Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0933
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0933, 2247 aa
1>>>pF1KA0933 2247 - 2247 aa - 2247 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4611+/-0.00118; mu= 19.4592+/- 0.071
mean_var=83.2038+/-17.017, 0's: 0 Z-trim(103.0): 32 B-trim: 126 in 1/51
Lambda= 0.140606
statistics sampled from 7216 (7223) to 7216 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 6.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13643.1 DOPEY2 gene_id:9980|Hs108|chr21 (2298) 8891 1814.8 0
CCDS4996.1 DOPEY1 gene_id:23033|Hs108|chr6 (2465) 2352 488.3 1.8e-136
CCDS64467.1 DOPEY1 gene_id:23033|Hs108|chr6 (2476) 2352 488.3 1.8e-136
>>CCDS13643.1 DOPEY2 gene_id:9980|Hs108|chr21 (2298 aa)
initn: 8885 init1: 8885 opt: 8891 Z-score: 9732.8 bits: 1814.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14330; 97.7% identity (97.7% similar) in 2279 aa overlap (20-2247:20-2298)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
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CCDS13 MDPEEQELLNDYRYRSYSSVIEKALRNFESSSEWADLISSLGKLNKALQSNLRYSLLPRR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLISKRLAQCLHPALPSGVHLKALETYEIIFKIVGTKWLAKDLFLYSCGLFPLLAHAAVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VRPVLLTLYEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FYTALWGSVLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVQRNNLEIVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGSDIKGNTVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKPFRVLISLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ENRNASEIVKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPTVSELCA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLVFLLDVIPLELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKTCFKVLSKVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKIILETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSGIGLSASSPEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTASGEESKSEEPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTKSSESPSSSPS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPARKNGGEWDVEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCATFPVYLSEEETEQLCATLF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEVINHSQSLALVIEDKMKRYKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KA0 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQ--------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGHNPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQRVARVLWNQLNKETREHHVTCVELFY
850 860 870 880 890 900
880 890 900
pF1KA0 -------------------------GTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLHCLAPTANICEDIICHALLDPDKGTRLEALFRFSVIWHLTREIQGSRVTSHNRSFDRS
910 920 930 940 950 960
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LFVVLDSLACTDGAIGAAAQGWLVRALSLGDVARILEPVLLLLLQPKTQRTSIHCLKQEN
970 980 990 1000 1010 1020
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SADDLHRWFNRKKTSFREACAVPEPQESGSEEHLPLSQFTTVDREAIWAEVEKEPEKYPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSGHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGELSEEELPYYVELPDRTAHGAPDSSEHTESADTSSCHTDSENTSSFSSPSHDLQELSN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EENCCAPIPMGGRAYPKRSALLAAFQSESFKAGAKLSLVRVDSDKTQASESFSSDEEADL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ELQALTTSRLLKQQRERQEAVEALFKHILLYLQPYDSRRVLYAFSVLEAVLKTNPKEFIE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVSRTSMDTSSTAHLNLISNLLARHQEALIGQSFYGKLQTQVPNVCPHSLLLELLTYLCL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNAEFIHSLLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS13 SFLRSYYPCYLKVSHRDILGNRDVQVKSVEVLIRIMMQLVSVAKSSEGKNVEFIHSLLQR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CKVQEFVLLSLSASMYTSQKRYGLATAHHGRALPEDSLFEESLINLGQDQIWSEHPLQIE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLKLLQVLIVLEHHLGRAHEEAENQPDLSREWQRALNFQQAISALQYVQPHPLTSQGLLV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAVVRGLQPAYGYGMHPAWVSLVTHSLPYFGKSLGWTVTPFVVQICKNLDDLVKQYESES
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VKLSVSTTSKRENISPDYPLTLLEGLTTISHFCLLEQANQNKKTMAAGDPANLRNARNAI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LEELPRTVNTMALLWNVLRKEETQKRPVDLLGATKGSSSVYFKTTKTIRQKILDFLNPLT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AHLGVQLTAAVAAVWSRKKAQRHSKMKIIPTASASQLTLVDLVCALSTLQTDTLLHLVKE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 VVKRPPQVKGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VVKRPPQVKGGDEKSPLVDIPVLQFCYAFLQRLPVPALQENFSSLLGVLKESVQLNLAPP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 GYFLLLSMLNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYFLLLSMLNDFVTRTPNLENKKDQKDLQEITQKILEAVGNIAGSSLEQTSWLSRNLEVK
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 AQPQASLEESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQPQASLEESDAEEDLYDAAAASAMVSSSAPSVYSVQALSLLAEVLASLLDMVYRSDEKE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 KAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KAVPLISRLLYYVFPYLRNHSAYNAPSFRAGAQLLSSLSGYAYTKRAWRKEVLELFLDPA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 FFQMDTSCVHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FFQMDTSCVHWKSIIDHLLTHEKTMFKDLMNMQSSSLKLFSSFEQKAMLLKRQAFAVFSG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 ELDQYHLYLPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ELDQYHLYLPLIQERLTDNLRVGQTSIVAAQMFLFFRVLLLRISPQHLTSLWPIMVSELI
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 QTFTQLEEDLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTFTQLEEDLKDEDESLRSTNKVNRTKVSVPDANGPSVGEIPQSELILYLSACKFLDTAL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 SFPPDKMPLFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFPPDKMPLFQIYRWAFIPEVDTEGPAFLSDVEENHQECKPHTVRILELLKLKFGEISSS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 DEITMKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DEITMKSEFPLLRQHSVSSIRQLMPFFMTLNGAFKTQRQLPADSPGTPFLDFPVTDSPRI
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2230 2240
pF1KA0 LKQLEECIEYDFLEHPEC
::::::::::::::::::
CCDS13 LKQLEECIEYDFLEHPEC
2290
>>CCDS4996.1 DOPEY1 gene_id:23033|Hs108|chr6 (2465 aa)
initn: 4550 init1: 1071 opt: 2352 Z-score: 2563.6 bits: 488.3 E(32554): 1.8e-136
Smith-Waterman score: 4298; 36.1% identity (64.6% similar) in 2344 aa overlap (159-2243:159-2460)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YEKYFLPLQKLLLPSLQAFIVGLLPGLEEGSEISDRTDALLLRLSLVVGKEVFYTALWGS
:: .::. :: ... .: . .::.:::::
CCDS49 YEIYYLPLGKTLKPGLQGLLTGILPGLEEGSEYYERTNMLLEKVAAAVDQSAFYSALWGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VLASPSIRLPASVFVVGHINRDAPGREQKYMLGTNHQLTVKSLRASLLDSNVLVQRNNLE
.:.::..:::. ..:..:.:: ..: :..:.. .: :... .:. ::.:::::..:.
CCDS49 LLTSPAVRLPGITYVLAHLNRKLSMEDQLYIIGSDIELMVEAVSTSVQDSSVLVQRSTLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IVLFFFPFYTCLDSNERAIPLLRSDIVRILSAATQTLLRRDMSLNRRLYAWLLGSDIKGN
..:: :::. . : :..:::::: ...::::::::::::::::: : .:
CCDS49 LILFCFPFHMSQAT--------RPDMIRILSAALHVVLRRDMSLNRRLYAWLLGFDNNGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TVVPESEISNSYEDQSSYFFEKYSKDLLVEGLAEILHQKFIDADVEERHHAYLKPFRVLI
. :.: .. :....:.: .::.:::.... ::. . . :. :::::.::
CCDS49 IIGPRSTRHSNPEEHATYYFTTFSKELLVQAMVGILQVNGFGE--ENTLMQDLKPFRILI
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLLDKPEIGPQVVGNLFLEVIRAFYSYCRDALGSDLKLSYTQSGNSLISAIKENRNASEI
:::::::.:: .. ....::.:..:: :. : . . .... .: : ..::....:.
CCDS49 SLLDKPELGPVILEDVLIEVFRTLYSQCKAELDLQTEPPFSKDHAQLSSKLRENKKTAEL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VKTVNLLITSLSTDFLWDYMTRCFEECFRPVKQRYSVRNSVSPPPT--VSEL-----CAL
.::.:::..:. ..:::..: :::: : . :: ...: . ::: : :
CCDS49 IKTANLLFNSFEPYYMWDYVARWFEECCR---RTLHVRLQIGPGDSNDSSELQLTNFCLL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KA0 LVFLLDVIPL----------ELYSEVQTQYLPQVLGCLVQPLAEDMEALSLPELTHALKT
. ::::.. : : : :.::..:::.: ... :. ...: : ::: .:.
CCDS49 VDFLLDIVSLPTRSMRVLCQETYIEIQTEHLPQLLLRMISALTSHLQTLHLSELTDSLRL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 CFKVLSKVQMPPSYLDTESTSGTSSPVKGENGKII-LETKAVIPGDEDASFPPLKSEDSG
: :.::::: :: : . ::.:. . .:.:... : : : ... : ::.
CCDS49 CSKILSKVQ-PP--LLSASTGGVLQFPSGQNNSVKEWEDKKVSSVSHEN--PTEVFEDGE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 IGLSASSPELSEHLRVPRVSLERDDVWKKGGSMQRTFLCIQELIANFASKNIFGVQLTAS
:. : : . . . . ::. .. . : . : :.. .:.. . :..
CCDS49 NPPSSRSSESGFTEFIQYQADRTDDIDRELSEGQGA-AAIP--IGSTSSET--ETASTVG
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 GEESKSEEPAGKRDRDGTQSLAANDSSRKNSWEPKPITVPQFKQMLSDLFTARGSPFKTK
.::. . :. . .:.: ...:.. . : :: : .:. ... :
CCDS49 SEETIIQTPSVVTQGTATRS---RKTAQKTAMQCCLEYVQQFLTRLINLYIIQNNSF---
650 660 670 680 690
720 730 740 750 760
pF1KA0 SSESPSSSPSSPARKNGGE---WD------VEKVVIDLGGSREERREAFAAACHLLLDCA
:.: .. .. .. :: :: :.. :. . .: :: :::.:.:.:.
CCDS49 -SQSLATEHQGDLGREQGETSKWDRNSQGDVKEKNISKQKTSKEYLSAFLAACQLFLECS
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 TFPVYLSE-EETEQLCATLFQLPGAGDSSFPSWLKSLMTICCCVTDCYLQNVAISTLLEV
.::::..: ..: .: . .. . :.::..::. : ..: .:.:::: ....
CCDS49 SFPVYIAEGNHTSELRSEKLETD-CEHVQPPQWLQTLMNACSQASDFSVQSVAISLVMDL
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870
pF1KA0 INHSQSLALVIEDKMKRYKSSGH-NPFFGKLQMVTVPPIAPGILKVIAEKTDFYQ-----
.. .::.:.: .... . . .: :.. .: ::.. : :. :::::.:..
CCDS49 VGLTQSVAMVTGENINSVEPAQPLSPNQGRVAVVIRPPLTQGNLRYIAEKTEFFKHVALT
820 830 840 850 860 870
880
pF1KA0 -------GT---------------------------------------RLEALFRFSVIW
:: :.:: .:.:.:
CCDS49 LWDQLGDGTPQHHQKSVELFYQLHNLVPSSSICEDVISQQLTHKDKKIRMEAHAKFAVLW
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930 940
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::::... .. .: ::::::::..:::: ::. ....:.:: ..:. :.::.:::.
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1010 1020 1030 1040 1050
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. :: :.:. : . :. .. : . : : .:. : .:::. . . ::
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1060 1070 1080
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. :: :. : ..: :.... :::. :.:.
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:::: . : :
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::: ..:.: :.:: ..:. : :: ::: .. . ..
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.:. . .. :..:.::::: ::: :.:::::...:.::::: :..:.: ::...
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. : .:.:..::::::. ...:..::... .. . :. .:.: ::: ..::.::
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..::. .:..:::..:. :.:.: .. .:..: .:: :: ..:..::::. .:
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::::.. :: :. :. . .. .: ...:::.. .:.: ::... ::.:.:.
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....:::..:.. ..... . ..:. . ... . .::..::.::..:.:.. . ::..
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:.:.: .:..: ::: : : .: ... .:: :.. : : ::::::::::
CCDS49 LVQVFLLMEQELTADEDISRTSGPSVAGLETTYTGGNGFSTSYNSQRWLNLYLSACKFLD
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: : :. ::::.. : : : :.::..:::.: ... :. ...: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]