Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0966
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0966, 1132 aa
1>>>pF1KA0966 1132 - 1132 aa - 1132 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9545+/-0.0011; mu= 13.8638+/- 0.066
mean_var=99.8251+/-19.128, 0's: 0 Z-trim(105.2): 31 B-trim: 11 in 1/49
Lambda= 0.128367
statistics sampled from 8273 (8293) to 8273 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 4.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7616.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 (1132) 7512 1402.7 0
CCDS58098.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 ( 522) 3242 611.8 1.3e-174
CCDS81513.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 ( 219) 1380 266.8 3.9e-71
CCDS82762.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3 ( 484) 895 177.1 8.8e-44
CCDS33745.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3 ( 587) 895 177.1 1e-43
CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1526) 641 130.2 3.5e-29
CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1295) 585 119.8 4e-26
CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1350) 585 119.8 4.2e-26
CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1612) 585 119.9 4.9e-26
CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6 (1496) 573 117.6 2.1e-25
>>CCDS7616.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 (1132 aa)
initn: 7512 init1: 7512 opt: 7512 Z-score: 7516.4 bits: 1402.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7512; 100.0% identity (100.0% similar) in 1132 aa overlap (1-1132:1-1132)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MELFQAKDHYILQQGERALWCSRRDGGLQLRPATDLLLAWNPICLGLVEGVIGKIQLHSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MELFQAKDHYILQQGERALWCSRRDGGLQLRPATDLLLAWNPICLGLVEGVIGKIQLHSD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LPWWLILIRQKALVGKLPGDHEVCKVTKIAVLSLSEMEPQDLELELCKKHHFGINKPEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LPWWLILIRQKALVGKLPGDHEVCKVTKIAVLSLSEMEPQDLELELCKKHHFGINKPEKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TYDLTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TYDLTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNPRPRLDRSEKETVAYFCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNPRPRLDRSEKETVAYFCA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 HFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHEHCRGMKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHEHCRGMKFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LKKLGVMPPEQPLPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVMKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKKLGVMPPEQPLPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVMKD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 GVNSANRYYLNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQELIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GVNSANRYYLNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQELIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDDEVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDDEVDK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VNQYQRLSLENLEKIEIGPEPTLFGKPKFSCMRLHYRYKEASGYFHTLRAVMRNPEEDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VNQYQRLSLENLEKIEIGPEPTLFGKPKFSCMRLHYRYKEASGYFHTLRAVMRNPEEDGK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DTLQCIAEMLQITKQAMGSDLPIIEKKLERKSSKPHEDIIGIRSQNQGSLAQGKNFLMSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DTLQCIAEMLQITKQAMGSDLPIIEKKLERKSSKPHEDIIGIRSQNQGSLAQGKNFLMSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FSSLNQKVKQTKSNVNIGNLRKLGNFTKPEMKVNFLKPNLKVNLWKSDSSLETMENTGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FSSLNQKVKQTKSNVNIGNLRKLGNFTKPEMKVNFLKPNLKVNLWKSDSSLETMENTGVM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DKVQAESDGDMSSDNDSYHSDEFLTNSKSDEDRQLANSLESVGPIDYVLPSCGIIASAPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DKVQAESDGDMSSDNDSYHSDEFLTNSKSDEDRQLANSLESVGPIDYVLPSCGIIASAPR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LGSRSQSLSSTDSSVHAPSEITVAHGSGLGKGQESPLKKSPSAGDVHILTGFAKPMDIYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LGSRSQSLSSTDSSVHAPSEITVAHGSGLGKGQESPLKKSPSAGDVHILTGFAKPMDIYC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 HRFVQDAQNKVTHLSETRSVSQQASQERNQMTNQVSNETQSESTEQTPSRPSQLDVSLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HRFVQDAQNKVTHLSETRSVSQQASQERNQMTNQVSNETQSESTEQTPSRPSQLDVSLSA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 TGPQFLSVEPAHSVASQKTPTSASSMLELETGLHVTPSPSESSSSRAVSPFAKIRSSMVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TGPQFLSVEPAHSVASQKTPTSASSMLELETGLHVTPSPSESSSSRAVSPFAKIRSSMVQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VASITQAGLTHGINFAVSKVQKSPPEPEIINQVQQNELKKMFIQCQTRIIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VASITQAGLTHGINFAVSKVQKSPPEPEIINQVQQNELKKMFIQCQTRIIQI
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS58098.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 (522 aa)
initn: 3241 init1: 3241 opt: 3242 Z-score: 3248.1 bits: 611.8 E(32554): 1.3e-174
Smith-Waterman score: 3242; 99.2% identity (99.6% similar) in 508 aa overlap (625-1132:17-522)
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 HQELISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYY
.: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MCHDVIFMAWLKQQFSEC--TLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYY
10 20 30 40
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 DDEVDKVNQYQRLSLENLEKIEIGPEPTLFGKPKFSCMRLHYRYKEASGYFHTLRAVMRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DDEVDKVNQYQRLSLENLEKIEIGPEPTLFGKPKFSCMRLHYRYKEASGYFHTLRAVMRN
50 60 70 80 90 100
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 PEEDGKDTLQCIAEMLQITKQAMGSDLPIIEKKLERKSSKPHEDIIGIRSQNQGSLAQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PEEDGKDTLQCIAEMLQITKQAMGSDLPIIEKKLERKSSKPHEDIIGIRSQNQGSLAQGK
110 120 130 140 150 160
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 NFLMSKFSSLNQKVKQTKSNVNIGNLRKLGNFTKPEMKVNFLKPNLKVNLWKSDSSLETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NFLMSKFSSLNQKVKQTKSNVNIGNLRKLGNFTKPEMKVNFLKPNLKVNLWKSDSSLETM
170 180 190 200 210 220
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 ENTGVMDKVQAESDGDMSSDNDSYHSDEFLTNSKSDEDRQLANSLESVGPIDYVLPSCGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENTGVMDKVQAESDGDMSSDNDSYHSDEFLTNSKSDEDRQLANSLESVGPIDYVLPSCGI
230 240 250 260 270 280
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 IASAPRLGSRSQSLSSTDSSVHAPSEITVAHGSGLGKGQESPLKKSPSAGDVHILTGFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IASAPRLGSRSQSLSSTDSSVHAPSEITVAHGSGLGKGQESPLKKSPSAGDVHILTGFAK
290 300 310 320 330 340
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 PMDIYCHRFVQDAQNKVTHLSETRSVSQQASQERNQMTNQVSNETQSESTEQTPSRPSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMDIYCHRFVQDAQNKVTHLSETRSVSQQASQERNQMTNQVSNETQSESTEQTPSRPSQL
350 360 370 380 390 400
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 DVSLSATGPQFLSVEPAHSVASQKTPTSASSMLELETGLHVTPSPSESSSSRAVSPFAKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DVSLSATGPQFLSVEPAHSVASQKTPTSASSMLELETGLHVTPSPSESSSSRAVSPFAKI
410 420 430 440 450 460
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 RSSMVQVASITQAGLTHGINFAVSKVQKSPPEPEIINQVQQNELKKMFIQCQTRIIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSSMVQVASITQAGLTHGINFAVSKVQKSPPEPEIINQVQQNELKKMFIQCQTRIIQI
470 480 490 500 510 520
>>CCDS81513.1 INPP5F gene_id:22876|Hs108|chr10 (219 aa)
initn: 1380 init1: 1380 opt: 1380 Z-score: 1390.5 bits: 266.8 E(32554): 3.9e-71
Smith-Waterman score: 1380; 100.0% identity (100.0% similar) in 205 aa overlap (1-205:1-205)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MELFQAKDHYILQQGERALWCSRRDGGLQLRPATDLLLAWNPICLGLVEGVIGKIQLHSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MELFQAKDHYILQQGERALWCSRRDGGLQLRPATDLLLAWNPICLGLVEGVIGKIQLHSD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LPWWLILIRQKALVGKLPGDHEVCKVTKIAVLSLSEMEPQDLELELCKKHHFGINKPEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPWWLILIRQKALVGKLPGDHEVCKVTKIAVLSLSEMEPQDLELELCKKHHFGINKPEKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TYDLTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQ
:::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TYDLTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVPLTARRAGFALGKK
190 200 210
>>CCDS82762.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3 (484 aa)
initn: 949 init1: 438 opt: 895 Z-score: 899.5 bits: 177.1 E(32554): 8.8e-44
Smith-Waterman score: 1009; 39.3% identity (67.9% similar) in 417 aa overlap (166-576:18-406)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 HIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSLTYDLTNSVQRQS--T
.:. .. ..::.: :::::...:: : .
CCDS82 MLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDGFYFSTTYDLTHTLQRLSNTS
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 GERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEELVVNYTESSD
: . : ...:.:: :: .....:. . :.: . .:...::. .. .:
CCDS82 PEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELS--AQPEVHRFALPVLHGFITMHSCSIN------
50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 DEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGNVANYVETEQL
: :::::: :::.:: ::.:..:..::.:::::.
CCDS82 -------------------GKYFDWILISRRSCFRAGVRYYVRGIDSEGHAANFVETEQI
100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQV-GYRYNPRPRLDRSEKETVAYFCAHFEEQLNIYKKQ
.: .. ::::::::.:::::: . .:.: :.... .. . : ::. :. :: ::
CCDS82 VHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVANH-MDGFQRHFDSQVIIYGKQ
150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHEHCRGMKFENVQTLTDAIYDI
:::::..: : :: . ... .: .... . :..::::..:..:... .. : : . ..
CCDS82 VIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHKECKNMRWDRLSILLDQVAEM
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 ILDMKWCWVDEAG-VICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQQLKKLGVMPPEQ
.... :: :: :. .:::.:: :::::::::::.:. .:: .. ::..:::. :
CCDS82 QDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSLLARRSLQAQLQRLGVLHVGQ
260 270 280 290 300 310
500 510 520 530 540
pF1KA0 PLPVK--CNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVMKDGVNSANRYY
: . ..::. ::.:... ..:::::.::: ::::::.: :.. :: :: :::
CCDS82 KLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRTGKRTHLGLIMDGWNSMIRYY
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQELISQLLQSYMKL
: :.:..:: :::. : ...: :
CCDS82 KNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFLALPIIMVVAFSMCIICLLMA
380 390 400 410 420 430
>>CCDS33745.1 SACM1L gene_id:22908|Hs108|chr3 (587 aa)
initn: 949 init1: 438 opt: 895 Z-score: 898.2 bits: 177.1 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1010; 38.0% identity (66.8% similar) in 437 aa overlap (146-576:101-509)
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KPEKIIPSPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSES
:: . . . . . . . .:. .. ..
CCDS33 YLIVITKKIKVGEFFSHVVWKATDFDVLSYKKTMLHLTDIQLQDNKTFLAMLNHVLNVDG
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 FYYSLTYDLTNSVQRQS--TGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIP
::.: :::::...:: : . : . : ...:.:: :: .....:. . :.: . .:
CCDS33 FYFSTTYDLTHTLQRLSNTSPEFQEMSLLERADQRFVWNGHLLRELS--AQPEVHRFALP
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MIQGFVQIEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRY
...::. .. .: : :::::: :::.::
CCDS33 VLHGFITMHSCSIN-------------------------GKYFDWILISRRSCFRAGVRY
190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KRRGVDKNGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQV-GYRYNPRPRLDRSEK
::.:..:..::.:::::..: .. ::::::::.:::::: . .:.: :.... .
CCDS33 YVRGIDSEGHAANFVETEQIVHYNGSKASFVQTRGSIPVFWSQRPNLKYKPLPQISKVAN
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ETVAYFCAHFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSHLTYVSFDFHE
. . : ::. :. :: :::::::..: : :: . ... .: .... . :..::::.
CCDS33 H-MDGFQRHFDSQVIIYGKQVIINLINQKGSEKPLEQTFATMVSSLGSGMMRYIAFDFHK
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 HCRGMKFENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAG-VICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAA
.:..:... .. : : . .. .... :: :: :. .:::.:: :::::::::::.:.
CCDS33 ECKNMRWDRLSILLDQVAEMQDELSYFLVDSAGQVVANQEGVFRSNCMDCLDRTNVIQSL
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520
pF1KA0 IARVVMEQQLKKLGVMPPEQPLPVK--CNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRT
.:: .. ::..:::. : : . ..::. ::.:... ..:::::.::: :::::
CCDS33 LARRSLQAQLQRLGVLHVGQKLEEQDEFEKIYKNAWADNANACAKQYAGTGALKTDFTRT
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 GERKLAGVMKDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHK
:.: :.. :: :: ::: : :.:..:: :::. : ...: :
CCDS33 GKRTHLGLIMDGWNSMIRYYKNNFSDGFRQDSIDLFLGNYSVDELESHSPLSVPRDWKFL
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ENQRSHQELISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAY
CCDS33 ALPIIMVVAFSMCIICLLMAGDTWTETLAYVLFWGVASIGTFFIILYNGKDFVDAPRLVQ
530 540 550 560 570 580
>>CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1526 aa)
initn: 600 init1: 225 opt: 641 Z-score: 637.3 bits: 130.2 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 699; 31.2% identity (59.4% similar) in 475 aa overlap (159-621:113-535)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYS-----LTYD
: :. : .. ..: .::.. .. :
CCDS54 GCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISE--VRKVLNSGNFYFAWSASGISLD
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEE
:. ...: : : : .:.:::::. . : . :. . : :.. .. : :.:.
CCDS54 LSLNAHR-SMQE-------QTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGV-NCDDWLLRLMCGGVEIRT
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGN
. . . : ..: :::: : .::: :.. ::.. .:.
CCDS54 IYAAHK--------------QAKAC-----------LISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGH
200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNP-RPRLDRSEKETVAYFCAHF
:::.:::::.... . . ::.: :::::.:: : : . . : :..:. . .. : ::
CCDS54 VANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHF
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KA0 EEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSH---LTYVSFDFHEHCRGMKF
. :.: ::.:.::. . :.... :. : : . : . .:.::.:. .: :
CCDS54 RTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAF--QSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKA
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQ
:..... . .::. . . . . : : : :.::.::::::: ::: .. .. .
CCDS54 EKLHSVLKPQVQKFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAK
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 QLKKLGVMPPEQP-LPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVM
::. ::. :.: : .. ..... ::. ::::::. ::::.::.: . :: .
CCDS54 QLEALGL--AEKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEG-------KAKAGKL
410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVID-LMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQE
:::. :..: : : :. .: .:: :. : .. :: .: . : . :. ..
CCDS54 KDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDL-----ADKARALLTTGSLRASSK
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LISQLLQSYMKLLLPDDEKFH-GGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDD
..... ....: : . : :
CCDS54 VLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQ
520 530 540 550 560 570
>>CCDS54483.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1295 aa)
initn: 607 init1: 225 opt: 585 Z-score: 582.4 bits: 119.8 E(32554): 4e-26
Smith-Waterman score: 670; 33.0% identity (60.4% similar) in 427 aa overlap (159-574:113-489)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYS-----LTYD
: :. : .. ..: .::.. .. :
CCDS54 GCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISE--VRKVLNSGNFYFAWSASGISLD
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEE
:. ...: : : : .:.:::::. . : . :. . : :.. .. : :.:.
CCDS54 LSLNAHR-SMQE-------QTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGV-NCDDWLLRLMCGGVEIRT
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGN
. . . : ..: :::: : .::: :.. ::.. .:.
CCDS54 IYAAH--------------KQAKAC-----------LISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGH
200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNP-RPRLDRSEKETVAYFCAHF
:::.:::::.... . . ::.: :::::.:: : : . . : :..:. . .. : ::
CCDS54 VANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHF
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KA0 EEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSH---LTYVSFDFHEHCRGMKF
. :.: ::.:.::. . :.... :. : : . : . .:.::.:. .: :
CCDS54 RTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAF--QSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKA
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQ
:..... . .::. . . . . : : : :.::.::::::: ::: .. .. .
CCDS54 EKLHSVLKPQVQKFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAK
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 QLKKLGVMPPEQP-LPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVM
::. ::. :.: : .. ..... ::. ::::::. ::::.::.: . ::
CCDS54 QLEALGLA--EKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEG------KAKL----
410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVID-LMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQE
:::. :..: : : :. .: .:: :. : .. ::
CCDS54 KDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSA
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDDE
CCDS54 SSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQ
520 530 540 550 560 570
>>CCDS33540.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1350 aa)
initn: 607 init1: 225 opt: 585 Z-score: 582.1 bits: 119.8 E(32554): 4.2e-26
Smith-Waterman score: 670; 33.0% identity (60.4% similar) in 427 aa overlap (159-574:152-528)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYS-----LTYD
: :. : .. ..: .::.. .. :
CCDS33 GCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISE--VRKVLNSGNFYFAWSASGISLD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEE
:. ...: : : : .:.:::::. . : . :. . : :.. .. : :.:.
CCDS33 LSLNAHR-SMQE-------QTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGV-NCDDWLLRLMCGGVEIRT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGN
. . . : ..: :::: : .::: :.. ::.. .:.
CCDS33 IYAAH--------------KQAKAC-----------LISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGH
240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNP-RPRLDRSEKETVAYFCAHF
:::.:::::.... . . ::.: :::::.:: : : . . : :..:. . .. : ::
CCDS33 VANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KA0 EEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSH---LTYVSFDFHEHCRGMKF
. :.: ::.:.::. . :.... :. : : . : . .:.::.:. .: :
CCDS33 RTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAF--QSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKA
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQ
:..... . .::. . . . . : : : :.::.::::::: ::: .. .. .
CCDS33 EKLHSVLKPQVQKFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAK
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 QLKKLGVMPPEQP-LPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVM
::. ::. :.: : .. ..... ::. ::::::. ::::.::.: . ::
CCDS33 QLEALGLA--EKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEG------KAKL----
450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVID-LMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQE
:::. :..: : : :. .: .:: :. : .. ::
CCDS33 KDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSA
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDDE
CCDS33 SSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQ
560 570 580 590 600 610
>>CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1612 aa)
initn: 607 init1: 225 opt: 585 Z-score: 580.9 bits: 119.9 E(32554): 4.9e-26
Smith-Waterman score: 670; 33.0% identity (60.4% similar) in 427 aa overlap (159-574:152-528)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYS-----LTYD
: :. : .. ..: .::.. .. :
CCDS33 GCMSVGKIQESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISE--VRKVLNSGNFYFAWSASGISLD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQGFVQIEE
:. ...: : : : .:.:::::. . : . :. . : :.. .. : :.:.
CCDS33 LSLNAHR-SMQE-------QTTDNRFFWNQSLHLHLKHYGV-NCDDWLLRLMCGGVEIRT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRGVDKNGN
. . . : ..: :::: : .::: :.. ::.. .:.
CCDS33 IYAAH--------------KQAKAC-----------LISRLSCERAGTRFNVRGTNDDGH
240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNP-RPRLDRSEKETVAYFCAHF
:::.:::::.... . . ::.: :::::.:: : : . . : :..:. . .. : ::
CCDS33 VANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRHF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KA0 EEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSH---LTYVSFDFHEHCRGMKF
. :.: ::.:.::. . :.... :. : : . : . .:.::.:. .: :
CCDS33 RTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAF--QSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKA
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICKQEGIFRVNCMDCLDRTNVVQAAIARVVMEQ
:..... . .::. . . . . : : : :.::.::::::: ::: .. .. .
CCDS33 EKLHSVLKPQVQKFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAK
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 QLKKLGVMPPEQP-LPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGDFTRTGERKLAGVM
::. ::. :.: : .. ..... ::. ::::::. ::::.::.: . ::
CCDS33 QLEALGLA--EKPQLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEG------KAKL----
450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVID-LMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHEALHKENQRSHQE
:::. :..: : : :. .: .:: :. : .. ::
CCDS33 KDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAIDVLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSA
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLSNSAYYVAYYDDE
CCDS33 SSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNVNGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQ
560 570 580 590 600 610
>>CCDS5254.1 SYNJ2 gene_id:8871|Hs108|chr6 (1496 aa)
initn: 458 init1: 222 opt: 573 Z-score: 569.4 bits: 117.6 E(32554): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 630; 32.1% identity (57.2% similar) in 430 aa overlap (153-565:108-484)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SPDDSKFLLKTFTHIKSNVSAPNKKKVKESKEKEKLERRLLEELLKMFMDSESFYYSLT-
.:. : :.::. :: ...: ::.:
CCDS52 FLVLVTGCTSVGRIPDAEIYKITATDFYPLQEEAKEEERLIA--LKKILSSGVFYFSWPN
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230
pF1KA0 ----YDLTNSVQRQSTGERDGRPLWQKVDDRFFWNKYMIQDLTEIGTPDVDFWIIPMIQG
.::: .:.:. : : . ::::. . : . . : :.. .: :
CCDS52 DGSRFDLTVRTQKQG----DDSSEW---GNSFFWNQLLHVPLRQHQVSCCD-WLLKIICG
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FVQIEELVVNYTESSDDEKSSPETPPQESTCVDDIHPRFLVALISRRSRHRAGMRYKRRG
: :. . ... : ..: :.:: : .:.: :.. ::
CCDS52 VVTIRTVYASHK--------------QAKAC-----------LVSRVSCERTGTRFHTRG
190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 VDKNGNVANYVETEQLIHVHNHTLSFVQTRGSVPVFWSQVGYRYNPRP-RLDRSEKETVA
:. .:.:.:.:::::.:.. . . :::: :::::.:: : : . . . :: :. . ..
CCDS52 VNDDGHVSNFVETEQMIYMDDGVSSFVQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHHLRLHRGLEANAP
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 YFCAHFEEQLNIYKKQVIINLVDQAGREKIIGDAYLKQVLLFNNSH---LTYVSFDFHEH
: :. . : .::..::. . : :.... :. : ::. . : ...::::.
CCDS52 AFDRHMVLLKEQYGQQVVVNLLGSRGGEEVLNRAFKK--LLWASCHAGDTPMINFDFHQF
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460
pF1KA0 CRGMKFENVQTLTDAIYDIILDMKWCWVDEAGVICK--------QEGIFRVNCMDCLDRT
.: :.:...:: ..: : : :. : :.: .:.::.::::::
CCDS52 AKGGKLEKLETLLRP------QLKLHWEDF-DVFTKGENVSPRFQKGTLRMNCLDCLDRT
350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 NVVQAAIARVVMEQQLKKLGVMPPEQPLPVKCNRIYQIMWANNGDSISRQYAGTAALKGD
:.::. :: :.. ::: ::. .:. . . .. ::. :: :.:. ..:. ::.:
CCDS52 NTVQSFIALEVLHLQLKTLGL--SSKPIVDRFVESFKAMWSLNGHSLSKVFTGSRALEG-
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 FTRTGERKLAGVMKDGVNSANRYYLNRFKDAYRQAVIDLMQGIPVTEDLYSIFTKEKEHE
. .: .:::. : .: . : :. .: .: :.
CCDS52 ------KAKVGKLKDGARSMSRTIQSNFFDGVKQEAIKLLLVGDVYGEEVADKGGMLLDS
460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ALHKENQRSHQELISQLLQSYMKLLLPDDEKFHGGWALIDCDPSLIDATHRDVDVLLLLS
CCDS52 TALLVTPRILKAMTERQSEFTNFKRIRIAMGTWNVNGGKQFRSNVLRTAELTDWLLDSPQ
510 520 530 540 550 560
1132 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 10:36:01 2016 done: Thu Nov 3 10:36:01 2016
Total Scan time: 4.020 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]