FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0919, 672 aa
1>>>pF1KA0919 672 - 672 aa - 672 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7914+/-0.00129; mu= 12.9097+/- 0.078
mean_var=103.4271+/-20.123, 0's: 0 Z-trim(103.2): 33 B-trim: 7 in 1/50
Lambda= 0.126112
statistics sampled from 7253 (7276) to 7253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46333.1 EXOC6B gene_id:23233|Hs108|chr2 ( 811) 4311 795.8 0
CCDS82468.1 EXOC6B gene_id:23233|Hs108|chr2 ( 815) 4311 795.8 0
CCDS7424.2 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 ( 804) 3060 568.2 1.6e-161
CCDS31247.1 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 ( 799) 2941 546.5 5.3e-155
CCDS81487.1 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 ( 701) 1221 233.5 7.6e-61
>>CCDS46333.1 EXOC6B gene_id:23233|Hs108|chr2 (811 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 4243.2 bits: 795.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MERGKMAEAESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEEHGRFMEKLETRIRNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEELKQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEELKQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLQQRNISATVDKLMLCLPVLEMYSKLRDQMKTKRHYPALKTLEHLEHTYLPQVSHYRFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQPRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYRCLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYRCLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 IYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHILHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHILHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGFPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGFPVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDIELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDIELE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRTLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRTLSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTTTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTTTFK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFTHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFTHLP
610 620 630 640 650 660
670
pF1KA0 VSGSCSYFVLYI
CCDS46 GKVAQTACMSACKHLATSLMQLLLEAEVRQLTLGALQQFNLDVRECEQFARSGPVPGFQE
670 680 690 700 710 720
>>CCDS82468.1 EXOC6B gene_id:23233|Hs108|chr2 (815 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 4243.2 bits: 795.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MERGKMAEAESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEEHGRFMEKLETRIRNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MERGKMAEAESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEEHGRFMEKLETRIRNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEELKQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEELKQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RLQQRNISATVDKLMLCLPVLEMYSKLRDQMKTKRHYPALKTLEHLEHTYLPQVSHYRFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLQQRNISATVDKLMLCLPVLEMYSKLRDQMKTKRHYPALKTLEHLEHTYLPQVSHYRFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQPRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYRCLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYRCLH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 IYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHILHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHILHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGFPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGFPVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDIELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDIELE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRTLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRTLSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTTTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTTTFK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFTHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFTHLP
610 620 630 640 650 660
670
pF1KA0 VSGSCSYFVLYI
CCDS82 GKVAQTACMSACKHLATSLMQLLLEAEVRQLTLGALQQFNLDVRECEQFARSGPVPGFQE
670 680 690 700 710 720
>>CCDS7424.2 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 (804 aa)
initn: 3051 init1: 1983 opt: 3060 Z-score: 3013.2 bits: 568.2 E(32554): 1.6e-161
Smith-Waterman score: 3060; 70.7% identity (88.4% similar) in 658 aa overlap (6-660:1-651)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MERGKMAE-AESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEE--HGRFMEKLETRI
::: .::: :. ::::::.:::::::::.::::::::: . : .:::::.. :
CCDS74 MAENSESLGTVPEHERILQEIESTDTACVGPTLRSVYDDQPNAHKKFMEKLDACI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RNHDREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEEL
::::.:::::::::.:::::.:::::::: .:.::: :::::::..: :::... :..
CCDS74 RNHDKEIEKMCNFHHQGFVDAITELLKVRTDAEKLKVQVTDTNRRFQDAGKEVIVHTEDI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KQCRLQQRNISATVDKLMLCLPVLEMYSKLRDQMKTKRHYPALKTLEHLEHTYLPQVSHY
.::.:::::...:.::.::::::::::::..::..::.: ::::.:.::..:.: ::.:
CCDS74 IRCRIQQRNITTVVEKLQLCLPVLEMYSKLKEQMSAKRYYSALKTMEQLENVYFPWVSQY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RFCKVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQ
:::..:..:.:::::.::..::::::::::::::::::::::::::::.:... .. ::.
CCDS74 RFCQLMIENLPKLREDIKEISMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQHQKTF-SVSLQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PRIGSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYR
.: : :. :: : : . . : :. ::: ..::. .:::::::::::
CCDS74 Q---NKMKFGKNMYINRDRIPEERNETVLKHS--LEEEDE-NEEEILTVQDLVDFSPVYR
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 CLHIYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHI
::::::::: .:::::::::::.::::::::: ::::::.::::.::.::::::::::::
CCDS74 CLHIYSVLGDEETFENYYRKQRKKQARLVLQPQSNMHETVDGYRRYFTQIVGFFVVEDHI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LHTTQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGF
::.:::::.::: ::::.::::: ::.::.:::::.::.:::.:::: :.:::::: :::
CCDS74 LHVTQGLVTRAYTDELWNMALSKIIAVLRAHSSYCTDPDLVLELKNLTVIFADTLQGYGF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PVNQLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDI
:::.:::.:.::::::.:::::::::.::.:.. ::::::::..:: :: :...:::::
CCDS74 PVNRLFDLLFEIRDQYNETLLKKWAGVFRDIFEEDNYSPIPVVNEEEYKIVISKFPFQDP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ELEKQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRT
.:::: ::::::.:. ::..: :.:::::: :::::.:: ::::.:::.:::::::::::
CCDS74 DLEKQSFPKKFPMSQSVPHIYIQVKEFIYASLKFSESLHRSSTEIDDMLRKSTNLLLTRT
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LSNSLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTT
::. : :.:.. .:::::::::::::::::..:::::.:::::::. ::::::.::: .
CCDS74 LSSCLLNLIRKPHIGLTELVQIIINTTHLEQACKYLEDFITNITNISQETVHTTRLYGLS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 TFKDARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFT
:::::::::: ::::.::::::.:.::::::: .. ..:: ::.::: :::: : :::
CCDS74 TFKDARHAAEGEIYTKLNQKIDEFVQLADYDWTMSEPDGRASGYLMDLINFLRSIFQVFT
590 600 610 620 630 640
660 670
pF1KA0 HLPVSGSCSYFVLYI
:::
CCDS74 HLPGKVAQTACMSACQHLSTSLMQMLLDSELKQISMGAVQQFNLDVIQCELFASSEPVPG
650 660 670 680 690 700
>>CCDS31247.1 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 (799 aa)
initn: 2914 init1: 1983 opt: 2941 Z-score: 2896.2 bits: 546.5 E(32554): 5.3e-155
Smith-Waterman score: 2941; 68.9% identity (87.1% similar) in 650 aa overlap (13-660:5-646)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MERGKMAEAESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEE--HGRFMEKLETRIR
:: .: .: ::.: . . ::::::: . : .:::::.. ::
CCDS31 MLEEETDQTYENVLAEIQSFELP-VEATLRSVYDDQPNAHKKFMEKLDACIR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 NHDREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEELK
:::.:::::::::.:::::.:::::::: .:.::: :::::::..: :::... :..
CCDS31 NHDKEIEKMCNFHHQGFVDAITELLKVRTDAEKLKVQVTDTNRRFQDAGKEVIVHTEDII
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QCRLQQRNISATVDKLMLCLPVLEMYSKLRDQMKTKRHYPALKTLEHLEHTYLPQVSHYR
.::.:::::...:.::.::::::::::::..::..::.: ::::.:.::..:.: ::.::
CCDS31 RCRIQQRNITTVVEKLQLCLPVLEMYSKLKEQMSAKRYYSALKTMEQLENVYFPWVSQYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 FCKVMVDNIPKLREEIKDVSMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQQQRNLDNIVLQQP
::..:..:.:::::.::..::::::::::::::::::::::::::::.:... .. ::.
CCDS31 FCQLMIENLPKLREDIKEISMSDLKDFLESIRKHSDKIGETAMKQAQHQKTF-SVSLQKQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 RIGSKRKSKKDAYIIFDTEIESTSPKSEQDSGILDVEDEEDDEEVPGAQDLVDFSPVYRC
.: : :. :: : : . . : :. ::: ..::. .::::::::::::
CCDS31 ---NKMKFGKNMYINRDRIPEERNETVLKHS--LEEEDE-NEEEILTVQDLVDFSPVYRC
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LHIYSVLGARETFENYYRKQRRKQARLVLQPPSNMHETLDGYRKYFNQIVGFFVVEDHIL
:::::::: .:::::::::::.::::::::: ::::::.::::.::.:::::::::::::
CCDS31 LHIYSVLGDEETFENYYRKQRKKQARLVLQPQSNMHETVDGYRRYFTQIVGFFVVEDHIL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 HTTQGLVNRAYIDELWEMALSKTIAALRTHSSYCSDPNLVLDLKNLIVLFADTLQVYGFP
:.:::::.::: ::::.::::: ::.::.:::::.::.:::.:::: :.:::::: ::::
CCDS31 HVTQGLVTRAYTDELWNMALSKIIAVLRAHSSYCTDPDLVLELKNLTVIFADTLQGYGFP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 VNQLFDMLLEIRDQYSETLLKKWAGIFRNILDSDNYSPIPVTSEEMYKKVVGQFPFQDIE
::.:::.:.::::::.:::::::::.::.:.. ::::::::..:: :: :...::::: .
CCDS31 VNRLFDLLFEIRDQYNETLLKKWAGVFRDIFEEDNYSPIPVVNEEEYKIVISKFPFQDPD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LEKQPFPKKFPFSEFVPKVYNQIKEFIYACLKFSEDLHLSSTEVDDMIRKSTNLLLTRTL
:::: ::::::.:. ::..: :.:::::: :::::.:: ::::.:::.::::::::::::
CCDS31 LEKQSFPKKFPMSQSVPHIYIQVKEFIYASLKFSESLHRSSTEIDDMLRKSTNLLLTRTL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 SNSLQNVIKRKNIGLTELVQIIINTTHLEKSCKYLEEFITNITNVLPETVHTTKLYGTTT
:. : :.:.. .:::::::::::::::::..:::::.:::::::. ::::::.::: .:
CCDS31 SSCLLNLIRKPHIGLTELVQIIINTTHLEQACKYLEDFITNITNISQETVHTTRLYGLST
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 FKDARHAAEEEIYTNLNQKIDQFLQLADYDWMTGDLGNKASDYLVDLIAFLRSTFAVFTH
::::::::: ::::.::::::.:.::::::: .. ..:: ::.::: :::: : ::::
CCDS31 FKDARHAAEGEIYTKLNQKIDEFVQLADYDWTMSEPDGRASGYLMDLINFLRSIFQVFTH
590 600 610 620 630 640
660 670
pF1KA0 LPVSGSCSYFVLYI
::
CCDS31 LPGKVAQTACMSACQHLSTSLMQMLLDSELKQISMGAVQQFNLDVIQCELFASSEPVPGF
650 660 670 680 690 700
>>CCDS81487.1 EXOC6 gene_id:54536|Hs108|chr10 (701 aa)
initn: 2433 init1: 1220 opt: 1221 Z-score: 1205.8 bits: 233.5 E(32554): 7.6e-61
Smith-Waterman score: 2264; 57.8% identity (73.6% similar) in 658 aa overlap (6-660:1-548)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MERGKMAE-AESLETAAEHERILREIESTDTACIGPTLRSVYDGEE--HGRFMEKLETRI
::: .::: :. ::::::.:::::::::.::::::::: . : .:::::.. :
CCDS81 MAENSESLGTVPEHERILQEIESTDTACVGPTLRSVYDDQPNAHKKFMEKLDACI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RNHDREIEKMCNFHYQGFVDSITELLKVRGEAQKLKNQVTDTNRKLQHEGKELVIAMEEL
::::.:::::::::.:::::.:::::::: .:.::: :::::::..: :::... :..
CCDS81 RNHDKEIEKMCNFHHQGFVDAITELLKVRTDAEKLKVQVTDTNRRFQDAGKEVIVHTEDI
60 70 80 90 100 110
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]