FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0968, 478 aa
1>>>pF1KA0968 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9721+/-0.0014; mu= 4.1356+/- 0.080
mean_var=236.0497+/-54.842, 0's: 0 Z-trim(106.1): 651 B-trim: 103 in 1/50
Lambda= 0.083478
statistics sampled from 8037 (8778) to 8037 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 3225 402.5 5.1e-112
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 2854 357.8 1.4e-98
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 2854 357.8 1.4e-98
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 2854 357.8 1.5e-98
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 2842 356.4 4e-98
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 2821 353.8 2.3e-97
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 2224 282.0 1e-75
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 2038 259.6 5.8e-69
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 2038 259.6 5.9e-69
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 2018 257.1 3e-68
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 2012 256.4 4.9e-68
CCDS5486.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 503) 2005 255.6 8.9e-68
CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 2005 255.6 9.1e-68
CCDS43573.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 517) 1993 254.2 2.5e-67
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 1974 251.9 1.3e-66
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 1952 249.2 7.4e-66
CCDS5484.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 542) 1952 249.3 7.8e-66
CCDS5487.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 492) 1951 249.1 8e-66
CCDS5483.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 666) 1952 249.3 9e-66
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 1947 248.6 1e-65
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 1912 244.4 2.2e-64
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 1912 244.4 2.2e-64
CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 897) 936 127.1 7.5e-29
CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 898) 936 127.1 7.5e-29
CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 921) 936 127.1 7.6e-29
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 822 113.1 6.6e-25
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 809 111.4 1.6e-24
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 809 111.4 1.7e-24
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 785 108.6 1.5e-23
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 772 107.0 3.7e-23
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 761 105.6 9e-23
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 761 105.7 1e-22
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 745 104.1 5.7e-22
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 745 104.1 5.7e-22
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 735 102.6 8.8e-22
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 732 102.2 1.1e-21
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 735 102.8 1.3e-21
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 732 102.5 1.6e-21
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 716 100.3 4.3e-21
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 715 100.4 6.2e-21
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 670 94.8 2.1e-19
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 674 95.8 3.2e-19
CCDS82776.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 470) 659 93.5 5.4e-19
CCDS33762.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 501) 659 93.5 5.6e-19
CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 ( 370) 649 92.1 1.1e-18
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 633 90.6 6.6e-18
CCDS81839.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 723) 625 89.6 1.2e-17
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 625 89.6 1.3e-17
CCDS6240.1 PSKH2 gene_id:85481|Hs108|chr8 ( 385) 607 87.1 3.6e-17
CCDS54002.1 PHKG2 gene_id:5261|Hs108|chr16 ( 374) 605 86.8 4.2e-17
>>CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 (478 aa)
initn: 3225 init1: 3225 opt: 3225 Z-score: 2124.6 bits: 402.5 E(32554): 5.1e-112
Smith-Waterman score: 3225; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLERE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHIH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA0 LMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
430 440 450 460 470
>>CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (478 aa)
initn: 2860 init1: 1983 opt: 2854 Z-score: 1883.1 bits: 357.8 E(32554): 1.4e-98
Smith-Waterman score: 2854; 87.6% identity (96.2% similar) in 474 aa overlap (2-475:3-475)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::.: ::: :.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS43 LESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS43 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIE
:::::::::::::::..:: :: ::::::.::.::::::::.:.::::::::::::::
CCDS43 KGAILTTMLATRNFSAAKSLL-KKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIE
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHI
::.:::::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::: :...::.:: :::::.
CCDS43 AINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
::.::..:::::::.:::.:..:.:.: :::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS43 HLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIN
420 430 440 450 460 470
>>CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (478 aa)
initn: 2860 init1: 1983 opt: 2854 Z-score: 1883.1 bits: 357.8 E(32554): 1.4e-98
Smith-Waterman score: 2854; 87.6% identity (96.2% similar) in 474 aa overlap (2-475:3-475)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::.: ::: :.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS37 LESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS37 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIE
:::::::::::::::..:: :: ::::::.::.::::::::.:.::::::::::::::
CCDS37 KGAILTTMLATRNFSAAKSLL-KKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIE
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHI
::.:::::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::: :...::.:: :::::.
CCDS37 AINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
::.::..:::::::.:::.:..:.:.: :::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS37 HLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (499 aa)
initn: 2860 init1: 1983 opt: 2854 Z-score: 1882.9 bits: 357.8 E(32554): 1.5e-98
Smith-Waterman score: 2854; 87.6% identity (96.2% similar) in 474 aa overlap (2-475:3-475)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::.: ::: :.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS37 LESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS37 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIE
:::::::::::::::..:: :: ::::::.::.::::::::.:.::::::::::::::
CCDS37 KGAILTTMLATRNFSAAKSLL-KKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIE
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHI
::.:::::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::: :...::.:: :::::.
CCDS37 AINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
::.::..:::::::.:::.:..:.:.: :::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS37 HLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKP
420 430 440 450 460 470
CCDS37 PCIPNGKENFSGGTSLWQNI
480 490
>>CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (498 aa)
initn: 2849 init1: 1972 opt: 2842 Z-score: 1875.1 bits: 356.4 E(32554): 4e-98
Smith-Waterman score: 2842; 87.6% identity (96.0% similar) in 474 aa overlap (2-475:3-474)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::.: ::: :.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS82 LESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS82 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIE
:::::::::::::::. :: :: ::::::.::.::::::::.:.::::::::::::::
CCDS82 KGAILTTMLATRNFSA-KSLL-KKPDGVKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIE
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHI
::.:::::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::: :...::.:: :::::.
CCDS82 AINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
::.::..:::::::.:::.:..:.:.: :::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS82 HLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKP
420 430 440 450 460 470
CCDS82 PCIPNGKENFSGGTSLWQNI
480 490
>>CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 (479 aa)
initn: 2820 init1: 2820 opt: 2821 Z-score: 1861.6 bits: 353.8 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 2821; 86.1% identity (96.4% similar) in 475 aa overlap (3-477:4-477)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
:.::::::.::::.:..:::::::::::::. .:.::::::::::::::::::::::
CCDS54 MATTVTCTRFTDEYQLYEDIGKGAFSVVRRCVKLCTGHEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::: ::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EARICRLLKHSNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS54 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKCKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::. ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 LSPEVLRKEAYGKPVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHKLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
::::::.:::.::::::.::::: :::::::. .:::::: :::::::.:::::::::::
CCDS54 VTPEAKNLINQMLTINPAKRITAHEALKHPWVCQRSTVASMMHRQETVECLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIE
:::::::::::::::..:: :::.:::::::.:.::::::::.:.:::::::.::::::
CCDS54 KGAILTTMLATRNFSAAKSLLNKKADGVKESSDSANTTIEDEDAKARKQEIIKTTEQLIE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHI
:..:::::.:.:.::::.:.::::::::::::.:::::::::: ..::::.::::::::.
CCDS54 AVNNGDFEAYAKICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENLLAKNSKPIHTTILNPHV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
:..:...:::::::.:::.:. : :::.:::::::::::::::: :::: :::: : :
CCDS54 HVIGEDAACIAYIRLTQYIDGQGRPRTSQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHCSGAP-VAPLQ
430 440 450 460 470
>>CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 (489 aa)
initn: 3219 init1: 2214 opt: 2224 Z-score: 1472.9 bits: 282.0 E(32554): 1e-75
Smith-Waterman score: 3193; 97.8% identity (97.8% similar) in 489 aa overlap (1-478:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLERE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KA0 GAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVK-----------ESSESTNTTIEDEDTKVRKQE
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS43 GAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKKRKSSSSVQLMESSESTNTTIEDEDTKVRKQE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 IIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 VHTTILNPHIHLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VHTTILNPHIHLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHR
430 440 450 460 470 480
470
pF1KA0 SGAPSVLPH
:::::::::
CCDS43 SGAPSVLPH
>>CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (512 aa)
initn: 2923 init1: 2015 opt: 2038 Z-score: 1351.6 bits: 259.6 E(32554): 5.8e-69
Smith-Waterman score: 2812; 82.8% identity (90.9% similar) in 507 aa overlap (2-475:3-509)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS82 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS82 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKS-----GG---NKKS-------------------------DG
:::::::::::::::..:: : :.:. ::
CCDS82 KGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKINNKANVVTSPKENIPTPALEPQTTVIHNPDG
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALG
:::.::.::::::::.:.::::::::::::::::.:::::.:::.::::.:::::::::
CCDS82 NKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 NLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHIHLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRT
:::::.::::::::: :...::.:: :::::.::.::..:::::::.:::.:..:.:.:
CCDS82 NLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKT
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KA0 AQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
:::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS82 MQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIK
490 500 510
>>CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (533 aa)
initn: 2923 init1: 2015 opt: 2038 Z-score: 1351.4 bits: 259.6 E(32554): 5.9e-69
Smith-Waterman score: 2812; 82.8% identity (90.9% similar) in 507 aa overlap (2-475:3-509)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS82 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS82 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKS-----GG---NKKS-------------------------DG
:::::::::::::::..:: : :.:. ::
CCDS82 KGAILTTMLATRNFSAAKSLLKKPDGVKINNKANVVTSPKENIPTPALEPQTTVIHNPDG
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VKESSESTNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALG
:::.::.::::::::.:.::::::::::::::::.:::::.:::.::::.:::::::::
CCDS82 NKESTESSNTTIEDEDVKARKQEIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 NLVEGLDFHRFYFENLWSRNSKPVHTTILNPHIHLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRT
:::::.::::::::: :...::.:: :::::.::.::..:::::::.:::.:..:.:.:
CCDS82 NLVEGMDFHRFYFENALSKSNKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKT
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KA0 AQSEETRVWHRRDGKWQIVHFHRSGAPSVLPH
:::::::::::::::: :::::::.:.:
CCDS82 MQSEETRVWHRRDGKWQNVHFHRSGSPTVPIKPPCIPNGKENFSGGTSLWQNI
490 500 510 520 530
>>CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 (489 aa)
initn: 2854 init1: 1983 opt: 2018 Z-score: 1338.9 bits: 257.1 E(32554): 3e-68
Smith-Waterman score: 2822; 85.6% identity (94.0% similar) in 485 aa overlap (2-475:3-486)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
.: ::::::.:::::::::::::::::::.:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MASTTTCTRFTDEYQLFEELGKGAFSVVRRCMKIPTGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
:::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGY
::.: ::: :.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS54 LESVNHCHLNGIVHRDLKPENLLLASKSKGAAVKLADFGLAIEVQGDQQAWFGFAGTPGY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSPEVLRKDPYGKPVDMWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
:::::::::::::::::.:::::.:::::::: .:::::: :::::::::::::::::::
CCDS54 VTPEAKDLINKMLTINPAKRITASEALKHPWICQRSTVASMMHRQETVDCLKKFNARRKL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KA0 KGAILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVK-----------ESSESTNTTIEDEDTKVRKQ
:::::::::::::::..:: :: :::: ::.::.::::::::.:.:::
CCDS54 KGAILTTMLATRNFSAAKSLL-KKPDGVKKRKSSSSVQMMESTESSNTTIEDEDVKARKQ
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 EIIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHRFYFENLWSRNSK
:::::::::::::.:::::.:::.::::.::::::::::::::.::::::::: :...:
CCDS54 EIIKVTEQLIEAINNGDFEAYTKICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHRFYFENALSKSNK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PVHTTILNPHIHLMGDESACIAYIRITQYLDAGGIPRTAQSEETRVWHRRDGKWQIVHFH
:.:: :::::.::.::..:::::::.:::.:..:.:.: :::::::::::::::: ::::
CCDS54 PIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIRLTQYMDGSGMPKTMQSEETRVWHRRDGKWQNVHFH
420 430 440 450 460 470
470
pF1KA0 RSGAPSVLPH
:::.:.:
CCDS54 RSGSPTVPIK
480
478 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:09:07 2016 done: Wed Nov 2 20:09:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]