Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0619
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0619, 1388 aa
1>>>pF1KA0619 1388 - 1388 aa - 1388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.2219+/-0.00161; mu= -33.9829+/- 0.094
mean_var=786.4064+/-172.489, 0's: 0 Z-trim(109.9): 569 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.045735
statistics sampled from 10663 (11227) to 10663 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 6.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 9053 614.6 6.1e-175
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 4176 292.8 4.4e-78
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 1516 117.4 3.6e-25
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 1486 115.4 1.4e-24
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 1476 114.7 2.2e-24
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1410 110.4 5.3e-23
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 1398 109.5 7.4e-23
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1396 109.5 1e-22
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1262 100.2 1.6e-20
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1262 100.3 1.8e-20
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1262 100.3 1.8e-20
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1186 95.3 5.9e-19
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1115 90.6 1.5e-17
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 783 68.5 4.2e-11
>>CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388 aa)
initn: 9053 init1: 9053 opt: 9053 Z-score: 3254.2 bits: 614.6 E(32554): 6.1e-175
Smith-Waterman score: 9053; 99.9% identity (100.0% similar) in 1388 aa overlap (1-1388:1-1388)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKT
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLSDSPSCRETDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 IYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQQK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 MIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 DIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 HEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 ISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRTSMKIQQNQSIRRPSR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 QLAPNKPS
::::::::
CCDS42 QLAPNKPS
>>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354 aa)
initn: 5013 init1: 2349 opt: 4176 Z-score: 1515.3 bits: 292.8 E(32554): 4.4e-78
Smith-Waterman score: 5872; 65.9% identity (86.1% similar) in 1361 aa overlap (25-1377:9-1344)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
.: .:.. :.:::.: .: . :::::..:: :::::
CCDS11 MSTGDSFETRFEKMDNLLRDPKSEVNSDCLLDGLDALVYDLDFP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
::::::::::::.::. ..::: :.::::::.:::::::::::::::::::...:::::
CCDS11 ALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MSNYDVPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD
:::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS11 MSNYDVPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
. :::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH
:::::::.::::: ::.: .:::.::::::::::::::::::::::::..: :::::::
CCDS11 GTYSKIMNHKNSLTFPDDNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL
:...:.:.:::::.::::::.:::::.:.:::. ::::::::::::::::.::::: .
CCDS11 WETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPKAFVGNQLPFVGFTYYSNRR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KA0 LLSDSPSCRENDSIQSRKNEES-QE-IQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLE
:: : ::. : . ..: :: .:: .: :::.: :::: :.:.::::.. : .:.
CCDS11 YLS---SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 KTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKD
: :::.:: . :...::.. :.:.:: ::::. ::::::..: .:.::.::.:..:::
CCDS11 KIMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEYQRKAEQENEKRRNVENEVSTLKD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 QLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESN
::::::: .::::...::..:::.::.:.: :::::::::.::::...: ::.:.::::
CCDS11 QLEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 NRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNG
::.::..: .::..: . .:.. .::. ::.::::: : ::.:.:::.:: .:.:..:.
CCDS11 NRELQERNRILENSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 KILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADK
: : ::: :... :. .. ::::.:.:::..:.:: .:: :::: :::.:::::.::
CCDS11 KHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDK
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 NKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINEL
..::::::: :: :::::: ::: ..:.:: ... ::.::.:: ::::::::...:
CCDS11 ---HQSIEEAKSVAMCEMEKKLKEEREAREKAENRVVQIEKQCSMLDVDLKQSQQKLEHL
710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMK
.:. ....:.::::..:::..:: : ::.:: :. ....:: :::.::: : :.: :
CCDS11 TGNKERMEDEVKNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLKGLEKQMKQEINTLLEAK
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 MNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKELQ
:: . :.: :. . .:::.::::::::::::::::::::.::::: :::.. :
CCDS11 RLLEFELAQLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNR---ENL
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 QKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHK
.: ::::.:...::.::... :::.::::::.. :::: .: .:. :. .:..
CCDS11 KKIQELQNEKETLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQES-------KKAASRNR
880 890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 QELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKA
::.:.:: :.. :::.: ::.:. : :.:::..:.: ..:. . :.:::: .::
CCDS11 QEITDKDHTVSRLEEANSMLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISN--LKA
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 QFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKE---PVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSERE
:::.. ::::::::::::::::::::. :..: :.:.::::::::..::..:::
CCDS11 AFEKNINTERTLKTQAVNKLAEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQERE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 KLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSI
:..:...:.:::::.::::..:: : :::: : ::.:::::::..: : ::.:.
CCDS11 KFNQMVVKHQKELNDMQAQLVEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLS---DSTSV
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 GSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSN
.: :. :.: ..::::.:::::.: :.: :..:: :.::.:::::::::..::::::::
CCDS11 ASFPSADETDGNLPESRIEGWLSVPNRGNIKRYGWKKQYVVVSSKKILFYNDEQDKEQSN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 PYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPVEPV--GEKS
: :::::::::::::::: :::::...:::.::::::::::: .:. : .::: .::.
CCDS11 PSMVLDIDKLFHVRPVTQGDVYRAETEEIPKIFQILYANEGECRKDVE--MEPVQQAEKT
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 NYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIA
:. ::::::::::::::.::.:: :::::.:::::::::::::.:::.::.::::..:
CCDS11 NFQNHKGHEFIPTLYHFPANCDACAKPLWHVFKPPPALECRRCHVKCHRDHLDKKEDLIC
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 PCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFARSSPRT-SMKIQQN
:::: ::...:...:::: : .::.:::..:::::::.::. :.:.:::: : . :
CCDS11 PCKVSYDVTSARDMLLLACSQDEQKKWVTHLVKKIPKNPPSG--FVRASPRTLSTRSTAN
1290 1300 1310 1320 1330
1380
pF1KA0 QSIRRPSRQLAPNKPS
::.:.
CCDS11 QSFRKVVKNTSGKTS
1340 1350
>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa)
initn: 1310 init1: 449 opt: 1516 Z-score: 565.3 bits: 117.4 E(32554): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 1642; 30.5% identity (62.1% similar) in 1241 aa overlap (22-1230:2-1152)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPIN-----VESLLDGLNSLVL
.: : :.:: .: : . : ::.::: : :
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 DLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ
. . ::..::: ..:. . ...:.. .... ::....::::::::::: .:. : ..
CCDS15 ECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGG
::.:::.:.:.::.::...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::
CCDS15 KVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DLVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADF
::..:.:... .:: :.:: ::.:.:.:..:.. .:::.::::.:.: .::..::::
CCDS15 DLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GTCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
:.:.:. : : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:
CCDS15 GSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGET
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQH
::::.::: ::.:::.::. . :: .. ..:..::.:: .. .:: :::.::.:....:
CCDS15 PFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA0 PFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPK--AFVGNQL
:::.. . :::::. :: .::.:: :.:::: ..:: . ::.: : :: :..:
CCDS15 PFFSGID--WDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFD-VDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHL
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
::.:::: . .::: :: .. . : ... .... :.:.. : : :.
CCDS15 PFVGFTY-TSSCVLSDR-SC-----LRVTAGPTSLDLD---VNVQRTLDNNL-ATEAYER
400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
. : :::. :: .. :..:.... .:: :.... : ...
CCDS15 RIK----RLEQEKLELSRK--LQESTQTV-------QAL-QYSTV------DGPLTASKD
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
:: ...::...: :.:. .: ..:..::.:.::. : : : : .:. .:
CCDS15 LE--IKNLKEEIEKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDA--FRQIKAYE
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
:::. :... .:: .:. . . .:: : .. :.. . .: . . . ... :.
CCDS15 -KQIKTLQQEREDL-NKELVQASERLK------NQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERL
540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEH
.:.. : ::. .: :. .:: .: . .. .:. ... .. :..
CCDS15 ----TELHTQKQKLARHVRDK----EEEVDLVMQKVE---SLRQELRRTERAKKELEVHT
590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDL
.: :. . :. :. :. ... .:.: :... .. . .: ... . : ::
CCDS15 EALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLENELEG--LKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDL
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 -KQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKI-EQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQ
:.: .:: :.. . ....:: .. ..: :. :... . .. . .: . :...
CCDS15 EKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSE
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 LKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEE
.. .. :.:.. :.... : .: . ... .: : . . . .:..: ..
CCDS15 REEFES---EFKQQYEREKVLLTEENKKLTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADK
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 CEEKTKLGKELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKA--DSEQLARSIAEEQYSDLE-KEK
: .. .. . : ..::.:. . :. .: . : : : . .:. : .
CCDS15 KESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDA-RGYLQALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMR
820 830 840 850 860
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 IMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQL
. .:... . .. .: : : :: :.. .:.. . . :. ...:. ..:
CCDS15 RFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIE
870 880 890 900 910 920
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 SRLKD-EEI-SAAAIKAQ-FEKQLLTERTLKTQAVNKLAEI----MNRKEPVKRGNDTDV
. .:: ::. : .:. : ....:. . :.:.... . .. . :. : .
CCDS15 QLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTPTDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPG
930 940 950 960 970 980
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 RRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRI---ELQMTLDSKD
.:: :. . . : : .. . : . : . . .. ..: .:
CCDS15 STGFPPKRKTHQFFVKSFTTPT----KCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 SDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKK
. . .:.: .. : : : :: . .: ..:: :: .
CCDS15 PTTCPVPPEQTKGPLGIDPQK---GIGTA----------YEGHVRIPKPAGVKK-GWQRA
1050 1060 1070 1080 1090
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 YVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVL----DI-DKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIF
.:: . :...:: . : :.: .:. :. :. : : : .:: .:. :.:: ::
CCDS15 LAIVCDFKLFLYDIAEGKA-SQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA0 QILYANEGESKKEQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPP
..
CCDS15 RVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDST
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711 aa)
initn: 1331 init1: 465 opt: 1486 Z-score: 554.6 bits: 115.4 E(32554): 1.4e-24
Smith-Waterman score: 1653; 30.0% identity (61.8% similar) in 1274 aa overlap (26-1256:6-1206)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRD-P---RSPINVESLLDGLNSLVLD
: .::: :. : : .: ..::.::: : : .
CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
. :::..: . .::. . ... .. .:.. ::....::::::::::: .:. : ...
CCDS99 CSHSALRRDKYVAEFLEWAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTER
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
.::::.:.:.::.::...: : ::::... .. :.. : :::::. .::.::.:. :::
CCDS99 IYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
:..:.:... .:: :.:: .:.:::.:.::.. .:::.::::.::: .::..:::::
CCDS99 LLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTP
.:.::.. : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.::
CCDS99 SCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 FYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
:::.::: ::.:::.:.. . :: . ..:..::.:: .. .:: :::.::.:....:
CCDS99 FYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPKA---FVGNQL
::.. .:.:::. :: .:..:: :.:::: ..:: ..: .: : . : : .:
CCDS99 FFEG--LNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFD-VDDDVLRNTEILP-PGSHTGFSGLHL
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
::::::. :. . :: : . . .:: .....:. : :: : .:.: :.
CCDS99 PFIGFTFTTESCF-SDRGSLK--SIMQSNTLTKDEDVQRDL----EH-SLQMEA---YER
400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
. . :::. :: .. :..:.... .:: . . . .: ..: .. .:
CCDS99 RIR----RLEQEKLELSRK--LQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKN
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
: : :. :::: :. . ::... :..: . ..: :.. .:.: .:.
CCDS99 KIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQ----HRVVRQEKE---ELHKQLVEA
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
: ..:.:. ..:.: . . :: :. :: .:. . : .. . :. . : . ..
CCDS99 S---ERLKSQAKELKDAH---QQRKLALQ-EFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRDKEEEM
560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSL-EQEEAE
. . . . ..: ...:. .. : : :. . .:. .... .: :.:
CCDS99 EVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKER-----KLREHSENFCKQMESE
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 HKATKARLADKNKIYESIEEAK--SEAMKEMEKKLL--EERTLKQKVENLLLEAEKRCSL
.: :.. . .. ..:. . :. .:.:::.: ::. ..... ..: . . .
CCDS99 LEALKVKQGGRGA-GATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEV
670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 LDCDLKQ-SQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKM
: . .: . :: :.: :: :... :. ..:. . . .: . .. .. .
CCDS99 HDSESHQLALQK--EILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAV-------GTIKDKYERERAMLF
720 730 740 750 760 770
830 840 850 860
pF1KA0 SE-KQLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDA----------DGQMKEL----QDQLE
.: :.: ::..: . .: :: .:. : :: ..:. :. .:. .
CCDS99 DENKKLTAENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKD
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 AEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLG-KELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQ
:. :...: . ...:: : ....:: . :. . .... ...:.::. . ..:
CCDS99 ARGYLQALASKMTEEL--EALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQ-SALEAEI
840 850 860 870 880
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 LARSIAEEQYSDLEKEKIMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTS-DVANL
:.....:. .. .. : ..:. :.... : : . ..:: :. :. . ..
CCDS99 RAKQLVQEELRKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDF
890 900 910 920 930 940
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 ANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRK
. : : ... : . ::. ..: : . . :... : : :
CCDS99 QDSIFEYFNTAPLAHDLTFRTS----SASEQETQAPKPEASPSM--SVAASEQQEDMAR-
950 960 970 980 990 1000
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 EPVKRGNDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIK-YQKELNEMQAQIAEESQIRIE
: .: . . . . . : . . : : :: ... . . . ::
CCDS99 -PPQRPSAVPLPTTQA------LALAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQG
1010 1020 1030 1040 1050
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 LQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNN
. : . . :. : ..:. : .... :. . .: ...: ..
CCDS99 YACEVCSFACHVSCKDGAPQVCPIPPEQSK---RPLGVDVQRGIGTAY-KGHVKVPKPTG
1060 1070 1080 1090 1100
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KA0 TKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYM----VLDI-DKLFHVRPVTQTDVYRA
.:: :: . :..: . :...:: . : ...: . :::. : : : : .:: .:
CCDS99 VKK-GWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGK-STQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA0 DAKEIPRIFQILYANEGESKKEQEFPV--EPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEAC
..:: ::.. . : .: . . . : .:: ...
CCDS99 TRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILTENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVH
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA0 MKPLWHMFKPPPALECRRCHIKCHKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQ
CCDS99 VPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAVGLEEGLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELA
1230 1240 1250 1260 1270 1280
>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa)
initn: 1347 init1: 449 opt: 1476 Z-score: 551.3 bits: 114.7 E(32554): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 1578; 30.9% identity (61.1% similar) in 1229 aa overlap (22-1230:2-1071)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPIN-----VESLLDGLNSLVL
.: : :.:: .: : . : ::.::: : :
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 DLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ
. . ::..::: ..:. . ...:.. .... ::....::::::::::: .:. : ..
CCDS15 ECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGG
::.:::.:.:.::.::...: : ::::... ... :.. : :::::: ::.::.:. ::
CCDS15 KVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 DLVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADF
::..:.:... .:: :.:: ::.:.:.:..:.. .:::.::::.:.: .::..::::
CCDS15 DLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 GTCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
:.:.:. : : :. ..:::::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:
CCDS15 GSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGET
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQH
::::.::: ::.:::.::. . :: .. ..:..::.:: .. .:: :::.::.:....:
CCDS15 PFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KA0 PFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPK--AFVGNQL
:::.. . :::::. :: .::.:: :.:::: ..:: . ::.: : :: :..:
CCDS15 PFFSGID--WDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFD-VDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHL
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQ
::.:::: . .::: :: .. . : ... .... :.:.. : : :.
CCDS15 PFVGFTY-TSSCVLSDR-SC-----LRVTAGPTSLDLD---VNVQRTLDNNL-ATEAYER
400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRN
. : :::. :: .. :..:.... .:: :.... : ...
CCDS15 RIK----RLEQEKLELSRK--LQESTQTV-------QAL-QYSTV------DGPLTASKD
450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 LENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAES
:: ...::...: :.:. .: ..:..::.:.::. : : : : .:. .:
CCDS15 LE--IKNLKEEIEKLRKQVTES-------SHLEQQLEEANAV-RQELDDA--FRQIKAYE
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRI
:::. :... .::. ::: . : . ..:. : .. . ..:....
CCDS15 -KQIKTLQQEREDLN-----------KLEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLENEL
540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 CGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEH
::.. . . . ..: ..... . ::::: :: . :. . : ..:. :
CCDS15 EGLKQKQISYSPGVCSIE-HQQEITKLKTDLEK-KS-----IFYE-----EELSKREGIH
590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 KATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDL
: :.....: :... :.. :... ::.:.:. :.... .. ..
CCDS15 ANEIKNL--KKELHDS--EGQQLALN---KEIM---ILKDKLEKTRRESQSEREEFESEF
640 650 660 670 680
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 KQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLK
::. .. .: .:.:. ..:: .... : : .: :.. ..::.
CCDS15 KQQYER------EKVLLTEENKKLTSELDKLTT---LYEN-----------LSIHNQQLE
690 700 710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 QENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECE
.: . : . : .. . .:.. . .. ..:. .:. :...: . ...:: :
CCDS15 EEVKDLADKKESVAHWEAQITE-------IIQWVSDEKDARGYLQALASKMTEEL--EAL
730 740 750 760 770
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 EKTKLGKELQQKKQELQD-ERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKE
....:: . . ... . ...:.::. . :.: :.. .:. . .. .:. :
CCDS15 RNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQ-SALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIITE
780 790 800 810 820 830
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 LEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLK
..:. :. : : :.. .: .. ::: .. : ...: :. .
CCDS15 CKLKDS------------------EKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSE-KGIEHQDSQHS
840 850 860 870
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 DEEISAAAIKA--QFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKENRK
. . : ::: : ...: .. : . . : :: . .. :
CCDS15 FLAFLNTPTDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTK
880 890 900 910 920 930
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 LHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQA
: . :. :. .. . .. : .. . . :: .. :
CCDS15 CH--------QCTSLMVGLIRQ--GCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPL--
940 950 960 970
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 LHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFY
:.: .. : : : :: . .: ..:: :: . .:: . :...:
CCDS15 ---GIDPQK---GIGTA----------YEGHVRIPKPAGVKK-GWQRALAIVCDFKLFLY
980 990 1000 1010 1020
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 DSEQDKEQSNPYMVL----DI-DKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKK
: . : :.: .:. :. :. : : : .:: .:. :.:: ::..
CCDS15 DIAEGKA-SQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 EQEFPVEPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECRRCHIKC
CCDS15 KCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027 aa)
initn: 1105 init1: 441 opt: 1410 Z-score: 526.5 bits: 110.4 E(32554): 5.3e-23
Smith-Waterman score: 1520; 26.9% identity (58.9% similar) in 1410 aa overlap (27-1300:32-1403)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLD
: : . .. ::.. :..::.: : .
CCDS91 LKFKYGARNPLDAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
. ::: : :...::. .: . ... :: .:.:..: ...: : :.:::.::.::.
CCDS91 CSQPALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
.::::...: .. . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.::::
CCDS91 IYAMKVMKKKALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
:..:.. :. . :. .:: ::..::. ..: :: .:::.::.:.:.:. ::.::.:::
CCDS91 LLSLLNRYEDQLDENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDG--FYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
. ::. . ::. .:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .
CCDS91 SAAKMNSNKMVNAKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
:: . . :...::. . : ::.: ..:. .:: ..: .. :: .: . ::
CCDS91 PFAEGTSARTFNNIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEG---LCCHP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPI---PKAFVGNQLP
::. . :.:::.. : :: :.:: :.::::. : .. : . : :..: :..::
CCDS91 FFS--KIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSW-VSSSPCQLSPSGFSGEELP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KA0 FIGFTYYRENLLLS---------DSPSCRENDSIQSR---KNEESQEIQKKLYTLEEHLS
:.::.: . .:. :::. ...:.... :..: :. : : . .:....
CCDS91 FVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPA--KTSSMEKKLLIKSKELQDSQDKCHKMEQEMT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 NEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQR
.:... . :.. : . ::. : :. .:. : : . :... . .
CCDS91 -------RLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARM
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 KADHEADKKRNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDT
....: :: .: .:. . .:...:... ..:. :.. .. ::.: . : .::
CCDS91 EVSQEDDKALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQV--EEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDL
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KA0 -AARLRKTQ--AESSKQIQQLESNNRDL----QDKNCLLETAKL-KLEKE----FINLQS
..::... :: :. . : ... : : : . : ::: :.. : . .::
CCDS91 YESELRESRLAAEEFKR-KATECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQE
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKILLAKVELEKRQLQERFTDLEK-EKS
::. . :...:...... :..:.. : . : .. ....... :. :..
CCDS91 KLEKAVKASTEATELLQNIRQAKERAERELEK----LQNREDSSEGIRKKLVEAEELEEK
650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 NMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEER
. : ... : .. :.:.: .: : .. : :.: ... : .:....: .. ::
CCDS91 HREAQVSAQH--LEVHLKQKE-QHYEEKIKVLD-NQIKKDL--ADKETLENMMQRHEEEA
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780
pF1KA0 TLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINEL-----------------LKQKDVLNE
: :. : : . . .: ... .:.: :: .: .. .
CCDS91 HEKGKI---LSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMIS
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEK-QLKQENNHLMEMKMNLEKQNA
..:. . .: .. : . :. : .... :.: .: . ...: :.... :.:.
CCDS91 ELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKL
820 830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 ELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEECEEKTKLGKE----LQQKKQ
::... . . ...: ..:: : : . ..:.:. : : :: : ..: : ...
CCDS91 ELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRD
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940
pF1KA0 ELQDERDSLAAQLEIT---------LTKADSE------QLARSIAEEQYSDLEKEKIMKE
:.: . :.: . . ::. ..: :.... : . .. : .. .:
CCDS91 EIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 LE-IKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRL
.. ... .......:: . :. .:. : : .: .: ..:: .: .. . : :
CCDS91 VDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 KDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKL---------------AEIMNRKEPVKRG
::. . .....: ::. ...: ... :::. .. .:.
CCDS91 GDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKEQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090
pF1KA0 -------ND--TDVRRK----EKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEE
.: .:...: : . :.:...:..::: : :.... : .:.. : .. ..
CCDS91 KLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERE-LKQRLLEEQAKLQQ-QMDLQKN
1120 1130 1140 1150 1160
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SQIRIE--LQMTLDSKD------SDIEQLRSQLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGF--
.:. :: .:: : ::.: ..:.:. . :. ... : .
CCDS91 HIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQA
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1150 1160 1170 1180
pF1KA0 ----PESRLEGWLS-----------LPVRNNTKKFGWVKKYV-------IVSSKKILFYD
: .. .: .: .:.. : :.. :. . ... .: . .
CCDS91 KMDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA0 SEQD----KEQSNPYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEGESKKEQ
.... : ..:. . .... . :. .. : ...: : . .::.
CCDS91 AREEAAHRKATDHPHPSTPATAR---QQIAMSAIVRSPEHQ-PSAMSLL-APPSSRRKES
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KA0 EFPVEPVGEKSNYICHK-GHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECR-RCHIKC
: : . .. . :. :.: : :.: .:. . . :::. :: ::
CCDS91 STPEEFSRRLKERMHHNIPHRFNVGLNMRATKCAVCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKC
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 HKDHMDKKEEIIAPCKVYYDISTAKNLLLLANSTEEQQKWVSRLVKKIPKKPPAPDPFAR
CCDS91 STCLPATCGLPAEYATHFTEAFCRDKMNSPGLQTKEPSSSLHLEGWMKVPRNNKRGQQGW
1410 1420 1430 1440 1450 1460
>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa)
initn: 1283 init1: 447 opt: 1398 Z-score: 523.8 bits: 109.5 E(32554): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 1424; 34.4% identity (64.9% similar) in 834 aa overlap (26-836:4-796)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRS--PINVESLLDGLNSLVLDLD
: : :: : : . : ....::: : .: .:.
CCDS31 MERRLRALEQLARGEAGGCP-GLDGLLDLLLALHHELS
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 FPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVY
::..... .::. .:.:.. :... .:....::::::::::: .::.. . ...
CCDS31 SGPLRRERSVAQFLSWASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIF
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 AMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLV
:::.: :.::.::...: : ::::... ..: ::. : :::::..:::.::.:. ::::.
CCDS31 AMKMLHKWEMLKRAETACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 NLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC
.:.: .. .: . :.:: ::.:::. ..:..: .::::::::.::: .::..:::::.:
CCDS31 TLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFY
.... .::: ..:::::::::::.:.. . : : :: .:::::.:: ::.: :.::::
CCDS31 LRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFY
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFF
:.::: ::.:::.:.. : :: :. .. :..:: .: .: ::::.:....:.::::
CCDS31 AESLVETYGKIMNHEDHLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK--AFVGNQLPFIG
.. .: . . ..:: .::: . .:.:::: .: . :.: :. :: :..:::.:
CCDS31 EGVDW--ERLASSTAPYIPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKS
::: : :: :..: : ...:: ::.. . :.. :.. . .
CCDS31 FTYTSG----SHSP---ESSS------EAWAALERKLQCLEQE-KVELSRKHQEALHAPT
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KA0 VNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKK------
. .::. ::.. ::: : .. :.:: :.. .. . ...: .
CCDS31 DHRELEQLRKEVQ---TLRDR----LPEMLRDKASLSQTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRL
450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 -RNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQ
:.: . .:. : ..: . . ... ..... :.. : . :. :. . : .:
CCDS31 HRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQLEEARAAQ
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 AESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQ
: :...: . .:: . .:. .. ....: :.. .:. .:.
CCDS31 RELEAQVSSLSRQVTQLQGQ----WEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPPEGGPQEAQLR
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 GRICGLEEDLKNGKILLAKVELEKR-QLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQE
.. .:.:.:.... . . : ::::. : .:. .: ... : . .: :: :
CCDS31 KEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQEENRRLSREQERLEAELA-QEQESKQRLEGE
620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 EAEHKAT-KARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSL
. : ... .:.::: . . . :... .. . :. :: ..: . : :.
CCDS31 RRETESNWEAQLADILS-WVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTLPARP----
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 LDCDLKQSQ-QKI--NELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTL
:: . : . ::. . :. ...:. ..: .: :.: ::: . . : : :
CCDS31 LDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRA-----KQGLQER-LTQVQ-EAQLQAERRL
730 740 750 760 770
830 840 850 860 870
pF1KA0 KMSEKQ---LKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYK
. .::: :.:: : :
CCDS31 QEAEKQSQALQQELAMLREELRARGPVDTKPSNSLIPFLSFRSSEKDSAKDPGISGEATR
780 790 800 810 820 830
>>CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069 aa)
initn: 1105 init1: 441 opt: 1396 Z-score: 521.3 bits: 109.5 E(32554): 1e-22
Smith-Waterman score: 1500; 28.6% identity (61.2% similar) in 1236 aa overlap (27-1127:32-1247)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLD
: : . .. ::.. :..::.: : .
CCDS55 LKFKYGARNPLDAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQK
. ::: : :...::. .: . ... :: .:.:..: ...: : :.:::.::.::.
CCDS55 CSQPALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 VYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGD
.::::...: .. . . .:: :::.:.. ..:::. :: ::::: .::.::::.::::
CCDS55 IYAMKVMKKKALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LVNLMSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFG
:..:.. :. . :. .:: ::..::. ..: :: .:::.::.:.:.:. ::.::.:::
CCDS55 LLSLLNRYEDQLDENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDG--FYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT
. ::. . ::. .:::::..:::: ..::: :: .::::::::. :::. : .
CCDS55 SAAKMNSNKMVNAKLPIGTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP
:: . . :...::. . : ::.: ..:. .:: ..: .. :: .:. ::
CCDS55 PFAEGTSARTFNNIMNFQRFLKFPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEGLCC---HP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA0 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPI---PKAFVGNQLP
:: .. :.:::.. : :: :.:: :.::::. : .. : . : :..: :..::
CCDS55 FF--SKIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDEPEKNSW-VSSSPCQLSPSGFSGEELP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KA0 FIGFTYYRENLLLS---------DSPSCRENDSIQSR---KNEESQEIQKKLYTLEEHLS
:.::.: . .:. :::. ...:.... :..: :. : : . .:....
CCDS55 FVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPA--KTSSMEKKLLIKSKELQDSQDKCHKMEQEMT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KA0 ------NEMQA---KEELEQKCKSVNTRL--EKTAKELEEEITLRKSVESALRQLERE--
.:..: ..:.: : . .. : . : . : .:..:.:.: .. .:
CCDS55 RLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRSLEQARMEVSQEDD
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KA0 KAL-LQHKNAEYQRKADHEADKKRNLEND-----VNSLKDQLEDLKKRN-------QNSQ
::: : : : .:: .. ... . . . .:.:...: . ..:. ..:.
CCDS55 KALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQVEEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLYESELRESR
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KA0 ISTE----KVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQL----ESNNRDLQ
...: :... :..: ... . : :.:.: .::.. .::.: :. .
CCDS55 LAAEEFKRKATECQHKLLKAKDQGKPEVGEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKAST
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KA0 DKNCLLET---AKLKLEKEFINLQSALESE---RRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKN
. . ::.. :: . :.:. .::. .: :. ... : ..:.... :: .
CCDS55 EATELLQNIRQAKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLVEAEERRHSLENKVKRLETMERR
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 GKILLAKVELEKRQLQERFTD--LEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARL
. : .. ...:.:. ..: :: :... : ... : .. :.:.: .: : ..
CCDS55 ENRLKDDIQTKSQQIQQ-MADKILELEEKHREAQVSAQH--LEVHLKQKE-QHYEEKIKV
720 730 740 750 760
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 ADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKI
: :.: ... : .:....: .. :: : :. : : . . .: ... .:.:
CCDS55 LD-NQIKKDL--ADKETLENMMQRHEEEAHEKGKI---LSEQKAMINAMDSKIRSLEQRI
770 780 790 800 810 820
780 790 800 810
pF1KA0 NEL-----------------LKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVN
:: .: .. . ..:. . .: .. : . :. : ....
CCDS55 VELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKIS
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TLKMSEK-QLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQDADGQMKELQDQLEAEQYFSTLYK
:.: .: . ...: :.... :.:. ::... . . ...: ..:: : : . .
CCDS55 HQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALE
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920
pF1KA0 TQVRELKEECEEKTKLGKE----LQQKKQELQDERDSLAAQLEIT---------LTKADS
.:.:. : : :: : ..: : ...:.: . :.: . . ::. ..
CCDS55 SQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNA
950 960 970 980 990 1000
930 940 950 960 970
pF1KA0 E------QLARSIAEEQYSDLEKEKIMKELE-IKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRT
: :.... : . .. : .. .:.. ... .......:: . :. .:. :
CCDS55 ELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTM
1010 1020 1030 1040 1050 1060
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 LTSDVANLANEKEELNNKLKDVQEQLSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNK
: .: .: ..:: .: .. . : : ::. . .....: ::. ...: ..
CCDS55 LEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1040 1050 1060
pF1KA0 L---------------AEIMNRKEPVKRG-------ND--TDVRRK----EKENRKLHME
. :::. .. .:. .: .:...: : . :.:...
CCDS55 ITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQK
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 LKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIE--LQMTLDSKD------SDIEQLRS
:..::: : :.... : .: ..: .. .. .:. :: .:: : ::.:
CCDS55 LETERE-LKQRLLEEQAKL-QQQMDLQKNHIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLE
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 QLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKK
..:.:.
CCDS55 NIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYN
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (530 aa)
initn: 1142 init1: 419 opt: 1262 Z-score: 481.9 bits: 100.2 E(32554): 1.6e-20
Smith-Waterman score: 1262; 38.3% identity (68.4% similar) in 532 aa overlap (26-544:6-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
: :.:. :. :: . ...: ::: : .. .:
CCDS74 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGAS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
: ..: . .::. : :: ... .... .:....::::::::.:: .:. : . .::::
CCDS74 ELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAM
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
:...:..:.::.. . : ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:
CCDS74 KIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 MSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMK
.:.. .: . :.:: ::.:.:.:..: .: .:::.::::.:::. ::..:::::.:.:
CCDS74 LSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGD---GFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFY
. : :. .:::::::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::
CCDS74 LRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFY
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFF
::: . ::.::. .:. : .: : . ..:...: .: :.::::.:. ..: ::::
CCDS74 ADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK--AFVGNQLPFIG
. ::..:... : .:.. . :. ::: .:: .::. . : .: .:::.:
CCDS74 FG--LDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKE-ELEQKCK
..: : :. : . . . . :. : . . .:: .: . .. : .
CCDS74 YSYSCMALRDSEVP----GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KA0 SVNTRLEKTAKEL----EEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKR
..... : : .:: :::. :.: : :: .. : .. . . ..:
CCDS74 AAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS-------LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNR
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 NLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAE
.:: : .:....: :.
CCDS74 DLEAHVRQLQERMELLQAEGATGP
510 520 530
>>CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (624 aa)
initn: 1102 init1: 419 opt: 1262 Z-score: 480.9 bits: 100.3 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 1262; 38.3% identity (68.4% similar) in 532 aa overlap (26-544:6-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSRPPPTGKMPGAPETAPGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFP
: :.:. :. :: . ...: ::: : .. .:
CCDS46 MSAEVRLRRLQQLVLDP-GFLGLEPLLDLLLGVHQELGAS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM
: ..: . .::. : :: ... .... .:....::::::::.:: .:. : . .::::
CCDS46 ELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAM
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL
:...:..:.::.. . : ::::... .. :..:: .::::. :::.::::. ::::..:
CCDS46 KIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 MSNYD--VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMK
.:.. .: . :.:: ::.:.:.:..: .: .:::.::::.:::. ::..:::::.:.:
CCDS46 LSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLK
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGD---GFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFY
. : :. .:::::::.:::.:.. :: : :: :::::..::: :::. :.::::
CCDS46 LRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFY
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFF
::: . ::.::. .:. : .: : . ..:...: .: :.::::.:. ..: ::::
CCDS46 ADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK--AFVGNQLPFIG
. ::..:... : .:.. . :. ::: .:: .::. . : .: .:::.:
CCDS46 FG--LDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKE-ELEQKCK
..: : :. : . . . . :. : . . .:: .: . .. : .
CCDS46 YSYSCMALRDSEVP----GPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KA0 SVNTRLEKTAKEL----EEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKR
..... : : .:: :::. :.: : :: .. : .. . . ..:
CCDS46 AAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS-------LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNR
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 NLENDVNSLKDQLEDLKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAE
.:: : .:....: :.
CCDS46 DLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHR
510 520 530 540 550 560
1388 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:58:15 2016 done: Thu Nov 3 09:58:16 2016
Total Scan time: 6.100 Total Display time: 0.690
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]