Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0944
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0944, 4024 aa
1>>>pF1KA0944 4024 - 4024 aa - 4024 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6020+/-0.00143; mu= 21.8350+/- 0.085
mean_var=87.9942+/-17.258, 0's: 0 Z-trim(99.1): 42 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.136725
statistics sampled from 5578 (5606) to 5578 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.488), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 8.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42794.1 DNAH7 gene_id:56171|Hs108|chr2 (4024) 26719 5282.6 0
CCDS10594.1 DNAH3 gene_id:55567|Hs108|chr16 (4116) 8362 1661.6 0
CCDS46842.1 DNAH1 gene_id:25981|Hs108|chr3 (4265) 6430 1280.5 0
CCDS3882.1 DNAH5 gene_id:1767|Hs108|chr5 (4624) 4272 854.9 0
CCDS75447.1 DNAH8 gene_id:1769|Hs108|chr6 (4707) 4253 851.1 0
CCDS9255.2 DNAH10 gene_id:196385|Hs108|chr12 (4471) 2560 517.2 1.2e-144
CCDS64602.1 DNAH11 gene_id:8701|Hs108|chr7 (4516) 2162 438.7 5.2e-121
CCDS32551.1 DNAH2 gene_id:146754|Hs108|chr17 (4427) 2096 425.7 4.2e-117
CCDS53701.1 DYNC2H1 gene_id:79659|Hs108|chr11 (4307) 1883 383.6 1.8e-104
CCDS46348.1 DNAH6 gene_id:1768|Hs108|chr2 (4158) 1856 378.3 7.1e-103
CCDS44717.1 DYNC2H1 gene_id:79659|Hs108|chr11 (4314) 1855 378.1 8.5e-103
CCDS11160.1 DNAH9 gene_id:1770|Hs108|chr17 (4486) 1827 372.6 4e-101
CCDS11161.1 DNAH9 gene_id:1770|Hs108|chr17 ( 798) 1701 347.5 2.6e-94
CCDS9966.1 DYNC1H1 gene_id:1778|Hs108|chr14 (4646) 563 123.3 4.7e-26
CCDS33771.1 DNAH12 gene_id:201625|Hs108|chr3 ( 457) 358 82.5 8.7e-15
>>CCDS42794.1 DNAH7 gene_id:56171|Hs108|chr2 (4024 aa)
initn: 26719 init1: 26719 opt: 26719 Z-score: 28465.5 bits: 5282.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 26719; 99.9% identity (99.9% similar) in 4024 aa overlap (1-4024:1-4024)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSEQDKSASKEKSKKPVRFLPQLSMEKLASKEKFKAPARALPQLSMVSTKPHWQQAAPS
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CCDS42 MSSEQDKSASKEKSKKPVRFLPQLSMEKLASKEKFKAPARALPQLSMVSTKPHWQQAAPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 FHLSVKQDDESPEPFSVKNEQSHAEYMERFGKKGKLPHQVDDSYVGPSTSKSKGKSPHKE
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CCDS42 FHLSVKQDDESPEPFSVKNEQSHAEYMERFGKKGKLPHQVDDSYVGPSTSKSKGKSPHKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RENFRSTLVNVIMQQDADLDSAVPDGSTIPKPTASAIEKDILRYYYYIHHGIDTDHVAPM
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CCDS42 RENFRSTLVNVIMQQDADLDSAVPDGSTIPKPTASAIEKDILRYYYYIHHGIDTDHVAPM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EDSWLEHVLDLVPQHLKVFTDSIVTLSDEMREDYLLSVRKSIVDFVLKDPREKGDDKKTD
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CCDS42 EDSWLEHVLDLVPQHLKVFTDSIVTLSDEMREDYLLSVRKSIVDFVLKDPREKGDDKKTD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ELPAHRAEMEILPKPWRKSFLAASSYIRDHLNAMNPTMLAVLDLWHTNFKKLRLVDIKEF
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CCDS42 ELPAHRAEMEILPKPWRKSFLAASSYIRDHLNAMNPTMLAVLDLWHTNFKKLRLVDIKEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 HNCQDALELSSFQNIIMRHMDSAKETLLKMWFPEVQNIYYQGNKKKQLPTGDSSAKLESF
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CCDS42 HNCQDALELSSFQNIIMRHMDSAKETLLKMWFPEVQNIYYQGNKKKQLPTGDSSAKLESF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FNCAAALMTLQLQDLTLVSMQDFTDLIAQPPDSVRAFEHPGFIMRLILDNDTIKFEPELS
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CCDS42 FNCAAALMTLQLQDLTLVSMQDFTDLIAQPPDSVRAFEHPGFIMRLILDNDTIKFEPELS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DYIDIFLNVYDVMIKAVSFVPRVETKLYSKWESKSKPTTLKPIILNEIVDAHKEKIKEVI
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CCDS42 DYIDIFLNVYDVMIKAVSFVPRVETKLYSKWESKSKPTTLKPIILNEIVDAHKEKIKEVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 MKESVAPTEHLRLYDKYDFLITRKAERDVDNFLAENHSYEKIIDEICKYQKLIEEIQYTS
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CCDS42 MKESVAPTEHLRLYDKYDFLITRKAERDVDNFLAENHSYEKIIDEICKYQKLIEEIQYTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 IKTICLGMFEMHCEELIRALVKRADIICGKLLAKMFRDHQEVNTRLCDEFERIAEKALST
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IKTIRLGMFEMHCEELIRALVKRADIICGKLLAKMFRDHQEVNTRLCDEFERIAEKALST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PPNTAELMEMKAYIQKVEVTDMIELEQRLVDSKNCLAFLIEYVNFSPADMRLNNSVFQWY
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CCDS42 PPNTAELMEMKAYIQKVEVTDMIELEQRLVDSKNCLAFLIEYVNFSPADMRLNNSVFQWY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GRMGEIFEEHRKIIKEKIEQYQEGLKLRCERFVEELESYAKQSEEFYSFGDLQDVQRYLK
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CCDS42 GRMGEIFEEHRKIIKEKIEQYQEGLKLRCERFVEELESYAKQSEEFYSFGDLQDVQRYLK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KAQILNGKLDLAADKIEQFNAEEEAFGWLPSVYPQRKKIQDGLNPYLRLYETAVEFSSNY
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CCDS42 KAQILNGKLDLAADKIEQFNAEEEAFGWLPSVYPQRKKIQDGLNPYLRLYETAVEFSSNY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 RAWTEGPYHKVNPDQVEADIGNYWRGLYKLEKTFHDSPYALAMTKKVRSKVEDFKQHIPL
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CCDS42 RAWTEGPYHKVNPDQVEADIGNYWRGLYKLEKTFHDSPYALAMTKKVRSKVEDFKQHIPL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 IQVICNPGLRPRHWEAMSAIVGYPLQPSDDSTVSSFLDMNLEPYIDRFEGISEAASKEYS
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CCDS42 IQVICNPGLRPRHWEAMSAIVGYPLQPSDDSTVSSFLDMNLEPYIDRFEGISEAASKEYS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LEKAMEKMITEWDAVEFVIHSYRETGTFILASVDEIQMLLDDHIIKTQTMRGSPFIKPYE
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CCDS42 LEKAMEKMITEWDAVEFVIHSYRETGTFILASVDEIQMLLDDHIIKTQTMRGSPFIKPYE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KQMREWEGKLLLLQEILDEWLKVQATWLYLEPIFSSPDIMSQMPEEGRRFTAVDKTWRDT
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CCDS42 KQMREWEGKLLLLQEILDEWLKVQATWLYLEPIFSSPDIMSQMPEEGRRFTAVDKTWRDI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 MRSVMQDKHVLTVVTIDRMLERLKKSNELLELILKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELL
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CCDS42 MRSVMQDKHVLTVVTIDRMLERLKKSNELLELILKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EILSETKDPTRVQPHLKKCFEGIAKVEFTETLDITHMKSSEGEVVELIEIISTAKARGQV
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CCDS42 EILSETKDPTRVQPHLKKCFEGIAKVEFTETLDITHMKSSEGEVVELIEIISTAKARGQV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EKWLVELERVMINSIHKVTGDATFAYTKYERINWVRDWPGQTVLCVSQIFWTKEVQTAIP
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CCDS42 EKWLVELERVMINSIHKVTGDATFAYTKYERINWVRDWPGQTVLCVSQIFWTKEVQTAIP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 MGIKALEQYLKTCNRQIDDIVTLVRGKLSMQNRVTLGALVVLDVHARDVLSSLVKKNISD
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CCDS42 MGIKALEQYLKTCNRQIDDIVTLVRGKLSMQNRVTLGALVVLDVHARDVLSSLVKKNISD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 DSDFEWLSQLRYYWQENHLETKMINAGLRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLFGALHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSDFEWLSQLRYYWQENHLETKMINAGLRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLFGALHL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 HLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLLSCGAWACFD
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CCDS42 HLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLLSCGAWACFD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 EFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINAGADILMFEGTELKLDPTCAVFITMNPGYAGRSEL
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CCDS42 EFNRIDLEVLSVVAQQILTIQRGINAGADILMFEGTELKLDPTCAVFITMNPGYAGRSEL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 PDNLKALFRTVAMMVPDYAMIAEIVLYSCGFVTARPLSVKIVATYRLCSEQLSSQHHYDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PDNLKALFRTVAMMVPDYAMIAEIVLYSCGFVTARPLSVKIVATYRLCSEQLSSQHHYDY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 GMRAVKSVLTAAGNLKLKYPNENEEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGVK
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CCDS42 GMRAVKSVLTAAGNLKLKYPNENEEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGVK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LPKPDYNDLLAAIKDNCASMNLQMTAFFSEKILQVYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYR
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CCDS42 LPKPDYNDLLAAIKDNCASMNLQMTAFFSEKILQVYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 VLAGALNDICEKGLMEENKVQITVLNPKSVTMGQLYGQFDSVSHEWSDGVLAVSFRAFAS
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CCDS42 VLAGALNDICEKGLMEENKVQITVLNPKSVTMGQLYGQFDSVSHEWSDGVLAVSFRAFAS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 SVTPDRKWLIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVAS
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CCDS42 SVTPDRKWLIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVAS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 PATVSRCGMIYMEPHMLGWRPLMLSWVNLLPASVSVIQKEFIMGLFDRMVPVSVEFIRKH
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CCDS42 PATVSRCGMIYMEPHMLGWRPLMLSWVNLLPASVSVIQKEFIMGLFDRMVPVSVEFIRKH
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 TKELSPTSDTNLVRSLMNLIDCFMDDFADEVKLKERNDRETYSLLEGIFLFSLIWSVGAS
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CCDS42 TKELSPTSDTNLVRSLMNLIDCFMDDFADEVKLKERNDRETYSLLEGIFLFSLIWSVGAS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 CTDDDRLKFNKILRELMESPISDRTRNTFKLQSGTEQTSSKALTVPFPEKGTIYDYQFVT
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CCDS42 CTDDDRLKFNKILRELMESPISDRTRNTFKLQSGTEQTSSKALTVPFPEKGTIYDYQFVT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 EGIGKWEPWIKKLKEAPPIPKDVMFNEIIVPTLDTIRYSALMELLTTHQKPSIFVGPTGT
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CCDS42 EGIGKWEPWIKKLKEAPPIPKDVMFNEIIVPTLDTIRYSALMELLTTHQKPSIFVGPTGT
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 GKSVYITNFLLNQLNKEIYKPLLINFSAQTTAAQTQNIVMSKLDKRRKGVFGPPLGKRMV
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CCDS42 GKSVYITNFLLNQLNKEIYKPLLINFSAQTTAAQTQNIVMSKLDKRRKGVFGPPLGKRMV
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 VFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHWNWYDLKDCSMIKLVDIQIMCAMGPPGGGRN
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CCDS42 VFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHWNWYDLKDCSMIKLVDIQIMCAMGPPGGGRN
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 PVTPRYMRHFNIITINEFSDKSMYTIFSRILTWHLEICYKFPDEFLDLTTQIVNGTMTLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PVTPRYMRHFNIITINEFSDKSMYTIFSRILTWHLEICYKFPDEFLDLTTQIVNGTMTLY
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 KEAMKNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETTETTEVIKRLWVHEVLRVYYDRL
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CCDS42 KEAMKNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETTETTEVIKRLWVHEVLRVYYDRL
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 LDNTDRSWLINYIQEILRNYMYEDFHELFQRLDFDNDGMVEADDLRSLMFCDFHDPKRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LDNTDRSWLINYIQEILRNYMYEDFHELFQRLDFDNDGMVEADDLRSLMFCDFHDPKRED
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 TNYREIADVDNLRMIVEIHLEEYNNISKKPMNLVLFRFAIEHISRISRILKQPRSHALLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TNYREIADVDNLRMIVEIHLEEYNNISKKPMNLVLFRFAIEHISRISRILKQPRSHALLV
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 GVGGSGRQSVTRLAAHMADYSVFQVEISKGYDTTEWHEDLKVILRKCAEGEMQGVFLFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GVGGSGRQSVTRLAAHMADYSVFQVEISKGYDTTEWHEDLKVILRKCAEGEMQGVFLFTD
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 TQIKEESFLEDVSNLLNAGEIPNLFALDEKQEICDKMRQLDRQRDKTKQTDGSPIALFNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TQIKEESFLEDVSNLLNAGEIPNLFALDEKQEICDKMRQLDRQRDKTKQTDGSPIALFNM
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 FIDHCRSQLHVVLAMSPIGDAFRNRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPEDALQAVASRFLEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FIDHCRSQLHVVLAMSPIGDAFRNRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPEDALQAVASRFLEEI
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KA0 EMSEEIRDGCIDMCKSFHTSTIDLSKSFFVELQRYNYVTPTSYLELISTFKLLLEKKRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EMSEEIRDGCIDMCKSFHTSTIDLSKSFFVELQRYNYVTPTSYLELISTFKLLLEKKRSE
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KA0 VMKMKKRYEVGLEKLDSASSQVATMQMELEALHPQLKVASKEVDEMMIMIEKESVEVAKT
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CCDS42 VMKMKKRYEVGLEKLDSASSQVATMQMELEALHPQLKVASKEVDEMMIMIEKESVEVAKT
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KA0 EKIVKADETIANEQAMASKAIKDECDADLAGALPILESALAALDTLTAQDITVVKSMKSP
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CCDS42 EKIVKADETIANEQAMASKAIKDECDADLAGALPILESALAALDTLTAQDITVVKSMKSP
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KA0 PAGVKLVMEAICILKGIKADKIPDPTGSGKKIEDFWGPAKRLLGDMRFLQSLHEYDKDNI
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CCDS42 PAGVKLVMEAICILKGIKADKIPDPTGSGKKIEDFWGPAKRLLGDMRFLQSLHEYDKDNI
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KA0 PPAYMNIIRKNYIPNPDFVPEKIRNASTAAEGLCKWVIAMDSYDKVAKIVAPKKIKLAAA
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CCDS42 PPAYMNIIRKNYIPNPDFVPEKIRNASTAAEGLCKWVIAMDSYDKVAKIVAPKKIKLAAA
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KA0 EGELKIAMDGLRKKQAALKEVQDKLARLQDTLELNKQKKADLENQVDLCSKKLERAEQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGELKIAMDGLRKKQAALKEVQDKLARLQDTLELNKQKKADLENQVDLCSKKLERAEQLI
2830 2840 2850 2860 2870 2880
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CCDS10 VSRCGMIYMEPHQLGWKPLKDSYMDTLPSSLTKEHKELVNDMFMWLVQPCLEFGRLHCKF
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. :: .:. :.: : . ..:.. .:..: : .... . :.:.:::::.:.:.
CCDS10 VVQTSPIHLAFSMMRLYSSLLDEIRAVEEEEMELGEGLSSQQIFLWLQGLFLFSLVWTVA
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CCDS10 GTINADSRKKFDVFFRNLIMGMDDNHPRPKSVKLTKNN----------IFPERGSIYDFY
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1240 1250 1260 1270 1280 1290
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 LERLKKSNELLELILKGLNEYLEKKRLFFPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQPHLKKC
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CCDS46 LDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLETKRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKC
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1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 FEGIAKVEFTETLDITHMKSSEGEVVELIEIISTAKARGQVEKWLVELERVMINSIHKVT
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CCDS46 FENIARLLFQEDLEITHMYSAEGEEVQLCFSIYPSS---NVEDWLREVERSMKASVHDII
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 GDATFAYTKYERINWVRDWPGQTVLCVSQIFWTKEVQTAIPMGIKALEQYLKTCNRQIDD
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CCDS46 EKAIRAYPTMPRTQWVLNWPGQVTIAGCQTYWTMEVAEALEAGNLRSQLFPQLC-QQLSD
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KA0 IVTLVRGKLSMQNRVTLGALVVLDVHARDVLSSLVKKNISDDSDFEWLSQLRYYWQENHL
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CCDS46 LVALVRGKLSRMQRAVLSALIVIEVHAKDVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDL
1480 1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KA0 ETKMINAGLRYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLFGALHLHLGGAPEGPAGTGKTETTK
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CCDS46 YIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTK
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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pF1KA0 DLAKAVAKQCVVFNCSDGLDYLALGKFFKGLLSCGAWACFDEFNRIDLEVLSVVAQQILT
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CCDS46 DLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITT
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KA0 IQRGINAGADILMFEGTELKLDPTCAVFITMNPGYAGRSELPDNLKALFRTVAMMVPDYA
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CCDS46 IQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYA
1660 1670 1680 1690 1700 1710
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pF1KA0 MIAEIVLYSCGFVTARPLSVKIVATYRLCSEQLSSQHHYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKY
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CCDS46 MITEISLYSFGFNEASVLAKKITTTFKLSSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKREN
1720 1730 1740 1750 1760 1770
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pF1KA0 PNENEEILLLRSIIDVNLPKFLSHDLPLFEGITSDLFPGVKLPKPDYNDLLAAIKDNCAS
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CCDS46 PSMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPTIKEEDTDYGILDEAIREACRN
1780 1790 1800 1810 1820 1830
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pF1KA0 MNLQMTAFFSEKILQVYEMMIVRHGFMIVGEPFGGKTSAYRVLAGALNDICEK----GLM
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CCDS46 SNLKDVEGFLTKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGM
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA0 EENKVQITVLNPKSVTMGQLYGQFDSVSHEWSDGVLAVSFRAFASSVTPDRKWLIFDGPV
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CCDS46 YEA-VNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKKWYMFDGPV
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pF1KA0 DAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMNLIFEPMDLEVASPATVSRCGMIYMEPH
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CCDS46 DAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPS
1960 1970 1980 1990 2000 2010
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA0 MLGWRPLMLSWVNLLPASVSVIQKEFIMGLFDRMVPVSVEFIRKHTKELSPTSDTNLVRS
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CCDS46 ILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHF-KALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLTMS
2020 2030 2040 2050 2060 2070
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA0 LMNLIDCFMDDFADEVKLK----ERNDRETYSLLEGIFLFSLIWSVGASCTDDDRLKFNK
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CCDS46 LLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSR-IVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFSH
2080 2090 2100 2110 2120
1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 ILRELMESPISDRTRNTFKLQSGTEQTSSKALTVPFPEKGTIYDYQFVTEGIG-------
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CCDS46 WLRLKMEN----------------EQ-----LTLLFPEEGLVFDYRLEDAGISGTNDSED
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pF1KA0 -----KWEPWIKKLKEAPP---IPKDVMFNEIIVPTLDTIRYSALMELLTTHQKPSIFVG
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CCDS46 EEEEYKQVAWVKWMDSSAPFTMVP-DTNYCNIIVPTMDTVQMSHLLDMLLTNKKPVLCIG
2170 2180 2190 2200 2210 2220
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KA0 PTGTGKSVYITNFLLNQLNKEIYKPLLINFSAQTTAAQTQNIVMSKLDKRRKGVFGPPLG
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CCDS46 PTGTGKTLTISDKLLKNLALD-YISHFLTFSARTSANQTQDFIDSKLDKRRKGVFGPPLG
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KA0 KRMVVFVDDVNMPAREVYGAQPPIELLRQWLDHWNWYDLKDCSMIK-LVDIQIMCAMGPP
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CCDS46 RNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
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pF1KA0 GGGRNPVTPRYMRHFNIITINEFSDKSMYTIFSRIL-TWHL----EICYK--FPD--EFL
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CCDS46 GGGRNTVTPRLMRHFNYLSFAEMDEVSKKRIFSTILGNWLDGLLGEKSYRERVPGAPHIA
2350 2360 2370 2380 2390 2400
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pF1KA0 DLTTQIVNGTMTLYKEAMKNLLPTPAKSHYLFNLRDFSRVIQGVCLSRPETTETTEVIKR
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CCDS46 HFTEPLVEATIMVYATITSQLLPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGMLMADPAKVEDQVQLLR
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pF1KA0 LWVHEVLRVYYDRLLDNTDRSWLINYIQEILRNYMYEDFHELFQRLDFDNDGMVEADDLR
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CCDS46 LWYHENCRVFRDRLVNEEDRSWF----DQLLKRCM-EQWEVTFNKVC----------PFQ
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pF1KA0 SLMFCDFHDPKREDTNYREIADVDNLRMIVEIHLEEYNNISKKPMNLVLFRFAIEHISRI
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CCDS46 PILYGDFMSPGSDVKSYELITSESKMMQVIEEYIEDYNQINTAKLKLVLFMDAMSHICRI
2520 2530 2540 2550 2560 2570
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pF1KA0 SRILKQPRSHALLVGVGGSGRQSVTRLAAHMADYSVFQVEISKGYDTTEWHEDLKVILRK
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CCDS46 SRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQIELSKNYGMSEWRDDVKKVLLK
2580 2590 2600 2610 2620 2630
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pF1KA0 CAEGEMQGVFLFTDTQIKEESFLEDVSNLLNAGEIPNLFALDEKQEICDKMRQLDRQRDK
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CCDS46 AGLQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNVLNSGDIPNLYTADEQDQIVSTMRPYI-QEQG
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pF1KA0 TKQTDGSPIALFNMFIDHCRSQLHVVLAMSPIGDAFRNRLRKFPALVNCCTIDWFQSWPE
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CCDS46 LQPTKAN---LMAAYTGRVRSNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPA
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pF1KA0 DALQAVASRFLEEI---EMSEEIRDGCIDMCKSFHTSTIDLSKSFFVELQRYNYVTPTSY
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CCDS46 EALKSVATVFLNEIPELESSQEEIQGLIQVCVYIHQSVSKKCIEYLAELTRHNYVTPKSY
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pF1KA0 LELISTFKLLLEKKRSEVMKMKKRYEVGLEKLDSASSQVATMQMELEALHPQLKVASKEV
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CCDS46 LELLHIFSILIGQKKLELKTAKNRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQEDLESMHPLLEEAAKDT
2810 2820 2830 2840 2850 2860
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pF1KA0 DEMMIMIEKESVEVAKTEKIVKADETIANEQAMASKAIKDECDADLAGALPILESALAAL
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CCDS46 MLTMEQIKVDTAIAEETRNSVQTEEIKANEKAKKAQAIADDAQKDLDEALPALDAALASL
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pF1KA0 DTLTAQDITVVKSMKSPPAGVKLVMEAICILKGIKADKIPDPTGSGKKIEDFWGPAKRLL
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CCDS46 RNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEK-PGTKVDDYWEPGKGLL
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pF1KA0 GDM-RFLQSLHEYDKDNIPPAYMNIIRKNYIPNPDFVPEKIRNASTAAEGLCKWVIAMDS
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CCDS46 QDPGHFLESLFKFDKDNIGDVVIKAIQP-YIDNEEFQPATIAKVSKACTSICQWVRAMHK
2990 3000 3010 3020 3030 3040
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pF1KA0 YDKVAKIVAPKKIKLAAAEGELKIAMDGLRKKQAALKEVQDKLARLQDTLELNKQKKADL
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CCDS46 YHFVAKAVEPKRQALLEAQDDLGVTQRILDEAKQRLREVEDGIATMQAKYRECITKKEEL
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pF1KA0 ENQVDLCSKKLERAEQLIGGLGGEKTRWSHTALELGQLYINLTGDILISSGVVAYLGAFT
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CCDS46 ELKCEQCEQRLGRAGKLINGLSDEKVRWQETVENLQYMLNNISGDVLVAAGFVAYLGPFT
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pF1KA0 STYRQNQTKEWTTLCKGRDIPCSDDCSLMGTLGEAVTIRTWNIAGLPSDSFSIDNGIIIM
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CCDS46 GQYRTVLYDSWVKQLRSHNVPHTSEPTLIGTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQ
3170 3180 3190 3200 3210 3220
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pF1KA0 NARRWPLMIDPQSQANKWIKNMEKANSLYVIKLSEPDYVRTLENCIQFGTPVLLENVGEE
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CCDS46 FSQRWTHFIDPQSQANKWIKNMEKDNGLDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEE
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pF1KA0 LDPILEPLLLKQTFKQGGSTCIRLGDSTIEYAPDFRFYITTKLRNPHYLPETSVKVTLLN
::: :::.:::::.:: :.: ..:::..: : :::.:::::: :::: :: :.:.::.:
CCDS46 LDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYTPEISTKLTLIN
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CCDS46 FTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNP
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CCDS46 VDDMELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAIRTQILFFCVSDLAN
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pF1KA0 IEPMYQYSLTWFINLFILSIENSEKSEILAKRLQILKDHFTYSLYVNVCRSLFEKDKLLF
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CCDS46 VDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRISNINRYLTYSLYSNVCRSLFEKHKLMF
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pF1KA0 SFCLTINLLLHERAINKAEWRFLLTGG---IGLDNPYANPCTWLPQKSWDEICRLDDLPA
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CCDS46 AFLLCVRIMMNEGKINQSEWRYLLSGGSISIMTENPAPD---WLSDRAWRDILALSNLPT
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pF1KA0 FKTIRREFMRLKDGWKKVYDSLEPHHEVFPEEWEDKANEFQRMLIIRCLRPDKVIPMLQE
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CCDS46 FSSFSSDFVKHLSEFRVIFDSLEPHREPLPGIWDQYLDQFQKLLVLRCLRGDKVTNAMQD
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CCDS46 FVATNLEPRFIEPQTANLSVVFKDSNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFS-KKLS
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CCDS46 AISLGQGQGPRAEAMMRSSIERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLW
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::: :: .::::.:::: ::: : :.:.:::...:: . ... .:..::.: :::.::
CCDS46 LTSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVRANLLKSY--SSLGE-DFLNSCHKVMEFKSLL
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pF1KA0 YGLCFFHALVQERRKFGPLGWNIPYEFNETDLRISVQQLHMFLNQYEELPYEALRYMTGE
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CCDS46 LSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLRICISQLKMFLDEYDDIPYKVLKYTAGE
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pF1KA0 CNYGGRVTDDWDRRTLRSILNKFFNPELVENSDYKFDSSGIYF-VPPSGDHKSYIEYTKT
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CCDS46 INYGGRVTDDWDRRCIMNILEDFYNPD-VLSPEHSYSASGIYHQIPPTYDLHGYLSYIKS
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CCDS46 LPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALLGTIIQLQPKSSSAGSQGREEIVEDVTQNILL
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pF1KA0 KLPNNFDIEAAMRRYPTTYTQSMNTVLVQEMGRFNKLLKTIRDSCVNIQKAIKGLAVMST
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CCDS46 KVPEPINLQWVMAKYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNRLLQVITQTLQDLLKALKGLVVMSS
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CCDS46 QLELMAASLYNNTVPELWSAKAYPSLKPLSSWVMDLLQRLDFLQAWIQDGIPAVFWISGF
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CCDS46 FFPQAFLTGTLQNFARKFVISIDTISFDFKVMFEAPSELTQRPQVGCYIHGLFLEGARWD
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CCDS46 PEAFQLAESQPKELYTEMAVIWLLPTPNRKAQDQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNY
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CCDS32 EINLVWSCGIFITMNPGYAGRTELPENLKSMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKI
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CCDS32 PLQR-----MFEKLINKMLAFKKDNCKELVPLPEYSGITSLCKLYSALA---TPENGVNP
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CCDS32 YRPCAQRASILFFVLNDMGCIDPMYQFSLDAYISLFILSIDKSHRSNKLEDRIDYLNDYH
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CCDS32 TYAVYRYTCRTLFERHKLLFSFHMCAKILETSGKLNMDEYNFFLRGGVVLDREGQMDNPC
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CCDS32 SSWLADAYWDNITELDKLTNFHGLMNSFEQYPRDWHLWYTNAAPEKAMLPGEWENACNEM
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CCDS32 QRMLIVRSLRQDRVAFCVTSFIITNLGSRFIEPPVLNMKSVLEDSTPRSPLVFILSPGVD
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CCDS53 LSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGI--------------FDTSWVSMKSFLAKRGVRE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]