FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0628, 536 aa
1>>>pF1KA0628 536 - 536 aa - 536 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0322+/-0.0018; mu= 11.4343+/- 0.106
mean_var=235.7681+/-48.210, 0's: 0 Z-trim(104.2): 946 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.083528
statistics sampled from 6783 (7806) to 6783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 3760 467.4 1.8e-131
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CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1810 232.6 1.2e-60
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1728 222.7 1.1e-57
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CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1720 221.5 1.7e-57
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1711 220.7 4.6e-57
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CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1704 219.8 8.1e-57
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1700 219.2 1e-56
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CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1691 218.0 1.9e-56
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1695 218.8 1.9e-56
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1695 218.9 2e-56
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1695 218.9 2e-56
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1692 218.4 2.3e-56
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1686 217.7 3.8e-56
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1685 217.6 4.3e-56
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1685 217.6 4.4e-56
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1684 217.5 4.6e-56
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CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1681 217.1 5.6e-56
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1671 215.6 1.1e-55
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CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1662 214.7 2.6e-55
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1660 214.6 3.4e-55
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CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1655 213.8 4.6e-55
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1655 213.8 4.6e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1657 214.3 4.7e-55
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1653 213.7 5.9e-55
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1653 213.7 6.1e-55
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1651 213.4 6.6e-55
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1651 213.4 6.7e-55
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1647 212.9 9.1e-55
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1648 213.1 9.3e-55
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1647 212.9 9.4e-55
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1644 212.5 1.1e-54
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1641 212.2 1.5e-54
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1641 212.2 1.5e-54
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1641 212.3 1.7e-54
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1639 212.0 1.8e-54
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1639 212.0 1.9e-54
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1633 211.1 2.7e-54
>>CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 (536 aa)
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Smith-Waterman score: 3760; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MILLSFVSDSNVGTGEKKVTEAWISEDENSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MILLSFVSDSNVGTGEKKVTEAWISEDENSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKEC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA0 HTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
490 500 510 520 530
>>CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 (496 aa)
initn: 3511 init1: 3511 opt: 3511 Z-score: 2311.9 bits: 437.4 E(32554): 1.9e-122
Smith-Waterman score: 3511; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (41-536:1-496)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 NVGTGEKKVTEAWISEDENSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGS
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 TFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 YSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 IRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 RIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHT
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 GEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRP
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECS
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530
pF1KA0 QYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
460 470 480 490
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
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Smith-Waterman score: 1810; 54.9% identity (77.9% similar) in 448 aa overlap (69-509:219-665)
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 TVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVT------HWKIQTGE
: .: . . : .. . : :..:::
CCDS12 HTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGE
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 TAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEA-NPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPY
: . :. ::.: : :: : :: : : :.:: :.:. :. :.:::::
CCDS12 KPYECKECGKAFTQNSQLTLHQR-LHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 TCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQ
: .:::.: .:.: .::.::.::. : :. ::. ::. : :..:::.:.::::.:: .
CCDS12 ECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEE
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 CGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKS
::::: ..:.: .:::.:: :.:.::::::: ::..: : .::::::::.::.:.::::.
CCDS12 CGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKA
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 FIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRS
: :.: : :: .::: : ::::::::.: . :.: .:.::::::.:.::.::::.:::.
CCDS12 FNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRG
430 440 450 460 470 480
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLI
:.: :::::::::.:: :.:: :.:.:...::::.::::: : :::::::: . ::
CCDS12 SQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLI
490 500 510 520 530 540
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 RHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQI
.::.:::::. :.::::::::.. ..::.::.::.:..:.:::.::::: ..:.: :::
CCDS12 QHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQR
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 IHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQE
:::::::: : : :.: : :.. .::.::: :: :.:.. :. :. ... ..::.:
CCDS12 IHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHIS
610 620 630 640 650 660
520 530
pF1KA0 GLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
CCDS12 EKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
670 680
>>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058 aa)
initn: 10108 init1: 1739 opt: 1747 Z-score: 1159.6 bits: 225.2 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1747; 53.8% identity (77.6% similar) in 429 aa overlap (83-509:237-663)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLL
. ::.:.::. : . :.. ..: :
CCDS74 HLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKS--FTSGSTL
210 220 230 240 250 260
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LQRELIEGEANP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQ
:.. :. .: : :::.:: .: :.::. :.::::: : .:::.:...: :..::
CCDS74 NQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQ
270 280 290 300 310 320
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 RIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHT
::::::. : :. :::.: .:.::.:::.:.::::. : .:::.: : :: :: .::
CCDS74 RIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHT
330 340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 RERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQ
:.:..::::::.:. .: ::.::::::::.::.:.:::::: .:.:..: .::: :
CCDS74 GEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKP
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 YECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCN
: ::::::.: :: .::::::::.:..:.::::.: .: :.:::::::::.:: :.
CCDS74 YCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCK
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:::: :. :.. :: .::::: :.:.::::.: : ::.::.:::::. :.::::::
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.: . : .::.::.:..:..::.::::: .: :: :::::::: :. :::.:..
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:.. ::..::: :: ::: . :. : . : .....:.:
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::.:: : .::::::::.:..:.::::::.: : : .:. :::::.:: :. ::: : :
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CCDS74 IHDLT
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CCDS59 IHDLT
1090
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:
CCDS64 HTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
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CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
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CCDS74 TKHQRTHTG
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CCDS74 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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CCDS74 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
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CCDS74 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
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CCDS12 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
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CCDS12 TKHQRTHTG
670
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CCDS54 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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CCDS54 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
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pF1KA0 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
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CCDS54 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
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240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
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CCDS54 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
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CCDS54 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
500 510 520 530 540 550
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pF1KA0 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
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560 570 580 590 600 610
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pF1KA0 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
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CCDS54 TKHQRTHTG
680
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:54:03 2016 done: Fri Nov 4 00:54:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]