Result of FASTA (omim) for
pF1KA0929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0929, 3623 aa
1>>>pF1KA0929 3623 - 3623 aa - 3623 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7585+/-0.000599; mu= -30.0580+/- 0.038
mean_var=753.4514+/-157.066, 0's: 0 Z-trim(122.4): 134 B-trim: 651 in 1/59
Lambda= 0.046725
statistics sampled from 40210 (40373) to 40210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.473), width: 16
Scan time: 30.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055816 (OMIM: 613484) msx2-interacting protein (3664) 23205 1582.0 0
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 553 55.1 4.1e-05
NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654) 483 50.4 0.0011
NP_001188474 (OMIM: 606077) putative RNA-binding p ( 969) 448 47.6 0.0014
NP_073605 (OMIM: 606077) putative RNA-binding prot ( 977) 448 47.7 0.0014
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 427 46.4 0.0068
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 427 46.4 0.0068
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 427 46.4 0.0068
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 427 46.4 0.0068
>>NP_055816 (OMIM: 613484) msx2-interacting protein [Hom (3664 aa)
initn: 23205 init1: 23205 opt: 23205 Z-score: 8467.5 bits: 1582.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 23205; 100.0% identity (100.0% similar) in 3529 aa overlap (95-3623:136-3664)
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KRGQNWGSYVHNSLPRFNWDYRSCFHTWKRASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHY
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHY
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDIT
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 REVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSIS
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVR
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 STDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQ
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 IEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIV
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLS
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NP_055 DIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLS
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD
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NP_055 SNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRTYYESVRTPGTYPED
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NP_055 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRTYYESVRTPGTYPED
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERE
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NP_055 SRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERE
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGS
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NP_055 RERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGS
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 CSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTDKQKRK
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NP_055 CSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTDKQKRK
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKE
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NP_055 GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKE
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGL
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NP_055 KEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGL
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKS
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NP_055 SSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKS
950 960 970 980 990 1000
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREGEAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKD
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NP_055 SPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREGEAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKD
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 CQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPE
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NP_055 CQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 REDVRKNYCSLRDETPERKSGQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEME
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NP_055 REDVRKNYCSLRDETPERKSGQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEME
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 IAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNY
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NP_055 IAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNY
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNITVREE
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NP_055 RSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNITVREE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSL
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NP_055 SLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSL
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 RKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSS
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NP_055 RKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSS
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDS
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NP_055 LERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDS
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 APRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQH
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NP_055 APRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQH
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 LERKEEDSDFISGRIYGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPK
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NP_055 LERKEEDSDFISGRIYGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPK
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EVEKQEDTENHPKTPESAPENKDSELKTPPSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKTVEA
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NP_055 EVEKQEDTENHPKTPESAPENKDSELKTPPSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKTVEA
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 PLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPAPAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSG
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NP_055 PLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPAPAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSG
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 DQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEP
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NP_055 DQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEP
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 DANQKAEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSE
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NP_055 DANQKAEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSE
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 RIDREKLKRSNSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVR
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NP_055 RIDREKLKRSNSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVR
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 SVYATMGDHENRSPVKEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEEEE
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NP_055 SVYATMGDHENRSPVKEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEEEE
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 NEAKEPAETLKPPEGWRSPRSQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATTEVGPQIGVKE
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NP_055 NEAKEPAETLKPPEGWRSPRSQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATTEVGPQIGVKE
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 SSMEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRL
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NP_055 SSMEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRL
2030 2040 2050 2060 2070 2080
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 AVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPD
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NP_055 AVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPD
2090 2100 2110 2120 2130 2140
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 KEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYKADAPEGLAPEDRDK
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NP_055 KEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYKADAPEGLAPEDRDK
2150 2160 2170 2180 2190 2200
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 PAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGMET
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NP_055 PAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGMET
2210 2220 2230 2240 2250 2260
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 DEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTL
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NP_055 DEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTL
2270 2280 2290 2300 2310 2320
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 VRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEK
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NP_055 VRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEK
2330 2340 2350 2360 2370 2380
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 QSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQ
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NP_055 QSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQ
2390 2400 2410 2420 2430 2440
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 ARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQ
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NP_055 ARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQ
2450 2460 2470 2480 2490 2500
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 EEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAA
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NP_055 EEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAA
2510 2520 2530 2540 2550 2560
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KA0 PCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRM
2570 2580 2590 2600 2610 2620
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KA0 PVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVST
2630 2640 2650 2660 2670 2680
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KA0 PAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGA
2690 2700 2710 2720 2730 2740
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KA0 VTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAG
2750 2760 2770 2780 2790 2800
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KA0 LRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQ
2810 2820 2830 2840 2850 2860
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KA0 PPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQ
2870 2880 2890 2900 2910 2920
2890 2900 2910 2920 2930 2940
pF1KA0 GGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPH
2930 2940 2950 2960 2970 2980
2950 2960 2970 2980 2990 3000
pF1KA0 HPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPSST
2990 3000 3010 3020 3030 3040
3010 3020 3030 3040 3050 3060
pF1KA0 ASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTL
3050 3060 3070 3080 3090 3100
3070 3080 3090 3100 3110 3120
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. : :.. . .. . :.: .. : . : ..: : . . .:. .
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: ::.. : : .:.. :. . :.: . . :. .:: .:
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:... :: :. . . :.... : . ....... : ..: :. . . .: : :
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.: . ....:. ..... : . .. :. ... . ..:. :.
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. .: .: :.. . : . :. . . .. .... : : :.
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NP_002 PITTTTTVTPTP-TPTGTQTPTPTPITTTTTV---TPTPTPTGTQTPTSTPITTNTTVTP
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:..: ::.:. .:. ... :.: :. : : : ::. . : .
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. ::: : : .. : .: . : . . . ::.:.:.: .: :
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. :. . .:. ... : :.: .. : : : .. : .. ...
NP_002 PITTTTTVTPTPTPTGTQT----------PTTTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTAITT
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pF1KA0 VPPASKAPQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPA-PVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQ
. .. .: : ..:: . : : . :.:.:. .:. .: ... .: ::.
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: . :...: : ... .: :. :. : :. :... . .
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: :.. : : : : :. .: . :.: :. : . : . :.
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:::: . : .. : : ::. . : :.. :.:. .: : :.. :
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..: : . : : :: . : :.: ..: :
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. : . . ..:.. : . :: : .: : .:. .: . .. :
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. : . .. . . :.: : . .... .. : .. :. .:.
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:.:.: . :. . ..: .:: .. . . : : . :. : : .:...
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...: : . :.: : .. .::.. ... : .: . . ...:. :...:
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: ..::: : .:.. : . .. : ... . .:. ::. :.
NP_001 ---------PTTSTTSTP--QTSTISSPTTSTTSTP---QTSTTSSPTTSTTSA----PT
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: . . : .: : : . :. :: : : :. :.: ... . :
NP_001 T----STTSAP----TTSTTSTPQTSISSAPTS-----STTSAPTASTISAPTTSTTSFH
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. ..: :: .: :... ..: .:..:. .. : : : :. :.
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..: : ::.: ... . :. : :.. .. . :: .. .:. ..
NP_001 SKT-STSHVSVSKTTHSQPVTRDCHPRCTWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEK
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. . : .:: : ... :.. . . : :: ... . :. . .
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::.. :. :. : .: .: . : : . : .. .. .::....
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. .:: . .:. .: . ::. . : : :... . : :.: . .: .
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.:. . . : :. : .. :..:... :. .:: :: . :
NP_001 TTSTNSAPTTSTISASTTSTISAPTTSTISS-PTSSTTSTPQTSKTSAATSSTTSGSGTT
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: : :. :: :. . : . : :: :: .:..: . .: . . :
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pF1KA0 ------LPAGPANRP-PEPHTQVQRA---QAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAP
. .::.. : : : :.. : .. .:: . :::: .. . :.. :.
NP_001 SAPTSSMTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPITSTTSGPG
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. : ::::: :.:
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pF1KA0 ---------SRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSL
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NP_001 LDKSSSRGGSREYDTGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGGGESRS---SGA
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.. : . : .:...: . .: ...::::::::.:: : ::.: : :...:
NP_001 ASSAPGGGDGAEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDV-SVKISHLSGSGSGDE
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pF1KA0 RYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFF---GMQIE------------------------VT
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NP_001 RVAFVNFRRPEDA-RAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDTYPPSASVVG
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 AWIG----P------------------------------------------ETESENEF-
: .: : . : : ..
NP_001 ASVGGHRHPPGGGGGQRSLSPGGAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRDLERERDYP
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pF1KA0 -----RP---LDERI------------DEFHP----KATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIF
:: :. :. ::. : .:.::::.:::. :.: ::: :
NP_001 FYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQRANRTLFLGNLDITVTESDLRRAF
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pF1KA0 QRFGEIVDIDIKKVN-G-VPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPT
.::: :...:::. . : . :.::.. .. .: :.:. . : .:.:.::. ::
NP_001 DRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPIKIGYGKATPT
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. .:. ::. : :.:.: :.: . . . . . : . :. .. :.:: . .:
NP_001 TRLWVGGLGPWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFP
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.:: ...::::. : : . . . . . . : . : . :.. : .
NP_001 LGGPDRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYELVTDAFGHRAP--DPLRGARDRTPPLL
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: . : ::... : :: .. . . :: : . : : : . :
NP_001 YRD--RDRDLYPDSDWVPPPPPVRERSTRTAATSVPAYE------PLDSLDRRRDGWSLD
580 590 600 610 620
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:. . :. :.. :.:. : . : .: : .:. : .: .: ::... .:
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:. .: :. ..::: : : : . .. ::. ....: :.. . . :: ...:
NP_001 SSSRDR--YNSDNDRS-SRLLLERPSPIRDRRGSLEK-SQGDKRDRKNSASAERDRKHRT
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: . . ::. . .:::. ..: ::.. ..:. :..: .. ::.:::
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:: .. . :::: : :: :...:: . .:: . .. : :.
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.::: :...:::. . : . :.::.. .. .: :.:. . : .:.:.::. ::
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. .. . :: : : . : : . :..: :. .:::..:: : . : :. ..
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. .:: .: . . :. :: :. . ::.: :. : . .: . :.
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: :..:. .. : :. . : . . .... :: : . : : :.
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. :: : : .: :.: :.: :.. . ::. .::: :. :.. . .::. :
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. : :. . : . .. . . .:. : : : : : .: : : : . :.
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.: .. : ..:.: :. .: .. . ::: :: .:.. . .. ... . .: .
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: : . :. :. ::... . . . .:: . : . . ::
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.: . . :.: . . :: .. .:. :: :: :: .: .::.
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:. . .:. . : .: :.: :. : :. :: : :.: : .: .
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:: .: :. . ... :: . . . . . . ..: :. : .:
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. . : ..: . : .: : . : : :.. : :. : . :
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:. :.::: ::: .: : : .:: : :.: ..:: . :.: ::: . . .
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: . . ::: . : .: : . : :. : :.: :
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: : :... : . ::::: .:::. . :. :
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