FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0623, 1036 aa
1>>>pF1KA0623 1036 - 1036 aa - 1036 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4153+/-0.00119; mu= -6.7295+/- 0.070
mean_var=360.4801+/-77.390, 0's: 0 Z-trim(112.4): 634 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.067551
statistics sampled from 12464 (13196) to 12464 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 5.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036) 6936 691.1 3.3e-198
CCDS9274.1 ULK1 gene_id:8408|Hs108|chr12 (1050) 2334 242.6 3.4e-63
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CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 472) 655 78.7 3.3e-14
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 603 73.8 1.9e-12
CCDS73254.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11 ( 473) 543 67.8 6.4e-11
CCDS7789.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11 ( 514) 543 67.8 6.8e-11
>>CCDS11213.1 ULK2 gene_id:9706|Hs108|chr17 (1036 aa)
initn: 6936 init1: 6936 opt: 6936 Z-score: 3672.0 bits: 691.1 E(32554): 3.3e-198
Smith-Waterman score: 6936; 99.8% identity (99.9% similar) in 1036 aa overlap (1-1036:1-1036)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQILLGKEIKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQILLGKEIKIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLHQIAAAMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLHQIAAAMR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAATLCGSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAATLCGSPMY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSLMPSIPRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSLMPSIPRET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPFLEQGPVKKSCPVPVPMYSGSVSGSSCGSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPFLEQGPVKKSCPVPVPMYSGSVSGSSCGSSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTDDFVLVPHNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTDDFVLVPHNI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SSDHSCDMPMGTAGRRASNEFLVCGGQCQPTVSPHSETAPIPVPTQIRNYQRIEQNLTST
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSDHSCDMPVGTAGRRASNEFLVCGGQCQPTVSPHSETAPIPVPTQIRNYQRIEQNLTST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ASSGTNVHGSPRSAVVRRSNTSPMGFLRPGSCSPVPADTAQTVGRRLSTGSSRPYSPSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASSGTNVHGSPRSAVVRRSNTSPMGFLRPGSCSPVPADTAQTVGRRLSTGSSRPYSPSPL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VGTIPEQFSQCCCGHPQGHDSRSRNSSGSPVPQAQSPQSLLSGARLQSAPTLTDIYQNKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGTIPEQFSQCCCGHPQGHDSRSRNSSGSPVPQAQSPQSLLSGARLQSAPTLTDIYQNKQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLRKQHSDPVCPSHTGAGYSYSPQPSRPGSLGTSPTKHLGSSPRSSDWFFKTPLPTIIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLRKQHSDPVCPSHTGAGYSYSPQPSRPGSLGTSPTKHLGSSPRSSDWFFKTPLPTIIGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PTKTTAPFKIPKTQASSNLLALVTRHGPAEEQSKDGNEPRECAHCLLVQGSERQRAEQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PTKTTAPFKIPKTQASSNLLALVTRHGPAEEQSKDGNEPRECAHCLLVQGSERQRAEQQS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 KAVFGRSVSTGKLSDQQGKTPICRHQGSTDSLNTERPMDIAPAGACGGVLAPPAGTAASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAVFGRSVSTGKLSDQQGKTPICRHQGSTDSLNTERPMDIAPAGACGGVLAPPAGTAASS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KAVLFTVGSPPHSAAAPTCTHMFLRTRTTSVGPSNSGGSLCAMSGRVCVGSPPGPGFGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAVLFTVGSPPHSAAAPTCTHMFLRTRTTSVGPSNSGGSLCAMSGRVCVGSPPGPGFGSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PPGAEAAPSLRYVPYGASPPSLEGLITFEAPELPEETLMEREHTDTLRHLNVMLMFTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PPGAEAAPSLRYVPYGASPPSLEGLITFEAPELPEETLMEREHTDTLRHLNVMLMFTECV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LDLTAMRGGNPELCTSAVSLYQIQESVVVDQISQLSKDWGRVEQLVLYMKAAQLLAASLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDLTAMRGGNPELCTSAVSLYQIQESVVVDQISQLSKDWGRVEQLVLYMKAAQLLAASLH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LAKAQIKSGKLSPSTAVKQVVKNLNERYKFCITMRKKLTEKLNRFFSDKQRFIDEINSVT
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAKAQIKSGKLSPSTAVKQVVKNLNERYKFCITMCKKLTEKLNRFFSDKQRFIDEINSVT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AEKLIYNCAVEMVQSAALDEMFQQTEDIVYRYHKAALLLEGLSRILQDPADIENVHKYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEKLIYNCAVEMVQSAALDEMFQQTEDIVYRYHKAALLLEGLSRILQDPADIENVHKYKC
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KA0 SIERRLSALCHSTATV
::::::::::::::::
CCDS11 SIERRLSALCHSTATV
1030
>>CCDS9274.1 ULK1 gene_id:8408|Hs108|chr12 (1050 aa)
initn: 2883 init1: 1478 opt: 2334 Z-score: 1248.1 bits: 242.6 E(32554): 3.4e-63
Smith-Waterman score: 3237; 52.6% identity (74.0% similar) in 1073 aa overlap (2-1029:9-1044)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQILL
:.:: ::.:..::.:::::::::.::::.: : :::.: ::::::.::: ::
CCDS92 MEPGRGGTETVGKFEFSRKDLIGHGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLAKSQTLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 GKEIKILKELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLH
::::::::::.::::::::: ::. :::.:::::::::::::::.: ::::::::.::.
CCDS92 GKEIKILKELKHENIVALYDFQEMANSVYLVMEYCNGGDLADYLHAMRTLSEDTIRLFLQ
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120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QIAAAMRILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAAT
:::.:::.::::::::::::::::::: :... ..::.:::::::::::.:::::::
CCDS92 QIAGAMRLLHSKGIIHRDLKPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNMMAAT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LCGSPMYMAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSLM
:::::::::::::::::::.:::::::::..::::.:: ::::.::::::.:::::..:.
CCDS92 LCGSPMYMAPEVIMSQHYDGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPFLEQGP-VKKSCPVPVPMYSGSVS
:.:::::: : .:::.:::::.::::::. :: ::::. .: :.:: ::::: : .: :
CCDS92 PTIPRETSAPLRQLLLALLQRNHKDRMDFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTDD
::: .:: . ..:::::: .::..:. .:.:: ..:. :.::.. ::.:::::::
CCDS92 GSSSSSSSTSHLASPPSLGEMQQLQK-TLASPA-DTAGFLHSSRDSGG--SKDSSCDTDD
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KA0 FVLVPHNISSDHSCDMP----------------MGTAGRRASNEFLVCGGQCQPTVSPHS
::.:: .. .: . : ...:: .. .. . :. . :: .
CCDS92 FVMVPAQFPGDLVAEAPSAKPPPDSLMCSGSSLVASAGLESHGRTPSPSPPCSSSPSPSG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KA0 E-----------TAPIPVPTQIRNYQRIEQNLTSTASSGTNVHGSPRSAVVRRS-NTSPM
. ..:::::::..::::::.:: : .. : :::...::: .:::.
CCDS92 RAGPFSSSRCGASVPIPVPTQVQNYQRIERNLQSPTQFQT-----PRSSAIRRSGSTSPL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 GFLRPGSCSPVPADTAQTVGRRLSTGSSRPYSPSPLVGTIPEQFSQCCCGHPQGHDSRSR
:: : . :. :. . ...:..: :..:::.::: ::::::. . ::: . :.
CCDS92 GFARASPSPPAHAEHGGVLARKMSLGGGRPYTPSPQVGTIPERPGWSGTPSPQGAEMRGG
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 NSS--GSPVPQAQSPQSLLSGARLQSAPTLTDIYQNKQKLRKQHSDPVCPSHTGAGYSYS
: :: .:. .::.. : ::.:::.:.:.. . :: : .::. :: .:
CCDS92 RSPRPGSSAPE-HSPRTSGLGCRLHSAPNLSDLHVVRPKLPKPPTDPL-----GAVFS-P
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 PQPSRPG-SLGTSPTKHLGSSPRSSDWFFKTPLPTIIGSPTKTTAPFKIPKTQASSNLLA
:: : : : : . ..: .::. :.. ..::: :.:::::.. : .::: .:.::::
CCDS92 PQASPPQPSHGLQSCRNLRGSPKLPDFLQRNPLPPILGSPTKAVPSFDFPKTPSSQNLLA
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670
pF1KA0 LVTRHGPAEEQSKDGNEPRECAHCLLVQGSERQ---RAEQQSKAVFGRSVSTGKLSDQQG
:..:.: . .. . : . .. .:. : .. :. :::: ::..:.:
CCDS92 LLARQGVVMTPPRNRTLP-DLSEVGPFHGQPLGPGLRPGEDPKGPFGRSFSTSRLTDLLL
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 KTPICRHQ---GSTDSLNTERPMDIAPAGACGGVLAPPA--GTAASSKAVLFTVGSPPHS
:. . . :::.::. :.::.:::... :: : : : : ..: . :.::::::: .
CCDS92 KAAFGTQAPDPGSTESLQ-EKPMEIAPSAGFGGSLHPGARAGGTSSPSPVVFTVGSPPSG
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 AAAPTCTHMFLRTRTTSVGPSNSGGSLCAMSGRVCVGSPPGPGFGSSPPGAEAAPSLRYV
.. : ::: :.::..:..: :.: : ::: : : :: :
CCDS92 STPPQGP----RTRMFSAGPTGSASS----SARHLV---PGPC--SEAP----APELPAP
770 780 790 800
800 810 820 830 840
pF1KA0 PYG---ASP--PSLEGLITFEAPELPEETLMEREHTDTLRHLNVMLMFTECVLDLTAMRG
.: :.: .::: .:::::.::::::::.:::. :: : :.:.. ::...:..:
CCDS92 GHGCSFADPITANLEGAVTFEAPDLPEETLMEQEHTEILRGLRFTLLFVQHVLEIAALKG
810 820 830 840 850 860
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 GNPELCTSAVSLYQIQESVVVDQISQLSKDWGRVEQLVLYMKAAQLLAASLHLAKAQIKS
. : ... ::.:::::.:::: ::..:: .::::::.:.:.::...:. : ::..
CCDS92 SASE--AAGGPEYQLQESVVADQISLLSREWGFAEQLVLYLKVAELLSSGLQSAIDQIRA
870 880 890 900 910 920
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 GKLSPSTAVKQVVKNLNERYKFCITMRKKLTEKLNRFFSDKQRFIDEINSVTAEKLIYNC
::: :..:::::. ::: :: .. . :. .:.::: ::::..:.:.:.:::.::..
CCDS92 GKLCLSSTVKQVVRRLNELYKASVVSCQGLSLRLQRFFLDKQRLLDRIHSITAERLIFSH
930 940 950 960 970 980
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 AVEMVQSAALDEMFQQTEDIVYRYHKAALLLEGLSRILQDPADIENVHKYKCSIERRLSA
::.::::::::::::. : : ::::: ::::::...:.: :::::: : : :::::::
CCDS92 AVQMVQSAALDEMFQHREGCVPRYHKALLLLEGLQHMLSDQADIENVTKCKLCIERRLSA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1030
pF1KA0 LCHSTATV
:
CCDS92 LLTGICA
1050
>>CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 (470 aa)
initn: 652 init1: 317 opt: 655 Z-score: 368.6 bits: 78.7 E(32554): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 655; 38.4% identity (69.2% similar) in 289 aa overlap (15-299:20-300)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQIL-LG
.: :..:.:... .. : :::: . ::.:.:... :
CCDS76 MAGPGWGPPRLDGFILTERLGSGTYATVYKAYAKKDTREVVAIKCVAKKSLNKASVENLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KEIKILKELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLHQ
::.::: ..: .:: : : : ....:.::.: ::::. ..... : : . :::..:
CCDS76 TEIEILKGIRHPHIVQLKDFQWDSDNIYLIMEFCAGGDLSRFIHTRRILPEKVARVFMQQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 IAAAMRILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAATL
.:.:...:: ..: : :::::::::: :. ..:.::::::... .:
CCDS76 LASALQFLHERNISHLDLKPQNILLS-------SLEKPHLKLADFGFAQHMSPWDEKHVL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 CGSPMYMAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSL-M
:::.:::::.. ...:::..::::.:...:. : :.::: . : ..:. ..:: . .
CCDS76 RGSPLYMAPEMVCQRQYDARVDLWSMGVILYEALFGQPPFASRSFSELEEKIRSNRVIEL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPF--LEQGPVKKSCPVPVPMYSGSV
: : : .:: ::.:. . :..:. ::.::. ::. : .: . . .:
CCDS76 PLRPL-LSRDCRDLLQRLLERDPSRRISFQDFFAHPWVDLEHMPSGESLGRATALVVQAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SGSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTD
. .. :.:
CCDS76 KKDQEGDSAAALSLYCKALDFFVPALHYEVDAQRKEAIKAKVGQYVSRAEELKAIVSSSN
300 310 320 330 340 350
>>CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 (472 aa)
initn: 652 init1: 317 opt: 655 Z-score: 368.6 bits: 78.7 E(32554): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 655; 38.4% identity (69.2% similar) in 289 aa overlap (15-299:20-300)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MEVVGDFEYSKRDLVGHGAFAVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLSKSQIL-LG
.: :..:.:... .. : :::: . ::.:.:... :
CCDS45 MAGPGWGPPRLDGFILTERLGSGTYATVYKAYAKKDTREVVAIKCVAKKSLNKASVENLL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 KEIKILKELQHENIVALYDVQELPNSVFLVMEYCNGGDLADYLQAKGTLSEDTIRVFLHQ
::.::: ..: .:: : : : ....:.::.: ::::. ..... : : . :::..:
CCDS45 TEIEILKGIRHPHIVQLKDFQWDSDNIYLIMEFCAGGDLSRFIHTRRILPEKVARVFMQQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 IAAAMRILHSKGIIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNMMAATL
.:.:...:: ..: : :::::::::: :. ..:.::::::... .:
CCDS45 LASALQFLHERNISHLDLKPQNILLS-------SLEKPHLKLADFGFAQHMSPWDEKHVL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 CGSPMYMAPEVIMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSL-M
:::.:::::.. ...:::..::::.:...:. : :.::: . : ..:. ..:: . .
CCDS45 RGSPLYMAPEMVCQRQYDARVDLWSMGVILYEALFGQPPFASRSFSELEEKIRSNRVIEL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PSIPRETSPYLANLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPF--LEQGPVKKSCPVPVPMYSGSV
: : : .:: ::.:. . :..:. ::.::. ::. : .: . . .:
CCDS45 PLRPL-LSRDCRDLLQRLLERDPSRRISFQDFFAHPWVDLEHMPSGESLGRATALVVQAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SGSSCGSSPSCRFASPPSLPDMQHIQEENLSSPPLGPPNYLQVSKDSASTSSKNSSCDTD
. .. :.:
CCDS45 KKDQEGDSAAALSLYCKALDFFVPALHYEVDAQRKEAIKAKVGQYVSRAEELKAIVSSSN
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 (970 aa)
initn: 426 init1: 165 opt: 603 Z-score: 336.8 bits: 73.8 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 604; 27.2% identity (58.9% similar) in 569 aa overlap (2-547:7-542)
10 20 30 40 50
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::::.: :..::. . . ..:.::.: ..: :.:.:::.... .. :.
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.. . .: : .:. ::.:: ::... . ..:::. .. :: : .
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:: .. :. .. : : :: : ... : . :: :: . : . :... .:
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. : .. .... ...: : . :: . .:.. ..:.. . : . :.
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: .. .. . ..... .: .: .....:..
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10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]