Result of FASTA (omim) for
pF1KA0925
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0925, 475 aa
1>>>pF1KA0925 475 - 475 aa - 475 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5657+/-0.000489; mu= 17.9514+/- 0.030
mean_var=133.7275+/-29.923, 0's: 0 Z-trim(112.4): 224 B-trim: 2022 in 2/53
Lambda= 0.110908
statistics sampled from 20909 (21246) to 20909 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 6.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001310943 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 3229 528.9 1.2e-149
NP_001177386 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 3229 528.9 1.2e-149
NP_001177385 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 3229 528.9 1.2e-149
NP_001310944 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [ ( 475) 3229 528.9 1.2e-149
NP_006082 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 1 [Hom ( 480) 3229 528.9 1.2e-149
XP_011517288 (OMIM: 602159) PREDICTED: coronin-2A ( 525) 2039 338.6 2.6e-92
NP_438171 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525) 2039 338.6 2.6e-92
NP_003380 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] ( 525) 2039 338.6 2.6e-92
NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [ ( 527) 1433 241.6 4e-63
XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 527) 1433 241.6 4e-63
XP_016874611 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 474) 1429 240.9 5.8e-63
NP_055140 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [Hom ( 474) 1429 240.9 5.8e-63
NP_001263400 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform b [ ( 474) 1429 240.9 5.8e-63
XP_016874612 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 474) 1429 240.9 5.8e-63
NP_065174 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapiens] ( 489) 1385 233.9 7.8e-61
NP_001018080 (OMIM: 609849) coronin-1B [Homo sapie ( 489) 1385 233.9 7.8e-61
NP_001180262 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Hom ( 461) 1381 233.2 1.2e-60
XP_011544016 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 461) 1381 233.2 1.2e-60
NP_009005 (OMIM: 605000,615401) coronin-1A [Homo s ( 461) 1381 233.2 1.2e-60
XP_016878375 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463) 1365 230.7 6.9e-60
XP_016878374 (OMIM: 605000,615401) PREDICTED: coro ( 463) 1365 230.7 6.9e-60
NP_001188402 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 3 [H ( 840) 758 133.9 1.7e-30
NP_001188401 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 2 [H ( 907) 758 133.9 1.8e-30
NP_078811 (OMIM: 611668) coronin-7 isoform 1 [Homo ( 925) 758 133.9 1.8e-30
XP_011536427 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C ( 286) 675 120.0 8.8e-27
NP_599027 (OMIM: 610091) WD repeat and SOCS box-co ( 275) 249 51.8 2.8e-06
NP_056441 (OMIM: 610091) WD repeat and SOCS box-co ( 421) 249 52.0 3.7e-06
NP_002884 (OMIM: 300825) histone-binding protein R ( 425) 246 51.6 5.2e-06
NP_001185648 (OMIM: 300825) histone-binding protei ( 469) 246 51.6 5.5e-06
XP_005272220 (OMIM: 609012) PREDICTED: WD repeat-c ( 334) 238 50.1 1.1e-05
NP_438172 (OMIM: 609012) WD repeat-containing prot ( 334) 238 50.1 1.1e-05
NP_060058 (OMIM: 609012) WD repeat-containing prot ( 334) 238 50.1 1.1e-05
NP_001308124 (OMIM: 270710,602342,608628,616944) F ( 427) 237 50.1 1.4e-05
NP_001128728 (OMIM: 602923) histone-binding protei ( 390) 235 49.8 1.7e-05
NP_001128727 (OMIM: 602923) histone-binding protei ( 424) 235 49.8 1.8e-05
NP_005601 (OMIM: 602923) histone-binding protein R ( 425) 235 49.8 1.8e-05
NP_056975 (OMIM: 605585) pre-mRNA-processing facto ( 579) 229 49.0 4.1e-05
XP_011543873 (OMIM: 300196) PREDICTED: F-box-like/ ( 526) 220 47.5 0.00011
NP_001132940 (OMIM: 300196) F-box-like/WD repeat-c ( 526) 220 47.5 0.00011
NP_001132939 (OMIM: 300196) F-box-like/WD repeat-c ( 526) 220 47.5 0.00011
NP_001132938 (OMIM: 300196) F-box-like/WD repeat-c ( 577) 220 47.6 0.00011
NP_005638 (OMIM: 300196) F-box-like/WD repeat-cont ( 577) 220 47.6 0.00011
XP_016879922 (OMIM: 610091) PREDICTED: WD repeat a ( 383) 217 46.9 0.00012
NP_150600 (OMIM: 400033) F-box-like/WD repeat-cont ( 522) 217 47.0 0.00015
NP_599020 (OMIM: 400033) F-box-like/WD repeat-cont ( 522) 217 47.0 0.00015
NP_599021 (OMIM: 400033) F-box-like/WD repeat-cont ( 522) 217 47.0 0.00015
XP_005262629 (OMIM: 400033) PREDICTED: F-box-like/ ( 536) 217 47.0 0.00015
XP_016885576 (OMIM: 400033) PREDICTED: F-box-like/ ( 540) 217 47.1 0.00015
XP_016885575 (OMIM: 400033) PREDICTED: F-box-like/ ( 577) 217 47.1 0.00016
XP_011510117 (OMIM: 612173) PREDICTED: sperm-assoc ( 592) 209 45.8 0.00039
>>NP_001310943 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [Homo (475 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 2807.9 bits: 528.9 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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NP_001 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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NP_001 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
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250 260 270 280 290 300
pF1KA0 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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NP_001 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
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NP_001 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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NP_001 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
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430 440 450 460 470
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NP_001 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470
>>NP_001177386 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [Homo (475 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 2807.9 bits: 528.9 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
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pF1KA0 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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NP_001 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
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370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
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NP_001 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
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430 440 450 460 470
pF1KA0 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470
>>NP_001177385 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [Homo (475 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 2807.9 bits: 528.9 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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NP_001 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
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pF1KA0 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
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NP_001 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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pF1KA0 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
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pF1KA0 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
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pF1KA0 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470
>>NP_001310944 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 2 [Homo (475 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 2807.9 bits: 528.9 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3229; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
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NP_001 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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NP_001 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
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NP_001 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEPVKMIDCHTDVILC
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pF1KA0 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
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NP_001 MSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRW
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pF1KA0 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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NP_001 NTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKP
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310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KA0 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470
>>NP_006082 (OMIM: 605002) coronin-2B isoform 1 [Homo sa (480 aa)
initn: 3229 init1: 3229 opt: 3229 Z-score: 2807.9 bits: 528.9 E(85289): 1.2e-149
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10 20 30 40 50
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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240 250 260 270 280 290
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGYKKSSKMVFKAPIKEKKSVV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
430 440 450 460 470 480
>>XP_011517288 (OMIM: 602159) PREDICTED: coronin-2A isof (525 aa)
initn: 2354 init1: 1181 opt: 2039 Z-score: 1778.4 bits: 338.6 E(85289): 2.6e-92
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
:::.:::::::::.:.:: :..:.:.:..:::..:::::::::: .:.:.::: ::::.:
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:::::.:::...:.:::::::.:::::.::::: : :::::::....:: ::. : ::
XP_011 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
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pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGE-----PVKMIDCHT
.: :: ::.:::::::::::. ::::::::::::.:::::. : :.. :.::
XP_011 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVITSPMSTISCHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
:::: :::::.::::.:::::.:.:::.::.: :::::. :.::...:.::::.:.:..:
XP_011 DVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVLQEASYKGHRASKVLFLGNLKKLMST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
:.::::.::.:::::..::.::.::..:: ::.::::::::: :::..:::::::::::.
XP_011 GTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRYYEV
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300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
:..::.:::: :.:: ::::.:::::.:::::.::.::::::.: :.::::::::::::
XP_011 SADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIVPRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KA0 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLK----------------------
:.:::::::: : :..:.:: .:::.:.::::.:.::.
XP_011 SESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFNSMA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KA0 ----------------EGYKKSSKMVFKAP-------IKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTE
.:...:: . : : ..:::. ..::.:..: ::.::
XP_011 PASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPPKTE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KA0 NELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
::::.::.:::.:::::.: :.:.... .::.
XP_011 NELLQMFYRQQEEIRRLRELLTQREVQAKQLELEIKNLRMGSEQL
490 500 510 520
>>NP_438171 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] (525 aa)
initn: 2354 init1: 1181 opt: 2039 Z-score: 1778.4 bits: 338.6 E(85289): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 2170; 61.1% identity (82.4% similar) in 512 aa overlap (1-462:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
:::.:::::::::.:.:: :..:.:.:..:::..:::::::::: .:.:.::: ::::.:
NP_438 MSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAF
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
:::::.:::...:.:::::::.:::::.::::: : :::::::....:: ::. : ::
NP_438 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGE-----PVKMIDCHT
.: :: ::.:::::::::::. ::::::::::::.:::::. : :.. :.::
NP_438 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVITSPMSTISCHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
:::: :::::.::::.:::::.:.:::.::.: :::::. :.::...:.::::.:.:..:
NP_438 DVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVLQEASYKGHRASKVLFLGNLKKLMST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
:.::::.::.:::::..::.::.::..:: ::.::::::::: :::..:::::::::::.
NP_438 GTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRYYEV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
:..::.:::: :.:: ::::.:::::.:::::.::.::::::.: :.::::::::::::
NP_438 SADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIVPRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KA0 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLK----------------------
:.:::::::: : :..:.:: .:::.:.::::.:.::.
NP_438 SESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFNSMA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KA0 ----------------EGYKKSSKMVFKAP-------IKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTE
.:...:: . : : ..:::. ..::.:..: ::.::
NP_438 PASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPPKTE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KA0 NELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
::::.::.:::.:::::.: :.:.... .::.
NP_438 NELLQMFYRQQEEIRRLRELLTQREVQAKQLELEIKNLRMGSEQL
490 500 510 520
>>NP_003380 (OMIM: 602159) coronin-2A [Homo sapiens] (525 aa)
initn: 2354 init1: 1181 opt: 2039 Z-score: 1778.4 bits: 338.6 E(85289): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 2170; 61.1% identity (82.4% similar) in 512 aa overlap (1-462:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
:::.:::::::::.:.:: :..:.:.:..:::..:::::::::: .:.:.::: ::::.:
NP_003 MSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
:::::.:::...:.:::::::.:::::.::::: : :::::::....:: ::. : ::
NP_003 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA0 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGE-----PVKMIDCHT
.: :: ::.:::::::::::. ::::::::::::.:::::. : :.. :.::
NP_003 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVITSPMSTISCHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNHRVNRVVFLGNMKRLLTT
:::: :::::.::::.:::::.:.:::.::.: :::::. :.::...:.::::.:.:..:
NP_003 DVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVLQEASYKGHRASKVLFLGNLKKLMST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEI
:.::::.::.:::::..::.::.::..:: ::.::::::::: :::..:::::::::::.
NP_003 GTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRYYEV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRR
:..::.:::: :.:: ::::.:::::.:::::.::.::::::.: :.::::::::::::
NP_003 SADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIVPRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KA0 SDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLK----------------------
:.:::::::: : :..:.:: .:::.:.::::.:.::.
NP_003 SESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFNSMA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KA0 ----------------EGYKKSSKMVFKAP-------IKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTE
.:...:: . : : ..:::. ..::.:..: ::.::
NP_003 PASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPPKTE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KA0 NELLRMFFRQQDEIRRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
::::.::.:::.:::::.: :.:.... .::.
NP_003 NELLQMFYRQQEEIRRLRELLTQREVQAKQLELEIKNLRMGSEQL
490 500 510 520
>>NP_001098707 (OMIM: 605269) coronin-1C isoform a [Homo (527 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1433 Z-score: 1254.3 bits: 241.6 E(85289): 4e-63
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10 20
pF1KA0 MSWRPQYR----SSKFRNVYGKVANREHCF
: :. .: .::::.:.:.... ..:.
NP_001 KERGCSIACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCY
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 DGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVL
: : ... . :. ::::: ::.::. :..:::.:::.::..::::. .:: :::: : ::
NP_001 DDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVL
80 90 100 110 120 130
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pF1KA0 DIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNN
:: : : :..::: ::: .: .:.:::.:: ..:: .. :.:::.:::.: ::::. :
NP_001 DIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARN
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCHTDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPR
.:.::: : ..:::. .:: ... : :.:.: .:.: .:::. :. ::::.:::.::
NP_001 VLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPR
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 SGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEI
. ... : . : : : :..::.. . ..::: :: . ::.:::. .... :. .:.
NP_001 KQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEM
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPK
: .:.:.:::: :: ..:: ::::..:::.::. :.::. :: : : ::.:.: :::
NP_001 DTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 HGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGG
.::::. ::. ::.:: : ::: : :::.:: .:.:.:: : : : :: .::. :
NP_001 RGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEG
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA0 INRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFR
: ::.:.:::.:: :. . : : : ..: .. . ::. ..: .: . .
NP_001 KNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLI-SIPKKTTDTASVQNEA
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440 450 460 470
pF1KA0 QQDEI----RRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLRNSPKNC
. ::: . .:. . ..: :: .:. .. ..
NP_001 KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
500 510 520
>>XP_016874610 (OMIM: 605269) PREDICTED: coronin-1C isof (527 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1433 Z-score: 1254.3 bits: 241.6 E(85289): 4e-63
Smith-Waterman score: 1433; 44.9% identity (72.5% similar) in 483 aa overlap (1-468:48-525)
10 20
pF1KA0 MSWRPQYR----SSKFRNVYGKVANREHCF
: :. .: .::::.:.:.... ..:.
XP_016 KERGCSIACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCY
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 DGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVL
: : ... . :. ::::: ::.::. :..:::.:::.::..::::. .:: :::: : ::
XP_016 DDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 DIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNN
:: : : :..::: ::: .: .:.:::.:: ..:: .. :.:::.:::.: ::::. :
XP_016 DIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARN
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 ILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCHTDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPR
.:.::: : ..:::. .:: ... : :.:.: .:.: .:::. :. ::::.:::.::
XP_016 VLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPR
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 SGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEI
. ... : . : : : :..::.. . ..::: :: . ::.:::. .... :. .:.
XP_016 KQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEM
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPK
: .:.:.:::: :: ..:: ::::..:::.::. :.::. :: : : ::.:.: :::
XP_016 DTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 HGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGG
.::::. ::. ::.:: : ::: : :::.:: .:.:.:: : : : :: .::. :
XP_016 RGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEG
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA0 INRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPIKEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFR
: ::.:.:::.:: :. . : : : ..: .. . ::. ..: .: . .
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