FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0901, 1215 aa
1>>>pF1KA0901 1215 - 1215 aa - 1215 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3309+/-0.000909; mu= 18.6706+/- 0.055
mean_var=112.9332+/-22.770, 0's: 0 Z-trim(108.9): 51 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.120688
statistics sampled from 10455 (10502) to 10455 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 4.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215) 8196 1438.9 0
CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 ( 669) 1378 251.6 4.8e-66
CCDS54545.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 ( 649) 997 185.3 4.4e-46
CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2 (1084) 774 146.6 3.2e-34
CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 954) 738 140.3 2.2e-32
CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 974) 738 140.3 2.2e-32
CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 991) 738 140.3 2.3e-32
CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1122) 720 137.2 2.2e-31
CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1123) 720 137.2 2.2e-31
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025) 716 136.5 3.3e-31
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066) 716 136.5 3.4e-31
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069) 716 136.5 3.4e-31
CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1011) 701 133.9 2e-30
CCDS14420.1 HDAC8 gene_id:55869|Hs108|chrX ( 377) 400 81.1 5.6e-15
CCDS360.1 HDAC1 gene_id:3065|Hs108|chr1 ( 482) 387 78.9 3.3e-14
CCDS43493.2 HDAC2 gene_id:3066|Hs108|chr6 ( 488) 384 78.4 4.7e-14
CCDS4264.1 HDAC3 gene_id:8841|Hs108|chr5 ( 428) 321 67.4 8.6e-11
>>CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215 aa)
initn: 8196 init1: 8196 opt: 8196 Z-score: 7711.4 bits: 1438.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8196; 100.0% identity (100.0% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:1-1215)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSTGQDSTTTRQRRSRQNPQSPPQDSSVTSKRNIKKGAVPRSIPNLAEVKKKGKMKKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MTSTGQDSTTTRQRRSRQNPQSPPQDSSVTSKRNIKKGAVPRSIPNLAEVKKKGKMKKLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QAMEEDLIVGLQGMDLNLEAEALAGTGLVLDEQLNEFHCLWDDSFPEGPERLHAIKEQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QAMEEDLIVGLQGMDLNLEAEALAGTGLVLDEQLNEFHCLWDDSFPEGPERLHAIKEQLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QEGLLDRCVSFQARFAEKEELMLVHSLEYIDLMETTQYMNEGELRVLADTYDSVYLHPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QEGLLDRCVSFQARFAEKEELMLVHSLEYIDLMETTQYMNEGELRVLADTYDSVYLHPNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YSCACLASGSVLRLVDAVLGAEIRNGMAIIRPPGHHAQHSLMDGYCMFNHVAVAARYAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YSCACLASGSVLRLVDAVLGAEIRNGMAIIRPPGHHAQHSLMDGYCMFNHVAVAARYAQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KHRIRRVLIVDWDVHHGQGTQFTFDQDPSVLYFSIHRYEQGRFWPHLKASNWSTTGFGQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KHRIRRVLIVDWDVHHGQGTQFTFDQDPSVLYFSIHRYEQGRFWPHLKASNWSTTGFGQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QGYTINVPWNQVGMRDADYIAAFLHVLLPVALEFQPQLVLVAAGFDALQGDPKGEMAATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGYTINVPWNQVGMRDADYIAAFLHVLLPVALEFQPQLVLVAAGFDALQGDPKGEMAATP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 AGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNLRALAEGVSASLHTLLGDPCPMLESPGAPCRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNLRALAEGVSASLHTLLGDPCPMLESPGAPCRSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QASVSCALEALEPFWEVLVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPILTWPVLQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QASVSCALEALEPFWEVLVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPILTWPVLQSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TGLVYDQNMMNHCNLWDSHHPEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPRPATEAELLTCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGLVYDQNMMNHCNLWDSHHPEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPRPATEAELLTCH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICPSTFACAQLATGAACRLVEAVLSGEVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICPSTFACAQLATGAACRLVEAVLSGEVLN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDWDVHHGNGTQHMF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFTVNVAWNGPRMGDADYLAAWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFTVNVAWNGPRMGDADYLAAWH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMGLASGRIILILEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMGLASGRIILILEG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GYNLTSISESMAACTRSLLGDPPPLLTLPRPPLSGALASITETIQVHRRYWRSLRVMKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GYNLTSISESMAACTRSLLGDPPPLLTLPRPPLSGALASITETIQVHRRYWRSLRVMKVE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DREGPSSSKLVTKKAPQPAKPRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFGEESTPGQTNSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DREGPSSSKLVTKKAPQPAKPRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFGEESTPGQTNSET
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 AVVALTQDQPSEAATGGATLAQTISEAAIGGAMLGQTTSEEAVGGATPDQTTSEETVGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVVALTQDQPSEAATGGATLAQTISEAAIGGAMLGQTTSEEAVGGATPDQTTSEETVGGA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ILDQTTSEDAVGGATLGQTTSEEAVGGATLAQTTSEAAMEGATLDQTTSEEAPGGTELIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILDQTTSEDAVGGATLGQTTSEEAVGGATLAQTTSEAAMEGATLDQTTSEEAPGGTELIQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 TPLASSTDHQTPPTSPVQGTTPQISPSTLIGSLRTLELGSESQGASESQAPGEENLLGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPLASSTDHQTPPTSPVQGTTPQISPSTLIGSLRTLELGSESQGASESQAPGEENLLGEA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 AGGQDMADSMLMQGSRGLTDQAIFYAVTPLPWCPHLVAVCPIPAAGLDVTQPCGDCGTIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AGGQDMADSMLMQGSRGLTDQAIFYAVTPLPWCPHLVAVCPIPAAGLDVTQPCGDCGTIQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 ENWVCLSCYQVYCGRYINGHMLQHHGNSGHPLVLSYIDLSAWCYYCQAYVHHQALLDVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENWVCLSCYQVYCGRYINGHMLQHHGNSGHPLVLSYIDLSAWCYYCQAYVHHQALLDVKN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KA0 IAHQNKFGEDMPHPH
:::::::::::::::
CCDS14 IAHQNKFGEDMPHPH
1210
>>CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 (669 aa)
initn: 1492 init1: 1328 opt: 1378 Z-score: 1299.2 bits: 251.6 E(32554): 4.8e-66
Smith-Waterman score: 1414; 39.4% identity (62.6% similar) in 728 aa overlap (85-806:2-633)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KMKKLGQAMEEDLIVGLQGMDLNLEAEALAGTGLVLDEQLNEFHCLWDDSF--PEGPERL
::.:: :... . :::: : ::::
CCDS14 MGTALVYHEDMTATRLLWDDPECEIERPERL
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 HAIKEQLIQEGLLDRCVSFQARFAEKEELMLVHSLEYIDLMETTQYMNEGELRVLADTYD
: ..: :.:: .::. ..:: : .::: :::: ::..:.. :: ... ::..:. .:
CCDS14 TAALDRLRQRGLEQRCLRLSAREASEEELGLVHSPEYVSLVRETQVLGKEELQALSGQFD
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SVYLHPNSYSCACLASGSVLRLVDAVLGAEIRNGMAIIRPPGHHAQHSLMDGYCMFNHVA
..:.::... :: ::.:. :.:::::: . ..::.:..::::::.:.. .:.:.::.::
CCDS14 AIYFHPSTFHCARLAAGAGLQLVDAVLTGAVQNGLALVRPPGHHGQRAAANGFCVFNNVA
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VAARYAQQKHRIRRVLIVDWDVHHGQGTQFTFDQDPSVLYFSIHRYEQGRFWPHLKASNW
.:: .:.::: ..:.:.:::::::::: :. :..:::::::: ::::.::::: :. :.
CCDS14 IAAAHAKQKHGLHRILVVDWDVHHGQGIQYLFEDDPSVLYFSWHRYEHGRFWPFLRESDA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STTGFGQGQGYTINVPWNQVGMRDADYIAAFLHVLLPVALEFQPQLVLVAAGFDALQGDP
...: ::: :.:.:.::::::: .:::.:::::.:::.:.::.:.::::.::::. :::
CCDS14 DAVGRGQGLGFTVNLPWNQVGMGNADYVAAFLHLLLPLAFEFDPELVLVSAGFDSAIGDP
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KGEMAATPAGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNLRALAEGVSASLHTLLGDPCPMLES
.:.: ::: ::.::.::. ::::.. :::::.:..:::.: ...:::::: : : .
CCDS14 EGQMQATPECFAHLTQLLQVLAGGRVCAVLEGGYHLESLAESVCMTVQTLLGDPAPPLSG
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PGAPCRSAQASVSCALEALEPFWEVLVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPIL
: :::.:: :.. : : : :. : .. :. . . .: : : ::.::
CCDS14 PMAPCQSALESIQSARAAQAPHWKSLQQQDVTA----VPMSPSSHSPEGRP--PPLLP--
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520
pF1KA0 TWPVLQ---SRTGLVYDQNMMNHCNLWDSHHPEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPR
:: . : . . :: . : : .: : .. :.: :
CCDS14 GGPVCKAAASAPSSLLDQPCL--C----------PAPSVRTAVALTTPDIT---LVLPPD
390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 PAT-EAELLTCHSAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICPSTFACAQLATGAACR
:: : .. .. : :.. .: : : :
CCDS14 VIQQEASALREETEAWA---RPHESLAREE--------------------ALTALGKLLY
430 440 450 460
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LVEAVLSGEVLNGAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDW
:....:.:.: .: :.. :. : :: .. ::.:.. .: : :.: :
CCDS14 LLDGMLDGQVNSGIAAT--PASAA---AA-------TLDVAVRRG--LSHGAQRLLCVA-
470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 DVHHGNGTQHMFEDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFTVNVAWNGP
. . . . .: : :..... : :.:. .. : :.. :
CCDS14 -LGQLDRPPDLAHDGRS-LWLNIR----------GKEAAALSM-------FHVSTPL--P
520 530 540
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 RMGDADYLAAWHRLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMG
: . .:. ::::.:: :.:.::::. : : : : .:.. : :. .: :
CCDS14 VM-TGGFLSCILGLVLPLAYGFQPDLVLVALG-------PGHGLQ-GPHA-ALLAAMLRG
550 560 570 580 590
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 LASGRIILILEGGYNLTSISESMAACTRSLLGDPPPLLTLPRPPLSGALASITETIQVHR
::.::.. .:: .: . . .: : :. :: :
CCDS14 LAGGRVLALLE----ENSTPQLAGILARVLNGEAPPSLGPSSVASPEDVQALMYLRGQLE
600 610 620 630 640 650
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 RYWRSLRVMKVEDREGPSSSKLVTKKAPQPAKPRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFG
CCDS14 PQWKMLQCHPHLVA
660
>>CCDS54545.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 (649 aa)
initn: 1096 init1: 957 opt: 997 Z-score: 940.9 bits: 185.3 E(32554): 4.4e-46
Smith-Waterman score: 1271; 37.6% identity (60.2% similar) in 728 aa overlap (85-806:2-613)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KMKKLGQAMEEDLIVGLQGMDLNLEAEALAGTGLVLDEQLNEFHCLWDDSF--PEGPERL
::.:: :... . :::: : ::::
CCDS54 MGTALVYHEDMTATRLLWDDPECEIERPERL
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 HAIKEQLIQEGLLDRCVSFQARFAEKEELMLVHSLEYIDLMETTQYMNEGELRVLADTYD
: ..: :.:: .::. ..:: : .::: :::: ::..:.. :: ... ::..:. .:
CCDS54 TAALDRLRQRGLEQRCLRLSAREASEEELGLVHSPEYVSLVRETQVLGKEELQALSGQFD
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SVYLHPNSYSCACLASGSVLRLVDAVLGAEIRNGMAIIRPPGHHAQHSLMDGYCMFNHVA
..:.::... :: ::.:. :.:::::: . ..::.:..::::::.:.. .:.:.::.::
CCDS54 AIYFHPSTFHCARLAAGAGLQLVDAVLTGAVQNGLALVRPPGHHGQRAAANGFCVFNNVA
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VAARYAQQKHRIRRVLIVDWDVHHGQGTQFTFDQDPSVLYFSIHRYEQGRFWPHLKASNW
.:: .:.::: ..:.:.:::::::::: :. :..:::::::: ::::.::::: :. :.
CCDS54 IAAAHAKQKHGLHRILVVDWDVHHGQGIQYLFEDDPSVLYFSWHRYEHGRFWPFLRESDA
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 STTGFGQGQGYTINVPWNQVGMRDADYIAAFLHVLLPVALEFQPQLVLVAAGFDALQGDP
...: ::: :.:.:.::::::: .:::.:::::.:::.:.:
CCDS54 DAVGRGQGLGFTVNLPWNQVGMGNADYVAAFLHLLLPLAFE-------------------
220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KGEMAATPAGFAQLTHLLMGLAGGKLILSLEGGYNLRALAEGVSASLHTLLGDPCPMLES
:.: ::: ::.::.::. ::::.. :::::.:..:::.: ...:::::: : : .
CCDS54 -GQMQATPECFAHLTQLLQVLAGGRVCAVLEGGYHLESLAESVCMTVQTLLGDPAPPLSG
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PGAPCRSAQASVSCALEALEPFWEVLVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPIL
: :::.:: :.. : : : :. : .. :. . . .: : : ::.::
CCDS54 PMAPCQSALESIQSARAAQAPHWKSLQQQDVTA----VPMSPSSHSPEGRP--PPLLP--
320 330 340 350 360
480 490 500 510 520
pF1KA0 TWPVLQ---SRTGLVYDQNMMNHCNLWDSHHPEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPR
:: . : . . :: . : : .: : .. :.: :
CCDS54 GGPVCKAAASAPSSLLDQPCL--C----------PAPSVRTAVALTTPDIT---LVLPPD
370 380 390 400
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 PAT-EAELLTCHSAEYVGHLRATEKMKTRELHRESSNFDSIYICPSTFACAQLATGAACR
:: : .. .. : :.. .: : : :
CCDS54 VIQQEASALREETEAWA---RPHESLAREE--------------------ALTALGKLLY
410 420 430 440
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LVEAVLSGEVLNGAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDW
:....:.:.: .: :.. :. : :: .. ::.:.. .: : :.: :
CCDS54 LLDGMLDGQVNSGIAAT--PASAA---AA-------TLDVAVRRG--LSHGAQRLLCVA-
450 460 470 480 490
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 DVHHGNGTQHMFEDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFTVNVAWNGP
. . . . .: : :..... : :.:. .. : :.. :
CCDS54 -LGQLDRPPDLAHDGRS-LWLNIR----------GKEAAALSM-------FHVSTPL--P
500 510 520
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 RMGDADYLAAWHRLVLPIAYEFNPELVLVSAGFDAARGDPLGGCQVSPEGYAHLTHLLMG
: . .:. ::::.:: :.:.::::. : : : : .:.. : :. .: :
CCDS54 VM-TGGFLSCILGLVLPLAYGFQPDLVLVALG-------PGHGLQ-GPHA-ALLAAMLRG
530 540 550 560 570
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 LASGRIILILEGGYNLTSISESMAACTRSLLGDPPPLLTLPRPPLSGALASITETIQVHR
::.::.. .:: .: . . .: : :. :: :
CCDS54 LAGGRVLALLE----ENSTPQLAGILARVLNGEAPPSLGPSSVASPEDVQALMYLRGQLE
580 590 600 610 620 630
830 840 850 860 870 880
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660 670 680 690 700 710
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:::.. .:.::: ::.:.:::::::::::.: : ::: .:: . ....:. ::.::.:
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CCDS45 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFP--GSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDV
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CCDS45 EYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAG
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CCDS45 GRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQS
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..:
CCDS45 KHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEP
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pF1KA0 LILSLEGGYNLRALAEGVSASLHTLLGDPCPMLESPGAPCRSAQASVSCALEALEPFWEV
: :: ::: .. .... :. :. .
CCDS32 EEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQ-PLQPLQVYQAP
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pF1KA0 LVRSTETVERDNMEEDNVEESEEEGPWEPPVLPILTWPVLQSRTGLVYDQNMMNH-CNLW
: : :: .. . . . . : :: :. ::.::: :..: :
CCDS32 L--SLATVPHQALGRTQSSPAAPGGMKSPPDQPVKHL----FTTGVVYDTFMLKHQCMCG
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pF1KA0 DSH-HPEVPQRILRIMCRLEELGLAGRCLTLTPRPATEAELLTCHSAEYVGHLRAT----
..: ::: :: : ::.: :: ..: . : :: :. : :: :: : .:
CCDS32 NTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHS-EYHTLLYGTSPLN
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pF1KA0 -EKMKTRELHRESS--------------NFDSIYICPSTFACAQLATGAACRLVEAVLSG
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CCDS32 RQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAG
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pF1KA0 EVLNGAAVVRPPGHHAEQDAACGFCFFNSVAVAARHAQTISGHALRILIVDWDVHHGNGT
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CCDS32 ELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQ-KLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
820 830 840 850 860 870
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pF1KA0 QHMFEDDPSVLYVSLHRYDHGTFFPMGDEGASSQIGRAAGTGFTVNVAWNG---PRMGDA
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CCDS32 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFP--GSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDV
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CCDS32 EYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAG
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pF1KA0 GRIILILEGGYNLTSISESMAACTRSLLG-DPPPL--LTLPRPPLSGALASITETIQVHR
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CCDS32 GRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KA0 RYWRSLRVMKVEDREGPSSSKLVTKKAPQPAKPRLAERMTTREKKVLEAGMGKVTSASFG
..:
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