Result of FASTA (omim) for
pF1KA0933
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0933, 2247 aa
1>>>pF1KA0933 2247 - 2247 aa - 2247 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4484+/-0.000476; mu= 19.4886+/- 0.030
mean_var=97.6349+/-20.195, 0's: 0 Z-trim(110.6): 33 B-trim: 380 in 1/52
Lambda= 0.129799
statistics sampled from 18952 (18983) to 18952 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 23.740
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016883998 (OMIM: 604803) PREDICTED: protein dop (2080) 8891 1677.2 0
NP_001307643 (OMIM: 604803) protein dopey-2 [Homo (2298) 8891 1677.2 0
NP_005119 (OMIM: 604803) protein dopey-2 [Homo sap (2298) 8891 1677.2 0
XP_016866063 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2315) 2352 452.7 2.3e-125
XP_016866062 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2333) 2352 452.7 2.3e-125
XP_016866059 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2452) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866058 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2455) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866057 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2455) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866056 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2456) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866055 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2456) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866054 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2456) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866053 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2465) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866052 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2465) 2352 452.8 2.4e-125
NP_055833 (OMIM: 616823) protein dopey-1 isoform a (2465) 2352 452.8 2.4e-125
XP_011533921 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2475) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866051 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2476) 2352 452.8 2.4e-125
NP_001186871 (OMIM: 616823) protein dopey-1 isofor (2476) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866050 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2476) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866049 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2485) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866048 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2485) 2352 452.8 2.4e-125
XP_016866061 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2435) 1661 323.4 2.1e-86
XP_016866060 (OMIM: 616823) PREDICTED: protein dop (2450) 1661 323.4 2.1e-86
>>XP_016883998 (OMIM: 604803) PREDICTED: protein dopey-2 (2080 aa)
initn: 8885 init1: 8885 opt: 8891 Z-score: 8990.2 bits: 1677.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13058; 97.5% identity (97.5% similar) in 2080 aa overlap (219-2247:1-2080)
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNVLVQRNNLE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLGTNHQLTVKSLRASLLDSNVLVQRNNLE
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWLLGSDIKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWLLGSDIKGN
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAYLKPFRVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAYLKPFRVLI
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIKENRNASEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIKENRNASEI
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCALLVFLLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCALLVFLLDV
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQMPPSYLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQMPPSYLDT
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPELSEHLRVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPELSEHLRVPR
340 350 360 370 380 390
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPAGKRDRDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPAGKRDRDGT
400 410 420 430 440 450
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPSSPARKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPSSPARKNGG
460 470 480 490 500 510
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLFQLPGAGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLFQLPGAGDS
520 530 540 550 560 570
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKSSGHNPFFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKSSGHNPFFG
580 590 600 610 620 630
850 860 870
pF1KA0 KLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQ----------------------------------
::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQRVARVLWNQLNKETREHHVTCVELFYRLHCLAPT
640 650 660 670 680 690
880 890 900 910
pF1KA0 -----------------GTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRSLFVVLDSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANICEDIICHALLDPDKGTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRSLFVVLDSL
700 710 720 730 740 750
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 ACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQENSADDLHRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQENSADDLHRW
760 770 780 790 800 810
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 FNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPLRGELSEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPLRGELSEEE
820 830 840 850 860 870
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 LPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSGHTDSENTSSFSSPSHDLQELSNEENCCAPI
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSCHTDSENTSSFSSPSHDLQELSNEENCCAPI
880 890 900 910 920 930
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KA0 PMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADLELQALTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADLELQALTTS
940 950 960 970 980 990
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 RLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIEAVSRTSMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIEAVSRTSMD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA0 TSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCLSFLRSYYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCLSFLRSYYP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 CYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNAEFIHSLLQRCKVQEFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 CYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNVEFIHSLLQRCKVQEFVL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA0 LSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIELLKLLQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIELLKLLQVL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 IVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLVSAVVRGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLVSAVVRGLQ
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA0 PAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESESVKLSVSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESESVKLSVSTT
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 SKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAILEELPRTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAILEELPRTV
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KA0 NTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLTAHLGVQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLTAHLGVQLT
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA0 AAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKEVVKRPPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKEVVKRPPQV
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA0 KGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPPGYFLLLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPPGYFLLLSM
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA0 LNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVKAQPQASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVKAQPQASLE
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA0 ESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKEKAVPLISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKEKAVPLISR
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA0 LLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPAFFQMDTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPAFFQMDTSC
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA0 VHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSGELDQYHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSGELDQYHLY
1780 1790 1800 1810 1820 1830
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA0 LPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELIQTFTQLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELIQTFTQLEE
1840 1850 1860 1870 1880 1890
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KA0 DLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTALSFPPDKMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTALSFPPDKMP
1900 1910 1920 1930 1940 1950
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KA0 LFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSSDEITMKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSSDEITMKSE
1960 1970 1980 1990 2000 2010
2180 2190 2200 2210 2220 2230
pF1KA0 FPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRILKQLEECI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRILKQLEECI
2020 2030 2040 2050 2060 2070
2240
pF1KA0 EYDFLEHPEC
::::::::::
XP_016 EYDFLEHPEC
2080
>>NP_001307643 (OMIM: 604803) protein dopey-2 [Homo sapi (2298 aa)
initn: 8885 init1: 8885 opt: 8891 Z-score: 8989.5 bits: 1677.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 14330; 97.7% identity (97.7% similar) in 2279 aa overlap (20-2247:20-2298)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
670 680 690 700 710 720
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pF1KA0 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
790 800 810 820 830 840
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pF1KA0 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQ--------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQRVARVLWNQLNKETREHHVTCVELFY
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880 890 900
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLHCLAPTANICEDIICHALLDPDKGTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRS
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910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSGHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_001 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSCHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNAEFIHSLLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNVEFIHSLLQR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 VVKRPPQVKGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVKRPPQVKGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPP
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1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 GYFLLLSMLNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYFLLLSMLNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVK
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 AQPQASLEESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQPQASLEESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 KAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 FFQMDTSCVHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFQMDTSCVHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 ELDQYHLYLPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELDQYHLYLPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELI
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 QTFTQLEEDLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTFTQLEEDLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTAL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 SFPPDKMPLFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFPPDKMPLFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 DEITMKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEITMKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRI
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2230 2240
pF1KA0 LKQLEECIEYDFLEHPEC
::::::::::::::::::
NP_001 LKQLEECIEYDFLEHPEC
2290
>>NP_005119 (OMIM: 604803) protein dopey-2 [Homo sapiens (2298 aa)
initn: 8885 init1: 8885 opt: 8891 Z-score: 8989.5 bits: 1677.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 14330; 97.7% identity (97.7% similar) in 2279 aa overlap (20-2247:20-2298)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
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pF1KA0 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
370 380 390 400 410 420
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pF1KA0 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
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pF1KA0 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KA0 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQ--------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQRVARVLWNQLNKETREHHVTCVELFY
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880 890 900
pF1KA0 -------------------------GTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RLHCLAPTANICEDIICHALLDPDKGTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRS
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910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
970 980 990 1000 1010 1020
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSGHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_005 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSCHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNAEFIHSLLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_005 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNVEFIHSLLQR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]