Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0611, 911 aa
1>>>pF1KA0611 911 - 911 aa - 911 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5288+/-0.00127; mu= 19.7653+/- 0.075
mean_var=71.8363+/-14.281, 0's: 0 Z-trim(100.9): 71 B-trim: 106 in 1/47
Lambda= 0.151322
statistics sampled from 6233 (6296) to 6233 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33489.1 ATP9A gene_id:10079|Hs108|chr20 (1047) 5064 1115.9 0
CCDS77202.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1136) 3357 743.2 6.1e-214
CCDS12014.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1147) 3140 695.9 1.1e-199
CCDS33896.1 ATP11B gene_id:23200|Hs108|chr3 (1177) 975 223.2 2.2e-57
CCDS3466.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1164) 926 212.5 3.6e-54
CCDS41873.1 ATP8A2 gene_id:51761|Hs108|chr13 (1188) 886 203.8 1.6e-51
CCDS47049.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1149) 792 183.3 2.3e-45
CCDS32238.1 ATP8B4 gene_id:79895|Hs108|chr15 (1192) 545 129.4 4e-29
CCDS32011.1 ATP11A gene_id:23250|Hs108|chr13 (1134) 541 128.5 7.1e-29
CCDS1066.1 ATP8B2 gene_id:57198|Hs108|chr1 (1223) 541 128.5 7.5e-29
CCDS43394.1 ATP10B gene_id:23120|Hs108|chr5 (1461) 533 126.8 2.9e-28
CCDS3476.1 ATP10D gene_id:57205|Hs108|chr4 (1426) 529 125.9 5.3e-28
CCDS35410.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1119) 519 123.7 2e-27
CCDS14668.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1132) 519 123.7 2e-27
CCDS32178.1 ATP10A gene_id:57194|Hs108|chr15 (1499) 495 118.5 9.4e-26
CCDS11965.1 ATP8B1 gene_id:5205|Hs108|chr18 (1251) 479 115.0 9.1e-25
CCDS54196.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1263) 470 113.0 3.6e-24
CCDS45901.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1300) 470 113.0 3.7e-24
>>CCDS33489.1 ATP9A gene_id:10079|Hs108|chr20 (1047 aa)
initn: 5063 init1: 5063 opt: 5064 Z-score: 5968.9 bits: 1115.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5071; 87.2% identity (87.2% similar) in 943 aa overlap (90-911:105-1047)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 NQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGFVLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGFVLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEV
80 90 100 110 120 130
120 130
pF1KA0 NSQVYSRLTARGTV----------------------------------------------
::::::::::::::
CCDS33 NSQVYSRLTARGTVKVKSSNIQVGDLIIVEKNQRVPADMIFLRTSEKNGSCFLRTDQLDG
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 ------------------------------------------------------------
CCDS33 ETDWKLRLPVACTQRLPTAADLLQIRSYVYAEEPNIDIHNFVGTFTREDSDPPISESLSI
200 210 220 230 240 250
140 150 160 170
pF1KA0 ---------------VGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSKIGLFDLEVNCLTKILFGALVVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENTLWAGTVVASGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSKIGLFDLEVNCLTKILFGALVVV
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPISLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPISLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVR
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 SSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEMIFKRLHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQQSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEMIFKRLHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQQSQ
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 DPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVHEAVKAIALCHNVTPVYESNGVTDQAEAEKQYEDSCRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVHEAVKAIALCHNVTPVYESNGVTDQAEAEKQYEDSCRV
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 YQASSPDEVALVQWTESVGLTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YQASSPDEVALVQWTESVGLTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGII
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 VRDESTGEITFYMKGADVVMAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRDESTGEITFYMKGADVVMAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDF
560 570 580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EARYVQAKLSVHDRSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EARYVQAKLSVHDRSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVW
620 630 640 650 660 670
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 MLTGDKLETATCTAKNAHLVTRNQDIHVFRLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLTGDKLETATCTAKNAHLVTRNQDIHVFRLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSL
680 690 700 710 720 730
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 EVCLKYYEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVCLKYYEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQ
740 750 760 770 780 790
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 ESDCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ESDCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCIS
800 810 820 830 840 850
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 TMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TMQAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLL
860 870 880 890 900 910
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 KGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQ
920 930 940 950 960 970
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 TWHWLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TWHWLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLR
980 990 1000 1010 1020 1030
900 910
pF1KA0 RRFSPPSYSKLTS
:::::::::::::
CCDS33 RRFSPPSYSKLTS
1040
>--
initn: 658 init1: 658 opt: 658 Z-score: 770.5 bits: 154.0 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 658; 100.0% identity (100.0% similar) in 89 aa overlap (1-89:16-104)
10 20 30 40
pF1KA0 MDSRPRAGCCEWLRCCGGGEARPRTVWLGHPEKRDQRYPRNVINN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MTDNIPLQPVRQKKRMDSRPRAGCCEWLRCCGGGEARPRTVWLGHPEKRDQRYPRNVINN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 QKYNFFTFLPGVLFNQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGFVLAVTVIRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKYNFFTFLPGVLFNQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGFVLAVTVIRE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 AVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSKIGLFDLEVN
CCDS33 AVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVKVKSSNIQVGDLIIVEKNQRVPADMIFLRTSE
130 140 150 160 170 180
>>CCDS77202.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1136 aa)
initn: 3980 init1: 3178 opt: 3357 Z-score: 3954.4 bits: 743.2 E(32554): 6.1e-214
Smith-Waterman score: 4142; 77.4% identity (92.5% similar) in 804 aa overlap (120-911:333-1136)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 YWVPLGFVLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMN
:. : ..: :::.:::.:::.: :::::
CCDS77 QKPQMDIHSFEGTFTREDSDPPIHESLSIENTLWASTIVASGTVIGVVIYTGKETRSVMN
310 320 330 340 350 360
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 TSNPRSKIGLFDLEVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPI
::::..:.::.:::.: ::: :: :::..:.:::.:: :.: :: ...::::::: ::::
CCDS77 TSNPKNKVGLLDLELNRLTKALFLALVALSIVMVTLQGFVGPWYRNLFRFLLLFSYIIPI
370 380 390 400 410 420
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 SLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVRSSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEMIFKR
:::::::::: ::.:.. .: .:::::::.:::::.:::. :::::::::::::::::::
CCDS77 SLRVNLDMGKAVYGWMMMKDENIPGTVVRTSTIPEELGRLVYLLTDKTGTLTQNEMIFKR
430 440 450 460 470 480
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 LHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQ-QSQ-------DPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVH
::::::.:: :.:::.:::. . :.: ::: . : .:. . . :::...:::.:
CCDS77 LHLGTVSYGADTMDEIQSHVRDSYSQMQSQAGGNNTGSTPLRKAQSSAPKVRKSVSSRIH
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370
pF1KA0 EAVKAIALCHNVTPVYESN-GVTDQ---AEAEKQYEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVG
::::::.::::::::::: :::.. :::.... : :.:::::::::::::::::::
CCDS77 EAVKAIVLCHNVTPVYESRAGVTEETEFAEADQDFSDENRTYQASSPDEVALVQWTESVG
550 560 570 580 590 600
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGADVV
::::.:: .::::.::. :.:.: :::.:::: ::::::.:::::::.:::::::::::.
CCDS77 LTLVSRDLTSMQLKTPSGQVLSFCILQLFPFTSESKRMGVIVRDESTAEITFYMKGADVA
610 620 630 640 650 660
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 MAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKLSVHDRSLKVA
:. :::::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::.:::::.::::::::
CCDS77 MSPIVQYNDWLEEECGNMAREGLRTLVVAKKALTEEQYQDFESRYTQAKLSMHDRSLKVA
670 680 690 700 710 720
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 TVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETATCTAKNAHL
.:.:::: ::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::: ::..::
CCDS77 AVVESLEREMELLCLTGVEDQLQADVRPTLEMLRNAGIKIWMLTGDKLETATCIAKSSHL
730 740 750 760 770 780
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 VTRNQDIHVFRLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLKYYEYEFMELACQCP
:.:.::::.:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS77 VSRTQDIHIFRQVTSRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLKYYEHEFVELACQCP
790 800 810 820 830 840
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 AVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASLA
:::::::.:::::.:: :::..::. :::.::::::::::: .:::.:.:::::::::::
CCDS77 AVVCCRCSPTQKARIVTLLQQHTGRRTCAIGDGGNDVSMIQAADCGIGIEGKEGKQASLA
850 860 870 880 890 900
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 ADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLYQ
::::::::.:.::::::::::::::::::.:::.::.: :::::::::::::::::::::
CCDS77 ADFSITQFRHIGRLLMVHGRNSYKRSAALGQFVMHRGLIISTMQAVFSSVFYFASVPLYQ
910 920 930 940 950 960
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 GFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLISIY
:::..::.::::::::::::::.::: :.::::::::::: ::: ::.::::::::::::
CCDS77 GFLMVGYATIYTMFPVFSLVLDQDVKPEMAMLYPELYKDLTKGRSLSFKTFLIWVLISIY
970 980 990 1000 1010 1020
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 QGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLSLACYIA
::. .:::::.::::::::.::::::.::::::::::::..::::::.:::.:::.::..
CCDS77 QGGILMYGALVLFESEFVHVVAISFTALILTELLMVALTVRTWHWLMVVAEFLSLGCYVS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 SLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS
::.::.:..:: ::.:..::::::.::.::::::::::::::..::::: ::.:
CCDS77 SLAFLNEYFDVAFITTVTFLWKVSAITVVSCLPLYVLKYLRRKLSPPSYCKLAS
1090 1100 1110 1120 1130
>--
initn: 615 init1: 545 opt: 578 Z-score: 675.6 bits: 136.6 E(32554): 2.6e-31
Smith-Waterman score: 578; 63.8% identity (84.3% similar) in 127 aa overlap (9-133:99-225)
10 20 30
pF1KA0 MDSRPRAGCCEWLR--CCGGGEARPRTVWLGHPEKRDQ
:: :: : : . :::::: ::: ..
CCDS77 YHTLPRARIMQRKRGLEWFVCDGWKFLCTSCCGWLINICRRKKELKARTVWLGCPEKCEE
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RYPRNVINNQKYNFFTFLPGVLFNQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGF
..::: :.::::: :::.::::..:::.:.:::::...:::::: ...: :::::.::::
CCDS77 KHPRNSIKNQKYNVFTFIPGVLYEQFKFFLNLYFLVISCSQFVPALKIGYLYTYWAPLGF
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 VLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSK
:::::. :::..:.: . ::::::::.::.::.:: :
CCDS77 VLAVTMTREAIDEFRRFQRDKEVNSQLYSKLTVRGKVQVKSSDIQVGDLIIVEKNQRIPS
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 IGLFDLEVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPISLRVNLD
CCDS77 DMVFLRTSEKAGSCFIRTDQLDGETDWKLKVAVSCTQQLPALGDLFSISAYVYAQKPQMD
250 260 270 280 290 300
>>CCDS12014.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1147 aa)
initn: 3979 init1: 2953 opt: 3140 Z-score: 3698.3 bits: 695.9 E(32554): 1.1e-199
Smith-Waterman score: 4116; 76.4% identity (91.3% similar) in 815 aa overlap (120-911:333-1147)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 YWVPLGFVLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMN
:. : ..: :::.:::.:::.: :::::
CCDS12 QKPQMDIHSFEGTFTREDSDPPIHESLSIENTLWASTIVASGTVIGVVIYTGKETRSVMN
310 320 330 340 350 360
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 TSNPRSKIGLFDLEVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPI
::::..:.::.:::.: ::: :: :::..:.:::.:: :.: :: ...::::::: ::::
CCDS12 TSNPKNKVGLLDLELNRLTKALFLALVALSIVMVTLQGFVGPWYRNLFRFLLLFSYIIPI
370 380 390 400 410 420
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 SLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVRSSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEMIFKR
:::::::::: ::.:.. .: .:::::::.:::::.:::. :::::::::::::::::::
CCDS12 SLRVNLDMGKAVYGWMMMKDENIPGTVVRTSTIPEELGRLVYLLTDKTGTLTQNEMIFKR
430 440 450 460 470 480
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 LHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQ-QSQ-------DPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVH
::::::.:: :.:::.:::. . :.: ::: . : .:. . . :::...:::.:
CCDS12 LHLGTVSYGADTMDEIQSHVRDSYSQMQSQAGGNNTGSTPLRKAQSSAPKVRKSVSSRIH
490 500 510 520 530 540
330 340 350 360 370
pF1KA0 EAVKAIALCHNVTPVYESN-GVTDQ---AEAEKQYEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVG
::::::.::::::::::: :::.. :::.... : :.:::::::::::::::::::
CCDS12 EAVKAIVLCHNVTPVYESRAGVTEETEFAEADQDFSDENRTYQASSPDEVALVQWTESVG
550 560 570 580 590 600
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGADVV
::::.:: .::::.::. :.:.: :::.:::: ::::::.:::::::.:::::::::::.
CCDS12 LTLVSRDLTSMQLKTPSGQVLSFCILQLFPFTSESKRMGVIVRDESTAEITFYMKGADVA
610 620 630 640 650 660
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 MAGIVQYNDWLEEECGNMAREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKLSVHDRSLKVA
:. :::::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::.:::::.::::::::
CCDS12 MSPIVQYNDWLEEECGNMAREGLRTLVVAKKALTEEQYQDFESRYTQAKLSMHDRSLKVA
670 680 690 700 710 720
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 TVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETATCTAKNAHL
.:.:::: ::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::: ::..::
CCDS12 AVVESLEREMELLCLTGVEDQLQADVRPTLEMLRNAGIKIWMLTGDKLETATCIAKSSHL
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560 570 580 590 600 610
pF1KA0 VTRNQDIHVFRLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLKYYEYEFMELACQCP
:.:.::::.:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS12 VSRTQDIHIFRQVTSRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVCLKYYEHEFVELACQCP
790 800 810 820 830 840
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pF1KA0 AVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASLA
:::::::.:::::.:: :::..::. :::.::::::::::: .:::.:.:::::::::::
CCDS12 AVVCCRCSPTQKARIVTLLQQHTGRRTCAIGDGGNDVSMIQAADCGIGIEGKEGKQASLA
850 860 870 880 890 900
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 ADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVPLYQ
::::::::.:.::::::::::::::::::.:::.::.: :::::::::::::::::::::
CCDS12 ADFSITQFRHIGRLLMVHGRNSYKRSAALGQFVMHRGLIISTMQAVFSSVFYFASVPLYQ
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pF1KA0 GFLIIGYSTIYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWVLISIY
:::..::.::::::::::::::.::: :.::::::::::: ::: ::.::::::::::::
CCDS12 GFLMVGYATIYTMFPVFSLVLDQDVKPEMAMLYPELYKDLTKGRSLSFKTFLIWVLISIY
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KA0 QGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLSLACYIA
::. .:::::.::::::::.::::::.::::::::::::..::::::.:::.:::.::..
CCDS12 QGGILMYGALVLFESEFVHVVAISFTALILTELLMVALTVRTWHWLMVVAEFLSLGCYVS
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pF1KA0 SLVFLHE-----------FIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSY
::.::.: :.:: ::.:..::::::.::.::::::::::::::..:::::
CCDS12 SLAFLNEYFGIGRVSFGAFLDVAFITTVTFLWKVSAITVVSCLPLYVLKYLRRKLSPPSY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
910
pF1KA0 SKLTS
::.:
CCDS12 CKLAS
>--
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10 20 30
pF1KA0 MDSRPRAGCCEWLR--CCGGGEARPRTVWLGHPEKRDQ
:: :: : : . :::::: ::: ..
CCDS12 YHTLPRARIMQRKRGLEWFVCDGWKFLCTSCCGWLINICRRKKELKARTVWLGCPEKCEE
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40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RYPRNVINNQKYNFFTFLPGVLFNQFKYFFNLYFLLLACSQFVPEMRLGALYTYWVPLGF
..::: :.::::: :::.::::..:::.:.:::::...:::::: ...: :::::.::::
CCDS12 KHPRNSIKNQKYNVFTFIPGVLYEQFKFFLNLYFLVISCSQFVPALKIGYLYTYWAPLGF
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pF1KA0 VLAVTVIREAVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSK
:::::. :::..:.: . ::::::::.::.::.:: :
CCDS12 VLAVTMTREAIDEFRRFQRDKEVNSQLYSKLTVRGKVQVKSSDIQVGDLIIVEKNQRIPS
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160 170 180 190 200 210
pF1KA0 IGLFDLEVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGRWYLQIIRFLLLFSNIIPISLRVNLD
CCDS12 DMVFLRTSEKAGSCFIRTDQLDGETDWKLKVAVSCTQQLPALGDLFSISAYVYAQKPQMD
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. ::..::: : . ..: .. .: . . .: . : . :. :.: ..
CCDS33 TKEIFGVAVYTGMETKMALNYKSKSQKRSAVEKSMNTFLIIYLVILISEAVISTILKYTW
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pF1KA0 -ALQHFAGRWYLQ----------IIRF-------LLLFSNIIPISLRVNLDMGKIVYSWV
: ... :: : :.:: :.:.. :::::: :...: :.. :.
CCDS33 QAEEKWDEPWYNQKTEHQRNSSKILRFISDFLAFLVLYNFIIPISLYVTVEMQKFLGSFF
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: : . . : .: . :.::.. :..::::::::.::: :.. .. . :
CCDS33 IGWDLDLYHEESDQKAQVNTSDLNEELGQVEYVFTDKTGTLTENEMQFRECSINGMKYQE
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pF1KA0 ------------DSMDEVQSHIFSIYTQQSQDPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVHEAV-KA
:: . :.. :. .. . . .. :. .: . :. ::
CCDS33 INGRLVPEGPTPDSSEGNLSYLSSLSHLNNLSHLTTSSSFRTSPENETELIKEHDLFFKA
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..:::.: .. : .. ... : : :::::: :::. . .:....: ..
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.:...: : .. . .:.:. : . .::..::. : :: .. :::. .. :
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. . . ..: .:::.: .: .... ..:.... : .:. ....: :.:.:.. .:
CCDS33 IEKTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEEIDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQFIE
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pF1KA0 MEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETA-TCTAKNAHLVTRNQD
.. :: :.:::.:: :: :.:.:: ::::::.::::: ::: . . . .:. ..
CCDS33 KDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKVWVLTGDKHETAVSVSLSCGHF---HRT
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.....:........ .: . :. : . .::..: :: . :. .: :::. .
CCDS33 MNILELINQKSDSECAEQLRQLARRITEDHVIQHGLVVDGTSLSLALREHEKLFMEVCRN
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pF1KA0 CPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGK-LTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQA
: ::.::: :: :::...::.. : .: :::::.::::::::. :.:. ::::.::
CCDS33 CSAVLCCRMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQA
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pF1KA0 SLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYFASVP
. .:..:..:: :..::.:::. : : :.: :. .....:. : : ... :..
CCDS33 ARNSDYAIARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQT
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pF1KA0 LYQGFLIIGYSTIYTMFPV--FSLVLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRPLSYKTFLIWV
::.. . :. .: .:. .:: :.. : .: . : ::.:. :.: :: :::: :.
CCDS33 LYDSVYLTLYNICFTSLPILIYSL-LEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWT
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pF1KA0 LISIYQGSTIMYGALLLFESE---------FVHIV--AISFTSLILTELLMVALTIQTWH
.... .. ...:. ::. .. : . . .. :: ...: . .:: . :
CCDS33 ILGFSHAFIFFFGSYLLIGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWT
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pF1KA0 WLMTVAELLSLACY-IASLVF---LHEFI---DVYF--IATLSF--LWKVSVITLVSCLP
:. .. :. : . :: . : :. ..:: : :: : . .. .:.::
CCDS33 WINHLVTWGSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLF
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pF1KA0 LYVLK-YLRRRFSPPSYSKLTS
: ..: . :.. : : :
CCDS33 LDIIKKVFDRHLHPTSTEKAQLTETNAGIKCLDSMCCFPEGEAACASVGRMLERVIGRCS
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CCDS34 ITNVQILILFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFN
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:.::::: :.:.. :.. .. : : . : ....:.:.. :.::...:...::::
CCDS34 NLIPISLLVTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTG
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::: : : ::. .. :::: . : ... : :.:: : . . .: ... .
CCDS34 TLTCNVMQFKKCTIAGVAYG--HVPEPEDYGCSPDEWQNSQFGDEKTFSDSSLLENLQNN
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. . : . .:.::...: :.. . .:::.:::: :::. .
CCDS34 HPTAPIICEFLTMMAVCHTAVPEREGDKI---------------IYQAASPDEGALVRAA
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........:: .:. . . : : . .:... :: :::..::: : :.. .: ::
CCDS34 KQLNFVFTGRTPDSVIIDSLG-QEERYELLNVLEFTSARKRMSVIVRTPS-GKLRLYCKG
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::.: .: .:.. .. ..: ::::.: : ..: ..:...: : .:. ::
CCDS34 ADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSV
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..: ::. : .: ...:: :..::.:: .: :.::: .: ::.:.::::: :::
CCDS34 QNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDKLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAI
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pF1KA0 CTAKNAHLVTRNQDIHVF--------RLVTNRGEAHLELNAFRRKHDCALVISGDSLEVC
... .:. .:. . :. : . .: . : .:.:...: ::.:.: .:.
CCDS34 NIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSRHCTTLG-DALRKENDFALIIDGKTLKYA
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pF1KA0 LKY-YEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQES
: . . :..:: .: ::.::: .: ::...:....... .: :.:::.::::::: .
CCDS34 LTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVVTLAIGDGANDVSMIQTA
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pF1KA0 DCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTM
:::. :.:: ::. ..:.::.:::.: :::.:: .:.: . . ..... . .
CCDS34 HVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMIHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYII
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pF1KA0 QAVFSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSL-VLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLK
. :. : :.. :.. . : :....: .: ..: ..... ..: . :::::: .
CCDS34 EIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSCRKENMLKYPELYKTSQN
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pF1KA0 GRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFE----------SEFVHIVAISFTSLILTE
. .. :.: . : ..... ... : .. :... . . .: ...:
CCDS34 ALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGTAFGNGKTSDYLLLGNFVYTFVVITV
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: ..: . : :. .: :.: ..
CCDS34 CLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSSLWPAIPMAPDMSGEAAMLFSSGVFW
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pF1KA0 IREAVEEIRCYVRDKEVNSQVYSRLTARGTVVGVVLYTGRELRSVMNTSNPRSKIGLFDL
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CCDS41 GNLNLDGKSLVALGPDQILLRGTQLRNTQWVFGIVVYTGHDTKLMQNSTKAPLKRSNVEK
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pF1KA0 EVNCLTKILFGALVVVSLVMVALQHFAGR------WYLQ------------IIRFLLLFS
.: .::: :.:..:: : . .: ::.. .. :..:..
CCDS41 VTNVQILVLFGILLVMALVSSAGALYWNRSHGEKNWYIKKMDTTSDNFGYNLLTFIILYN
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:.::::: :.:.. : . . : :. . ...:.:.. :.::...::..::::
CCDS41 NLIPISLLVTLEVVKYTQALFINWDTDMYYIGNDTPAMARTSNLNEELGQVKYLFSDKTG
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::: : : ::. .. :.:: . : .: : . .: : : .. :.
CCDS41 TLTCNIMNFKKCSIAGVTYGHFPELAREPSSDDFCRMPPPCSDSCDFDDPRLLKNIEDRH
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. ..: . .:.::.:.: :..: :. .::::::::.:::. ..
CCDS41 PTAPCIQEFLTLLAVCHTVVP--EKDG------------DNI-IYQASSPDEAALVKGAK
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pF1KA0 SVGLTLVGRDQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGA
..:.....: :. ... : : .: ::... :. . :::..::: : :.. .: :::
CCDS41 KLGFVFTARTPFSVIIEAMG-QEQTFGILNVLEFSSDRKRMSVIVRTPS-GRLRLYCKGA
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pF1KA0 D-VVMAGIVQYNDWLEEECGNM---AREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARYVQAKLSVH
: :.. . . . ..:: .. : ::::.: :: .:.:..:... : .:. ..
CCDS41 DNVIFERLSKDSKYMEETLCHLEYFATEGLRTLCVAYADLSENEYEEWLKVYQEASTILK
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::. .. : .: .. :: :..::.::: : :. :: .: ::.:.::::: :::
CCDS41 DRAQRLEECYEIIEKNLLLLGATAIEDRLQAGVPETIATLLKAEIKIWVLTGDKQETAIN
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pF1KA0 TAKNAHLVTRNQDIHVFR---LVTNRGEA--H-LEL-NAFRRKHDCALVISGDSLEVCLK
. . .::..:. . ... : ..:. : .: : . ...: ::.:.: .:. :.
CCDS41 IGYSCRLVSQNMALILLKEDSLDATRAAITQHCTDLGNLLGKENDVALIIDGHTLKYALS
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. . :..:: .: ::.::: .: ::..:: ....:. .: :.:::.:::.::: .
CCDS41 FEVRRSFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEIVDVVKKRVKAITLAIGDGANDVGMIQTAHV
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pF1KA0 GVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQA
:::. :.:: ::. .:..:.::..: .::.::: ::.: . . ..... . ..
CCDS41 GVGISGNEGMQATNNSDYAIAQFSYLEKLLLVHGAWSYNRVTKCILYCFYKNVVLYIIEL
840 850 860 870 880 890
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:. : :.. :.. . : :..:.: .: :.: ..... .: . .:.::: .:.
CCDS41 WFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVIFTALPPFTLGIFERSCTQESMLRFPQLYKITQNGE
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pF1KA0 PLSYKTF-------------LIWVLISIYQGSTIMYGALLLFESEFVHIVAISFTSLILT
.. :.: :.: .. . .:.. .. .... . : .: ...:
CCDS41 GFNTKVFWGHCINALVHSLILFWFPMKALEHDTVLTSG---HATDYLFVGNIVYTYVVVT
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: ..: .:
CCDS41 VCLKAGLETTAWTKFSHLAVWGSMLTWLVFFGIYSTIWPTIPIAPDMRGQATMVLSSAHF
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: :.:.:::.. . ..:...: :.. .
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::: : : ::. .. :::: .:. :: :. . ... :. .: .
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: . .:.::...: :.. . .:::.:::: :::. ....
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.....:: .:. . . : : . .:... :: :::..::: : :.. .: ::::.
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: .: .:.. .. ..: ::::.: : ..: ..:...: : .:. ::..:
CCDS47 VIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSVQNR
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::. : .: ...:: :..::.:: .: :.::: .: ::.:.::::: ::: .
CCDS47 LLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDKLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAINIG
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.. .:. .:. . :. : . .: . : .:.:...: ::.:.: .:. : .
CCDS47 HSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSRHCTTLG-DALRKENDFALIIDGKTLKYALTF
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pF1KA0 -YEYEFMELACQCPAVVCCRCAPTQKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCG
. :..:: .: ::.::: .: ::...:....... .: :.:::.::::::: . :
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pF1KA0 VGVEGKEGKQASLAADFSITQFKHLGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAV
::. :.:: ::. ..:.::.:::.: :::.:: .:.: . . ..... . ..
CCDS47 VGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMIHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEIW
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pF1KA0 FSSVFYFASVPLYQGFLIIGYSTIYTMFPVFSL-VLDKDVKSEVAMLYPELYKDLLKGRP
:. : :.. :.. . : :....: .: ..: ..... ..: . :::::: ..
CCDS47 FAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSCRKENMLKYPELYKTSQNALD
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pF1KA0 LSYKTFLIWVLISIYQGSTIMYGALLLFE----------SEFVHIVAISFTSLILTELLM
.. :.: . : ..... ... : .. :... . . .: ...: :
CCDS47 FNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGTAFGNGKTSDYLLLGNFVYTFVVITVCLK
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..: . : :. .: :.: ..
CCDS47 AGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSSLWPAIPMAPDMSGEAAMLFSSGVFWMGL
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: :. .:: :. ...... . . .: : .: . ....
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:::::::: : ::: .. :: ::. :. .. . .. .:: : :
CCDS32 KTGTLTQNIMTFKRCSINGRIYGEVHDDLDQKTEITQEKEPVDFSVKSQADREFQFFDHH
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. . . .::: .. .::::.: .: : .::..:::: :
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:: ... :. . .: .. .. : .... .: .. :. :::..:::. :.:
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.: ::::... . :. : .. ...: ::::.:..: ..: .. .....
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.:. ....:. ..: . : .: .. :: :.:::.:: : :. .: :.::.:.::::
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: ::: .:. ... ... :. ..: : : ...:
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:.:.:... . .: :.:::.::::::. . :::. :.:: :: ::.:.:..::..: :
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::.:::: :: : . . ..... .. .. :. :.. .:. ..: .. .::
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.::... ..:.::... .. :.::: . .. . :.: :: .:: . ... :::
CCDS32 LPVLAMGIFDQDVSDQNSVDCPQLYKPGQLNLLFNKRKFFICVLHGIYTSLVLFFIPYGA
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. .: ::. :... :::... ...:: . : .. : :.: :.. :
CCDS32 FYNVAGEDGQHIADYQSFAVTMATSLVIVVSVQIALDTSYWTFINHVFIWGSIAIYFSIL
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pF1KA0 VFLHE------FIDVY-FIA------TLSFLWKVSVITLV-SCLPLYVLKYLRRRFSPPS
.: : . . :.. : . .: : ..: : : .:. ....:. . :
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pF1KA0 YSKLTS
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....: .: . .:. :::.: : ....: : . . :: :: .::::::::
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:. .. .:.: . .. :.. . ..: : .:.:. : .::..::.. .:::: .
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. :::: .. ... . : .. . : ::::.: :: : : .:.:. . ::.
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...:: :.: . :..: .. :: :.:::.:: . :.:.:..::::::.:::::.::
CCDS32 ALQDREKKLAEAYEQIEKDLTLLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMET
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CCDS32 AAATCYACKLFRRN--TQLLELTTKRIEEQSLHDVLFELSKTVLRHSGSLTRDNLSGLSA
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: .:.:.: .: . .: :. :.:. .: ::.::: :: ::::::.:.
CCDS32 DMQDYGLIIDGAALSLIMKPREDGSSGNYRELFLEICRSCSAVLCCRMAPLQKAQIVKLI
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. . .: :.:::.:::::: :. :.:: ::::.::. .:..: .:::: ..:.::
CCDS32 KFSKEHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLKKMLLVH
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:. : : . : :. .....:. : ... :.. ::. . :. .: .:.
CCDS32 GHFYYIRISELVQYFFYKNVCFIFPQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNISFTSLPILL
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.:: ... : .: : ::.:. :. : ...:. :.:...... ....:: ..::.
CCDS32 YSL-MEQHVGIDVLKRDPTLYRDVAKNALLRWRVFIYWTLLGLFDALVFFFGAYFVFENT
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pF1KA0 FV----HIVA------ISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLSLACYIA-SLV--
: .: . . :: ...: : .:: . : :. . :: :.. ::.
CCDS32 TVTSNGQIFGNWTFGTLVFTVMVFTVTLKLALDTHYWTWINHFVIWGSLLFYVVFSLLWG
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pF1KA0 -----FL-HEFIDVYFIATLSF--LW-KVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS
:: .. . :: :: : . ... .: ::
CCDS32 GVIWPFLNYQRMYYVFIQMLSSGPAWLAIVLLVTISLLPDVLKKVLCRQLWPTATERVQT
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CCDS32 KSQCLSVEQSTIFMLSQTSSSLSF
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CCDS10 TLYWKENKFPLSNQNMLLRGCVLRNTEWCFGLVIFAGPDTKLMQNSGRTKFKRTSIDRLM
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pF1KA0 NCLTKILFGALVVVSLVMV---AL-QHFAGR-------W-----------YLQIIRFLLL
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CCDS10 NTLVLWIFGFLVCMGVILAIGNAIWEHEVGMRFQVYLPWDEAVDSAFFSGFLSFWSYIII
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CCDS10 LNTVVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDKKMFCMKKRTPAEA-RTTTLNEELGQVEYIFSD
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CCDS10 KTGTLTQNIMVFNKCSINGHSYG-DVFD-VLGHKAELGERPEPVDFSFNPLADKKFLFWD
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CCDS10 PSLLEAVK-IGDPHTHEFFRLLSLCHTVMSEEKNEG--------ELY------YKAQSPD
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