPP
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pF1KA1 --------------GQPLPTSNYSTSSHAPPTQQVLPPQGYMQPPQ-QIQVSYYPPGQYP
:::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. :. . : ::.:
CCDS63 PPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQMPACYCAPGHYH
470 480 490 500 510 520
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pF1KA1 NSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMIGVQQPQNQGLLS
.:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::..::::::.:.:.:
CCDS63 SSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIVGVQQPQSQSLVS
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pF1KA1 SQRSSMGGQMQGLVVQYTPLPSYQVPVGSDSQNVVQPPFQQPMLVPVSQSVQGGLPAAGV
.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : .:: ::..:..:.
CCDS63 GQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-NQSNQGSMPTTGM
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:::::.:::.:::. : :::.:: ::::: :.:.. :::: :. . ..: : :
CCDS63 PVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQCTAGPPPPPGGG
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pF1KA1 VVVMQLNVPNGPQP-PQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSSPQANTQMSSSPV
.:.:::.:::.:: ..: ::.. ::: ::::: .. : :. : . :.:: :.
CCDS63 MVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNIVQHSPQLSS-PI
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::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: ::::::::: ::
CCDS63 ISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLGQPLQYN----PP
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pF1KA1 -LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLEVTDLPEGITRTE
.:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.:::.:.::.:::: :
CCDS63 AVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLEITELPDGITRME
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750 760 770 780 790 800
pF1KA1 ADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGG-----GGGDNSGTAENGRHSDLAALYTIVAVFP
:.::: .: ::::.::.: :. : :.:::... : .. ::::. ::..:.::
CCDS63 AEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSDLASTYTVLATFP
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810 820 830 840
pF1KA1 SPLAAQNASLRLNNSVSRFKLRMAKKNYDLRILERASSQ
: ::::: . :::..:::: .::.::.
CCDS63 SISAAQNALKKQINSVNKFKLRTSKKHYDFHILERASSQ
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10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
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CCDS21 IQLTQSFEKEEKPSKDEAEKEKASDKLPRKMLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKNNP
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pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
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CCDS21 RDRMMLLKLEQEILDFIGNNESPRKKFPPMTSYHRMLLHRVAAYFGLDHNVDQSGKSVIV
170 180 190 200 210 220
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pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQT---------------
:::::::::.:.:.:::::.:. .::.:.:::::..:.:.::::
CCDS21 NKTSNTRIPDQKFNEHIKDDKGEDFQKRYILKRDNSSFDKDDNQMRIRLKDDRRSKSIEE
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pF1KA1 -------------------GQNGYLNDIRLSKEAFSSSSHKRRQIFRGNREGLSRTSSSR
.:..:. : ::. : .::...:::::: :... .:...:.
CCDS21 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH
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::::..::: :::::::::::.:.:...: :::::::::::.:::::: ::::
CCDS21 QSSTENELKYSEPRPWSSTDSDSSLRNLKPAVTKASSFSGISVLTRGDSSGSSKSIGRLS
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240 250 260
pF1KA1 ----------GGSAGRISR-----PGMAL-----GAPEVCNQVT--SSQSVRG-------
:.:.: .:. :: :: ::: : :. :: : :
CCDS21 KTGSESSGSVGSSTGSLSHIQQPLPGTALSQSSHGAPVVYPTVSTHSSLSFDGGLNGQVA
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pF1KA1 -------LLPCTAQ------------------------------QQQQQQQQQLPALP--
::: : . :: ..:.:. :
CCDS21 SPSTSFFLLPLEAAGIPPGSILINPQTGQPFINPDGSPVVYNPPMTQQPVRSQVPGPPQP
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pF1KA1 --PTPQQQPPLNNHMISQADDLSNPFGQMSLSRQGSTEAADPSAALFQTPLISQHPQQTS
:.: ::: ::..:: :.:.. :..:::.:: :....:: ::.::. .. : :::..
CCDS21 PLPAPPQQPA-ANHIFSQ-DNLGSQFSHMSLARQPSADGSDPHAAMFQSTVVLQSPQQSG
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.::... :::.::..: .:.: : .: :: :::.: :. :
CCDS21 YIMTAAPPPHPPPPPPPPPPPPPLPPGQPVPTAGYPASGH-PVSQPVLQQQGYIQQPSPQ
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pF1KA1 IQVSYYPPGQYPNSNQQYRPLSHPVAYSPQRGQQLPQPSQQPGLQPMMPNQQQAAYQGMI
. . : ::.: .:. ::::. : :. . .: ::::.:: : : ..::::: :::..
CCDS21 MPACYCAPGHYHSSQPQYRPVPS-VHYNSHLNQPLPQPAQQTGYQ-VIPNQQQN-YQGIV
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::::::.:.:.:.: .:.:.:.::.:. :: .:.::: . . ::.. . .:::.. : .
CCDS21 GVQQPQSQSLVSGQPNSIGNQIQGVVIPYTSVPTYQVSLPQGSQGIPHQTYQQPVMFP-N
700 710 720 730 740 750
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pF1KA1 QSVQGGLPAAGVPVYYSMIPPAQQNGTSPSVGFLQPPGSEQYQMPQSPSPCSPPQMPQQY
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CCDS21 QSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQ
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pF1KA1 SGVSPSGP---GVVVMQLNVPNGPQP-PQNPSMVQWSHCKYYSMDQRGQKPGDLYSPDSS
..: : :.:.:::.:::.:: ..: ::.. ::: ::::: .. : :.
CCDS21 CTAGPPPPPGGGMVMMQLSVPNNPQSCAHSPP--QWKQNKYYCDHQRGQKCVEFSSVDNI
820 830 840 850 860 870
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: . :.:: :. ::.:::::. ...:..: . :: .. :: :: :.:::.:: :::
CCDS21 VQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLG
880 890 900 910 920 930
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pF1KA1 QPLQYNLSICPP-LLHGQSTYTVHQGQSGLKHGNRGKRQALKSASTDLGTADVVLGRVLE
:::::: :: .:::. .::: : .:::::.::: :.::::::....:.:.:::
CCDS21 QPLQYN----PPAVLHGH--IPNQQGQPGSRHGNRGRRQAKKAASTDLGAGETVVGKVLE
940 950 960 970 980
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pF1KA1 VTDLPEGITRTEADKLFTQLAMSGAKIQWLKDAQGLPGGGGGDNSGTAENGRHSDLAALY
.:.::.:::: ::.:::
CCDS21 ITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSD
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10 20 30
pF1KA1 MLSRDSSQEYTDSTGIDLHEFLVNTLKKNP
:::.: ::::::::::::::::.::::.:
CCDS26 EEDKSRKDDSEREKEKDKNKDKTSEKPKIRMLSKDCSQEYTDSTGIDLHEFLINTLKNNS
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RDRMMLLKLEQEILEFINDNNNQFKKFPQMTSYHRMLLHRVAAYFGMDHNVDQTGKAVII
::::.:::.::::..:: ::::..::::::.::.:::.::::::::.:::::::::.:::
CCDS26 RDRMILLKMEQEIIDFIADNNNHYKKFPQMSSYQRMLVHRVAAYFGLDHNVDQTGKSVII
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140
pF1KA1 NKTSNTRIPEQRFSEHIKDEKNTEFQQRFILKRDDASMDRDDNQTGQNGYLNDIRLSK--
::::.:::::::: ::.::::. : :.:::::::..:.:..::: .. . : : ::
CCDS26 NKTSSTRIPEQRFCEHLKDEKGEESQKRFILKRDNSSIDKEDNQQNRMHPFRDDRRSKSI
230 240 250 260 270 280
150 160 170
pF1KA1 ------------EAFSSSS------------------------HKRRQIFRGNREGLSRT
. :. .: .:.::.:::::.: .::
CCDS26 EEREEEYQRVRERIFAHDSVCSQESLFVENSRLLEDSNICNETYKKRQLFRGNRDGSGRT
290 300 310 320 330 340
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pF1KA1 SSSRQSSTDSELK-SLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSKG
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CCDS26 SGSRQSSSENELKWSDHQRAWSSTDSDSSNRNLKPAMTKTASFGGITVLTRGDSTSSTRS
350 360 370 380 390 400
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::.: .:: : :.: :.: . .::. :.
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260 270
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. ::: : :.:::
CCDS26 TSYILLPLEAATGIPPGSILLNPHTGQPFVNPDGTPAIYNPPTSQQPLRSAMVGQSQQQP
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:: :. : : ::: . . ...: ::... ::::.::::.: :. .: :. .. .
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:. : :: :...::::: :::...: : .:: .:::: :: ::..: :: :. :
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::: ::::.:. :::::.. :: :. ::.::.:: .:: : ::.. .:: ..::.::::
CCDS26 YYPSGQYPTSTTQQYRPMA-PVQYNAQRSQQMPQAAQQAGYQPVLSGQQ--GFQGLIGVQ
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CCDS63 ITELPDGITRMEAEKLFGELFKIGAKIRWLRDPQSQPRRHPLCCGSGDNTANPERSKPSD
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CCDS63 REEEYQRARDRIFSQDSLCSQENYIIDKRLQDED-ASSTQQRRQIFRVNKDASGRSTNSH
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 QSSTDSELKSLEPRPWSSTDSDGSVRSMRPPVTKASSFSGISILTRGDSIGSSK------
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CCDS63 QSNQGSMPTTGMPVYYSVIPPGQQNNLSSSVGYLQHPGSEQVQFPRTTSPCSSQQLQGHQ
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CCDS63 VQHSPQLSS-PIISPAQSPAPAQLSTLKTVRPSGPPLSIMPQFSRPFVPGQGDSRYPLLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]