Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0725
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0725, 711 aa
1>>>pF1KA0725 711 - 711 aa - 711 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4368+/-0.000919; mu= 19.6025+/- 0.056
mean_var=74.6676+/-14.576, 0's: 0 Z-trim(105.8): 24 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.148425
statistics sampled from 8619 (8638) to 8619 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34883.1 DDHD2 gene_id:23259|Hs108|chr8 ( 711) 4813 1040.5 0
CCDS7618.1 SEC23IP gene_id:11196|Hs108|chr10 (1000) 1485 327.9 4.4e-89
CCDS53895.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 ( 900) 327 79.9 1.8e-14
CCDS9714.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 ( 872) 307 75.6 3.4e-13
CCDS53896.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 ( 879) 288 71.6 5.8e-12
>>CCDS34883.1 DDHD2 gene_id:23259|Hs108|chr8 (711 aa)
initn: 4813 init1: 4813 opt: 4813 Z-score: 5566.3 bits: 1040.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4813; 99.9% identity (99.9% similar) in 711 aa overlap (1-711:1-711)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSVQSQQEQLSQSDPSPSPNSCSSFELIDMDAGSLYEPVSPHWFYCKIIDSKETWIPFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSSVQSQQEQLSQSDPSPSPNSCSSFELIDMDAGSLYEPVSPHWFYCKIIDSKETWIPFN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVVPTDGGRYDVHLGERMRYAVYWDELASEVRRCTWFYKGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVVPTDGGRYDVHLGERMRYAVYWDELASEVRRCTWFYKGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KDNKYVPYSESFSQVLEETYMLAVTLDEWKKKLESPNREIIILHNPKLMVHYQPVAGSDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDNKYVPYSESFSQVLEETYMLAVTLDEWKKKLESPNREIIILHNPKLMVHYQPVAGSDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 WGSTPMEQGRPRTVKRGVENISVDIHCGEPLQIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVND
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WGSTPTEQGRPRTVKRGVENISVDIHCGEPLQIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLPVNWHSPLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLPVNWHSPLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIYTLFLQRNPDFKGGVSIAGHSLGSLILFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIYTLFLQRNPDFKGGVSIAGHSLGSLILFDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LTNQKDSLGDIDSEKDSLNIVMDQGDTPTLEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTNQKDSLGDIDSEKDSLNIVMDQGDTPTLEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DRDLQEIGIPLGPRKKILNYFSTRKNSMGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRDLQEIGIPLGPRKKILNYFSTRKNSMGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGSPIGMFLTVRGLKRIDPNYRFPTCKGFFNIYHPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGSPIGMFLTVRGLKRIDPNYRFPTCKGFFNIYHPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DPVAYRIEPMVVPGVEFEPMLIPHHKGRKRMHLELREGLTRMSMDLKNNLLGSLRMAWKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPVAYRIEPMVVPGVEFEPMLIPHHKGRKRMHLELREGLTRMSMDLKNNLLGSLRMAWKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 FTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDVNTEETSVAVKEEVLPINVGMLNGGQRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDVNTEETSVAVKEEVLPINVGMLNGGQRID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA0 YVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKEIYQTQGIFLDQPLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKEIYQTQGIFLDQPLQ
670 680 690 700 710
>>CCDS7618.1 SEC23IP gene_id:11196|Hs108|chr10 (1000 aa)
initn: 2148 init1: 861 opt: 1485 Z-score: 1712.7 bits: 327.9 E(32554): 4.4e-89
Smith-Waterman score: 2442; 52.2% identity (73.7% similar) in 745 aa overlap (2-684:235-973)
10 20 30
pF1KA0 MSSVQSQQEQLSQSDP-SPSPNSCSSFELID
::::: .: . : .:: . : : : .
CCDS76 QTPGPPAHPPPSGPPVQMYQMPPGSLPPVPSSVQSPAQQQVPARPGAPSVQVPSPFLLQN
210 220 230 240 250 260
40 50 60 70 80
pF1KA0 MDAGSLYEPVSPHWFYCKIIDSKETWIPFNSEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVV-PTDGGRY
. ::::.::::::: .. :. :.::. :: .::: :.: . :: ::::::
CCDS76 Q-----YEPVQPHWFYCKEVEYKQLWMPFSVFDSLNLEEIYNSVQPDPESVVLGTDGGRY
270 280 290 300 310
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 DVHLGERMRYAVYWDELASEVRRCTWFYKGDKDNKYVPYSESFSQVLEETYMLAVTLDEW
::.: .:.: :.::.: .:::::::::::: :....::.: ::. :: : ::: ..:
CCDS76 DVYLYDRIRKAAYWEEEPAEVRRCTWFYKGDTDSRFIPYTEEFSEKLEAEYKKAVTTNQW
320 330 340 350 360 370
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KKKLESPNREIIILHNPKLMVHYQPVAGSDDWGSTPMEQGRPRTVKRGVENISVDIHCGE
...:: :. : :..::::..:..:: . :.::.: : :::.::::... .: ::
CCDS76 HRRLEFPSGETIVMHNPKVIVQFQPSSVPDEWGTTQDGQTRPRVVKRGIDDNLDEIPDGE
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 PLQIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVNDFRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLP
:.::::::::::::.::::::::..::.::: :::.::.:::::. .. ...::::::
CCDS76 MPQVDHLVFVVHGIGPVCDLRFRSIIECVDDFRVVSLKLLRTHFKKSLDDGKVSRVEFLP
440 450 460 470 480 490
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 VNWHSPL--HSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEM
:.::: : .:::: ....::::::.:.:::::.:.::..::::::::::::. :. :.
CCDS76 VHWHSSLGGDATGVDRNIKKITLPSIGRFRHFTNETLLDILFYNSPTYCQTIVEKVGMEI
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370
pF1KA0 NRIYTLFLQRNPDFKGGVSIAGHSLGSLILFDILTNQKD------------SLGDIDS--
:....::..::::::::::.::::::::::::::.:::: . : . .
CCDS76 NHLHALFMSRNPDFKGGVSVAGHSLGSLILFDILSNQKDLNLSKCPGPLAVANGVVKQLH
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410 420
pF1KA0 --EK-----------DSLNIVMDQGDTPTLEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCT
:: .: ..:... .. ::.: :. :.:::.:. :::::.: :.: .::
CCDS76 FQEKQMPEEPKLTLDESYDLVVENKEVLTLQETLEALSLSEYFSTFEKEKIDMESLLMCT
620 630 640 650 660 670
430 440 450 460
pF1KA0 DRDLQEIGIPLGPRKKILNYF-----------STRK-----NSMGIKRPAPQPASGANIP
::.:.:::::::::: :. : .: .. : .. : . . :..:
CCDS76 VDDLKEMGIPLGPRKKIANFVEHKAAKLKKAASEKKAVAATSTKGQEQSAQKTKDMASLP
680 690 700 710 720 730
470 480 490 500 510
pF1KA0 KESEF---------CSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGSPIGMFLTV
.::. : :: : . ..:: ::::: : : ..::::::.::::.::::.
CCDS76 SESNEPKRKLPVGACVSSVCVNYESFEVGAGQVSVAYNSLDFEPEIFFALGSPIAMFLTI
740 750 760 770 780 790
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 RGLKRIDPNYRFPTCKGFFNIYHPFDPVAYRIEPMVVPGVEFEPMLIPHHKGRKRMHLEL
::. ::: :: .::::::::::::.::::::.:::.:: .... .::::::::::.::::
CCDS76 RGVDRIDENYSLPTCKGFFNIYHPLDPVAYRLEPMIVPDLDLKAVLIPHHKGRKRLHLEL
800 810 820 830 840 850
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 REGLTRMSMDLKNNLLGSLRMAWKS---FTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDV
.:.:.::. :::.....::. ::.. :.:: . : .: :.. . . :: :
CCDS76 KESLSRMGSDLKQGFISSLKSAWQTLNEFARAHTSSTQLQEELEKVANQIKEEEEKQV-V
860 870 880 890 900 910
640 650 660 670 680
pF1KA0 NTE---ETSVAVKEEVLPINVGMLNGGQRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESED
..: :. :.: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EAEKVVESPDFSKDEDYLGKVGMLNGGRRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESED
920 930 940 950 960 970
690 700 710
pF1KA0 TVLLVLKEIYQTQGIFLDQPLQ
CCDS76 TALLLLKEIYRTMNISPEQPQH
980 990 1000
>>CCDS53895.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 (900 aa)
initn: 556 init1: 158 opt: 327 Z-score: 373.3 bits: 79.9 E(32554): 1.8e-14
Smith-Waterman score: 468; 25.9% identity (48.4% similar) in 717 aa overlap (86-700:261-886)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 WIPFNSEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVVPTDGGRYDVHLGERMRYAVYWDELAS-EVRRCT
:: :.: . . : :::.. . : :
CCDS53 EDRACGFCQSTTGHEPEMVELVNIEPVCVRGGLYEVDVTQGECYPVYWNQADKIPVMRGQ
240 250 260 270 280 290
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 WFYKGDKDNKYVPYSESFSQVLEETYMLAVTLDEWKKKLESPNREIIILHNPKLMVH-YQ
:: :. . : : :...:. .. .. ..... . : . : :: ..
CCDS53 WFI----DGTWQPLEEEESNLIEQEHLNCFRGQQMQENFDIEVSKSI---DGKDAVHSFK
300 310 320 330 340
180 190 200 210
pF1KA0 PVAGSDDWGS----------TPMEQGRPRTVKRGVENISVD---IHCG---------EPL
. :: : : . .: : : : . : . .: : .:
CCDS53 LSRNHVDWHSVDEVYLYSDATTSKIARTVTQKLGFSKASSSGTRLHRGYVEEATLEDKPS
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 QIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVNDFRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLPVN
: :.:::::::: : :.. . .: .. .. . :: ... .::::::.
CCDS53 QTTHIVFVVHGIGQKMDQG--RIIKNTAMMREAARKIEERHF-----SNHATHVEFLPVE
410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 WHSPLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIY
:.: : : :: :: .. :: . :.. .:...:.:: : . .: . .:.::.:
CCDS53 WRSKLTLDGDTVD--SITPDKVRGLRDMLNSSAMDIMYYTSPLYRDELVKGLQQELNRLY
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380
pF1KA0 TLFLQRNPDF--KGG-VSIAGHSLGSLILFDILTNQKDSLGDIDSEKDSLNIVMDQGDTP
.:: .::::: ::: :::..:::: .: .::.: : .:
CCDS53 SLFCSRNPDFEEKGGKVSIVSHSLGCVITYDIMT----------------------GWNP
520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 T-LEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCTDRDLQEIGIPLGPRKKILNYFSTRKNS
. : :.: :: :.: :.. .. . :.:. : :. :. . : .
CCDS53 VRLYEQL--LQK-------EEELPDERWMSYEERHLLDELYIT----KRRLKEIEERLH-
560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 MGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGS
:.: .:: :.. : : .: : :: .::
CCDS53 -GLK-------------------ASSMTQT---------------PALKFKVENFFCMGS
600 610 620
510 520 530 540 550
pF1KA0 PIGMFLTVRGLKRIDP---NYRFPT--CKGFFNIYHPFDPVAYRIEPMV------VPGVE
:...::..::.. . .. .: :. ..::.:: ::::::.::.. . :.
CCDS53 PLAVFLALRGIRPGNTGSQDHILPREICNRLLNIFHPTDPVAYRLEPLILKHYSNISPVQ
630 640 650 660 670 680
560 570 580
pF1KA0 FE------PMLIPHHK------GRKRMHLELREGLTRMSMDL------------------
.. :. : : ... . ::.. . .
CCDS53 IHWYNTSNPLPYEHMKPSFLNPAKEPTSVSENEGISTIPSPVTSPVLSRRHYGESITNIG
690 700 710 720 730 740
590 600 610 620 630
pF1KA0 KNNLLGSLR-------MAWKSFTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPS--DVNTE--
: ..::. : .. : :. . :.::: ... . .. .:: :.:.
CCDS53 KASILGAASIGKGLGGMLFSRFGRSS--TTQSSETSKDSMEDEKKPVASPSATTVGTQTL
750 760 770 780 790 800
640 650 660 670
pF1KA0 ----------------ETSVAVKEEVLPINV------GMLNGGQRIDYVLQEKPIESFNE
:. . . ..: :: .... .:::. :.: .:: .
CCDS53 PHSSSGFLDSAYFRLQESFFNLPQLLFPENVMQNKDNALVELDHRIDFELREGLVES--R
810 820 830 840 850
680 690 700 710
pF1KA0 YLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKEIYQTQGIFLDQPLQ
: :. :: :: : :..:..: .:.
CCDS53 YWSAVTSHTAYWSSLDVALFLLTFMYKHEHDDDAKPNLDPI
860 870 880 890 900
>>CCDS9714.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 (872 aa)
initn: 556 init1: 158 opt: 307 Z-score: 350.3 bits: 75.6 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 503; 26.4% identity (50.1% similar) in 689 aa overlap (86-700:261-858)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 WIPFNSEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVVPTDGGRYDVHLGERMRYAVYWDELAS-EVRRCT
:: :.: . . : :::.. . : :
CCDS97 EDRACGFCQSTTGHEPEMVELVNIEPVCVRGGLYEVDVTQGECYPVYWNQADKIPVMRGQ
240 250 260 270 280 290
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 WFYKGDKDNKYVPYSESFSQVLEETYMLAVTLDEWKKKLESPNREIIILHNPKLMVH-YQ
:: :. . : : :...:. .. .. ..... . : . : :: ..
CCDS97 WFI----DGTWQPLEEEESNLIEQEHLNCFRGQQMQENFDIEVSKSI---DGKDAVHSFK
300 310 320 330 340
180 190 200 210
pF1KA0 PVAGSDDWGS----------TPMEQGRPRTVKRGVENISVD---IHCG---------EPL
. :: : : . .: : : : . : . .: : .:
CCDS97 LSRNHVDWHSVDEVYLYSDATTSKIARTVTQKLGFSKASSSGTRLHRGYVEEATLEDKPS
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 QIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVNDFRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEFLPVN
: :.:::::::: : :.. . .: .. .. . :: ... .::::::.
CCDS97 QTTHIVFVVHGIGQKMDQG--RIIKNTAMMREAARKIEERHF-----SNHATHVEFLPVE
410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 WHSPLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEMNRIY
:.: : : :: :: .. :: . :.. .:...:.:: : . .: . .:.::.:
CCDS97 WRSKLTLDGDTVD--SITPDKVRGLRDMLNSSAMDIMYYTSPLYRDELVKGLQQELNRLY
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380
pF1KA0 TLFLQRNPDF--KGG-VSIAGHSLGSLILFDILTNQKDSLGDIDSEKDSLNIVMDQGDTP
.:: .::::: ::: :::..:::: .: .::.: : .:
CCDS97 SLFCSRNPDFEEKGGKVSIVSHSLGCVITYDIMT----------------------GWNP
520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 T-LEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCTDRDLQEIGIPLGPRKKILNYFSTRKNS
. : :.: :: :.: :.. .. . :.:. : :. :. . : .
CCDS97 VRLYEQL--LQK-------EEELPDERWMSYEERHLLDELYIT----KRRLKEIEERLH-
560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 MGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFFAFGS
:.: .:: :.. : : .: : :: .::
CCDS97 -GLK-------------------ASSMTQT---------------PALKFKVENFFCMGS
600 610 620
510 520 530 540 550
pF1KA0 PIGMFLTVRGLKRIDP---NYRFPT--CKGFFNIYHPFDPVAYRIEPMV------VPGVE
:...::..::.. . .. .: :. ..::.:: ::::::.::.. . :.
CCDS97 PLAVFLALRGIRPGNTGSQDHILPREICNRLLNIFHPTDPVAYRLEPLILKHYSNISPVQ
630 640 650 660 670 680
560 570 580
pF1KA0 FE------PMLIPHHK------GRKRMHLELREGLTRMSMDL------------------
.. :. : : ... . ::.. . .
CCDS97 IHWYNTSNPLPYEHMKPSFLNPAKEPTSVSENEGISTIPSPVTSPVLSRRHYGESITNIG
690 700 710 720 730 740
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 KNNLLGSLRMAWKSFTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDVNTEETSVAVKEEVL
: ..::. .. :.. . . : : . .:. .: .. . : . ....: ..:
CCDS97 KASILGAASIG-KGLGGMLFSRFGRSSTTQSSETSKDSMEDEKKPVASP-SATTVGTQTL
750 760 770 780 790 800
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 P-INVGMLNGG----QRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKEIYQT
: . :.:... .:::. :.: .:: .: :. :: :: : :..:..: .:.
CCDS97 PHSSSGFLDSALELDHRIDFELREGLVES--RYWSAVTSHTAYWSSLDVALFLLTFMYKH
810 820 830 840 850
710
pF1KA0 QGIFLDQPLQ
CCDS97 EHDDDAKPNLDPI
860 870
>>CCDS53896.1 DDHD1 gene_id:80821|Hs108|chr14 (879 aa)
initn: 556 init1: 158 opt: 288 Z-score: 328.3 bits: 71.6 E(32554): 5.8e-12
Smith-Waterman score: 496; 26.4% identity (50.5% similar) in 693 aa overlap (86-700:261-865)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 WIPFNSEDSQQLEEAYSSGKGCNGRVVPTDGGRYDVHLGERMRYAVYWDELAS-EVRRCT
:: :.: . . : :::.. . : :
CCDS53 EDRACGFCQSTTGHEPEMVELVNIEPVCVRGGLYEVDVTQGECYPVYWNQADKIPVMRGQ
240 250 260 270 280 290
120 130 140 150 160
pF1KA0 WFYKGDKDNKYVPYSESFSQVLEETYM-------LAVTLD-EWKKKLESPNREII---IL
:: :. . : : :...:. .. . ..: : .:.... . : .
CCDS53 WFI----DGTWQPLEEEESNLIEQEHLNCFRGQQMQENFDIEVSKSIDGKDGSGINYSAV
300 310 320 330 340
170 180 190 200
pF1KA0 HNPKLMVHYQPVAGSDDW----GSTPMEQGRPRTVKRGVENISVD---IHCG--------
:. :: .. . :. .: . .: : : : . : . .: :
CCDS53 HSFKLSRNHVDWHSVDEVYLYSDATTSKIARTVTQKLGFSKASSSGTRLHRGYVEEATLE
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 -EPLQIDHLVFVVHGIGPACDLRFRSIVQCVNDFRSVSLNLLQTHFKKAQENQQIGRVEF
.: : :.:::::::: : :.. . .: .. .. . :: ... .:::
CCDS53 DKPSQTTHIVFVVHGIGQKMDQG--RIIKNTAMMREAARKIEERHF-----SNHATHVEF
410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 LPVNWHSPLHSTGVDVDLQRITLPSINRLRHFTNDTILDVFFYNSPTYCQTIVDTVASEM
:::.:.: : : :: :: .. :: . :.. .:...:.:: : . .: . .:.
CCDS53 LPVEWRSKLTLDGDTVD--SITPDKVRGLRDMLNSSAMDIMYYTSPLYRDELVKGLQQEL
460 470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 NRIYTLFLQRNPDF--KGG-VSIAGHSLGSLILFDILTNQKDSLGDIDSEKDSLNIVMDQ
::.:.:: .::::: ::: :::..:::: .: .::.:
CCDS53 NRLYSLFCSRNPDFEEKGGKVSIVSHSLGCVITYDIMT----------------------
520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 GDTPT-LEEDLKKLQLSEFFDIFEKEKVDKEALALCTDRDLQEIGIPLGPRKKILNYFST
: .:. : :.: :: :.: :.. .. . :.:. : :. :. .
CCDS53 GWNPVRLYEQL--LQK-------EEELPDERWMSYEERHLLDELYIT----KRRLKEIEE
560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 RKNSMGIKRPAPQPASGANIPKESEFCSSSNTRNGDYLDVGIGQVSVKYPRLIYKPEIFF
: . :.: .:: :.. : : .: : ::
CCDS53 RLH--GLK-------------------ASSMTQT---------------PALKFKVENFF
610 620
510 520 530 540 550
pF1KA0 AFGSPIGMFLTVRGLKRIDP---NYRFPT--CKGFFNIYHPFDPVAYRIEPMV------V
.:::...::..::.. . .. .: :. ..::.:: ::::::.::.. .
CCDS53 CMGSPLAVFLALRGIRPGNTGSQDHILPREICNRLLNIFHPTDPVAYRLEPLILKHYSNI
630 640 650 660 670 680
560 570 580
pF1KA0 PGVEFE------PMLIPHHK------GRKRMHLELREGLTRMSMDL--------------
:... :. : : ... . ::.. . .
CCDS53 SPVQIHWYNTSNPLPYEHMKPSFLNPAKEPTSVSENEGISTIPSPVTSPVLSRRHYGESI
690 700 710 720 730 740
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 ----KNNLLGSLRMAWKSFTRAPYPALQASETPEETEAEPESTSEKPSDVNTEETSVAVK
: ..::. .. :.. . . : : . .:. .: .. . : . ....:
CCDS53 TNIGKASILGAASIG-KGLGGMLFSRFGRSSTTQSSETSKDSMEDEKKPVASP-SATTVG
750 760 770 780 790 800
650 660 670 680 690
pF1KA0 EEVLP-INVGMLNGG----QRIDYVLQEKPIESFNEYLFALQSHLCYWESEDTVLLVLKE
..:: . :.:... .:::. :.: .:: .: :. :: :: : :..:..:
CCDS53 TQTLPHSSSGFLDSALELDHRIDFELREGLVES--RYWSAVTSHTAYWSSLDVALFLLTF
810 820 830 840 850 860
700 710
pF1KA0 IYQTQGIFLDQPLQ
.:.
CCDS53 MYKHEHDDDAKPNLDPI
870
711 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 19:36:09 2016 done: Wed Nov 2 19:36:10 2016
Total Scan time: 2.580 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]