FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0700, 1130 aa
1>>>pF1KA0700 1130 - 1130 aa - 1130 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8359+/-0.000389; mu= 7.5135+/- 0.025
mean_var=191.8444+/-38.906, 0's: 0 Z-trim(119.3): 10 B-trim: 921 in 1/56
Lambda= 0.092598
statistics sampled from 33062 (33072) to 33062 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 16.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001284524 (OMIM: 607777) paired amphipathic hel (1130) 7586 1026.6 0
NP_001284526 (OMIM: 607777) paired amphipathic hel ( 720) 4759 648.8 3.4e-185
NP_056075 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix (1162) 4757 648.7 6e-185
XP_006722767 (OMIM: 607777) PREDICTED: paired amph ( 645) 4347 593.8 1.1e-168
NP_001138830 (OMIM: 607776,613406) paired amphipat (1273) 1885 265.0 2e-69
NP_001138829 (OMIM: 607776,613406) paired amphipat (1273) 1885 265.0 2e-69
XP_006720529 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0 2e-69
XP_006720528 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0 2e-69
XP_006720530 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0 2e-69
NP_056292 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic (1273) 1885 265.0 2e-69
>>NP_001284524 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix p (1130 aa)
initn: 7586 init1: 7586 opt: 7586 Z-score: 5484.1 bits: 1026.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7586; 100.0% identity (100.0% similar) in 1130 aa overlap (1-1130:1-1130)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 KKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 KEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 REMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 AARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 QYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESAC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
1090 1100 1110 1120 1130
>>NP_001284526 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix p (720 aa)
initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759 Z-score: 3445.9 bits: 648.8 E(85289): 3.4e-185
Smith-Waterman score: 4759; 99.9% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (422-1130:12-720)
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 ASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQ
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQRHSRHFLLVQVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQ
10 20 30 40
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 LHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRA
50 60 70 80 90 100
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 IYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKS
110 120 130 140 150 160
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILE
170 180 190 200 210 220
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQ
230 240 250 260 270 280
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 TTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYF
290 300 310 320 330 340
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 FLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVE
350 360 370 380 390 400
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 LEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSD
410 420 430 440 450 460
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 DVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQ
470 480 490 500 510 520
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 VIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFR
530 540 550 560 570 580
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 RRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCR
590 600 610 620 630 640
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 AKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHV
650 660 670 680 690 700
1120 1130
pF1KA0 HGLPVTRYRVQYSRRPASP
:::::::::::::::::::
NP_001 HGLPVTRYRVQYSRRPASP
710 720
>>NP_056075 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix prot (1162 aa)
initn: 4757 init1: 4757 opt: 4757 Z-score: 3441.4 bits: 648.7 E(85289): 6e-185
Smith-Waterman score: 7512; 97.2% identity (97.2% similar) in 1162 aa overlap (1-1130:1-1162)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KA0 KE--------------------------------VLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPY
:: ::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KELDHWTLLQGSWTDDYCMSKFKNTCWIPGYSAGVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPY
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 EEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQ
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 RRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAY
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 LKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQ
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSP
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 QGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNN
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 WYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 WYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPS
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 EVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHL
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 VSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQR
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLK
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 KFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 LCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCET
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130
pF1KA0 VHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
::::::::::::::::::::::
NP_056 VHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
1150 1160
>>XP_006722767 (OMIM: 607777) PREDICTED: paired amphipat (645 aa)
initn: 4347 init1: 4347 opt: 4347 Z-score: 3149.1 bits: 593.8 E(85289): 1.1e-168
Smith-Waterman score: 4347; 100.0% identity (100.0% similar) in 645 aa overlap (486-1130:1-645)
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 EDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRI
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRI
10 20 30
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 YGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQ
40 50 60 70 80 90
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 AVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAA
100 110 120 130 140 150
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDP
160 170 180 190 200 210
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRL
220 230 240 250 260 270
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 HQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEY
280 290 300 310 320 330
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCL
340 350 360 370 380 390
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pF1KA0 KVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMT
400 410 420 430 440 450
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pF1KA0 IELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQ
460 470 480 490 500 510
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 SEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQV
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 QPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLP
580 590 600 610 620 630
1120 1130
pF1KA0 VTRYRVQYSRRPASP
:::::::::::::::
XP_006 VTRYRVQYSRRPASP
640
>>NP_001138830 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic (1273 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
NP_001 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120
pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
:::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:.. : .:. .:
NP_001 SQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHG
160 170 180 190 200 210
130 140 150
pF1KA0 ----------LTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKP-----------QVP--------
:: .... :. : : : .:: :.:
NP_001 IQPQPQPPPQHPSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASP
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KA0 --------------------LESDS-VEFNNAISYVNKIKTRFLDHPEIYRSFLEILHTY
:.... ::::.::.::::::.:: .:.::..::::::::
NP_001 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
:::: :.. : ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. .. :
NP_001 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290
pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
. .:.: : :. . : .::: .: :. . :.::: :: . :: :.: .
NP_001 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
400 410 420 430 440 450
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
.:.: : ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
NP_001 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
460 470 480 490 500 510
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
::.::: :: . . ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.:::
NP_001 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
.::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
NP_001 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
580 590 600 610 620 630
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
.::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.::: :::.:
NP_001 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
640 650 660 670 680 690
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
NP_001 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
700 710 720 730 740 750
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
.:::.::: .: .. ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::. :.:.
NP_001 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
760 770 780 790 800 810
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
.:.:.:.:.:.:. ::. :: .:. : .. : .... . : :::. : :..
NP_001 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
820 830 840 850 860 870
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
. : . . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.: ::..:. :
NP_001 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
880 890 900 910 920
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 TEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYED
:.: :. . .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
NP_001 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
930 940 950 960 970 980
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
.::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:...
NP_001 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
990 1000 1010 1020 1030 1040
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
:. :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
NP_001 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
1050 1060 1070 1080 1090 1100
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
::.:.... .: : . ::::: :::...:. .... . .:. .: : . .:.:
NP_001 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
..:::::...:::....:::::::: .: ::.: . : : ::.:. : ..: ...
NP_001 LDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEH
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
: : :. .. ::::: : .::: : :.: .: . ...:::.:. .:
NP_001 VPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP
1230 1240 1250 1260 1270
>>NP_001138829 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic (1273 aa)
initn: 3914 init1: 1503 opt: 1885 Z-score: 1367.3 bits: 265.0 E(85289): 2e-69
Smith-Waterman score: 3851; 52.7% identity (75.8% similar) in 1162 aa overlap (44-1130:126-1273)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
NP_001 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120
pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
:::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:.. : .:. .:
NP_001 SQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHG
160 170 180 190 200 210
130 140 150
pF1KA0 ----------LTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKP-----------QVP--------
:: .... :. : : : .:: :.:
NP_001 IQPQPQPPPQHPSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASP
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KA0 --------------------LESDS-VEFNNAISYVNKIKTRFLDHPEIYRSFLEILHTY
:.... ::::.::.::::::.:: .:.::..::::::::
NP_001 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
:::: :.. : ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. .. :
NP_001 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290
pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
. .:.: : :. . : .::: .: :. . :.::: :: . :: :.: .
NP_001 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
400 410 420 430 440 450
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
.:.: : ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
NP_001 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
460 470 480 490 500 510
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
::.::: :: . . ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.:::
NP_001 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
.::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
NP_001 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
580 590 600 610 620 630
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
.::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.::: :::.:
NP_001 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
640 650 660 670 680 690
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
NP_001 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
700 710 720 730 740 750
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
.:::.::: .: .. ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::. :.:.
NP_001 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
760 770 780 790 800 810
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
.:.:.:.:.:.:. ::. :: .:. : .. : .... . : :::. : :..
NP_001 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
820 830 840 850 860 870
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
. : . . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.: ::..:. :
NP_001 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
880 890 900 910 920
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 TEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYED
:.: :. . .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
NP_001 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
930 940 950 960 970 980
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
.::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:...
NP_001 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
990 1000 1010 1020 1030 1040
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
:. :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
NP_001 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
1050 1060 1070 1080 1090 1100
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
::.:.... .: : . ::::: :::...:. .... . .:. .: : . .:.:
NP_001 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
..:::::...:::....:::::::: .: ::.: . : : ::.:. : ..: ...
NP_001 LDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEH
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
: : :. .. ::::: : .::: : :.: .: . ...:::.:. .:
NP_001 VPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP
1230 1240 1250 1260 1270
>>XP_006720529 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: paired a (1273 aa)
initn: 3914 init1: 1503 opt: 1885 Z-score: 1367.3 bits: 265.0 E(85289): 2e-69
Smith-Waterman score: 3851; 52.7% identity (75.8% similar) in 1162 aa overlap (44-1130:126-1273)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
XP_006 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120
pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
:::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:.. : .:. .:
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130 140 150
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:: .... :. : : : .:: :.:
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160 170 180 190
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:.... ::::.::.::::::.:: .:.::..::::::::
XP_006 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
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:::: :.. : ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. .. :
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. .:.: : :. . : .::: .: :. . :.::: :: . :: :.: .
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::.::: :: . . ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.:::
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.::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.::: :::.:
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pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
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.:::.::: .: .. ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::. :.:.
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. : . . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.: ::..:. :
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pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
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pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]