Result of FASTA (omim) for
pF1KA0628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0628, 536 aa
1>>>pF1KA0628 536 - 536 aa - 536 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7479+/-0.000857; mu= 14.0775+/- 0.053
mean_var=336.4808+/-70.431, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2013 B-trim: 88 in 1/51
Lambda= 0.069919
statistics sampled from 17295 (19604) to 17295 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 9.030
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1741 191.0 7.8e-48
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1741 191.2 8.7e-48
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1741 191.2 8.7e-48
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1741 191.2 8.7e-48
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1741 191.2 8.7e-48
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1728 189.8 2.1e-47
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1728 189.8 2.1e-47
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1728 189.8 2.1e-47
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1728 189.9 2.1e-47
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1728 189.9 2.1e-47
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1728 189.9 2.1e-47
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1728 189.9 2.1e-47
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1728 189.9 2.1e-47
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1728 189.9 2.1e-47
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1728 189.9 2.2e-47
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 1711 188.2 7.2e-47
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1704 187.3 1e-46
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1704 187.3 1e-46
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1704 187.3 1e-46
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1704 187.3 1e-46
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1704 187.4 1.1e-46
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1704 187.5 1.2e-46
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1704 187.5 1.2e-46
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1704 187.5 1.2e-46
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1704 187.5 1.2e-46
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1704 187.5 1.2e-46
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1704 187.5 1.2e-46
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1704 187.5 1.2e-46
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1704 187.5 1.2e-46
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1700 186.9 1.4e-46
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1700 186.9 1.4e-46
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1700 187.0 1.5e-46
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1700 187.0 1.5e-46
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1692 186.2 2.7e-46
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1692 186.2 2.7e-46
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1692 186.3 2.8e-46
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1692 186.3 2.8e-46
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1692 186.3 2.8e-46
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1685 185.6 4.7e-46
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1685 185.6 4.7e-46
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1685 185.6 4.7e-46
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1685 185.7 4.8e-46
>>XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger pro (542 aa)
initn: 4801 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 979.7 bits: 191.0 E(85289): 7.8e-48
Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:69-511)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI
:. : :... ..: : .:. .
XP_005 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE
.:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..:
XP_005 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK
.:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::.
XP_005 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC
:..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.:
XP_005 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF
:: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: :::::
XP_005 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS
:: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: ::
XP_005 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL
:: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:.
XP_005 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV
:: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::.
XP_005 HQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRI
460 470 480 490 500 510
510 520 530
pF1KA0 HQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
:
XP_005 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
520 530 540
>>NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [Ho (682 aa)
initn: 4880 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 978.9 bits: 191.2 E(85289): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:209-651)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI
:. : :... ..: : .:. .
NP_001 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE
.:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..:
NP_001 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK
.:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::.
NP_001 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC
:..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.:
NP_001 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF
:: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: :::::
NP_001 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS
:: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: ::
NP_001 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL
:: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:.
NP_001 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV
:: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::.
NP_001 HQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRI
600 610 620 630 640 650
510 520 530
pF1KA0 HQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
:
NP_001 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
660 670 680
>>XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger pro (682 aa)
initn: 4880 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 978.9 bits: 191.2 E(85289): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:209-651)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI
:. : :... ..: : .:. .
XP_011 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE
.:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..:
XP_011 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK
.:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::.
XP_011 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC
:..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.:
XP_011 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF
:: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: :::::
XP_011 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS
:: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: ::
XP_011 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL
:: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:.
XP_011 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV
:: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::.
XP_011 HQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRI
600 610 620 630 640 650
510 520 530
pF1KA0 HQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
:
XP_011 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
660 670 680
>>XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger pro (682 aa)
initn: 4880 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 978.9 bits: 191.2 E(85289): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:209-651)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI
:. : :... ..: : .:. .
XP_005 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE
.:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..:
XP_005 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK
.:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::.
XP_005 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC
:..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.:
XP_005 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF
:: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: :::::
XP_005 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS
:: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: ::
XP_005 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL
:: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:.
XP_005 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV
:: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::.
XP_005 HQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRI
600 610 620 630 640 650
510 520 530
pF1KA0 HQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
:
XP_005 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
660 670 680
>>NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [Homo (682 aa)
initn: 4880 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 978.9 bits: 191.2 E(85289): 8.7e-48
Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:209-651)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI
:. : :... ..: : .:. .
NP_008 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V
180 190 200 210 220 230
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE
.:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..:
NP_008 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK
.:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::.
NP_008 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC
:..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.:
NP_008 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF
:: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: :::::
NP_008 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS
:: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: ::
NP_008 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL
:: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:.
NP_008 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV
:: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::.
NP_008 HQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRI
600 610 620 630 640 650
510 520 530
pF1KA0 HQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
:
NP_008 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
660 670 680
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 1728 init1: 1728 opt: 1728 Z-score: 972.2 bits: 189.8 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1728; 56.8% identity (79.4% similar) in 398 aa overlap (85-482:218-615)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
: .:.::: ::. ::. . :. :
NP_001 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
: . :. :::.:.: :.. .:. .:.::::: :..:::.: :: :: .: ::::
NP_001 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
::. : :. ::: : : :.: .:::.:.::::..: .::::: . . ::.:::.:: :.:
NP_001 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
.:: ::::.::::.:: .:.::::::.:: ::::::.: .:::: .: . :: : :::.
NP_001 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
.::::::. . : .::::::::.:.:::.::::: .::.: .::::::::.:: ::.::.
NP_001 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
::: . . :::::::::: ::::.::.:: :: ::.::.::: :. : :.::::.: .
NP_001 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
490 500 510 520 530 540
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
.. :..:.. :.:..:.::.::::.: ::..: :. ::::::::.: :::.: . :..
NP_001 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
550 560 570 580 590 600
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
.::. ::
NP_001 TKHQRTHTG
610
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 1728 init1: 1728 opt: 1728 Z-score: 972.2 bits: 189.8 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1728; 56.8% identity (79.4% similar) in 398 aa overlap (85-482:223-620)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
: .:.::: ::. ::. . :. :
XP_016 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
200 210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
: . :. :::.:.: :.. .:. .:.::::: :..:::.: :: :: .: ::::
XP_016 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
::. : :. ::: : : :.: .:::.:.::::..: .::::: . . ::.:::.:: :.:
XP_016 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
.:: ::::.::::.:: .:.::::::.:: ::::::.: .:::: .: . :: : :::.
XP_016 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
.::::::. . : .::::::::.:.:::.::::: .::.: .::::::::.:: ::.::.
XP_016 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
::: . . :::::::::: ::::.::.:: :: ::.::.::: :. : :.::::.: .
XP_016 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
.. :..:.. :.:..:.::.::::.: ::..: :. ::::::::.: :::.: . :..
XP_016 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
560 570 580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
.::. ::
XP_016 TKHQRTHTG
620
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 1728 init1: 1728 opt: 1728 Z-score: 972.1 bits: 189.8 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1728; 56.8% identity (79.4% similar) in 398 aa overlap (85-482:230-627)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
: .:.::: ::. ::. . :. :
XP_016 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
200 210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
: . :. :::.:.: :.. .:. .:.::::: :..:::.: :: :: .: ::::
XP_016 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
::. : :. ::: : : :.: .:::.:.::::..: .::::: . . ::.:::.:: :.:
XP_016 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
.:: ::::.::::.:: .:.::::::.:: ::::::.: .:::: .: . :: : :::.
XP_016 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
.::::::. . : .::::::::.:.:::.::::: .::.: .::::::::.:: ::.::.
XP_016 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
::: . . :::::::::: ::::.::.:: :: ::.::.::: :. : :.::::.: .
XP_016 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
.. :..:.. :.:..:.::.::::.: ::..: :. ::::::::.: :::.: . :..
XP_016 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
560 570 580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
.::. ::
XP_016 TKHQRTHTG
620
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
initn: 1728 init1: 1728 opt: 1728 Z-score: 971.9 bits: 189.9 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1728; 56.8% identity (79.4% similar) in 398 aa overlap (85-482:260-657)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
: .:.::: ::. ::. . :. :
XP_016 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
230 240 250 260 270 280
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
: . :. :::.:.: :.. .:. .:.::::: :..:::.: :: :: .: ::::
XP_016 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
::. : :. ::: : : :.: .:::.:.::::..: .::::: . . ::.:::.:: :.:
XP_016 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
.:: ::::.::::.:: .:.::::::.:: ::::::.: .:::: .: . :: : :::.
XP_016 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
.::::::. . : .::::::::.:.:::.::::: .::.: .::::::::.:: ::.::.
XP_016 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
::: . . :::::::::: ::::.::.:: :: ::.::.::: :. : :.::::.: .
XP_016 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
.. :..:.. :.:..:.::.::::.: ::..: :. ::::::::.: :::.: . :..
XP_016 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
590 600 610 620 630 640
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
.::. ::
XP_016 TKHQRTHTG
650
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
initn: 1728 init1: 1728 opt: 1728 Z-score: 971.9 bits: 189.9 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 1728; 56.8% identity (79.4% similar) in 398 aa overlap (85-482:260-657)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
: .:.::: ::. ::. . :. :
NP_001 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
230 240 250 260 270 280
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
: . :. :::.:.: :.. .:. .:.::::: :..:::.: :: :: .: ::::
NP_001 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
::. : :. ::: : : :.: .:::.:.::::..: .::::: . . ::.:::.:: :.:
NP_001 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
.:: ::::.::::.:: .:.::::::.:: ::::::.: .:::: .: . :: : :::.
NP_001 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
.::::::. . : .::::::::.:.:::.::::: .::.: .::::::::.:: ::.::.
NP_001 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
::: . . :::::::::: ::::.::.:: :: ::.::.::: :. : :.::::.: .
NP_001 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
.. :..:.. :.:..:.::.::::.: ::..: :. ::::::::.: :::.: . :..
NP_001 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
590 600 610 620 630 640
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
.::. ::
NP_001 TKHQRTHTG
650
536 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:54:04 2016 done: Fri Nov 4 00:54:05 2016
Total Scan time: 9.030 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]