Result of FASTA (omim) for
pF1KA0953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0953, 728 aa
1>>>pF1KA0953 728 - 728 aa - 728 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2379+/-0.000431; mu= 20.4924+/- 0.027
mean_var=68.1068+/-13.252, 0's: 0 Z-trim(109.7): 16 B-trim: 49 in 1/50
Lambda= 0.155410
statistics sampled from 17861 (17876) to 17861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 10.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055786 (OMIM: 616797) protein EFR3 homolog B is ( 817) 4627 1047.2 0
NP_001306028 (OMIM: 616797) protein EFR3 homolog B ( 782) 4367 988.9 0
NP_055952 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A is ( 821) 3003 683.1 1.2e-195
NP_001310487 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 838) 2886 656.9 9.5e-188
NP_001310485 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 785) 2795 636.5 1.2e-181
NP_001310486 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 785) 2795 636.5 1.2e-181
NP_001310484 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 785) 2795 636.5 1.2e-181
NP_001310483 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 785) 2795 636.5 1.2e-181
NP_001310482 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A ( 785) 2795 636.5 1.2e-181
XP_011531003 (OMIM: 616797) PREDICTED: protein EFR ( 808) 2672 608.9 2.6e-173
>>NP_055786 (OMIM: 616797) protein EFR3 homolog B isofor (817 aa)
initn: 4627 init1: 4627 opt: 4627 Z-score: 5601.5 bits: 1047.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4627; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILIS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 FIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEERVPAEE
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VLGQPHLL
NP_055 ITYETLKKAIVDSVAVEEQERERRRQVVEKFQKAPFEEIAAHCGARASLLQSKLNQIFEI
730 740 750 760 770 780
>>NP_001306028 (OMIM: 616797) protein EFR3 homolog B iso (782 aa)
initn: 4367 init1: 4367 opt: 4367 Z-score: 5286.7 bits: 988.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4367; 100.0% identity (100.0% similar) in 679 aa overlap (36-714:1-679)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 GCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDV
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTNSFVKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTNSFVKF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVNDELQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVNDELQA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELLGRAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELLGRAAF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDANSRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDANSRSA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVSLGTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVSLGTKI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 IKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTGENRNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTGENRNR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILISFIDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILISFIDRH
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQKHYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQKHYEA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYLNLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYLNLISQ
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKISEVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKISEVLG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVRATVLGQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEERVPAEEITYET
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 HLL
NP_001 LKKAIVDSVAVEEQERERRRQVVEKFQKAPFEEIAAHCGARASLLQSKLNQIFEITIRPP
700 710 720 730 740 750
>>NP_055952 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A isofor (821 aa)
initn: 2970 init1: 1180 opt: 3003 Z-score: 3633.6 bits: 683.1 E(85289): 1.2e-195
Smith-Waterman score: 3003; 63.3% identity (85.3% similar) in 720 aa overlap (4-716:5-721)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSE
:: ::.::::::::::::::::::.::::::.::::::::.::::::::::.::.:
NP_055 MPTRVCCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGT
:: ::: ::: ::: :::::::::::::: :::. ::::::.:::::::: .:.::.:::
NP_055 RLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NSFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTV
:::::::::::::::::: ::::::::: :::: :.: ::.:.::..::.:.::::::::
NP_055 NSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NDELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLR
::::.:.::.::::::::::::::.:..::..:: :: .: .:: :.:: ::: :.:
NP_055 NDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKE-ENPAVLAENCFR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ELLGRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGH
::::::.:::..::..::. :::.:.::.:. ::..:::::::::: :.:: :::..:::
NP_055 ELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LDANSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYA---LTGS
::: ...: :::::..:: ::..::: ::.::::::.:::::..::::... : :.
NP_055 LDARKKDAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 YDGAVSLGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPR--PSLHQ
:.:.:.:. :...:.. :.:.:.:.: :.:.:: :::::...:::.::: : :
NP_055 SVGSVNLNTSS-KDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTH-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 AVDTGRTGENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRL
..: .. :. .: :::::.:::.:..:.. .....:::..::: ::: .:::: :.:
NP_055 TLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 FVLEILISFIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLS
.:::.. ...::: :: :. : . :.. ::.: .: :::: ::::..:::::::::.
NP_055 LVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 CKEETNVQKHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCAL
:::: ::::.:: :: ::::.:::::::::.:::::..:.:: : .::.:::...::..
NP_055 CKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 YALGAAYLNLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIE
.:: :::::..::. .:::::::. .::: : ::::.::: .: .. : ..:. .
NP_055 MALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKD
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 LLFRQSKISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEK
: : .::.: ::::::. .:: .::.::.:::::::.:.:: .:.:.::.. : : :
NP_055 LYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSD
660 670 680 690 700 710
720
pF1KA0 EEVSVRATVLGQPHLL
. ::
NP_055 DVVSNTEEITFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDR
720 730 740 750 760 770
>>NP_001310487 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A iso (838 aa)
initn: 2956 init1: 1180 opt: 2886 Z-score: 3491.7 bits: 656.9 E(85289): 9.5e-188
Smith-Waterman score: 2959; 61.9% identity (83.3% similar) in 737 aa overlap (4-716:5-738)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSE
:: ::.::::::::::::::::::.::::::.::::::::.::::::::::.::.:
NP_001 MPTRVCCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGT
:: ::: ::: ::: :::::::::::::: :::. ::::::.:::::::: .:.::.:::
NP_001 RLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NSFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTV
:::::::::::::::::: ::::::::: :::: :.: ::.:.::..::.:.::::::::
NP_001 NSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NDELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLR
::::.:.::.::::::::::::::.:..::..:: :: .: .:: :.:: ::: :.:
NP_001 NDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKE-ENPAVLAENCFR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 ELLGRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGH
::::::.:::..::..::. :::.:.::.:. ::..:::::::::: :.:: :::..:::
NP_001 ELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LDANSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYA---LTGS
::: ...: :::::..:: ::..::: ::.::::::.:::::..::::... : :.
NP_001 LDARKKDAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 YDGAVSLGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPR--PSLHQ
:.:.:.:. :...:.. :.:.:.:.: :.:.:: :::::...:::.::: : :
NP_001 SVGSVNLNTSS-KDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTH-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 AVDTGRTGENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRL
..: .. :. .: :::::.:::.:..:.. .....:::..::: ::: .:::: :.:
NP_001 TLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 FVLEILISFIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLS
.:::.. ...::: :: :. : . :.. ::.: .: :::: ::::..:::::::::.
NP_001 LVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 CKEETNVQKHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCAL
:::: ::::.:: :: ::::.:::::::::.:::::..:.:: : .::.:::...::..
NP_001 CKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGI
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pF1KA0 KISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVR
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pF1KA0 ATVLGQPHLL
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pF1KA0 GCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDV
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pF1KA0 NIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELLGRA
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pF1KA0 AFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDANSR
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NP_001 TFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKK
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NP_001 YLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYFLTN
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 KISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVR
::.: ::::::. .:: .::.::.:::::::.:.:: .:.:.::.. : : : . ::
NP_001 KIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVVSNT
630 640 650 660 670 680
720
pF1KA0 ATVLGQPHLL
NP_001 EEITFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILE
690 700 710 720 730 740
>>NP_001310482 (OMIM: 611798) protein EFR3 homolog A iso (785 aa)
initn: 2762 init1: 1094 opt: 2795 Z-score: 3381.8 bits: 636.5 E(85289): 1.2e-181
Smith-Waterman score: 2795; 62.2% identity (84.7% similar) in 688 aa overlap (36-716:1-685)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 GCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDV
::::::::.::::::::::.::.::: :::
NP_001 MEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTNSFVKF
::: ::: :::::::::::::: :::. ::::::.:::::::: .:.::.:::::::::
NP_001 VRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVNDELQA
:::::::::::: ::::::::: :::: :.: ::.:.::..::.:.::::::::::::.:
NP_001 ANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELLGRA
.::.::::::::::::::.:..::..:: :: .: .:: :.:: ::: :.:::::::
NP_001 TIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKE-ENPAVLAENCFRELLGRA
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDANSR
.:::..::..::. :::.:.::.:. ::..:::::::::: :.:: :::..:::::: ..
NP_001 TFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKK
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYA---LTGSYDGAVS
.: :::::..:: ::..::: ::.::::::.:::::..::::... : :. :.:.
NP_001 DAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGSVGSVN
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KA0 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPR--PSLHQAVDTGR
:.:. :...:.. :.:.:.:.: :.:.:: :::::...:::.::: : : ..: ..
NP_001 LNTSS-KDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTH-TLDISQ
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 TGENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEIL
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NP_001 LGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVM
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ISFIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETN
...::: :: :. : . :.. ::.: .: :::: ::::..:::::::::.:::: :
NP_001 HNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDN
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VQKHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAA
:::.:: :: ::::.:::::::::.:::::..:.:: : .::.:::...::...:: ::
NP_001 VQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMALVAA
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 YLNLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQS
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NP_001 YLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYFLTN
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 KISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVR
::.: ::::::. .:: .::.::.:::::::.:.:: .:.:.::.. : : : . ::
NP_001 KIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVVSNT
630 640 650 660 670 680
720
pF1KA0 ATVLGQPHLL
NP_001 EEITFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILE
690 700 710 720 730 740
>>XP_011531003 (OMIM: 616797) PREDICTED: protein EFR3 ho (808 aa)
initn: 2669 init1: 2669 opt: 2672 Z-score: 3232.6 bits: 608.9 E(85289): 2.6e-173
Smith-Waterman score: 4535; 98.7% identity (98.7% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESRSPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
XP_011 GRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQ---------QLLGHLDA
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYALTGSYDGAVS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVPRPSLHQAVDTGRTG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEILIS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 FIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETNVQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAAYL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQSKI
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEEVSVRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEERVPAEE
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 VLGQPHLL
XP_011 ITYETLKKAIVDSVAVEEQERERRRQVVEKFQKAPFEEIAAHCGARASLLQSKLNQIFEI
720 730 740 750 760 770
728 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:08:29 2016 done: Wed Nov 2 20:08:30 2016
Total Scan time: 10.850 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]