Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0743
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0743, 1061 aa
1>>>pF1KA0743 1061 - 1061 aa - 1061 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9145+/-0.00134; mu= 18.8739+/- 0.081
mean_var=94.5921+/-17.868, 0's: 0 Z-trim(102.0): 88 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.131870
statistics sampled from 6656 (6741) to 6656 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 4.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061) 7080 1358.7 0
CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571) 5634 1083.8 0
CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1477) 5579 1073.3 0
CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496) 4626 892.0 0
CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499) 4626 892.0 0
CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1507) 4626 892.0 0
CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1547) 4626 892.0 0
CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1712) 4373 843.9 0
CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1642) 3971 767.4 0
CCDS9871.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 432) 2224 434.6 2.2e-121
CCDS61515.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 637) 1604 316.8 9.6e-86
CCDS1845.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 442) 1542 304.9 2.6e-82
CCDS45145.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 459) 1472 291.6 2.7e-78
CCDS82445.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 139) 624 129.8 3.9e-30
CCDS82444.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 142) 608 126.8 3.3e-29
CCDS8078.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 ( 666) 607 127.1 1.3e-28
CCDS82447.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 469) 589 123.6 1e-27
CCDS82446.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 472) 589 123.6 1e-27
CCDS11436.1 CNTNAP1 gene_id:8506|Hs108|chr17 (1384) 456 98.6 9.9e-20
CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 383 84.7 1.4e-15
CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1308) 355 79.4 5.7e-14
CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9 (1288) 344 77.3 2.4e-13
CCDS6616.1 CNTNAP3 gene_id:79937|Hs108|chr9 (1288) 329 74.4 1.7e-12
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 324 73.5 3.6e-12
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1382) 319 72.5 6.9e-12
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1294) 315 71.8 1.1e-11
>>CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061 aa)
initn: 7080 init1: 7080 opt: 7080 Z-score: 7280.1 bits: 1358.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7080; 99.9% identity (100.0% similar) in 1061 aa overlap (1-1061:1-1061)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 GEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 RKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 GTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 YWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 LRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 IDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 KVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 DALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 FGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 GVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KA0 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
1030 1040 1050 1060
>>CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571 aa)
initn: 6261 init1: 5634 opt: 5634 Z-score: 5790.9 bits: 1083.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6374; 96.9% identity (97.0% similar) in 991 aa overlap (1-961:374-1364)
10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
350 360 370 380 390 400
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
410 420 430 440 450 460
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
470 480 490 500 510 520
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
530 540 550 560 570 580
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
590 600 610 620 630 640
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
650 660 670 680 690 700
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
710 720 730 740 750 760
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRY
770 780 790 800 810 820
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLS
830 840 850 860 870 880
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKG
890 900 910 920 930 940
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYS
950 960 970 980 990 1000
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQGV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS81 NLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQGV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRF
1130 1140 1150 1160 1170 1180
820 830 840
pF1KA0 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTG------------------------------RQLTIFN
::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS81 TRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTT
1250 1260 1270 1280 1290 1300
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPS
1310 1320 1330 1340 1350 1360
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQV
:
CCDS81 TDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPK
1370 1380 1390 1400 1410 1420
>--
initn: 707 init1: 641 opt: 653 Z-score: 669.5 bits: 136.1 E(32554): 5.7e-31
Smith-Waterman score: 653; 66.3% identity (77.3% similar) in 172 aa overlap (900-1061:1400-1571)
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 VLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR
: :::. ::. . ... :. .
CCDS81 TSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKM
1370 1380 1390 1400 1410 1420
930 940 950 960 970
pF1KA0 STASIQPTSD----DLVSSAECSSDD-EDFVECEP-----STANPTEPGIRRVPGASEVI
.. ...: : : .. : .: .. . : :::::::::::::::::::
CCDS81 NNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVI
1430 1440 1450 1460 1470 1480
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMK
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1040 1050 1060
pF1KA0 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKQQSSKSGHKKQKNKDREYYV
1550 1560 1570
>>CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1477 aa)
initn: 5557 init1: 2562 opt: 5579 Z-score: 5734.8 bits: 1073.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5630; 76.6% identity (92.1% similar) in 1071 aa overlap (1-1061:407-1477)
10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
380 390 400 410 420 430
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
:::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
CCDS54 CLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKW
440 450 460 470 480 490
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
:.:. ::::::::::::::::::.::::...:::. . ::::::.:.:::.:::::::
CCDS54 NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
500 510 520 530 540 550
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
::::::.:: ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
CCDS54 GSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLG
560 570 580 590 600 610
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
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pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
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.:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::::: :.::
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:.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.:::..:.:. :
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..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::.:::::::::::::::.:::
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10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
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CCDS82 DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
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CCDS82 NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
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pF1KA0 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
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pF1KA0 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
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CCDS82 GLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKET
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pF1KA0 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
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pF1KA0 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
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CCDS82 STVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVR
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pF1KA0 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTG------------------------------RQLTIF
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CCDS82 NRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
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10 20 30
pF1KA0 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
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:.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.:::..:.:. :
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..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::.:::::::::::::::.:::
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::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
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CCDS46 ESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDID
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pF1KA0 ECEPST---ANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYR
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CCDS46 PCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYR
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CCDS80 ALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMK
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CCDS80 GNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMF
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pF1KA0 TQTT--SMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRST----ASIQPTSDDLVSSAECSSDDED
..:: .. .:.::.:::::::::::::..:: .. : :.: ::.:::: :::::
CCDS80 AETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDED
1350 1360 1370 1380 1390 1400
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 FVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNR
. ::::::
CCDS80 LEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAAR
1410 1420 1430 1440 1450 1460
>--
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940 950 960 970 980 990
pF1KA0 TASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV
::::: :: : ::: ::::::::::::::
CCDS80 GPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVV
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pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGH
:::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::...::: .. :.
CCDS80 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPS
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1050 1060
pF1KA0 KKQKNKDREYYV
: .::::.::::
CCDS80 KAKKNKDKEYYV
1710
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10 20 30
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pF1KA0 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
:::.:::::::..:::::::. .: :::. :.. :.::.::.:::..::.:::...::.:
CCDS31 CLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRW
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pF1KA0 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
..:: ::::.::::::::::.::..:. . .. ..:.::.:::::.:::::::
CCDS31 SAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDM
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::: ::..:...:.::::: :::.:::::.:.:::::: ::: :.:.:::::::...:::
CCDS31 GSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLG
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pF1KA0 GLPEN-RAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRM
::::. :. : :: :.::: : :::::.:::::::::...: ::: :.:.:: :::
CCDS31 GLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRE
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pF1KA0 SAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVM
. ::: : ::.:..::..::::::::: :::. ::.:::::..:::::::::::..: .:
CCDS31 TLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAM
660 670 680 690 700 710
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pF1KA0 HTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGP
::::::::.::::::::::..:::::.::::::::::::..:: ::: .:::
CCDS31 HTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNL---------GKGP
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pF1KA0 ETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
:::.::.:::::::::::::::::::.:.::. ..:: :.: : ::::::::::::::.:
CCDS31 ETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNVTVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERR
770 780 790 800 810 820
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pF1KA0 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
.::::::.:::::..:.::: :.: ::.::: ::::.:::::: :.:::::::..::::
CCDS31 FISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYL
830 840 850 860 870 880
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pF1KA0 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
.:::::::.:::::::::::.:::..:::::.:::::..:::::::::::::::::...:
CCDS31 ALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMK
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pF1KA0 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
::::.:.:::::::::..:: .:.:.::.:...::: :::.::::::.::..::...:.
CCDS31 GNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMF
950 960 970 980 990 1000
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIKRGCEGPSTTCQEDSCANQG
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::: ::..:::.:::::: :.::::::
CCDS31 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQG
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pF1KA0 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
::.:::.::::::.::::.: :::::.::::::.:.:: :::: ::::::: :::::::
CCDS31 VCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGF
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pF1KA0 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
:: ....:::.::: ::::.:::::.:: .::.::.:: ::.: : . :.::::::::
CCDS31 STHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KA0 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLK
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CCDS31 FTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAGRQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLK
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:: .:::..::.. .: .::::: ::.: ...:: .. .:.::.:::::::::::::.
CCDS31 VLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRR
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KA0 NRST----ASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTANPTEPGIRRVPGASEVIRESS
.:: .. : :.: ::.:::: :::::. ::::::
CCDS31 GRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATR
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KA0 STTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQ
CCDS31 SPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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940 950 960 970 980 990
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::::: :: : ::: ::::::::::::::
CCDS31 GPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPTANPTGPGERGPPGAVEVIRESSSTTGMVV
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KA0 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGH
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CCDS31 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPAAPKTPS
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1050 1060
pF1KA0 KKQKNKDREYYV
: .::::.::::
CCDS31 KAKKNKDKEYYV
1640
>>CCDS9871.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (432 aa)
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690 700 710 720 730 740
pF1KA0 ANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRL
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CCDS98 QHEHHFHGSKHHSVPISIYRSPVSLRGGHAGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRL
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pF1KA0 AVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 AVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKY
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pF1KA0 HVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 HVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYY
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 DGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 DGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTT
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 RKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPST---ANPTEPGIRRVPGASEVIRES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS98 RKNRSTASIQPTSDDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSANPTEPGIRRVPGASEVIRES
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 SSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 SSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQ
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pF1KA0 QSSKSGHKKQKNKDREYYV
:::::::::::::::::::
CCDS98 QSSKSGHKKQKNKDREYYV
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1061 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 19:39:03 2016 done: Wed Nov 2 19:39:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]