Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0882
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0882, 1266 aa
1>>>pF1KA0882 1266 - 1266 aa - 1266 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2627+/-0.0012; mu= 19.1454+/- 0.073
mean_var=105.0659+/-20.322, 0's: 0 Z-trim(105.5): 101 B-trim: 87 in 1/50
Lambda= 0.125125
statistics sampled from 8347 (8449) to 8347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 5.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 8395 1527.3 0
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 5134 938.6 0
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 4560 835.0 0
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 2655 491.1 6.9e-138
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 2404 445.8 3e-124
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 2007 374.1 1.1e-102
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX ( 632) 892 172.7 2.7e-42
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 589 118.0 9.2e-26
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 531 107.3 6.9e-23
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 531 107.3 7.1e-23
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 534 108.2 1.1e-22
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 516 104.9 9.9e-22
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 495 101.1 1.2e-20
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 479 98.0 5.8e-20
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 467 95.8 2.7e-19
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 467 96.1 4.6e-19
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 463 95.2 4.8e-19
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 463 95.2 4.8e-19
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 400 84.0 2e-15
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 392 82.5 4.9e-15
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 391 82.3 5.6e-15
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 391 82.3 5.7e-15
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 386 81.4 1e-14
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 381 80.6 2.4e-14
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 379 80.1 2.5e-14
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 377 79.9 4.3e-14
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 340 73.1 3.4e-12
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 340 73.1 3.4e-12
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 340 73.2 4.6e-12
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 340 73.2 4.8e-12
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 340 73.2 4.8e-12
CCDS73606.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 236) 312 67.7 4.2e-11
>>CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266 aa)
initn: 8395 init1: 8395 opt: 8395 Z-score: 8188.3 bits: 1527.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8395; 100.0% identity (100.0% similar) in 1266 aa overlap (1-1266:1-1266)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 YYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLIRTSYEK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 FGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 NGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDI
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CCDS47 NGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQYFFEDI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWTPENKSKSKNAKD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 LPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQPAKEGGS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 GGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 RDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 RSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASDYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKNIRMMGKPLTSASDYE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 ISAMSG
::::::
CCDS47 ISAMSG
>>CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250 aa)
initn: 4910 init1: 2367 opt: 5134 Z-score: 5007.0 bits: 938.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5164; 63.1% identity (83.5% similar) in 1288 aa overlap (1-1266:1-1250)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
::..:::::.:::::.::::::.:.::::.:: : ::::.:::::::::::::::::
CCDS43 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH----GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::.
CCDS43 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
::::: :: . . :.: ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.:
CCDS43 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
:..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.:
CCDS43 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
::::::::::.:::::::.::: .:..::. : ...::::::::::::.: ::: ::
CCDS43 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH-RNISALKRDLDARAKNECYRATFR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.:::::.::::. : ::::::::::::::
CCDS43 LPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: :: :: .:
CCDS43 DSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQ------PGSIGSRK
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KA0 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EE
: . ::. : .::... . :. . :: .. .. .:::.: :. .... :: :.
CCDS43 ASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMED
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 FNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINE
.. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: ::
CCDS43 LGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRN
.:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 MVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 PNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELAR
:.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS43 PTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTR
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 DYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVL
:..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::::
CCDS43 DFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVL
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 DANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLI
:::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .: :::::.:.
CCDS43 DANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 RTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALF
..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .:
CCDS43 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 KAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRL
::.::.: ::: : . :.::::::::::::: ::. .:: : :::::.:. .::.:.
CCDS43 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 FQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQ
:.::::: ::::::.:::.:.:. :::::::::.:::.: :: :. . .: .::.::..
CCDS43 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000
pF1KA0 YFFEDITPECTHVVG-LDSRSKQGADDGFVTV----SLKPDKG--KRANSQENRNYLRLW
:: :: . : . ... :: :.... : . ..: : ..: . :.:::.:
CCDS43 YFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMW
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 TPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVG
. :....... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.:::::
CCDS43 AKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 KLFVAQPAKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDS
: : :. ... . .. .: :: : : . :.: :. . :.
CCDS43 KKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPP-AAGDPQ---------AKAGGDT
1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 EEHSLGG--QMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLH
. :: : .. .: .: . .:. :.:.:::.:::: :::::::.:.:: :.
CCDS43 H---LGKAPQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQ
1120 1130 1140 1150 1160
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 CEDIGEDTVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMA
:::...::::: .:.. . : . ..: :: :.:::.:::.::: .::..:.: : .
CCDS43 CEDLADDTVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1240 1250 1260
pF1KA0 RITSAKNIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
.: . :... . ...:::.: ..::
CCDS43 KIKDQKKVE---RQFSTASDHEQPGVSG
1230 1240 1250
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10 20 30 40 50
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::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::.
CCDS44 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
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::::: :: . . :.: ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.:
CCDS44 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
:..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.:
CCDS44 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
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::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: :: :: .:
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: . ::. : .::... . :. . :: .. .. .:::.: :. .... :: :.
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.. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: ::
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.:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::
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:.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
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:..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::::
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:::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .: :::::.:.
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..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .:
CCDS44 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF
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::.::.: ::: : . :.::::::::::::: ::. .:: : :::::.:. .::.:.
CCDS44 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM
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CCDS44 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH
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:: :: . : .: .. ..:. : . . : ..: . :.:::.:. :....
CCDS44 YFTEDSSSEE----ALPQEEQEGSG------SEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQ
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pF1KA0 SKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGKLFVAQP
... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.:::::: : :.
CCDS44 KETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSART
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pF1KA0 AKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGG
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CCDS44 GRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPP-AAGDPQ---------AKAGGDTH---LGK
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: .. .: .: . .:. :.:.:::.:::: :::::::.:.:: :.:::...:
CCDS44 APQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQCEDLADD
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pF1KA0 TVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAKN
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CCDS44 TVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKK
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pF1KA0 IRMMGKPLTSASDYEISAMSG
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CCDS44 VE---RQFSTASDHEQPGVSG
1220 1230
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CCDS82 RVAPFRILLQVPGSQVYSPIACGELLNGSDVYWAIATGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLS
60 70 80 90 100 110
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CCDS82 VFDNKDDIASFVKGKVKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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::: :::.::::::.::::::::::::..:.: :::. :::: .::......: :.:..
CCDS82 YSCCCWKGRVPRQGWLYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRI
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 STRSSEHFFSVFLNINETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALK
.:...:. ::.:::..:.::.:::::....:.::::: :. : : :.. :.... :
CCDS82 TTQNKERDFSMFLNLDEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLD---PDLQE--PSQIT--K
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..... :..: ::.. .::: : : :: :. .. . :: . .
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:::::.::.::::.: :... :.::::: .:::.:.:: :.:::::::::::::::::
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:::: ::::::::::::: :::.:::::.:::.:::::::.:::::::::::.:::::::
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:::::::.:::.::::.::::.::.. : . ::::.:. .:.:.:: . :.:: ::.
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CCDS82 HHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVL
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CCDS82 RVVIPEVSILPEDLEELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAH
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CCDS82 LFQLVSPWTCGAHTEILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRL
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CCDS82 HI-P-PALTENDRDSQSPLRNPLLSTSRPL---VFG------------------KPN-GD
940 950 960 970
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.. : .. .. : :.:. :.:::..: .::..:::.:.:: :::.:..::.:
CCDS82 AVDYQ--KQLKQMIKDLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAI
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CCDS82 ATVTTLLLQIGEVG--------QRGSSSG---SCSQ------------------ECGEEL
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pF1KA0 PASLAPDSEEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSH
:: :: ::.: ::..
CCDS82 RAS-AP-------------------SPED-----------------------SVFA----
1070
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 EEDKLHCEDIGEDTVLVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKP
: : .. : . :.:... .:::....:..::::::: .::..:.::
CCDS82 --------DTG------KTPQDSQAFPEAA--ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKP
1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA0 VCMMARITSAK----NIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
. : ... .:: :.. . : :. ..: .
CCDS82 LDMKSKLENAKINQYNLKTFEMSHQSQSELKLSNL
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MWVNPEEVLLANAL--WITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSA
::..:::::: ::: :.:.... :::::::.:: : ::: :.: :::.::.::::.:
CCDS46 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGH---GEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RVAPYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGK
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CCDS46 RVAPFRILLQVPGSQVYSPIACGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFDNKDDIASFVKGK
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 IQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGW
....::: .. ...... :::.::.:::. :..:: ::::.:::: :::.::::::
CCDS46 VKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSCCCWKGRVPRQGW
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 MYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNI
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CCDS46 LYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQNKERDFSMFLNL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 NETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRAL
.:.::.:::::....:.::::: :. : : :.. :.... ::::.:::..: .::.
CCDS46 DEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLD---PDLQE--PSQIT--KRDLEARAQNEFFRAF
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 FRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVE
::::. ::: . .::.:::::.. : :.::.: .::::.:.:.. :..:.:::::. .:
CCDS46 FRLPRKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKIILPLREVVSIE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNS
: ...:.:: :. .: :....: : .:.::: ::. . :.: ..... :..
CCDS46 KMEDTSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQ----VHANHPV--HYDT
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pF1KA0 S-DDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-GERQFNLNGNSVPTATQ--------TLMTMYR
: ::.. .::: : : :: :. .. . :: . . .:.: ..
CCDS46 SADDDM----ASLVFHS--TSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDALVTAFQ
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pF1KA0 RRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLL
. . . . ....: .: . :. ::.:::. .::.:::: :.:: :::::.::.::::.
CCDS46 QSGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLWLLF
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pF1KA0 SGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLT
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CCDS46 SDAVTDLASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRRVLT
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pF1KA0 AYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGV
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CCDS46 AYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVDQSV
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pF1KA0 FEELARDYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQ
:::: . ..:.: . :.::......:::::::::::.::.:::: :::::::.:::.:::
CCDS46 FEELIKGHLPELAEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKAIFQ
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pF1KA0 LALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEV
:.::::.::.. : . ::::.:. .:.:.:: . :.:: ::. :...::: :::: .
CCDS46 LGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPYPVT
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pF1KA0 DIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELE
:: ::: :::::: .. ::..:.:.:..:.: :::::.::.:... :.:. ..::
CCDS46 DISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPEDLE
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pF1KA0 ELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSD
::: ::: ::. :::: .::::: :: :::::: .:: .: :. ::.::.:..
CCDS46 ELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGAHTE
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pF1KA0 VLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDS
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CCDS46 ILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHI-P-PALTENDRDS
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pF1KA0 AFEATQYFFEDITPECTHVVGLDSRSKQGADDGFVTVSLKPDKGKRANSQENRNYLRLWT
. .. : : : ::. : .. : .. ..
CCDS46 QSPLRNPLLSTSRPL---VFG------------------KPN-GDAVDYQ--KQLKQMIK
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pF1KA0 PENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVGK
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CCDS46 DLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTLLLQIGEVG-
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pF1KA0 LFVAQPAKEGGSGGSGPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDSEEHSLGG
..:.:.: :: : : : : :: ::
CCDS46 -------QRGSSSG---SCSQ------------------ECGEELRAS-AP---------
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pF1KA0 QMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCEDIGEDTV
::.: ::.. : :
CCDS46 ----------SPED-----------------------SVFA------------DTG----
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pF1KA0 LVRSGQGTAALPRSTSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARITSAK----
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CCDS46 --KTPQDSQAFPEAA--ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQY
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pF1KA0 NIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
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CCDS46 NLKTFEMSHQSQSELKLSNL
1130 1140
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CCDS14 ESTEPSDNFEVQSLTS---QRECSKTVN---------------TEALMTVFHPQNLETLN
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CCDS14 NLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRE
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CCDS14 SNEKYGNIRYEDIHSMRCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVKLSLQELDELYVIFKK
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CCDS14 LLDENSDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTEVKSKDASKGDELSKE
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CCDS14 ELLYFSQL-----HV------SKPANEKEAESAKHSPEKGK--GKIDIQAYLSQWQDELF
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CCDS14 KKEENIKDLPRMNQSQFIQFSKTLYNLFHEDPEEESLYQAIAVVTSLLLRMEEVGRKL-H
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CCDS14 SPTS-SAKGFSGTVCGSGGPSEEKTGSHLEKDPCSFREEPQWSFAFEQILASLLNEPALV
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pF1KA0 IQGIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGW
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CCDS14 IRGLIAEEGKHCFAKEDDP-EKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGW
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pF1KA0 MYLSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNI
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CCDS14 LYLSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHI
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 NETFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRAL
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CCDS14 NQTYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDND---PVLY--NPLQIT--KRGLENRAHSEQFNAF
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pF1KA0 FRLPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVE
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CCDS14 FRLPKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAID
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pF1KA0 KADSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSD--KEFAGSY
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CCDS14 KTNDSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDISTELAISS
360 370 380 390 400
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pF1KA0 NSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFN
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CCDS14 ESTEPSDNFEVQSLTS---QRECSKTVN---------------TEALMTVFHPQNLETLN
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pF1KA0 PKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKA
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CCDS14 SKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMA
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CCDS14 TNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPK
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CCDS14 IGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGSDDFMPLVRIQGQCV
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CCDS14 IGEK
630
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pF1KA0 VQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSDDEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDADGERQFNL
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CCDS14 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKE
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pF1KA0 NGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQ-GICMYRTEKTRE
.:. : .. . . .:... . :: ... . . . .. . :.:: :
CCDS14 EGDE-PGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNH--DVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRS
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pF1KA0 LVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPE
::: :::..:: .::. ::::...: . :...:..: . ..:...::.:: :..:
CCDS14 LVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPS
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pF1KA0 HPAFQN--EMGIAALRRVLTAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCE
. : . .:. ::::: : :. :.:::::. ..:.. :::. .::.:::.. :. :
CCDS14 NACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIE
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CCDS14 DLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVV
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.. . . : ::::: .:.:::.:..: . ..:.. .... ...:. ... . .
CCDS14 DIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAEL
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: .: . :.: :: . . :: . . .: : . .. :...
CCDS14 LLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLG---AGTLTNLS--------QVVR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]