Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0766
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0766, 607 aa
1>>>pF1KA0766 607 - 607 aa - 607 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6619+/-0.00105; mu= 16.8203+/- 0.063
mean_var=65.3696+/-12.977, 0's: 0 Z-trim(103.0): 27 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.158630
statistics sampled from 7210 (7226) to 7210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46790.1 EPM2AIP1 gene_id:9852|Hs108|chr3 ( 607) 4026 930.7 0
CCDS5576.1 GTF2IRD2 gene_id:84163|Hs108|chr7 ( 949) 450 112.4 2.8e-24
CCDS34659.1 GTF2IRD2B gene_id:389524|Hs108|chr7 ( 949) 447 111.7 4.4e-24
CCDS47028.1 FAM200B gene_id:285550|Hs108|chr4 ( 657) 426 106.8 8.9e-23
CCDS5668.1 FAM200A gene_id:221786|Hs108|chr7 ( 573) 406 102.2 1.9e-21
CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325) 379 96.2 2.9e-19
CCDS387.2 ZMYM6 gene_id:9204|Hs108|chr1 (1325) 373 94.8 7.5e-19
CCDS34283.1 ZBED8 gene_id:63920|Hs108|chr5 ( 594) 359 91.5 3.4e-18
>>CCDS46790.1 EPM2AIP1 gene_id:9852|Hs108|chr3 (607 aa)
initn: 4026 init1: 4026 opt: 4026 Z-score: 4975.6 bits: 930.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4026; 100.0% identity (100.0% similar) in 607 aa overlap (1-607:1-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEA
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CCDS46 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVASFTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVASFTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDITRQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDITRQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 MVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEHLRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEHLRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKEDEKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKEDEKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKLQANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKLQANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPII
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHTLSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHTLSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVR
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ERNESNP
:::::::
CCDS46 ERNESNP
>>CCDS5576.1 GTF2IRD2 gene_id:84163|Hs108|chr7 (949 aa)
initn: 592 init1: 294 opt: 450 Z-score: 549.5 bits: 112.4 E(32554): 2.8e-24
Smith-Waterman score: 728; 27.7% identity (59.2% similar) in 584 aa overlap (9-588:418-949)
10 20 30
pF1KA0 MWMTPKRSKMEVD-EALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGA
: ..: :. ::. .: . :. :: .
CCDS55 SSMRRILEAAEFIKFTVIRPLPGLELSNVGKRKIDQEGRVFQEKWERAYFFVEVQ--NIP
390 400 410 420 430 440
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEH-EYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVASFTPEER
::.:.. . ...: ..::::...: ..:..:. ::.: .:.
CCDS55 TCLICKQSMSVSKEYNLRRHYQTNHSKHYDQYM---------ERMR-----------DEK
450 460 470 480
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 AARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDITRQRILS
. :: . : : .: .: ::. .:. . . . : . .
CCDS55 LHELKKGLRKYLL------GSSDT--EC---------PEQKQVFANPSPTQKSPVQPVED
490 500 510 520
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 IDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTH
. :: ..: .. :.: :::.:.:. . . . : .::::: ...:.:.:: . .:
CCDS55 LAGNLWEKLREKIRSFVAYSIAIDEITDINNTTQLAIFIRGVDENFDVSEELLDTVPMTG
530 540 550 560 570 580
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 HFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVI
: . ..: . .::.. .. ...:....: : :. :.:::. .. . :. : ..
CCDS55 TKSGNEIFSRVEKSLKNFCIDWSKLVSVASTGTPAMVDANNGLVTKLKSR-VATFCKGAE
590 600 610 620 630 640
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 HYS--GFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVN
: ..: : : . . ........ . . : .::. . :: ::: : .:..: .
CCDS55 LKSICCIIHPESLCAQKLKMDHVMDVVVKSVNWICSRGLNHSEFTTLLYELDSQYGSLLY
650 660 670 680 690 700
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEHLREL
.. :: :: .:: .: .:...:. : : ..:. .:. :..::::. :: :
CCDS55 YTEIK-WLSRGLVLKRFFESLEEIDSFMSSRGKPLPQLSSIDWIRDLAFLVDMTMHLNAL
710 720 730 740 750 760
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKEDEKI
. :. . ... .: : .: .:: :.. :. ..::. ::.:. : ..:. :
CCDS55 NISLQGHSQIVTQMYDLIRAFLAKLCLWETHLTRNNLAHFPTLK-----LASRNESDGLN
770 780 790 800 810 820
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 FDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKLQANT
. : : .:: ::.....:... ...: :::.::. : . . ...:. :: ::
CCDS55 YIPK-----IAELQTEFQKRLSDFKLYESELTLFSSPFSTKIDSVHEELQMEVIDLQCNT
830 840 850 860 870
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHTLSQP
: ..: . .:: : . ::: : :. :.: :. :::. :: . .. .
CCDS55 VLKTKYDKVGIPEFYKYLWG-SYPKYKHHCAKILSMFGSTYICEQLFSIMKLSKTKYCSQ
880 890 900 910 920 930
580 590 600
pF1KA0 LTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP
: : . ......::
CCDS55 LKDSQWDSVLHIAT
940
>>CCDS34659.1 GTF2IRD2B gene_id:389524|Hs108|chr7 (949 aa)
initn: 586 init1: 292 opt: 447 Z-score: 545.8 bits: 111.7 E(32554): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 716; 27.6% identity (58.9% similar) in 584 aa overlap (9-588:418-949)
10 20 30
pF1KA0 MWMTPKRSKMEVD-EALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGA
: ..: :. ::. .: . :. :: .
CCDS34 SSMRRILEAAEFIKFTVIRPLPGLELSNVGKRKIDQEGRVFQEKWERAYFFVEVQ--NIP
390 400 410 420 430 440
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 LCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEH-EYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVASFTPEER
::.:.. . ...: ..::::...: ..:..:. ::.: .:.
CCDS34 TCLICKQSMSVSKEYNLRRHYQTNHSKHYDQYT---------ERMR-----------DEK
450 460 470 480
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 AARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDITRQRILS
. :: . : : .: .: ::. .:. . . . : . .
CCDS34 LHELKKGLRKYLL------GSSDT--EC---------PEQKQVFANPSPTQKSPVQPVED
490 500 510 520
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 IDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTH
. :: ..: .. :.: :::.:.:. . . . : .::::: ...:.:.:: . .:
CCDS34 LAGNLWEKLREKIRSFVAYSIAIDEITDINNTTQLAIFIRGVDENFDVSEELLDTVPMTG
530 540 550 560 570 580
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 HFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVI
: . .. . .::. .. .:.:....: : :. :.:::. .. . :. : ..
CCDS34 TKSGNEIFLRVEKSLKKFCINWSRLVSVASTGTPAMVDANNGLVTKLKSR-VATFCKGAE
590 600 610 620 630 640
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 HYS--GFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVN
: ..: : : . . ........ . . : .::. . :: ::: : .:..: .
CCDS34 LKSICCIIHPESLCAQKLKMDHVMDVVVKSVNWICSRGLNHSEFTTLLYELDSQYGSLLY
650 660 670 680 690 700
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEHLREL
.. :: :: .:: .: .:...:. : : ..:. .:. :..::::. :: :
CCDS34 YTEIK-WLSRGLVLKRFFESLEEIDSFMSSRGKPLPQLSSIDWIRDLAFLVDMTMHLNAL
710 720 730 740 750 760
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 SEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKEDEKI
. :. . ... .: : .: .:: :.. :. ..::. ::.:. : ..:. :
CCDS34 NISLQGHSQIVTQMYDLIRAFLAKLCLWETHLTRNNLAHFPTLK-----LVSRNESDGLN
770 780 790 800 810 820
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 FDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKLQANT
. : : .:. ::.....:... ...: :::.::. : . . ...:. :: ::
CCDS34 YIPK-----IAELKTEFQKRLSDFKLYESELTLFSSPFSTKIDSVHEELQMEVIDLQCNT
830 840 850 860 870
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHTLSQP
: ..: . .:: : . ::: : :. :.: :. :::. :: . .. .
CCDS34 VLKTKYDKVGIPEFYKYLWG-SYPKYKHHCAKILSMFGSTYICEQLFSIMKLSKTKYCSQ
880 890 900 910 920 930
580 590 600
pF1KA0 LTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP
: : . ......::
CCDS34 LKDSQWDSVLHIAT
940
>>CCDS47028.1 FAM200B gene_id:285550|Hs108|chr4 (657 aa)
initn: 76 init1: 76 opt: 426 Z-score: 522.4 bits: 106.8 E(32554): 8.9e-23
Smith-Waterman score: 426; 22.6% identity (56.2% similar) in 594 aa overlap (30-599:77-650)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGALCLVCRRLIV--ATRERDVRRH
.: :.: :..: ... . . ..::
CCDS47 TSFEPHFKKKKVSARRYNEDYLKYGFIKCEKPFENDRPQCVICNNILANESLKPSKLKRH
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 YEAEH-EYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVASFTPEERAARAGLGLCRLLALK-GRGW
:..: : .. . .: .: : .. . :. . : :. : .
CCDS47 LETQHAELIDKPLEYFQRKKKDIKLSTQFLSCSTAVSEKALLSSYLVAYRVAKEKIANTA
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 GEGDFVYQCMEVLLREVLPEH-VSVLQGVDLSPDITRQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKA
.: .. :.. ..: .. .. .. :. . . . . :: .: ..:...:..: ..
CCDS47 AEKIILPACLD-MVRTIFDDKSADKLKTIP-NDNTVSLRICTIAEHLETMLITRLQSGID
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 YSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTHHFSVGALMSAILESLQTA
... ::... .. . :::..: . . . ::.: ..::: :.: : . . :: . .
CCDS47 FAIQLDESTDIGSCTTLLVYVRYAWQD-DFLEDFLCFLNLTSHLS-GLDIFTELER-RIV
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 G---LSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVIHYSGFLHLELLSSYD
: :. . :.:. : : :..: ... . : . . :: : :.: : :.: .
CCDS47 GQYKLNWKNCKGITSDGTATMTGKHSRVIKKLLEVTNNGAVWN--HC--FIHREGLASRE
290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KA0 VDVN--QIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVNGRCLNNWLRRGKTLK
. : ..... . . .:: .. ..:. .: ..: . . . :: .:: :.
CCDS47 IPQNLMEVLKNAVKVVNFIKGSSLNSRLLETFCSEIGTNHTHLLYHTKIR-WLSQGKILS
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 LIFSLRKEMEAFLVSVGATTVH-FSDKQWLCDFGFLVDIMEHLRELSEEL--RVSKVFAA
.. ::.:.. ::. . . : : :. ...:.::. : ::: .: . : ::
CCDS47 RVYELRNEIHFFLIEKKSHLASIFEDDTWVTKLAYLTDIFSILNELSLKLQGKNSDVFQH
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 AAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTD--FPALREVVDELKQQNKEDEKIFDPDRYQMVI
. ..: :. : :.: ... . . :: . . ..: : .:.:. . ....
CCDS47 V--ERIQGFRKTLLLWQVRLKSNRPSYYMFPRFLQHIEE----NIINENILKEIKLEILL
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510
pF1KA0 --CRLQKEFERHFKDLRF-IKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRV------ELTKLQANTN
:.. :.. : . .: .. ..:: :. . : . . :: .:... .
CCDS47 HLTSLSQTFNHFFPEEKFETLRENSWVKDPFAFRHPESIIELNLVPEEENELLQLSSSYT
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHTLSQPL
: :.:. .:. :. .. :..:... . . : ....:: .:: ::. . ..
CCDS47 LKNDYETLSLSAFWMKVK-EDFPLLSRKSVLLLLPFTTTSLCELGFSILTQLK---TKER
580 590 600 610 620
580 590 600
pF1KA0 TDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP
. . :..::: . : :..:.
CCDS47 NGLNCAAVMRVALSSCVPDWNELMNRQAHPS
630 640 650
>>CCDS5668.1 FAM200A gene_id:221786|Hs108|chr7 (573 aa)
initn: 296 init1: 96 opt: 406 Z-score: 498.6 bits: 102.2 E(32554): 1.9e-21
Smith-Waterman score: 407; 23.2% identity (55.7% similar) in 582 aa overlap (45-606:23-573)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 ALVFRPEWTQRYLVVEPPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGER
.:: ..:.: . :.. :.. : :
CCDS56 MTPESRDTTDLSPGGTQEMEGIVIVKVEEEDEEDHFQKERNKVESSPQVLSR
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 AALV-ERLRQGDLPVASFTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVL
.. . :: .. :: . .:. :... .: .. ::. ..: ..
CCDS56 STTMNERALLSSYLVAYRVAKEKMAHTA--------------AEKIILPACMD-MVRTIF
60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 PEH-VSVLQGVDLSPDITRQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLL
.. .. :. . :: . .:: .: ..:. .:..: .. ... ::... .: ::
CCDS56 DDKSADKLRTIPLSDNTISRRICTIAKHLEAMLITRLQSGIDFAIQLDESTDIASCPTLL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 VFIRGVGPELEVQEDLLTIINLTHHFSVGALMSAILES--LQTAGLSLQRMVGLTTTHTL
:..: : . . :::: .::. :.. : . . ::. : :. .. :... :
CCDS56 VYVRYVWQD-DFVEDLLCCLNLNSHIT-GLDLFTELENCLLGQYKLNWKHCKGISSDGTA
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KA0 RMIGENSGLVSYMREKAVSPNCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVD--VNQIINTISEWIVLI
: :..: :. . : . . :: : :.: : : : ... . ..... . . .:
CCDS56 NMTGKHSRLTEKLLEATHNNAVWN--HC--FIHREALVSKEISPSLMDVLKNAVKTVNFI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KTRGVRRPEFQTLLTESESEHGERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGAT
: .. .. . .: .: . . . :: .::.:. .. ::.:. ::: .
CCDS56 KGSSLNSRLLEIFCSEIGVNHTHLLFHTEVR-WLSQGKVLSRVYELRNEIYIFLVEKQSH
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pF1KA0 TVH-FSDKQWLCDFGFLVDIMEHLRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIE
.. : : :. ...: ::. : ::: ... .. ..:: :. : :.: ...
CCDS56 LANIFEDDIWVTKLAYLSDIFGILNELSLKMQGKNNDIFQYLEHILGFQKTLLLWQARLK
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 EKNLTD--FPALREVVDELKQQNKEDEKIFDPDRYQMVI--CRLQKEFERHFKDLRF--I
. . ::.: . ..: : .: . . .... :.. :. .: . .: .
CCDS56 SNRPSYYMFPTLLQHIEE----NIINEDCLKEIKLEILLHLTSLSQTFNYYFPEEKFESL
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:... . ..:: :. . : . .: : .:... .: : :.: .:. :. .. .
CCDS56 KENIWM-KDPFAFQNPESIIELNLEPEEENELLQLSSSFTLKNYYKILSLSAFWIKIK-D
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..:... . . : .. .:: .:: ::: . . :.. .::: . : :
CCDS56 DFPLLSRKSILLLLPFTTTYLCELGFSILTRLKTKKRNRLNSA---PDMRVALSSCVPDW
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600
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.:. :. . :.
CCDS56 KELMNRQAHPSH
570
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: .:: . ....::... . : .:: ::. .: :::..: . ...:.
CCDS34 DTIARRIQELANDMEDQLIEQIKLAKYFSLQLDECRDIANMIILLVYVRFEHDD-DIKEE
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: :.: .. : :.: : :. . ..:...: : . . ::. .. :. : .
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: ::. . .:. .. ... . :.. . ::. .. .: : : ...:
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. : : .:... ... : :: .: . . . ..::: . .
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..: .. : :: .. .: .. .: .:. . ..:: . .: :. :: :. .
CCDS34 NLTVTLQDKLLKLATDEGLKISFENTASLPSFWIK-AKNDYPELAEIALKLLLLFPSTYL
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:: .:: :. ...: : ... .::: . ..: : :. ..
CCDS34 CETGFSTLSVIKTKHRNSL-----NIHYPLRVALSSIQPRLDKLTSKKQAHLSH
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CCDS38 NVTIQHRIDELSADIEDQLIQKVRESKWFALQIDESSEISNITLLLCYIRFIDYDCRDVK
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:.:: :.. ... .. : . ... .:. .. ::: : . : :. ::: . ..:
CCDS38 EELLFCIEMPTQITGFEIFELINKYIDSKSLNWKHCVGLCTDGAASMTGRYSGLKAKIQE
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:. : : :.: : : . .. ...:. .. . .::. .. . :
CCDS38 VAM--NTAAFTHC--FIHRERLVAEKLSPCLHKILLQSAQILSFIKSNALNSRMLTILCE
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CCDS38 EMGSEH-VSLPLHAEVRWISRGRMLKRLFELRHEIEIFLSQKHSDLAKYFHDEEWVGKLA
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CCDS38 YLSDIFSLINELNLSLQGTLTTFFNLCNKIDVFKRKLKMWLKRTQENDYDMFPSFSEF--
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CCDS38 NLTDFEEEKLTELSSDLGLQALFKSVSVTQFWIN-AKTSYPELHERAMKFLLPFSTVYLC
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CCDS38 DAAFSALTESKQKNLLGSGP-------AL-RLAVTSLIPRIEKLVKEKE
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CCDS34 ASHEDTLLQASYQFAYLCAKEKNPHTVAEKLVKPCALEIAQIVLGPDAQKKLQQVPLSDD
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CCDS34 KEI--PHIV-VTHCLLNPHALVIKTLPTKLRDALFTVVRVINFIKGRAPNHRLFQAFFEE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]