Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0942
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0942, 513 aa
1>>>pF1KA0942 513 - 513 aa - 513 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4775+/-0.000916; mu= 12.7578+/- 0.055
mean_var=89.1911+/-17.242, 0's: 0 Z-trim(107.2): 57 B-trim: 4 in 1/51
Lambda= 0.135804
statistics sampled from 9391 (9445) to 9391 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 3.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 ( 513) 3379 672.2 3.7e-193
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047) 3279 652.8 5.5e-187
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 ( 771) 1945 391.3 2e-108
CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 ( 645) 1904 383.3 4.5e-106
CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024) 1904 383.4 6.7e-106
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs108|chr2 (1056) 1286 262.3 1.9e-69
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs108|chr7 ( 399) 384 85.4 1.3e-16
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 397) 363 81.3 2.3e-15
CCDS42392.2 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 398) 363 81.3 2.3e-15
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs108|chr19 ( 399) 358 80.3 4.5e-15
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs108|chr22 ( 394) 323 73.4 5.1e-13
CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs108|chr8 (1849) 332 75.5 5.9e-13
CCDS7533.1 GBF1 gene_id:8729|Hs108|chr10 (1859) 330 75.1 7.8e-13
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 ( 963) 310 71.1 6.6e-12
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (1114) 310 71.1 7.5e-12
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 ( 759) 304 69.8 1.2e-11
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 (1182) 304 69.9 1.8e-11
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX ( 949) 293 67.7 6.5e-11
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX (1488) 293 67.8 9.7e-11
>>CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (513 aa)
initn: 3379 init1: 3379 opt: 3379 Z-score: 3581.2 bits: 672.2 E(32554): 3.7e-193
Smith-Waterman score: 3379; 100.0% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSILKEGGKELLSNDESEAAGLKKSHSSPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSILKEGGKELLSNDESEAAGLKKSHSSPSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KA0 NPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
490 500 510
>>CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047 aa)
initn: 3279 init1: 3279 opt: 3279 Z-score: 3470.5 bits: 652.8 E(32554): 5.5e-187
Smith-Waterman score: 3279; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (12-513:546-1047)
10 20 30 40
pF1KA0 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GYSSGVTNGLNDASDSIYTKGTPEIAFWGSNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLS
520 530 540 550 560 570
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 NGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQS
580 590 600 610 620 630
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHN
640 650 660 670 680 690
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 IGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEK
700 710 720 730 740 750
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 ANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFY
760 770 780 790 800 810
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 AVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVL
820 830 840 850 860 870
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 LFQTQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LFQTQSPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSH
880 890 900 910 920 930
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 ESKLKQITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSILKEGGKELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESKLKQITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSILKEGGKELL
940 950 960 970 980 990
470 480 490 500 510
pF1KA0 SNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 (771 aa)
initn: 1942 init1: 1067 opt: 1945 Z-score: 2060.0 bits: 391.3 E(32554): 2e-108
Smith-Waterman score: 1975; 62.8% identity (84.1% similar) in 471 aa overlap (21-481:284-753)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEA
.. ::..:.: :: . . :.:: .. ::
CCDS42 GPGGDEDDDEEDTDKLLNSASDPSLKDGLSDSDSELSSSEGLEPGSADPLANGCQGVSEA
260 270 280 290 300 310
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFS
:.:::.:::.:. :.: :::..::::::::.::: :::.::::.:.::: .:: :.:::
CCDS42 AHRLARRLYHLEGFQRCDVARQLGKNNEFSRLVAGEYLSFFDFSGLTLDGALRTFLKAFP
320 330 340 350 360 370
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQE
:.:::::::::: ::: :: :::: .:.::.: ::::.::::::::::::::::.::.
CCDS42 LMGETQERERVLTHFSRRYCQCNPDDSTSEDGIHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKKMSCQQ
380 390 400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 FIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTI
:::::. .:.: ::.:::::.:::::::::::::.:..: .:: :: ...: :: : .
CCDS42 FIANLDQLNDGQDFAKDLLKTLYNSIKNEKLEWAIDEDELRKSLSELVDDKF-GTGTKKV
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 SRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLY
.:: . :::::.:. .:..:: : :.:: :::::::.::::.:::: ::::::::.::
CCDS42 TRILDGGNPFLDVPQALSATTYKHGVLTRKTHADMDGKRTPRGRRGWKKFYAVLKGTILY
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEE
::::::.:.::::: :::::. ::::::..:.:: :: ::.:::::::::.:::. : ::
CCDS42 LQKDEYRPDKALSEGDLKNAIRVHHALATRASDYSKKSNVLKLKTADWRVFLFQAPSKEE
560 570 580 590 600 610
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 MQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITT
: .:: .:: :::.:::: ::::..:.::: :::::. ::.: :::::.:::.::.:.:.
CCDS42 MLSWILRINLVAAIFSAPAFPAAVSSMKKFCRPLLPSCTTRLCQEEQLRSHENKLRQLTA
620 630 640 650 660 670
420 430 440 450 460
pF1KA0 ELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL------
:::::: .: .. .:.:...::.::.::: :::.::: :. .: : :. .:
CCDS42 ELAEHRCHPVERGIKSKEAEEYRLKEHYLTFEKSRYETYIHLLAMKIKVGSDDLERIEAR
680 690 700 710 720 730
470 480 490 500 510
pF1KA0 LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
:.. :.. .:.:.::::.:.
CCDS42 LATLEGDDPSLRKTHSSPALSQGHVTGSKTTKDATGPDT
740 750 760 770
>>CCDS73187.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (645 aa)
initn: 1920 init1: 981 opt: 1904 Z-score: 2017.8 bits: 383.3 E(32554): 4.5e-106
Smith-Waterman score: 1938; 59.0% identity (82.0% similar) in 505 aa overlap (21-511:149-644)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEA
.. ::. ::: : . ..:::: ....::
CCDS73 EPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEA
120 130 140 150 160 170
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFS
:.:::::::.:: :...:::.::::::.:::::: :::::: ::::::::.:: :.: ..
CCDS73 AQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELA
180 190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQE
:.:::::::::: :::.::: :::....:.::.: ::::.::::::::::::::.::: .
CCDS73 LMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGD
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 FIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTI
::.::.:.:.: :: ..::::::.:::::::.::.:.:: ..: :: .. .::.:
CCDS73 FIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADP-----NPKVI
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280
pF1KA0 SRI----GSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKG
.:: :: ..::::. .:.::::: : :.::.::: : .::::::::::.:...:::
CCDS73 KRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKG
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQ
.:::::.:::: ::::: .::::.:.:::::..:.:: :.:.:: :.::::::.:::.
CCDS73 MILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAP
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 SPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLK
: :.::.::..:: :::.:::::::::..:::::::::::...:.::::::...::.:::
CCDS73 SLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLK
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL--
...:: :::. :: ..:...: . :. ::::::.:: :...: : :..::
CCDS73 AMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDA
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510
pF1KA0 ----LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
:.. : :: :::::::.: : ...:. :: :: . : ..:
CCDS73 VEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSS-QPRAQRHSSE---PRPGAGSGRRKP
600 610 620 630 640
>>CCDS31272.1 PSD gene_id:5662|Hs108|chr10 (1024 aa)
initn: 1920 init1: 981 opt: 1904 Z-score: 2014.7 bits: 383.4 E(32554): 6.7e-106
Smith-Waterman score: 1938; 59.0% identity (82.0% similar) in 505 aa overlap (21-511:528-1023)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MGSSWCLYGCCNAGVKTTRLEAHSEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEA
.. ::. ::: : . ..:::: ....::
CCDS31 EPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEA
500 510 520 530 540 550
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFS
:.:::::::.:: :...:::.::::::.:::::: :::::: ::::::::.:: :.: ..
CCDS31 AQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELA
560 570 580 590 600 610
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQE
:.:::::::::: :::.::: :::....:.::.: ::::.::::::::::::::.::: .
CCDS31 LMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSEDGAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGD
620 630 640 650 660 670
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 FIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTI
::.::.:.:.: :: ..::::::.:::::::.::.:.:: ..: :: .. .::.:
CCDS31 FIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKLQWAIDEEELRRSLSELADP-----NPKVI
680 690 700 710 720 730
240 250 260 270 280
pF1KA0 SRI----GSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHADMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKG
.:: :: ..::::. .:.::::: : :.::.::: : .::::::::::.:...:::
CCDS31 KRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVHADPDCRKTPRGKRGWKSFHGILKG
740 750 760 770 780 790
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQ
.:::::.:::: ::::: .::::.:.:::::..:.:: :.:.:: :.::::::.:::.
CCDS31 MILYLQKEEYKPGKALSETELKNAISIHHALATRASDYSKRPHVFYLRTADWRVFLFQAP
800 810 820 830 840 850
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 SPEEMQGWINKINCVAAVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLK
: :.::.::..:: :::.:::::::::..:::::::::::...:.::::::...::.:::
CCDS31 SLEQMQSWITRINVVAAMFSAPPFPAAVSSQKKFSRPLLPSAATRLSQEEQVRTHEAKLK
860 870 880 890 900 910
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QITTELAEHRSYPPDKKVKAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL----KEGGKEL--
...:: :::. :: ..:...: . :. ::::::.:: :...: : :..::
CCDS31 AMASELREHRAAQLGKKGRGKEAEEQRQKEAYLEFEKSRYSTYAALLRVKLKAGSEELDA
920 930 940 950 960 970
470 480 490 500 510
pF1KA0 ----LSNDESEAAGLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
:.. : :: :::::::.: : ...:. :: :: . : ..:
CCDS31 VEAALAQAGSTEDGLPPSHSSPSLQPKPSS-QPRAQRHSSE---PRPGAGSGRRKP
980 990 1000 1010 1020
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10 20 30 40 50 60
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..:.::. .: ..: ::.:::.:. :..:
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CCDS33 EVAAYLQKNNDFSRAVAEEYLSFFQFGGQSLDRALRSFLQALVLSGETQERERILYQFSR
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CCDS33 LLKALYWSIRSEKLEWAVDEEDTAR-P-----EKAQPSLPA-----GKMSKPFLQLAQDP
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CCDS33 TVPTYKQGILARKMHQDADGKKTPWGKRGWKMFHTLLRGMVLYFLKQGEDHCLEGESLVG
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pF1KA0 EDLKNAVSVHHALASKATDYEKKPNVFKLKTADWRVLLFQTQSPEEMQGWINKINCVAAV
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CCDS33 QMVDEPVGVHHSLATPATHYTKKPHVFQLRTADWRLYLFQAPTAKEMSSWIARINLAAAT
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pF1KA0 FSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPPDKKV
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CCDS33 HSAPPFPAAVGSQRRFVRPILPVGPAQSSLEEQHRSHENCLDAAADDLLDLQRNLPERRG
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pF1KA0 KAKDVDEYKLKDHYLEFEKTRYEMYVSIL---------------KEGGKELLSNDESEAA
......:..:. .:::.:::::: ::..: .. :.: .. : . .
CCDS33 RGRELEEHRLRKEYLEYEKTRYETYVQLLVARLHCPSDALDLWEEQLGREAGGTREPKLS
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pF1KA0 GLKKSHSSPSLNPDTSPITAKVKRNVSERKDHRPETPSIKQKVT
::::::::::. : .: :::::::.:::. .: :
CCDS33 -LKKSHSSPSLHQDEAPTTAKVKRNISERRTYRKIIPKRNRNQL
1020 1030 1040 1050
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.:. ::. . .... .. .::. .::. :
CCDS53 AMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLQSSPEDVAQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDEFNIKV
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90 100 110 120 130 140
pF1KA0 AEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGV
. .... .:. ..: :.:: :. .: : ::.:. .:.. :..:: ::: .. : :
CCDS53 LQAFVELHEFADLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFASRYCLCNPGVFQSTDTC
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150 160 170 180 190 200
pF1KA0 HCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEW
. :. ::..:::.::.::. : : ..::: .:.::: :. ..::. ::.::::: ..
CCDS53 YVLSFAIIMLNTSLHNHNVRDKPTAERFIAMNRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKI
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHA
::
CCDS53 PEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPL
260 270 280 290 300 310
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CCDS32 AMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQV
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90 100 110 120 130 140
pF1KA0 AEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGV
. .... .:: ..: :.:: :. .: : ::.:. .:.. :..:: :: .. : :
CCDS32 LHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNGVFQSTDTC
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150 160 170 180 190 200
pF1KA0 HCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEW
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CCDS32 YVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNE----
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210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHA
: . :. .: . :. :.. :. . :.: .
CCDS32 ----------PFKIPEDDGN-----------DLTHTFFN----PD----REGWLLK----
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270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATD
. :. . :: . .: . :: :: .: . .. . ... :. . ..
CCDS32 -LGGRV-----KTWKRRWFILTDNCLYYF--EYTTDK-----EPRGIIPLEN-LSIREVE
270 280 290 300 310
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pF1KA0 YEKKPNVFKL-------------KT-ADWRVLL-------FQTQSPEEMQGWINKINCVA
:::: :.: :: :: ::. ... .::: . :: .:.
CCDS32 DSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEEWI---KCIK
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 AVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPPDK
:..: :: ....::
CCDS32 AAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH
380 390
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CCDS42 AMGRKKFNMDPKKGIQFLIENDLLKNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQV
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 AEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGV
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CCDS42 LHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNGVFQSTDTC
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150 160 170 180 190 200
pF1KA0 HCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEW
. :. ::..:::.::. :. : : ..::: .:.:.: :. ..::. ::.:::::
CCDS42 YVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDKPTVERFIAMNRGINDGGDLPEELLRNLYESIKNE----
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 AVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHA
: . :. .: . :. :.. :. . :.: .
CCDS42 ----------PFKIPEDDGN-----------DLTHTFFN----PD----REGWLLK----
250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DMDGKKTPRGKRGWKTFYAVLKGTVLYLQKDEYKPEKALSEEDLKNAVSVHHALASKATD
. : .. :: : : .: . :: :: .: . .. . ... :. . ..
CCDS42 -LGGGRVKTWKRRW--F--ILTDNCLYYF--EYTTDK-----EPRGIIPLEN-LSIREVE
270 280 290 300 310
330 340 350 360
pF1KA0 YEKKPNVFKL-------------KT-ADWRVLL-------FQTQSPEEMQGWINKINCVA
:::: :.: :: :: ::. ... .::: . :: .:.
CCDS42 DSKKPNCFELYIPDNKDQVIKACKTEADGRVVEGNHTVYRISAPTPEEKEEWI---KCIK
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 AVFSAPPFPAAIGSQKKFSRPLLPATTTKLSQEEQLKSHESKLKQITTELAEHRSYPPDK
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CCDS42 AAISRDPFYEMLAARKKKVSSTKRH
380 390
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pF1KA0 LVAEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQD
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CCDS12 AVLHAFVDLHEFTDLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPGVFQSTD
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 GVHCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKL
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CCDS12 TCYVLSFAVIMLNTSLHNPNVRDKPGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPF
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 EWAVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKI
. ::
CCDS12 KIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGII
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513 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]