Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0651
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0651, 1080 aa
1>>>pF1KA0651 1080 - 1080 aa - 1080 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6611+/-0.000989; mu= 11.4859+/- 0.059
mean_var=153.1734+/-31.182, 0's: 0 Z-trim(109.7): 64 B-trim: 13 in 1/50
Lambda= 0.103629
statistics sampled from 10990 (11048) to 10990 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 5.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 985) 6306 955.6 0
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 986) 6294 953.8 0
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 958) 6263 949.1 0
CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813) 1822 285.5 1.1e-75
CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817) 1822 285.5 1.1e-75
CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434) 1809 283.4 2.5e-75
CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392) 1663 261.5 9.1e-69
CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705) 1663 261.6 1.1e-68
CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731) 1663 261.6 1.1e-68
CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173) 1460 231.1 1.1e-59
CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015) 1449 229.4 3e-59
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 539 93.4 2.4e-18
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 539 93.4 2.5e-18
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 539 93.4 2.6e-18
CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 537 93.2 4.7e-18
CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 537 93.2 4.8e-18
CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 519 90.5 2.9e-17
CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 519 90.5 3e-17
CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 519 90.5 3e-17
>>CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (985 aa)
initn: 6306 init1: 6306 opt: 6306 Z-score: 5101.7 bits: 955.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6306; 99.9% identity (100.0% similar) in 966 aa overlap (115-1080:20-985)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 RCSQLEGHSGTRVGSSLRQTFSFLSGMTGKAKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTTISVSG
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MSRIESLTRARIDRSRELASKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTTISVSG
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 MTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVS
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRR
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 ILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHK
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 KEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIH
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 TRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALK
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 LYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEE
350 360 370 380 390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 ERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLR
410 420 430 440 450 460
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 RKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVRD
470 480 490 500 510 520
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 IANQEKGMFLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IANQEKGMFLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAYL
530 540 550 560 570 580
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 RRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPR
590 600 610 620 630 640
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 GERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFNG
650 660 670 680 690 700
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 SIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEG
710 720 730 740 750 760
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 PERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERAT
770 780 790 800 810 820
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 EAGSLEARLRESEQARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAGSLEARLRESEQARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAG
830 840 850 860 870 880
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 DALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEEE
890 900 910 920 930 940
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES
950 960 970 980
>>CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (986 aa)
initn: 5211 init1: 5211 opt: 6294 Z-score: 5092.0 bits: 953.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6294; 99.8% identity (99.9% similar) in 967 aa overlap (115-1080:20-986)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 RCSQLEGHSGTRVGSSLRQTFSFLSGMTGKAKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTTISVSG
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MSRIESLTRARIDRSRELASKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTTISVSG
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 MTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTMCYACNKSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVS
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRR
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 ILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDE-EVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQH
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILSQSTDSLNMRNRTLSVESLIDEAEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQH
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 KKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KKEVMKQQDVIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDI
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 HTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HTRFLSQLLERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKAL
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 KLYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLYKELYARDKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIE
350 360 370 380 390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 EERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EERQDLTTALGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELL
410 420 430 440 450 460
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 RRKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RRKLIHDGCLLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVR
470 480 490 500 510 520
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 DIANQEKGMFLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DIANQEKGMFLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAY
530 540 550 560 570 580
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 LRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESP
590 600 610 620 630 640
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 RGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFN
650 660 670 680 690 700
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 GSIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPE
710 720 730 740 750 760
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 GPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERA
770 780 790 800 810 820
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 TEAGSLEARLRESEQARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TEAGSLEARLRESEQARALLEREAEEARRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPA
830 840 850 860 870 880
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 GDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEE
890 900 910 920 930 940
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES
950 960 970 980
>>CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (958 aa)
initn: 6263 init1: 6263 opt: 6263 Z-score: 5067.1 bits: 949.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6263; 100.0% identity (100.0% similar) in 958 aa overlap (123-1080:1-958)
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SGTRVGSSLRQTFSFLSGMTGKAKTREKEKMKEAKDARYTNGHLFTTISVSGMTMCYACN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKEAKDARYTNGHLFTTISVSGMTMCYACN
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 KSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KSITAKEALICPTCNVTIHNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIR
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 ERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERPSSAIYPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDS
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LNMRNRTLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNMRNRTLSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQD
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 VIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VIYELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLL
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 ERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERRRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYAR
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 DKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DKRFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTA
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGLVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVRDIANQEKGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLWKTATGRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSVVSLQNLIVRDIANQEKGM
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 FLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAYLRRIKMELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLISAAPPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDEAYLRRIKMELQ
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 QKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESPRGERLLQDA
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 IREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFNGSIELCRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFNGSIELCRAD
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 SDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEGPERREKLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEGPERREKLC
700 710 720 730 740 750
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 RANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERATEAGSLEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCRRLGEERATEAGSLEAR
760 770 780 790 800 810
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:::.. :. .: :...:: ::: :. :. : : : : : .:: . .
CCDS73 FRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVGPVSLPRRAE
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CCDS73 DLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQGQQDLEKEREELQQ
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. .. . : : : .: . :: : : . . ::
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CCDS73 SQAPASTSASTRLFGLTKPKEKKEKKKKNKTSRSQPGDGPASEVSAEGEEIFC
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CCDS54 NKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTLLYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQ
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pF1KA0 LTPREPA---------LPLEPDSGGNTSPGVTANGEAR---TFNGSIELCRAD---SDSS
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CCDS54 SQSCEDSCGDSVLADTLSSHDVPGSPTASLVTGGREGRGCSDVDPGIQGVVTDLAVSDAG
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CCDS54 EKVECRNFPGSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSI
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CCDS54 LRGGPLQDQKSRDA--DRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQE
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CCDS54 RERECQSQEELLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHG
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CCDS47 EPPRENRIQEEEWDKYIIPAKSESEKYKVSRTFSFLMNRMTSPRNKSKTKSKDAKDKEKL
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CCDS47 NRHQFAPGTFSGVLQCLVCDKTLLGKESLQCSNCNANVHKGCKDAAPACT--KKFQEKYN
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CCDS47 KNKPQTILGNSSFRDIP----QPGLSLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTL
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CCDS47 ESFRRSATSLESESDHNSCRSRSHSDELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQ
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CCDS47 LDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFYSMKERRQES-CAGSDRNFVIDRIGDILVQQFSEEN
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CCDS47 ASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKELQ-QNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQR
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CCDS47 ITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDLRKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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