FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0911, 981 aa
1>>>pF1KA0911 981 - 981 aa - 981 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6841+/-0.00132; mu= 5.5850+/- 0.079
mean_var=216.4367+/-43.787, 0's: 0 Z-trim(108.3): 89 B-trim: 359 in 1/49
Lambda= 0.087178
statistics sampled from 10053 (10130) to 10053 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 4.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 981) 6610 845.5 0
CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 ( 971) 6068 777.3 0
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CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 ( 955) 2033 269.9 1.8e-71
>>CCDS30580.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (981 aa)
initn: 6610 init1: 6610 opt: 6610 Z-score: 4507.6 bits: 845.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6610; 100.0% identity (100.0% similar) in 981 aa overlap (1-981:1-981)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KA0 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
:::::::::::::::::::::
CCDS30 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
970 980
>>CCDS105.1 CLSTN1 gene_id:22883|Hs108|chr1 (971 aa)
initn: 6539 init1: 6064 opt: 6068 Z-score: 4139.3 bits: 777.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6523; 99.0% identity (99.0% similar) in 981 aa overlap (1-981:1-971)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALDKDAPLRFA----------GEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVSVSPKEPFTISVWMRHGPFGRKKETILCSSDKTDMNRHHYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPSVTLYVDGTSHE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDLHMTQFFRGNLA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLTLEGEDLGELDK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQPEEPKISLSGV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLVSEEIVHDLDTC
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYEEVLHLLRYRNW
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQPQFVHPEHRSFV
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRTMRDQDTGKENE
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDWDDSALTITVNPMETYEDQHSSEEEEEEEEEEESEDGEEEDDITSAESESSEEEEGEQ
900 910 920 930 940 950
970 980
pF1KA0 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
:::::::::::::::::::::
CCDS10 GDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
960 970
>>CCDS8575.1 CLSTN3 gene_id:9746|Hs108|chr12 (956 aa)
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Smith-Waterman score: 3418; 51.9% identity (80.0% similar) in 954 aa overlap (15-949:8-945)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLI
::::.:: . . ..::::::.: :.::: ::::::::.:::.
CCDS85 MTLLLLPLLLASLLASCSC--NKANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCEL
:::::::::.: ::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .:::
CCDS85 ALDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEA
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QKDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYD
::...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: ::
CCDS85 QKEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAY
::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.:::::
CCDS85 RILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DCGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQ
:::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..:
CCDS85 DCGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ATVELETSHIGKGCDRDTYSEKSLHRLCGAAAGTAELLPSPSGSLNWTMGLPTDNGHDSD
::.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::.
CCDS85 ATIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400
pF1KA0 QVFEFNGTQAVRIPDGVVS---VSPKEP----FTISVWMRHG--PF-GRKKE-TILCSSD
.. :::::::..: : : .:.. ::.: ::.:: : :.:.: ::.:..
CCDS85 LIYWFNGTQAVQVPLGGPSGLGSGPQDSLSDHFTLSFWMKHGVTPNKGKKEEETIVCNTV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 KTDMNRHHYSLYVHGCRLIFLFRQDPSEEKKYRPAEFHWKLNQVCDEEWHHYVLNVEFPS
... . :::: :::::. ::. : :. ::..: :::.::::.:::::.::.:::.
CCDS85 QNEDGFSHYSLTVHGCRIAFLYW--PLLESA-RPVKFLWKLEQVCDDEWHHYALNLEFPT
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 VTLYVDGTSHEPFSVTEDYPLHPSKIETQLVVGACWQEFSGVENDNETEPVTVASAGGDL
::::.:: : .: . .. .:: . : :..:::: : .. :.. . . : .. : :
CCDS85 VTLYTDGISFDPALIHDNGLIHPPRREPALMIGACWTEEKNKEKE-KGDNSTDTTQGDPL
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 HMTQFFRGNLAGLTLRSGKLADKKVIDCLYTCKEGLDLQVLEDSGRGVQIQAHPSQLVLT
. ..:.: :::...:::.: ...::.:::.:.:::: . .:. :.:......::: .::
CCDS85 SIHHYFHGYLAGFSVRSGRLESREVIECLYACREGLDYRDFESLGKGMKVHVNPSQSLLT
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LEGEDLGELDKAMQHISYLNSRQFPTPGIRRLKITSTIKCFNEATCISVPPVDGYVMVLQ
:::.:. ...:.::..:.:. .: :::.: :..:...:::.: .:.:.: :.:::.:::
CCDS85 LEGDDVETFNHALQHVAYMNTLRFATPGVRPLRLTTAVKCFSEESCVSIPEVEGYVVVLQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 PEEPKISLSGVHHFARAASEFESSEGVFLFPELRIISTITREVEPEGDGAEDPTVQESLV
:. :.: :::. :::: : .::...:: :::.:.: .:...:: . : . . :: .. .
CCDS85 PDAPQILLSGTAHFARPAVDFEGTNGVPLFPDLQITCSISHQVEAKKDESWQGTVTDTRM
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 SEEIVHDLDTCEVTVEGEELNHEQESLEVDMARLQQKGIEVSSSELGMTFTGVDTMASYE
:.::::.:: ::... :..:. :.::: .: . :::.:.:.... .:..::.... ::
CCDS85 SDEIVHNLDGCEISLVGDDLDPERESLLLDTTSLQQRGLELTNTSAYLTIAGVESITVYE
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 EVLHLLRYRNWHARSLLDRKFKLICSELNGRYISNEFKVEVNVIHTANPMEHANHMAAQP
:.:. ::: :. .: :::.: :::.:::: :::: :::::.:. : . : .:. ..
CCDS85 EILRQARYRLRHGAALYTRKFRLSCSEMNGRYSSNEFIVEVNVLHSMNRVAHPSHVLSSQ
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 QFVHPEHRSFVDLSGHNLANPHPFAVVPSTATVVIVVCVSFLVFMIILGVFRIRAAHRRT
::.: :. ...::.::. : ...::.::..:::::.:::.:..::. ::.. :::.
CCDS85 QFLHRGHQPPPEMAGHSLASSHRNSMIPSAATLIIVVCVGFLVLMVVLGLVRIHSLHRRV
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 MRD------QDTGKENEMDWDDSALTITVNPMETYEDQHS--SEEEEEEEEEEESEDGEE
.. :. .. :::::::: :::::.:....: . ..:.:.: :.:
CCDS85 SGAGGPPGASSDPKDPDLFWDDSALTIIVNPMESYQNRQSCVTGAVGGQQEDEDSSDSEV
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980
pF1KA0 EDDITSAESESSEEEEGEQGDPQNATRQQQLEWDDSTLSY
:. .: :
CCDS85 ADSPSSDERRIIETPPHRY
940 950
>>CCDS3112.1 CLSTN2 gene_id:64084|Hs108|chr3 (955 aa)
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Smith-Waterman score: 3692; 54.4% identity (79.7% similar) in 992 aa overlap (15-981:11-955)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MLRRPAPALAPAARLLLA---GLLCGGG-------VWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTEND
:::: : ::: . ::.:::::::.: .:::..:::.
CCDS31 MLPGRLCWVPLLLALGVGSGSGGGGDSRQRRLLAAKVNKHKPWIETSYHGVITENN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 NTVLLDPPLIALDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVI
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