Result of FASTA (omim) for pF1KA0660
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0660, 482 aa
  1>>>pF1KA0660 482 - 482 aa - 482 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5976+/-0.000392; mu= -2.9628+/- 0.025
 mean_var=390.3486+/-80.762, 0's: 0 Z-trim(123.9): 21  B-trim: 2572 in 1/59
 Lambda= 0.064915
 statistics sampled from 44526 (44569) to 44526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.808), E-opt: 0.2 (0.523), width:  16
 Scan time:  8.800

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016864412 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase- ( 466) 1600 163.6 1.1e-39
XP_006714812 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase- ( 466) 1600 163.6 1.1e-39
XP_016864411 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase- ( 466) 1600 163.6 1.1e-39
NP_005745 (OMIM: 608431) ras GTPase-activating pro ( 466) 1600 163.6 1.1e-39
NP_938405 (OMIM: 608431) ras GTPase-activating pro ( 466) 1600 163.6 1.1e-39
XP_006714813 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase- ( 466) 1600 163.6 1.1e-39


>>XP_016864412 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase-acti  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
XP_016 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
XP_016 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
XP_016 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
XP_016 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
XP_016 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
XP_016 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
XP_016 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
XP_016 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
XP_016 RGLAPRQ      
     460            

>>XP_006714812 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase-acti  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
XP_006 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
XP_006 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
XP_006 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
XP_006 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
XP_006 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
XP_006 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
XP_006 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
XP_006 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
XP_006 RGLAPRQ      
     460            

>>XP_016864411 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase-acti  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
XP_016 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
XP_016 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
XP_016 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
XP_016 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
XP_016 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
XP_016 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
XP_016 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
XP_016 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
XP_016 RGLAPRQ      
     460            

>>NP_005745 (OMIM: 608431) ras GTPase-activating protein  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
NP_005 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
NP_005 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
NP_005 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
NP_005 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
NP_005 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
NP_005 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
NP_005 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
NP_005 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
NP_005 RGLAPRQ      
     460            

>>NP_938405 (OMIM: 608431) ras GTPase-activating protein  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
NP_938 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
NP_938 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
NP_938 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
NP_938 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
NP_938 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
NP_938 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
NP_938 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
NP_938 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
NP_938 RGLAPRQ      
     460            

>>XP_006714813 (OMIM: 608431) PREDICTED: ras GTPase-acti  (466 aa)
 initn: 1595 init1: 860 opt: 1600  Z-score: 833.4  bits: 163.6 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 1981; 65.4% identity (80.3% similar) in 482 aa overlap (1-471:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQND
       ::::::::::::::::::::::::.::..::::::.::::::::.:..::: .:::::..
XP_006 MVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNQAPDMLHRFYGKNSSYVHGGLDSNGKPADAVYGQKE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 IHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSV
       ::.::.: ::..::::::::::::::.:::::::::::::..:  :.:::::::::::::
XP_006 IHRKVMSQNFTNCHTKIRHVDAHATLNDGVVVQVMGLLSNNNQALRRFMQTFVLAPEGSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENANSGYYEAHP
        ::::::::.:::.:::::    : .::::.::::  :::: .:: : ..... .:.   
XP_006 ANKFYVHNDIFRYQDEVFGGFVTEPQEESEEEVEEP-EERQQTPEVVPDDSGT-FYDQAV
              130       140       150        160       170         

              190       200             210        220       230   
pF1KA0 VTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTE------ELKPQ-VEEKNLEELEEKSTTPPPAEP
       :.: .:: :::   ::::.:: : . :      : ::. : :..  :  .::..: ::. 
XP_006 VSNDMEEHLEEPVAEPEPDPEPEPEQEPVSEIQEEKPEPVLEETAPEDAQKSSSPAPADI
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260        270       280       290  
pF1KA0 VSLPQEPPKAFSWASVTSKNLPPSGTVSSSGIPPHV-KAPVSQPRVEAKPEVQSQPPRV-
       ..  ::  ..:::::::::::::::.:  .:::::: :.:.:::: :.::: :  : :  
XP_006 AQTVQEDLRTFSWASVTSKNLPPSGAVPVTGIPPHVVKVPASQPRPESKPESQIPPQRPQ
      240       250       260       270       280       290        

              300        310       320       330       340         
pF1KA0 REQRPRE-RPGFPP-RGPRPGRGDMEQNDSDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKE
       :.:: :: : ..:: ::::: :   ::.: . ::..:.:::::::.:::::..:..:::.
XP_006 RDQRVREQRINIPPQRGPRPIREAGEQGDIEPRRMVRHPDSHQLFIGNLPHEVDKSELKD
      300       310       320       330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 FFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKT
       ::.:.:::::::::.   :::::::::::::::::::..:  .:::::::::::::::::
XP_006 FFQSYGNVVELRINS---GGKLPNFGFVVFDDSEPVQKVLSNRPIMFRGEVRLNVEEKKT
      360       370          380       390       400       410     

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 RAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRG
       :::::        :::: :   :::::::: .::::      :::: ::::.:: : : :
XP_006 RAARE-------GDRRDNRL--RGPGGPRGGLGGGM------RGPP-RGGMVQKPGFGVG
         420                430       440              450         

     470       480  
pF1KA0 TGQMEGRFTGQRR
        :           
XP_006 RGLAPRQ      
     460            




482 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 19:30:09 2016 done: Wed Nov  2 19:30:10 2016
 Total Scan time:  8.800 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com