Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0972
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0972, 683 aa
1>>>pF1KA0972 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2250+/-0.00177; mu= 17.9246+/- 0.106
mean_var=317.8190+/-60.548, 0's: 0 Z-trim(103.1): 983 B-trim: 35 in 1/53
Lambda= 0.071942
statistics sampled from 6155 (7231) to 6155 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 4760 509.8 5.2e-144
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1992 222.5 1.6e-57
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1790 201.5 3.2e-51
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1655 187.4 5.1e-47
CCDS12837.1 ZNF175 gene_id:7728|Hs108|chr19 ( 711) 1482 169.6 1.4e-41
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1453 166.7 1.2e-40
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1451 166.4 1.3e-40
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1443 165.6 2.3e-40
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1438 165.0 3.2e-40
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1413 162.4 1.9e-39
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1395 160.5 6.8e-39
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1386 159.7 1.5e-38
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1371 158.4 4.9e-38
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1366 157.5 5.7e-38
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1365 157.3 5.7e-38
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1366 157.5 5.7e-38
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1366 157.5 5.8e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1365 157.3 5.8e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1365 157.4 5.9e-38
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 1353 156.2 1.5e-37
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1356 157.0 1.6e-37
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1346 155.4 2.4e-37
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1342 155.0 3.1e-37
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1342 155.0 3.2e-37
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1342 155.0 3.2e-37
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1342 155.0 3.2e-37
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 1341 155.0 3.5e-37
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1340 154.8 3.6e-37
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1340 154.8 3.6e-37
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1340 154.8 3.6e-37
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1341 155.0 3.7e-37
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1335 154.3 5.3e-37
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1332 154.1 6.9e-37
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1331 153.9 7e-37
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1331 153.9 7.2e-37
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1330 153.7 7.3e-37
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1332 154.2 7.4e-37
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1330 153.7 7.4e-37
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1328 153.5 8.4e-37
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1327 153.4 8.9e-37
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1327 153.5 9.4e-37
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1327 153.5 9.6e-37
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1321 152.8 1.4e-36
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 1312 151.8 2.6e-36
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1311 151.9 3.1e-36
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1309 151.8 3.7e-36
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1309 151.8 3.8e-36
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1309 151.8 3.8e-36
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1307 151.5 4.1e-36
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1300 150.7 6.7e-36
>>CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 (683 aa)
initn: 4760 init1: 4760 opt: 4760 Z-score: 2698.9 bits: 509.8 E(32554): 5.2e-144
Smith-Waterman score: 4760; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSPHPEAITDCVTLNTVGQLAEGGYPLRFSTLFQEQQKMNISQASVSFKDVTIEFTQEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSPHPEAITDCVTLNTVGQLAEGGYPLRFSTLFQEQQKMNISQASVSFKDVTIEFTQEEW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QQMAPVQKNLYRDVMLENYSNLVSVGYCCFKPEVIFKLEQGEEPWFSEEEFSNQSHPKDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QQMAPVQKNLYRDVMLENYSNLVSVGYCCFKPEVIFKLEQGEEPWFSEEEFSNQSHPKDY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RGDDLIKQNKKIKDKHLEQAICINNKTLTTEEEKVLGKPFTLHVAAVASTKMSCKCNSWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RGDDLIKQNKKIKDKHLEQAICINNKTLTTEEEKVLGKPFTLHVAAVASTKMSCKCNSWE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VNLQSISEFIINNRNYSTKKIGCGNVCENSPFKINFEKTQTGEKFYEHNKNMKALNYNEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNLQSISEFIINNRNYSTKKIGCGNVCENSPFKINFEKTQTGEKFYEHNKNMKALNYNEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LPKHPKFQTLEQAFECNKIGKAFNDKANCVKHNSSHTGETSSKDDEFRKNCDKKTLFDHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LPKHPKFQTLEQAFECNKIGKAFNDKANCVKHNSSHTGETSSKDDEFRKNCDKKTLFDHR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RTGTGKKHLHLNQCGKSFEKSTVEEYNKLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAHLTDPQTAVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RTGTGKKHLHLNQCGKSFEKSTVEEYNKLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAHLTDPQTAVIE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ENPLVSNDRTQTWVKSSEYHENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQKGHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ENPLVSNDRTQTWVKSSEYHENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQKGHLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KCNECGKKFVRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFGQKSNLRIHQRTHSGEKSYECNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KCNECGKKFVRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFGQKSNLRIHQRTHSGEKSYECNE
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KA0 YGKLCKKSTLSLYQKIQGEGNPY
:::::::::::::::::::::::
CCDS35 YGKLCKKSTLSLYQKIQGEGNPY
670 680
>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 (699 aa)
initn: 2874 init1: 1581 opt: 1992 Z-score: 1146.2 bits: 222.5 E(32554): 1.6e-57
Smith-Waterman score: 2027; 48.5% identity (71.9% similar) in 666 aa overlap (39-683:1-646)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 TDCVTLNTVGQLAEGGYPLRFSTLFQEQQKMNISQASVSFKDVTIEFTQEEWQQMAPVQK
:: ::::::.:::.::.:::::.:.::..
CCDS35 MNTFQASVSFQDVTVEFSQEEWQHMGPVER
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NLYRDVMLENYSNLVSVGYCCFKPEVIFKLEQGEEPWFSEEE--FSNQSHPKDYRGDDLI
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CCDS35 TLYRDVMLENYSHLVSVGYCFTKPELIFTLEQGEDPWLLEKEKGFLSRNSPEDSQPDEIS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KQNKKIKDKHLEQAICINNKTLTTEEEKVLGKPFTLHVAAVASTKMSCKCNSWEVNLQSI
... . . ::: : . ..:: ::::.: . ::: . . . : :::. :..
CCDS35 EKSPENQGKHLLQ-VLFTNKLLTTEQE-ISGKPHNRDINIFRARMMPCKCDIAGSACQGL
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SEFIINNRNYSTKKIGCGNVCENSPFKINFEKTQTGEKFYEHNKNMKALNYNENLPKHPK
: .. . .:: .: :::.. ..:. .:.: :: . ..: .:.:...:.. .:
CCDS35 S-LMAPHCQYSKEKAHERNVCDKWLISIKDGRTNTQEKSFAYSKIVKTLHHKEEVIQHQT
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FQTLEQAFECNKIGKAFNDKANCVKHNSSHTGETSSKDDEFRKNC-DKKTLFDHRRTGTG
.::: : :: :. ::: .:: : ::.: : . ..: .: ::.:.. . .
CCDS35 IQTLGQDFEYNESRKAFLEKAALVTSNSTHPKGKSYNFNKFGENKYDKSTFIIPQNMNPE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KA0 KKHLHLNQ---C-----------GKSF-EKSTVEEYNKLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAH
:.: ..:. : :::: .:: ..:......:.: .: :..:::..
CCDS35 KSHYEFNDTGNCFCRITHKTLTGGKSFSQKSHIREHHRVHIGVKPFEY---GKSFNRNST
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KA0 LTDPQTAVIEENPLVSNDRTQTWVKSSEYHENKK--SYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNE
: :. ..::.. : :.:: . ::: :. :... : :::. ::
CCDS35 L-----------PV--HQRTHATDKYSDYHPCTETFSYQ-STFSVHQKVHIRAKPYEYNE
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 CGKSFCQKGHLIQHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKT
:::: ...::: :..::::::.:: ::::.::.::.: ::: ::.::::::. : :.
CCDS35 CGKSCSMNSHLIWPQKSHTGEKPYECPECGKAFSEKSRLRKHQRTHTGEKPYKCDGCDKA
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 FVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQK
: :: :: ::: ::::::.:: ::::.: :: : :.: ::::: :.::.:::.:..
CCDS35 FSAKSGLRIHQRTHTGEKPFECHECGKSFNYKSILIVHQRTHTGEKPFECNECGKSFSHM
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SNLRIHQRTHTGEKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLR
:.:: :.::::::. :.:.:: :.: :. : .:..:::::::.:::.:::.:.. : ::
CCDS35 SGLRNHRRTHTGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHRTHTGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLR
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 VHQRIHTGEKPFKCNECGKKFVRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFGQKSNLRIHQR
:.::::::::.:::.::. : .:. : :.: ::::::.::..::::: :::::: :::
CCDS35 GHHRIHTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTGEKPYQCEECGKTFRQKSNLRGHQR
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680
pF1KA0 THSGEKSYECNEYGK-LCKKSTLSLYQKIQGEGNPY
::.::: ::::: :: . .::.: .:. . .::
CCDS35 THTGEKPYECNECGKAFSEKSVLRKHQRTHTGEKPYNCNQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTG
620 630 640 650 660 670
CCDS35 EKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD
680 690
>>CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (647 aa)
initn: 3605 init1: 1254 opt: 1790 Z-score: 1033.1 bits: 201.5 E(32554): 3.2e-51
Smith-Waterman score: 1869; 45.4% identity (69.7% similar) in 659 aa overlap (41-679:1-642)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 CVTLNTVGQLAEGGYPLRFSTLFQEQQKMNISQASVSFKDVTIEFTQEEWQQMAPVQKNL
..:.::::.:::..:::::::.. .::.:
CCDS74 MAQGSVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTL
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KA0 YRDVMLENYSNLVSVGYCCFKPEVIFKLEQGEEPWFSEEEFSNQSH-PKDYRGDDLIKQN
: ::::::: .:.::: ::.::.:::.::::: : :.... ......:.. .
CCDS74 YMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLERGEEPWTS---FAGHTCLEENWKAEDFLVKF
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KKIKDKHLEQAICINNKTLTTEEEKVLGKPFTLHVAAVASTKMSCKCNSWEVNLQSISEF
:. ..:. .... ::.: :. :. :. : ::: : : .. . .. :...::.
CCDS74 KEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTLGKNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSEL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IINNRNYSTKKIGCGNVCENSPFKINFEKTQTGEKFYEHNKNMKALNYNENLPKHPKFQT
::.: : . :... : .: .. . : :. : ::.. .:...:: : .. : .:
CCDS74 IISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPEVK--SHNQSARAFSHNEVLMQYQKTET
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LEQAFECNKIGKAFNDKANCVKHNSSHTGETSSKDDEFRKNCDKKTLFDHRRTGTGKKHL
:.: : :.: .... . :. . ::. : .. : : :. :::
CCDS74 PAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVYNKKR-----------RATNIEKKHT
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HLNQCGKSF-EKSTVEEYNKLNMGIKHYELNPSGNNFNRKAHLTDPQTAVIEENPLVSND
:.::::: .::.. .. .. : :. . :: : ::..: : : . :.:.: :.
CCDS74 -CNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLIDHQRTHTGEKPFVCNE
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KA0 ---------------RTQTWVKSSEYHENKKSYQTSVHRVR-RRSHSMMKPYKCNECGKS
::.: :: : . ..... . : .: .:.:. :::.::.::::
CCDS74 CGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSHLIRHQRTHTGEKPYECNDCGKS
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FCQKGHLIQHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQK
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CCDS74 FRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKPYICNECGKSFSQK
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pF1KA0 STLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLR
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CCDS74 TTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLI
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CCDS74 DHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYVCNECGKSFRQKATLTVHQK
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CCDS74 IHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCSECGKCFRQKTNLIVHQRTHTG
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CCDS74 EKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
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CCDS12 EPWTS---FAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFT
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CCDS12 SVYNKKR-----------RATNIEKKHT-CNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQ
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CCDS12 EKPYKCSECGKCFRQKTNLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIE
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pF1KA0 Y
CCDS12 MQ
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CCDS12 DVMLELYSHLFAVGYHIPNPEVIFRMLKEKEPRVEEAEVSHQRCQEREFGLEIPQ--KEI
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CCDS12 DTEQLDDVVGSGQLFSHSSSDACSKNIHTGETFCKGNQCRKVCGHKQSLKQHQIHTQKKP
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CCDS12 QRIHTGEKPYVCTECGKAFNGRSNFHKHQITHTRERPFVCYKCGKAFVQKSELITHQRTH
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CCDS12 SYKCSYSVKGFTKQ
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CCDS12 EKC-----FSQSSHLRT---HQRIHPGEK---LNRCHESGDCFNKSSFHSYQSNHTGEKS
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CCDS12 TGEKPYKCDVCGKGFSHNSPLICHRRVHTGEKPYKCEACGKGFTRNTDLHIHFRVHTGEK
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CCDS12 PYKCKECGKGFSQASNLQVHQNVHTGEKRFKCETCGKGFSQSSKLQTHQRVHTGEKPYRC
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CCDS12 DVCGKDFSYSSNLKLHQVIHTGEKPYKCEECGKGFSWRSNLHAHQRVHSGEKPYKCEQCD
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CCDS12 KSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKCGVCGKGFSQSSGLQSHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFR
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CCDS12 YSSQFIYHQRGHTGEKPYKCEECGKGFGRSLNLRHHQRVHTGEKPHICEECGKAFSLPSN
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CCDS12 PYKCGVCGKGFSQSSGLQSHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFRYSSQFIYHQRGHTGEKPYKC
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CCDS12 EECGKGFGRSLNLRHHQRVHTGEKPHICEECGKAFSLPSNLRVHLGVHTREKLFKCEECG
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CCDS12 KGFSQSARLEAHQRVHTGEKPYKCDICDKDFRHRSRLTYHQKVHTGKKL
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CCDS12 MMQAQESLTLEDVAVDFTWEEWQFLSPAQK
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CCDS12 DLYRDVMLENYSNLVAVGYQASKPDALSKLERGEETCTTEDEIYSRICSEIRKIDDPLQH
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CCDS12 -------HL-QNQSIQKSVKQCHEQNMFGNIVNQNKGHFL---LKQDCDTFDLHEKPLKS
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: ..:. . :. . : .: :. : .. : :: : .: .. . :.
CCDS12 NLSFENQKRSSGLKNSAEFNRDGKSLFHANHKQFYTEMKF---PAIAKPINKSQ-FIKQQ
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CCDS12 RTHNIENAHVCSECGKAFLKLSQFIDHQRVHTGEKPHVCSMCGKAFSRKSRLMDHQRTHT
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CCDS12 ELKHYECTECDKTFLKKSQLNIHQKTHMGGKPYTCSQCGKAFIKKCRLIYHQRTHTGEKP
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CCDS12 HGCSVCGKAFSTKFSLTTHQKTHTGEKPYICSECGKGFIEKRRLTAHHRTHTGEKPFICN
320 330 340 350 360 370
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pF1KA0 ECGKSFCQKGHLIQHQRTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGK
.:::.: :. :: ::.:::::: . :::::: ::.: : .::: ::.:::::::::::
CCDS12 KCGKGFTLKNSLITHQQTHTGEKLYTCSECGKGFSMKHCLMVHQRTHTGEKPYKCNECGK
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470 480 490 500 510 520
pF1KA0 TFVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQ
:. :: : ::: ::::::: :.:: : :..:: : :.: ::.:: . ::.::: :
CCDS12 GFALKSPLIRHQRTHTGEKPYVCTECRKGFTMKSDLIVHQRTHTAEKPYICNDCGKGFTV
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pF1KA0 KSNLRIHQRTHTGEKTYQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTL
:: : .::::::::: : :.:: :.: : .:. ::.:::::::. :::::: :.. : :
CCDS12 KSRLIVHQRTHTGEKPYVCGECGKGFPAKIRLMGHQRTHTGEKPYICNECGKGFTEKSHL
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CCDS12 NVHRRTHTGEKPYVCSECGKGLTGKSMLIAHQRTHTGEKPYICNECGKGFTMKSTLSIHQ
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CCDS12 QTHTGEKPYKCNECDKTFRKKTCLIQHQRFHTGKTSFACTECGKFSLRKNDLITHQRIHT
620 630 640 650 660 670
CCDS12 GEKPYKCSDCGKAFTTKSGLNVHQRKHTGERPYGCSDCGKAFAHLSILVKHRRIHR
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CCDS82 DVMLENYSNLVAVGYQASKPDALSKLERGEETCTTEDEIYSRICSEIRKIDDPLQH----
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..:. . :. . : .: :. : .. : :: : .: .. . :. . ..
CCDS82 ENQKRSSGLKNSAEFNRDGKSLFHANHKQFYTEMKF---PAIAKPINKSQFI-KQQRTHN
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CCDS82 IENAHVCSECGKAFLKLSQFIDHQRVHTGEKPHVCSMCGKAFSRKSRLMDHQRTHTELKH
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. ..: :.: .:: .. ..: .:: : : . :. : .: .: : . :.:
CCDS82 YECTECDKTFLKKSQLNIHQKTHMGGKPYTCSQCGKAFIKKCRLIYHQRTHTGEKPHGCS
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:.....:.: : : :.. . ...:.:. ::. ::.:::
CCDS82 VCGKAFSTKFSLTTHQKTHTGEKPYICSECGKGFIEKRRLTAHHRTHTGEKPFICNKCGK
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CCDS82 GFTLKNSLITHQQTHTGEKLYTCSECGKGFSMKHCLMVHQRTHTGEKPYKCNECGKGFAL
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CCDS82 KSPLIRHQRTHTGEKPYVCTECRKGFTMKSDLIVHQRTHTAEKPYICNDCGKGFTVKSRL
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: ::::::. :.:::: .. :..: ::: ::::::. ::.::: : .::.: :::.::.
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::: :.::: : .:.: : .:...
CCDS82 GEKPYKCNECDKTFRKKTCLIQHQRFHTGKTSFACTECGKFSLRKNDLITHQRIHTGEKP
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CCDS12 LENYSNLVSLDLPSRCASKDLSPEKNTYETELSQ--WEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAK
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...... . ....:.. : .: ... :.. : .:.: :
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CCDS12 HQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKV
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CCDS12 HTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGE
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CCDS12 KPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYK
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CCDS12 CEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKEC
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CCDS12 GKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSF
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CCDS12 IRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGL
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CCDS12 LLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTL
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CCDS12 HQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRI
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CCDS12 HISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
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CCDS46 MALPQGQLTFKDVAIEFSQEEWTCLDPAQK
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pF1KA0 NLYRDVMLENYSNLVSVGYCC------FKP-------EVIF-----KLEQGEEPWFSEEE
.:::::::::: ::::. : . : :... .::. . .: .:
CCDS46 TLYRDVMLENYRNLVSLDISCKCVNTDLPPKGKNNMGEAFYTVKLERLESCDTVGLSFQE
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pF1KA0 FSNQSHP-----KDYRGDD---LIKQNKKIKDKHLEQAI-CINNKTLTTEEEKVLGKPFT
..... :: .:. :. :.... .. .. .:. . :. :: :
CCDS46 VQKNTYDFECQWKDDEGNYKTVLMLQKENLPGRRAQRDRRAAGNRHI----ENQLGVSFQ
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pF1KA0 LHVAAVASTKMSCKCNSWEVNLQSISEFIINNRNYSTKKIGCGNVCENSPFKINFEKTQT
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CCDS46 SHLPELQQFQHEGKI--YEYNQVEKSP---NNRGKHYKCDECGKVFSQNSRLTSHKRIHT
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CCDS46 GEKPYQCNKCGKAFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCNECGKVFSQPSNLAGHQRIHTGEKP
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CCDS46 YKCNECGKAFRAHSKLTTHQVIHTGEKPYKCKECGKCFTQNSHLASHRRIHTGEKPYKCN
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CCDS46 ECGKAFSVRSSLTTHQTIHTGEKPYKCNECGKV------FRHN--SYLAK-HR---RIHT
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CCDS46 GEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQIIHTGEKPFKCNECVKVFTQYSHLANHRRIHTGEKP
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pF1KA0 TFARTSTLRVHQRIHTGEKPFKCNECGKKFVRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFGQ
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CCDS46 VFRHNSYLAIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLATHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQ
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CCDS46 NSHLANHRRIHTGEKPYRCNECGKAFSVRSTLTTHMAVHTGDKPYKCNQCGKVFTQNSNL
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CCDS46 AKHRRIHSG
670
683 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 01:13:27 2016 done: Fri Nov 4 01:13:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]