Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0774
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0774, 1379 aa
1>>>pF1KA0774 1379 - 1379 aa - 1379 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1757+/-0.00122; mu= -8.2086+/- 0.072
mean_var=381.5395+/-79.249, 0's: 0 Z-trim(112.3): 57 B-trim: 100 in 1/50
Lambda= 0.065661
statistics sampled from 13060 (13096) to 13060 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45022.1 MTUS2 gene_id:23281|Hs108|chr13 (1379) 9019 869.8 0
CCDS41874.1 MTUS2 gene_id:23281|Hs108|chr13 ( 348) 2088 212.8 1.3e-54
CCDS43717.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 (1270) 854 96.3 5.8e-19
CCDS43716.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 (1216) 829 93.9 2.9e-18
CCDS43719.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 ( 436) 814 92.2 3.4e-18
CCDS55204.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 ( 415) 808 91.6 4.8e-18
CCDS43718.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 ( 517) 809 91.8 5.4e-18
CCDS83254.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 ( 342) 727 83.9 8.5e-16
>>CCDS45022.1 MTUS2 gene_id:23281|Hs108|chr13 (1379 aa)
initn: 9019 init1: 9019 opt: 9019 Z-score: 4633.5 bits: 869.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9019; 99.9% identity (99.9% similar) in 1379 aa overlap (1-1379:1-1379)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASSPTKGLTMSVPVAPKKSCYTQLRDNRNAARNNNESILSLGDTNANQIMLEVSSSHDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MASSPTKGLTMSVPVAPKKSCYTQLRDNRNAARNNNESILSLGDTNANQIMLEVSSSHDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SKTCDLGDEIGNTNSSEPENRTHFHKEFHQLQGFGKGSQAGSASLKDFRLSSTIQRELNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SKTCDLGDEIGNTNSSEPENRTHFHKEFHQLQGFGKGSQAGSASLKDFRLSSTIQRELNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EHTVERGTDSLQTTRSIQGPSLSSWRNVMSEASLDVLAKRDAEIPRHVPKDKLAKTLDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EHTVERGTDSLQTTRSIQGPSLSSWRNVMSEASLDVLAKRDAEIPRHVPKDKLAKTLDNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ELRRHSLERASSSVAAVGSLTPQHPQPLSLDSREARGQIPGGGEGPQKTLPDHAVPAAFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELRRHSLERASSSVAAVGSLTPQHPQPLSLDSREARGQIPGGGEGPQKTLPDHAVPAAFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ATDSTSEGKSVRHPKPSTSESKQSTPSETQTVGAHVLQVCSEHTSHSAHPEPALNLTLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATDSTSEGKSVRHPKPSTSESKQSTPSETQTVGAHVLQVCSEHTSHSAHPEPALNLTLAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KEIPSKLEAQLGQGKGEAKLDLKYVPPRRVEQEGKAAQEGYLGCHKEENLSALEGRDPCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KEIPSKLEAQLGQGKGEAKLDLKYVPPRRVEQEGKAAQEGYLGCHKEENLSALEGRDPCG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EAHPEATDALGHLLNSDLHHLGVGRGNCEEKRGVNPGEQDSLHTTPKQGSASLGGADNQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAHPEATDALGHLLNSDLHHLGVGRGNCEEKRGVNPGEQDSLHTTPKQGSASLGGADNQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TGKISPCAGEKLGERTSSSFSPGDSHVAFIPNNLTDSKPLDVIEEERRLGSGNKDSVMVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGKISPCAGEKLGERTSSSFSPGDSHVAFIPNNLTDSKPLDVIEEERRLGSGNKDSVMVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VFNPSVGENKTEVPEPLDPQSGRSEARESKEVTTSVAENRNLLENADKIESTSARADSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFNPSVGENKTEVPEPLDPQSGRSEARESKEVTTSVAENRNLLENADKIESTSARADSVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NIPAPLHPETTVNMTYQPTTPSSSFQDVSVFGMDAGSPLVVPPPTDSARLLNTSPKVPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NIPAPLHPETTVNMTYQPTTPSSSFQDVSVFGMDAGSPLVVPPPTDSARLLNTSPKVPDK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NTCPSGIPKPVFTHSKDTPSSQEGMENYQVEKTEERTETKPIIMPKPKHVRPKIITYIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NTCPSGIPKPVFTHSKDTPSSQEGMENYQVEKTEERTETKPIIMPKPKHVRPKIITYIRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 NPQALGQVDASLVPVGLPYAPPTCTMPLPHEEKAAGGDLKPSANLYEKFKPDLQKPRVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NPQALGQVDASLVPVGLPYAPPTCTMPLPHEEKAAGGDLKPSANLYEKFKPDLQKPRVFS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SGLMVSGIKPPGHPFSQMSEKFLQEVTDHPGKEEFCSPPYAHYEVPPTFYRSAMLLKPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGLMVSGIKPPGHPFSQMSEKFLQEVTDHPGKEEFCSPPYAHYEVPPTFYRSAMLLKPQL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GLGAMSRLPSAKSRILIASQRSSASAIHPPGPITTATSLYSSDPSADLKKASSSNAAKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLGAMSRLPSAKSRILIASQRSSASAIHPPGPITTATSLYSSDPSADLKKASSSNAAKSN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LPKSGLRPPGYSRLPAAKLAAFGFVRSSSVSSVSSTQSGDSAQPEQGRPATRSTFGNEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPKSGLRPPGYSRLPAAKLAAFGFVRSSSVSSVSSTQSGDSAQPEQGRPATRSTFGNEEQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PVLKASLPSKDTPKGAGRVAPPASSSVTAPRRSLLPAPKSTSTPAGTKKDAPKDQDTNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS45 PVLKASLPSKDTPKGAGRVAPPASSSVTAPRRSLLPAPKSTSTPAGTKKDAQKDQDTNKP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AVSSPKRVAASTTKLHSPGYPKQRTAAARNGFPPKPDPQAREAERQLVLRLKERCEQQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AVSSPKRVAASTTKLHSPGYPKQRTAAARNGFPPKPDPQAREAERQLVLRLKERCEQQTR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 QLGVAQGELKRAICGFDALAVATQHFFRKNESALVKEKELSIELANIRDEVAFHTAKCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLGVAQGELKRAICGFDALAVATQHFFRKNESALVKEKELSIELANIRDEVAFHTAKCEK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHGDQLLSIRCQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHGDQLLSIRCQH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QEQVEDLTASHDAALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKELEENFEKLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEQVEDLTASHDAALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKELEENFEKLRL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMKSLKQVLEMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMKSLKQVLEMKN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 QQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQLSEENANLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQLSEENANLQE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 YVEKETQEKKRLSRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTSPVYRGSSSGPSSPARVSTTPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YVEKETQEKKRLSRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTSPVYRGSSSGPSSPARVSTTPR
1330 1340 1350 1360 1370
>>CCDS41874.1 MTUS2 gene_id:23281|Hs108|chr13 (348 aa)
initn: 2088 init1: 2088 opt: 2088 Z-score: 1093.8 bits: 212.8 E(32554): 1.3e-54
Smith-Waterman score: 2088; 99.4% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1048-1379:17-348)
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 QTRQLGVAQGELKRAICGFDALAVATQHFFRKNESALVKEKELSIELANIRDEVAFHTAK
. ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MGHCCCKPYNCLQCLDKTNESALVKEKELSIELANIRDEVAFHTAK
10 20 30 40
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 CEKLQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHGDQLLSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CEKLQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHGDQLLSIR
50 60 70 80 90 100
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 CQHQEQVEDLTASHDAALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKELEENFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CQHQEQVEDLTASHDAALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKELEENFEK
110 120 130 140 150 160
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 LRLSLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMKSLKQVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRLSLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMKSLKQVLE
170 180 190 200 210 220
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 MKNQQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQLSEENAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKNQQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQLSEENAN
230 240 250 260 270 280
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 LQEYVEKETQEKKRLSRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTSPVYRGSSSGPSSPARVSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQEYVEKETQEKKRLSRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTSPVYRGSSSGPSSPARVSTT
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 PR
::
CCDS41 PR
>>CCDS43717.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 (1270 aa)
initn: 811 init1: 401 opt: 854 Z-score: 454.0 bits: 96.3 E(32554): 5.8e-19
Smith-Waterman score: 854; 32.0% identity (63.9% similar) in 582 aa overlap (814-1379:705-1270)
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 AMSRLPSAKSRILIASQRSSASAIHPPGPITTATSLYSSDPSADLKKASSSNAAKSNLPK
::. :. : :.. .. .: : . :
CCDS43 SMEKQELKQEIMNETFEYGSLFLGSASKTTTTSGRNISKPDSCGLRQIAAPKA-KVGPPV
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SGLRPPGYSRLPAAKLAAFG--FVRSSSVSSVSSTQSGDSAQPEQGRPATRSTFGNEEQP
: :: . .: :.: :. . : :: .. .: ....:. . :: .: .. ..:
CCDS43 SCLRRNSDNRNPSADRAVSPQRIRRVSSSGKPTSLKTAQSSWVNLPRPLPKSK-ASLKSP
740 750 760 770 780 790
910 920 930 940 950
pF1KA0 VLK--ASLPS-KDTPKGAGRVAPPASSSVTAPRRSLLPAPKSTSTPAGTKKDAPKDQDTN
.:. .: :: .: . . . ...... . : : . .:. : . ..
CCDS43 ALRRTGSTPSIASTHSELSTYSNNSGNAAVIKYEEKPPKPAFQNGSSGSFYLKPLVSRAH
800 810 820 830 840 850
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 KPAVSSPKRVAASTTKLHSP--GYPKQRTAAARN-GFPPKPDPQAREAERQLVL-RLKER
...: . . : .: . . :.: :. . :. :.: :. : : . : .
CCDS43 VHLMKTPPK-GPSRKNLFTALNAVEKSRQKNPRSLCIQPQTAPDALPPEKTLELTQYKTK
860 870 880 890 900 910
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 CEQQTRQLGVAQGELKRAI-CG---FDALAVATQHFFRKNESALVKEKELSIELANIRDE
::.:. : .::. . :: :.::.:. ::.. . : :: ..: :: ::.:.: :
CCDS43 CENQS---GFIL-QLKQLLACGNTKFEALTVVIQHLLSEREEALKQHKTLSQELVNLRGE
920 930 940 950 960
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VAFHTAKCEKLQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHG
.. .. ::::.: ..::. .: :. :.::: : :.::. . :. .:.. .
CCDS43 LVTASTTCEKLEKARNELQTVYEAFVQ----QHQAEKTERENRLKEFYTREYEKLRDTYI
970 980 990 1000 1010 1020
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 DQLLSIRCQHQEQVEDLTASHDAALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKE
.. . . : ::: ..:.:.:... ::.: .:. . .:. .. ...:. . ::.:::
CCDS43 EEAEKYKMQLQEQFDNLNAAHETSKLEIEASHSEKLELLKKAYEASLSEIKKGHEIEKKS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 LEENFEKLRLSLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMK
::. . . . ::. :.. : ....: .. . :. .. ..:. .. ..::....
CCDS43 LEDLLSEKQESLEKQINDLKSENDALNEKLKSEEQ--KRRAREKANLKNPQIMYLEQELE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 SLKQVLEMKNQQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQ
::: :::.::...:.:. :....:::...: : .:.. .::.::.::::.:.. ...::
CCDS43 SLKAVLEIKNEKLHQQDIKLMKMEKLVDNNTALVDKLKRFQQENEELKARMDKHMAISRQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 LSEENANLQEYVEKETQEKKRLSRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTS---PVYRGSSSG
:: :.: ::: .:::.. .:::: ::::::::..:: :: : :::: :. .::
CCDS43 LSTEQAVLQESLEKESKVNKRLSMENEELLWKLHNGDLCSP-KRSPTSSAIPLQSPRNSG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1370
pF1KA0 PSSPARVSTTPR
: :. : .::
CCDS43 -SFPSP-SISPR
1270
>>CCDS43716.1 MTUS1 gene_id:57509|Hs108|chr8 (1216 aa)
initn: 811 init1: 401 opt: 829 Z-score: 441.4 bits: 93.9 E(32554): 2.9e-18
Smith-Waterman score: 840; 26.2% identity (56.2% similar) in 980 aa overlap (434-1379:317-1216)
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 TTPKQGSASLGGADNQPTGKISPCAGEKLGERTSSSFSPGDSHVAFIPNNLTDSKPLDVI
: .: : .. . . .:: .. .:
CCDS43 KETQALTPVSDGMEVPNDSALQEFFCLSHDESNSEPHSQSSYRHKEMGQNLRETVSYCLI
290 300 310 320 330 340
470 480 490 500 510
pF1KA0 EEERRLGSGNKDSVMVLVFNPSVGENKTEVPE------PLDPQSGRSEARESKEVTTSVA
..: : :. . :.:: ..:: . : :. :: :. .:.
CCDS43 DDECPLMVPAFDKSEAQVLNPEHKVTETEDTQMVSKGKDLGTQNHTSELILSSPPGQKVG
350 360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ENRNLLENA-DKIESTSARADSVLNIPAPLHPETTVNMTYQPTTPSSSFQDVSVFGMDAG
. .: .: : . :: :... . .:. : :... .: . . . : . :
CCDS43 SSFGLTWDANDMVIST----DKTMCMSTPVLEPTKVTFSVSPIEATEKCKKV-----EKG
410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SPLVVPPPTDSARLLNTSPKVPDKNTCPSGIPKPVFTHSKDTPSSQEGMENYQVEKTEER
. : :. ..::.. : .. :: . .: .. : .:.:::
CCDS43 N-----------RGLK---NIPDSKEAPVNLCKPSLGKSTIKTNTPIGC---KVRKTE--
460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TETKPIIMPKP--KHVRPKIITYIRRNPQALGQVDASLVPVGLPYAPPTCTMPLPHEEKA
: .:.: :.:. :... .:. ::.: : : :.. .:
CCDS43 ----IISYPRPNFKNVKAKVMSRAVLQPK-----DAALSKV----------TPRPQQTSA
500 510 520 530
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 AGG---DLKPSANLYEKFKPDLQKPRVFSSGLMVSGIKPPGHPFSQMSEKFLQEVTDHPG
.. . . .. : . . ::. . .. .... : . :... . .:: :
CCDS43 SSPSSVNSRQQTVLSRTPRSDLNADK--KAEILIN--KTHKQQFNKLITSQAVHVTTHSK
540 550 560 570 580 590
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 KEEFCSPPYAHYEVPPTFYRSAMLLKPQLGLGAMSRLPSAKSRILIASQRSSASAIHPPG
. : ..:: : .. . . : . : :: ... .. ..: :
CCDS43 N--------ASHRVPRT---TSAVKSNQEDVDKASSSNSACETGSVSALFQKIKGILPV-
600 610 620 630 640
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 PITTATSL-YSSDPSADLKKASSSNAAKSNLPKSGLRPPGYSRLPAAKLAAFGFVRSSSV
. .: : .. :. : . . ... : : .... .. . .: . .:.
CCDS43 KMESAECLEMTYVPNID-RISPEKKGEKEN--GTSMEKQELKQEIMNETFEYGSLFLGSA
650 660 670 680 690 700
880 890 900 910 920
pF1KA0 SSVSSTQSGDSAQPEQ-G-RP--ATRSTFGNEEQPVLKASL---PSKD---TPKGAGRVA
:....:.. . ..:.. : : : .. : . . . : :: : .:. ::.
CCDS43 SKTTTTSGRNISKPDSCGLRQIAAPKAKVGPPVSCLRRNSDNRNPSADRAVSPQRIRRVS
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pF1KA0 PPASSSVTAPRRSLLPAPKSTSTPAGTKKDAPKDQDTNKPAVSSPKRVAASTTKLHSP--
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CCDS43 SSAGNAAVIKYEEKPPKPAFQNGSSGSFYLKPLVSRAHVHLMKTPPK-GPSRKNLFTALN
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pF1KA0 GYPKQRTAAARN-GFPPKPDPQAREAERQLVL-RLKERCEQQTRQLGVAQGELKRAI-CG
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CCDS43 AVEKSRQKNPRSLCIQPQTAPDALPPEKTLELTQYKTKCENQS---GFIL-QLKQLLACG
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pF1KA0 ---FDALAVATQHFFRKNESALVKEKELSIELANIRDEVAFHTAKCEKLQKEKEELERRF
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CCDS43 NTKFEALTVVIQHLLSEREEALKQHKTLSQELVNLRGELVTASTTCEKLEKARNELQTVY
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pF1KA0 EDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMARLQEEHGDQLLSIRCQHQEQVEDLTASHD
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CCDS43 EAFVQ----QHQAEKTERENRLKEFYTREYEKLRDTYIEEAEKYKMQLQEQFDNLNAAHE
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pF1KA0 AALLEMENNHTVAITILQDDHDHKVQELMSTHELEKKELEENFEKLRLSLQDQVDTLTFQ
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CCDS43 TSKLEIEASHSEKLELLKKAYEASLSEIKKGHEIEKKSLEDLLSEKQESLEKQINDLKSE
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pF1KA0 SQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQHLEEDMKSLKQVLEMKNQQIHEQEKKILE
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CCDS43 NDALNEKLKSEEQ--KRRAREKANLKNPQIMYLEQELESLKAVLEIKNEKLHQQDIKLMK
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pF1KA0 LEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQNTVVTRQLSEENANLQEYVEKETQEKKRL
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CCDS43 MEKLVDNNTALVDKLKRFQQENEELKARMDKHMAISRQLSTEQAVLQESLEKESKVNKRL
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pF1KA0 SRTNEELLWKLQTGDPTSPIKLSPTS---PVYRGSSSGPSSPARVSTTPR
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CCDS43 SMENEELLWKLHNGDLCSP-KRSPTSSAIPLQSPRNSG-SFPSP-SISPR
1170 1180 1190 1200 1210
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CCDS43 MLLSPKFSLSTIHIRLTAKGLLRNLRLPSGFRRSTVVFHT--VEKSRQKNPRSLCIQ
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CCDS43 PQTAPDALPPEKTLELTQYKTKCENQS---GFIL-QLKQLLACGNTKFEALTVVIQHLLS
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CCDS43 EREEALKQHKTLSQELVNLRGELVTASTTCEKLEKARNELQTVYEAFVQ----QHQAEKT
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CCDS43 ERENRLKEFYTREYEKLRDTYIEEAEKYKMQLQEQFDNLNAAHETSKLEIEASHSEKLEL
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CCDS43 LKKAYEASLSEIKKGHEIEKKSLEDLLSEKQESLEKQINDLKSENDALNEKLKSEEQ--K
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CCDS43 RRAREKANLKNPQIMYLEQELESLKAVLEIKNEKLHQQDIKLMKMEKLVDNNTALVDKLK
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CCDS43 RFQQENEELKARMDKHMAISRQLSTEQAVLQESLEKESKVNKRLSMENEELLWKLHNGDL
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pF1KA0 TSPIKLSPTS---PVYRGSSSGPSSPARVSTTPR
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CCDS43 CSP-KRSPTSSAIPLQSPRNSG-SFPSP-SISPR
410 420 430
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pF1KA0 PKDQDTNKPAVSSPKRVAASTTKLHSPGYPKQRTAAARN-GFPPKPDPQAREAERQLVL-
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CCDS55 QYKTKCENQS---GFIL-QLKQLLACGNTKFEALTVVIQHLLSEREEALKQHKTLSQELV
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CCDS55 NLRGELVTASTTCEKLEKARNELQTVYEAFVQ----QHQAEKTERENRLKEFYTREYEKL
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CCDS55 RDTYIEEAEKYKMQLQEQFDNLNAAHETSKLEIEASHSEKLELLKKAYEASLSEIKKGHE
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CCDS55 IEKKSLEDLLSEKQESLEKQINDLKSENDALNEKLKSEEQ--KRRAREKANLKNPQIMYL
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CCDS55 EQELESLKAVLEIKNEKLHQQDIKLMKMEKLVDNNTALVDKLKRFQQENEELKARMDKHM
290 300 310 320 330 340
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CCDS55 AISRQLSTEQAVLQESLEKESKVNKRLSMENEELLWKLHNGDLCSP-KRSPTSSAIPLQS
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1370
pF1KA0 GSSSGPSSPARVSTTPR
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CCDS55 PRNSG-SFPSP-SISPR
410
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CCDS43 SYSLCIIPLLATFTGKKTGNAAVIKYEEKPPKPAFQNGSSGSFYLKPLVSRAHVHLMKTP
50 60 70 80 90 100
970 980 990 1000 1010 1020
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CCDS43 PK-GPSRKNLFTALNAVEKSRQKNPRSLCIQPQTAPDALPPEKTLELTQYKTKCENQS--
110 120 130 140 150 160
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: .::. . :: :.::.:. ::.. . : :: ..: :: ::.:.: :.. ..
CCDS43 -GFIL-QLKQLLACGNTKFEALTVVIQHLLSEREEALKQHKTLSQELVNLRGELVTASTT
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::::.: ..::. .: :. :.::: : :.::. . :. .:.. . .. . .
CCDS43 CEKLEKARNELQTVYEAFVQ----QHQAEKTERENRLKEFYTREYEKLRDTYIEEAEKYK
230 240 250 260 270
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: ::: ..:.:.:... ::.: .:. . .:. .. ...:. . ::.::: ::. . .
CCDS43 MQLQEQFDNLNAAHETSKLEIEASHSEKLELLKKAYEASLSEIKKGHEIEKKSLEDLLSE
280 290 300 310 320 330
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. ::. :.. : ....: .. . :. .. ..:. .. ..::....::: :::
CCDS43 KQESLEKQINDLKSENDALNEKLKSEEQ--KRRAREKANLKNPQIMYLEQELESLKAVLE
340 350 360 370 380 390
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CCDS43 IKNEKLHQQDIKLMKMEKLVDNNTALVDKLKRFQQENEELKARMDKHMAISRQLSTEQAV
400 410 420 430 440 450
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::: .:::.. .:::: ::::::::..:: :: : :::: :. .:: : :.
CCDS43 LQESLEKESKVNKRLSMENEELLWKLHNGDLCSP-KRSPTSSAIPLQSPRNSG-SFPSP-
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: .::
CCDS43 SISPR
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CCDS83 MGCPSSKLCLYSPCAATRREEALKQHKTLSQE
10 20 30
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 LANIRDEVAFHTAKCEKLQKEKEELERRFEDEVKRLGWQQQAELQELEERLQLQFEAEMA
:.:.: :.. .. ::::.: ..::. .: :. :.::: : :.::. . :.
CCDS83 LVNLRGELVTASTTCEKLEKARNELQTVYEAFVQ----QHQAEKTERENRLKEFYTREYE
40 50 60 70 80
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.:.. . .. . . : ::: ..:.:.:... ::.: .:. . .:. .. ...:. .
CCDS83 KLRDTYIEEAEKYKMQLQEQFDNLNAAHETSKLEIEASHSEKLELLKKAYEASLSEIKKG
90 100 110 120 130 140
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pF1KA0 HELEKKELEENFEKLRLSLQDQVDTLTFQSQSLRDRARRFEEALRKNTEEQLEIALAPYQ
::.::: ::. . . . ::. :.. : ....: .. . :. .. ..:. .. .
CCDS83 HEIEKKSLEDLLSEKQESLEKQINDLKSENDALNEKLKSEEQ--KRRAREKANLKNPQIM
150 160 170 180 190 200
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pF1KA0 HLEEDMKSLKQVLEMKNQQIHEQEKKILELEKLAEKNIILEEKIQVLQQQNEDLKARIDQ
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CCDS83 YLEQELESLKAVLEIKNEKLHQQDIKLMKMEKLVDNNTALVDKLKRFQQENEELKARMDK
210 220 230 240 250 260
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CCDS83 HMAISRQLSTEQAVLQESLEKESKVNKRLSMENEELLWKLHNGDLCSP-KRSPTSSAIPL
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pF1KA0 Y--RGSSSGPSSPARVSTTPR
:.:.: :: : : .::
CCDS83 QSPRNSGSFPS-P---SISPR
330 340
1379 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]