Result of FASTA (omim) for
pF1KA0829
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0829, 1230 aa
1>>>pF1KA0829 1230 - 1230 aa - 1230 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7775+/-0.000514; mu= 21.3782+/- 0.032
mean_var=96.8472+/-18.618, 0's: 0 Z-trim(109.5): 105 B-trim: 131 in 1/51
Lambda= 0.130326
statistics sampled from 17625 (17698) to 17625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 16.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060918 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD8-d (1230) 7917 1500.4 0
NP_001316604 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD (1206) 7766 1472.0 0
NP_001316603 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD (1206) 7766 1472.0 0
NP_001316605 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD (1197) 7475 1417.3 0
NP_001155971 (OMIM: 610403) cullin-associated NEDD (1236) 5192 988.1 0
XP_011531806 (OMIM: 610403) PREDICTED: cullin-asso (1212) 5062 963.6 0
XP_011531805 (OMIM: 610403) PREDICTED: cullin-asso (1145) 4653 886.7 0
NP_036430 (OMIM: 610403) cullin-associated NEDD8-d (1119) 3141 602.4 5.3e-171
>>NP_060918 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD8-disso (1230 aa)
initn: 7917 init1: 7917 opt: 7917 Z-score: 8043.6 bits: 1500.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7917; 100.0% identity (100.0% similar) in 1230 aa overlap (1-1230:1-1230)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230
pF1KA0 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
1210 1220 1230
>>NP_001316604 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD8-di (1206 aa)
initn: 7766 init1: 7766 opt: 7766 Z-score: 7890.3 bits: 1472.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7766; 100.0% identity (100.0% similar) in 1206 aa overlap (25-1230:1-1206)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230
pF1KA0 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
1180 1190 1200
>>NP_001316603 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD8-di (1206 aa)
initn: 7766 init1: 7766 opt: 7766 Z-score: 7890.3 bits: 1472.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7766; 100.0% identity (100.0% similar) in 1206 aa overlap (25-1230:1-1206)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEAL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLR
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLA
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLT
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALL
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEIT
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTL
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDL
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230
pF1KA0 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
1180 1190 1200
>>NP_001316605 (OMIM: 607727) cullin-associated NEDD8-di (1197 aa)
initn: 7475 init1: 7475 opt: 7475 Z-score: 7594.6 bits: 1417.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7475; 99.8% identity (99.9% similar) in 1161 aa overlap (70-1230:37-1197)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 KLDDDSERKVVKMILKLLEDKNGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDK
. ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIQNEITWGWNPSLNMKLIYVSYISLIHIARSLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDK
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 EQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMA
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 DMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLL
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 SELSKNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SELSKNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAF
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 ESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEY
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYL
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLT
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQA
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAA
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 DIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSP
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPP
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 LISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFF
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 QALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVG
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 QFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYA
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKH
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 CECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQP
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 IDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVR
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 KELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 KMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 VAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
1150 1160 1170 1180 1190
>>NP_001155971 (OMIM: 610403) cullin-associated NEDD8-di (1236 aa)
initn: 4800 init1: 1985 opt: 5192 Z-score: 5274.6 bits: 988.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5192; 62.4% identity (87.4% similar) in 1237 aa overlap (1-1230:1-1236)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
:..:..:::.:::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
NP_001 MSTAAFHISSLLEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::..::::::..:::::
NP_001 NGEVQNLAVKCLGPLVVKVKEYQVETIVDTLCTNMRSDKEQLRDIAGIGLKTVLSELPPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
..::.::.:::.::::.::::::.::::.::::::::..::::: : : :: :.: ::
NP_001 ATGSGLATNVCRKITGQLTSAIAQQEDVAVQLEALDILSDMLSRLGVPLGAFHASLLHCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..: : .. :: :::
NP_001 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
.....::::::.: .:....::: :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
NP_001 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
NP_001 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
:..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..:: .
NP_001 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
: . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
NP_001 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
:::::: :.::::....:::. : .: .. ..::::. :.:::.:::.: ::::..
NP_001 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
:::.: :.::... :: .: .: ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
NP_001 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
.::: ::.:: :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
NP_001 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
:::::::::.:.::.::: : .. . :: . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
NP_001 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
:.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.: :.:::: : . : :.
NP_001 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 MLTGPVYSQST---ALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSI
.::.::: :.. ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :... .:. ..
NP_001 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPF
..::.:::.:::. . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
NP_001 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAEC
.:..: ..:.:::::::::.: ...:. .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
NP_001 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
.:::.:..: :::::. : .: ..::.:.::::: :::.:.:::::::. ::.:...
NP_001 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFIGEFMES
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
:.::::::::..:. ::::.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
NP_001 LQDPDLNVRRATLAFFNSAVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.::::.:..::.:::
NP_001 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMVARLATLC
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
:. ::::.:::.::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.
NP_001 PAPVLQRVDRLIEPLRATCTAKVKAGSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEVGKSPI
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230
pF1KA0 MSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSST-NLESMDTS
:..:.::: :::::::.::::::::.:. . .::. :
NP_001 MADFSSQIRSNPELAALFESIQKDSASAPSTDSMELS
1200 1210 1220 1230
>>XP_011531806 (OMIM: 610403) PREDICTED: cullin-associat (1212 aa)
initn: 4670 init1: 1985 opt: 5062 Z-score: 5142.6 bits: 963.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5062; 62.1% identity (87.1% similar) in 1213 aa overlap (25-1230:1-1212)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
:::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
XP_011 MATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::..::::::..:::::
XP_011 NGEVQNLAVKCLGPLVVKVKEYQVETIVDTLCTNMRSDKEQLRDIAGIGLKTVLSELPPA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
..::.::.:::.::::.::::::.::::.::::::::..::::: : : :: :.: ::
XP_011 ATGSGLATNVCRKITGQLTSAIAQQEDVAVQLEALDILSDMLSRLGVPLGAFHASLLHCL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..: : .. :: :::
XP_011 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
.....::::::.: .:....::: :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
XP_011 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
XP_011 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
:..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..:: .
XP_011 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
: . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
XP_011 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
:::::: :.::::....:::. : .: .. ..::::. :.:::.:::.: ::::..
XP_011 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
:::.: :.::... :: .: .: ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
XP_011 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
.::: ::.:: :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
XP_011 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
:::::::::.:.::.::: : .. . :: . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
XP_011 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
:.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.: :.:::: : . : :.
XP_011 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 MLTGPVYSQST---ALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSI
.::.::: :.. ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :... .:. ..
XP_011 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPF
..::.:::.:::. . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
XP_011 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAEC
.:..: ..:.:::::::::.: ...:. .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
XP_011 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
.:::.:..: :::::. : .: ..::.:.::::: :::.:.:::::::. ::.:...
XP_011 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFIGEFMES
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
:.::::::::..:. ::::.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
XP_011 LQDPDLNVRRATLAFFNSAVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.::::.:..::.:::
XP_011 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMVARLATLC
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
:. ::::.:::.::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.
XP_011 PAPVLQRVDRLIEPLRATCTAKVKAGSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEVGKSPI
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230
pF1KA0 MSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSST-NLESMDTS
:..:.::: :::::::.::::::::.:. . .::. :
XP_011 MADFSSQIRSNPELAALFESIQKDSASAPSTDSMELS
1180 1190 1200 1210
>>XP_011531805 (OMIM: 610403) PREDICTED: cullin-associat (1145 aa)
initn: 4269 init1: 1735 opt: 4653 Z-score: 4727.3 bits: 886.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4653; 61.0% identity (86.7% similar) in 1126 aa overlap (1-1120:1-1125)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
:..:..:::.:::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
XP_011 MSTAAFHISSLLEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::..::::::..:::::
XP_011 NGEVQNLAVKCLGPLVVKVKEYQVETIVDTLCTNMRSDKEQLRDIAGIGLKTVLSELPPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
..::.::.:::.::::.::::::.::::.::::::::..::::: : : :: :.: ::
XP_011 ATGSGLATNVCRKITGQLTSAIAQQEDVAVQLEALDILSDMLSRLGVPLGAFHASLLHCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..: : .. :: :::
XP_011 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
.....::::::.: .:....::: :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
XP_011 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
XP_011 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
:..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..:: .
XP_011 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
: . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
XP_011 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
:::::: :.::::....:::. : .: .. ..::::. :.:::.:::.: ::::..
XP_011 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
:::.: :.::... :: .: .: ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
XP_011 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
.::: ::.:: :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
XP_011 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
:::::::::.:.::.::: : .. . :: . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
XP_011 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
:.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.: :.:::: : . : :.
XP_011 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 MLTGPVYSQST---ALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSI
.::.::: :.. ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :... .:. ..
XP_011 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPF
..::.:::.:::. . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
XP_011 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAEC
.:..: ..:.:::::::::.: ...:. .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
XP_011 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
.:::.:..: :::::. : .: ..::.:.::::: :::.:.:::::::. ::.:...
XP_011 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFIGEFMES
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
:.::::::::..:. ::::.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
XP_011 LQDPDLNVRRATLAFFNSAVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.
XP_011 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRGTFSCGILAALRSE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
XP_011 LHLFVL
1140
>>NP_036430 (OMIM: 610403) cullin-associated NEDD8-disso (1119 aa)
initn: 4161 init1: 1735 opt: 3141 Z-score: 3191.0 bits: 602.4 E(85289): 5.3e-171
Smith-Waterman score: 4333; 55.1% identity (78.3% similar) in 1237 aa overlap (1-1230:1-1119)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDK
:..:..:::.:::::::::::::::::.:::.:::::::.::.:::::::::.:.:::::
NP_036 MSTAAFHISSLLEKMTSSDKDFRFMATSDLMSELQKDSIQLDEDSERKVVKMLLRLLEDK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPA
:::::::::: ::
NP_036 NGEVQNLAVKWLG-----------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCL
: : : :: :.: ::
NP_036 -----------------------------VPLGA-----------------FHASLLHCL
80
190 200 210 220 230
pF1KA0 LPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKN---DSMSTTRTYIQC
::::.:::::::::.. :::::. .:.. .::.: .:::..: : .. :: :::
NP_036 LPQLSSPRLAVRKRAVGALGHLAAACSTDLFVELADHLLDRLPGPRVPTSPTAIRTLIQC
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTI
.....::::::.: .:....::: :::.::::::: :.::::.:.:.::::. ::: ..
NP_036 LGSVGRQAGHRLGAHLDRLVPLVEDFCNLDDDELRESCLQAFEAFLRKCPKEMGPHVPNV
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 INICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCL
..::.:. .:::::::. ::::. :... .. ..: :.::::::::::::::::::::.
NP_036 TSLCLQYIKHDPNYNYDS-DEDEEQMETEDSEFSEQESEDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCI
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDA
:..:.: ..::.:. :..:.:: :::::::::::::: ::. ::.::.: ..:: .
NP_036 AALISSRPDLLPDFHCTLAPVLIRRFKEREENVKADVFTAYIVLLRQTQPPKGWLEAMEE
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 MEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLV
: . : ::..::: .::::..:.:..::..:: ::..::::..::::.:..:.::::
NP_036 PTQTGSNLHMLRGQVPLVVKALQRQLKDRSVRARQGCFSLLTELAGVLPGSLAEHMPVLV
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 PGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITS
:::::: :.::::....:::. : .: .. ..::::. :.:::.:::.: ::::..
NP_036 SGIIFSLADRSSSSTIRMDALAFLQGLLGTEPAEAFHPHLPILLPPVMACVADSFYKIAA
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQII
:::.: :.::... :: .: .: ::. .. . :. ::.:.:.:::::::::::::...
NP_036 EALVVLQELVRALWPLHRPRMLDPEPYVGEMSAVTLARLRATDLDQEVKERAISCMGHLV
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 CNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILAS
.::: ::.:: :: ..:.::.:::::: ..:::::.: :::..::.:.:.:.. ::::
NP_036 GHLGDRLGDDLEPTLLLLLDRLRNEITRLPAIKALTLVAVSPLQLDLQPILAEALHILAS
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 FLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLT
:::::::::.:.::.::: : .. . :: . ..::: ::: :..::::::.:.:..::.
NP_036 FLRKNQRALRLATLAALDALAQSQGLSLPPSAVQAVLAELPALVNESDMHVAQLAVDFLA
570 580 590 600 610 620
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 TLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLR
:.... :.:: ..:: .:.::. :.::::: .:.:.: :.:::: : . : :.
NP_036 TVTQAQPASLVEVSGPVLSELLRLLRSPLLPAGVLAAAEGFLQALVGTRPPCVDYAKLIS
630 640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 MLTGPVYSQST---ALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSI
.::.::: :.. ::: ..:.:.:::::. :::.:. ....... :... .:. ..
NP_036 LLTAPVYEQAVDGGPGLHKQVFHSLARCVAALSAACPQEAASTASRLVCDARSPHSSTGV
690 700 710 720 730 740
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPF
..::.:::.:::. . : :::.:.:::..::::.:..::::::: ...:.::..:::
NP_036 KVLAFLSLAEVGQVAGPGHQRELKAVLLEALGSPSEDVRAAASYALGRVGAGSLPDFLPF
750 760 770 780 790 800
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAEC
.:..: ..:.:::::::::.: ...:. .::::.:.:::::...:: ::::::.:::::
NP_036 LLEQIEAEPRRQYLLLHSLREALGAAQPDSLKPYAEDIWALLFQRCEGAEEGTRGVVAEC
810 820 830 840 850 860
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKT
.:::.:..: :::::. : .: ..::.:.::::: :::.:.:::::::. :
NP_036 IGKLVLVNPSFLLPRLRKQLAAGRPHTRSTVITAVKFLISDQPHPIDPLLKSFI------
870 880 890 900 910 920
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 LEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHT
:.::::::.::::: .:: ::.:::.:..:::::::::::::
NP_036 ------------------AVHNKPSLVRDLLDDILPLLYQETKIRRDLIREVEMGPFKHT
930 940 950 960
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLC
::::::.:::::::::.::.::: .::: ::::::::::::::::.::::.:..::.:::
NP_036 VDDGLDVRKAAFECMYSLLESCLGQLDICEFLNHVEDGLKDHYDIRMLTFIMVARLATLC
970 980 990 1000 1010 1020
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 PSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPL
:. ::::.:::.::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.
NP_036 PAPVLQRVDRLIEPLRATCTAKVKAGSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEVGKSPI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1200 1210 1220 1230
pF1KA0 MSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSST-NLESMDTS
:..:.::: :::::::.::::::::.:. . .::. :
NP_036 MADFSSQIRSNPELAALFESIQKDSASAPSTDSMELS
1090 1100 1110
1230 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 10:23:06 2016 done: Thu Nov 3 10:23:08 2016
Total Scan time: 16.830 Total Display time: 0.520
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]