Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0605
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0605, 951 aa
1>>>pF1KA0605 951 - 951 aa - 951 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7080+/-0.00102; mu= 20.6300+/- 0.061
mean_var=124.0462+/-23.271, 0's: 0 Z-trim(109.0): 76 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.115155
statistics sampled from 10482 (10557) to 10482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 6876 1154.6 0
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CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117) 687 126.5 2.8e-28
CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224) 685 126.2 3.8e-28
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CCDS7307.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1226) 587 110.0 3e-23
CCDS12206.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 (1103) 580 108.7 6.3e-23
CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205) 579 108.6 7.5e-23
CCDS12071.1 ADAMTSL5 gene_id:339366|Hs108|chr19 ( 471) 573 107.2 8e-23
CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211) 572 107.5 1.7e-22
CCDS13579.1 ADAMTS5 gene_id:11096|Hs108|chr21 ( 930) 566 106.3 2.8e-22
CCDS30852.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 ( 877) 559 105.1 6.1e-22
CCDS955.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1074) 559 105.2 6.9e-22
CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 556 104.7 9e-22
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 544 102.8 3.9e-21
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 535 101.1 9.3e-21
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CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 520 99.0 8.3e-20
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 513 97.8 1.9e-19
CCDS47954.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 (1762) 509 97.2 3e-19
CCDS72908.1 ADAMTSL4 gene_id:54507|Hs108|chr1 (1097) 434 84.5 1.3e-15
CCDS82801.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1907) 429 83.9 3.2e-15
CCDS2903.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1935) 429 83.9 3.2e-15
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 412 81.0 2.1e-14
CCDS32114.1 PAPLN gene_id:89932|Hs108|chr14 (1251) 402 79.2 5.4e-14
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 397 78.0 5.5e-14
CCDS66817.1 THSD4 gene_id:79875|Hs108|chr15 ( 658) 398 78.3 5.7e-14
CCDS34140.1 ADAMTS12 gene_id:81792|Hs108|chr5 (1594) 393 77.9 1.8e-13
CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15 (1170) 351 70.7 1.9e-11
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 345 69.8 4e-11
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 345 69.8 4.1e-11
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 345 69.8 4.2e-11
CCDS73262.1 SPON1 gene_id:10418|Hs108|chr11 ( 807) 337 68.2 7.3e-11
>>CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 (951 aa)
initn: 6876 init1: 6876 opt: 6876 Z-score: 6178.8 bits: 1154.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6876; 99.8% identity (99.9% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDGRWQCSCWAWFLLVLAVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFS
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CCDS69 MDGRWQCSCWAWFLLVLAVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTACS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 RSCGGGVTSQERHCLQQRRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RSCGGGVTSQERHCLQQRRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NSHVYNGRTHQWKPLYPDDYVHISSKPCDLHCTTVDGQRQLMVPARDGTSCKLTDLRGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NSHVYNGRTHQWKPLYPDDYVHISSKPCDLHCTTVDGQRQLMVPARDGTSCKLTDLRGVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VSGKCEPIGCDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VSGKCEPIGCDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DIQIVERKKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DIQIVERKKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VAQGPTNQGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VAQGPTNQGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MGFIPHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPR
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MGFVPHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GKGFRDRNVTGTPLTGDKDDEEVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNETVNS
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CCDS69 GKGFRDRNVTGTPLTGDKDDEEVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNETVNS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IFAQGAPRSSLAESFFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSEAPFPNVSTSLLT
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CCDS69 IFAQGAPRSSLAESFFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSEAPFPNVSTSLLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SAGNRTHKARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SAGNRTHKARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSS
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CCDS69 DSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLC
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CCDS69 VYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 DPNTRPVGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQME
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CCDS69 DPNTRPVGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQME
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TKPLAIHPCGDKNCPAHWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TKPLAIHPCGDKNCPAHWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KKPPEESTCFERPCFKWYTSPWSECTKTCGVGVRMRDVKCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KKPPEESTCFERPCFKWYTSPWSECTKTCGVGVRMRDVKCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA0 ACDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ACDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS
910 920 930 940 950
>>CCDS31778.2 ADAMTS20 gene_id:80070|Hs108|chr12 (1910 aa)
initn: 745 init1: 189 opt: 828 Z-score: 745.0 bits: 150.2 E(32554): 3.6e-35
Smith-Waterman score: 1148; 26.8% identity (52.0% similar) in 975 aa overlap (50-909:559-1476)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 VAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRR
:: : ... ::.::::. : :.:
CCDS31 ADGTDCGPGMHCRHGLCVNKETETRPVNGEWGPWEPYSSCSRTCGGGIESATRRC----N
530 540 550 560 570 580
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 KSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSFNS-HV-YNG--RTHQWKPL
. : :. :.: ... : .. :: ..:::.:: .::. :. .: . .: :
CCDS31 RPEPRNGGNYCVGRRMKFRSCNTDSCPKGTQDFREKQCSDFNGKHLDISGIPSNVRWLPR
590 600 610 620 630 640
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 YPDDYVHISSKP-CDLHCTTVDGQRQLMVP--ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGCDG
: :..: : :.: .. . .. ..::: : :. . .::.:.: :::
CCDS31 YSG----IGTKDRCKLYCQVAGTNYFYLLKDMVEDGTPCG-TETHDICVQGQCMAAGCDH
650 660 670 680 690
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 VLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVERKKSAD
:: :. .::::.: ::.::: .:: . ...: ::..:..::::: ...: . . :..
CCDS31 VLNSSAKIDKCGVCGGDNSSCKTITGVF--NSSHYGYNVVVKIPAGATNVDIRQYSYSGQ
700 710 720 730 740 750
260 270 280 290 300
pF1KA0 ----VLALADEAGYYFFNGNYKVD-SPKNFNIAGT--VVKYRRPMDVYETGIEYIVAQGP
:::.: : ..::::. .. : :..:. :: :..: .. .: : . .
CCDS31 PDDSYLALSDAEGNFLFNGNFLLSTSKKEINVQGTRTVIEYSGSNNA----VERINSTNR
760 770 780 790 800 810
310 320 330 340 350
pF1KA0 TNQGLNVMVWN-QNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIY---YGFSESAES--QGLDGAG
.. : ..: : .:.. . ... : : : . . :: :. . :::. .
CCDS31 QEKELILQVLCVGNLYNPDVHYSFNI---PLEERSDMFTWDPYGPWEGCTKMCQGLQRRN
820 830 840 850 860 870
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 LMGFIPHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPP
. . . :. .. ..: : . . . : :: . . . .. .. :
CCDS31 ITCIHKSDHSVVSDKECDHLPLPSFVTQSCNTDCEL------RWHVIGKSECSSQC----
880 890 900 910 920
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RGKGFRDRNVTGTPLTGDKDDE-EVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNE-T
:.:.: .. . . . .:: :. .... . ...: .. . . .: .
CCDS31 -GQGYRTLDIHCMKYSIHEGQTVQVDDHYCGDQL---KPPTQELCHGNCVFTRWHYSEWS
930 940 950 960 970
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 VNSIFAQGAPRSSLAESFFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVA-NSSSEAPFPNVST
: :. :: ::. .. . : : .. ::: ::. .. .: :. ..
CCDS31 QCSRSCGGGERSR--ESYCMN-----NFGHRLADNECQELS--RVTRENCNEFSCPSWAA
980 990 1000 1010 1020
540 550 560 570
pF1KA0 S----LLTSAGNRTHKART--------------RPKARKQGVSPADMYR---WKLSSHEP
: :.. :. :.. .. ... ...:: ... :... :
CCDS31 SEWSECLVTCGKGTKQRQVWCQLNVDHLSDGFCNSSTKPESLSPCELHTCASWQVGPWGP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
580 590 600 610 620
pF1KA0 CSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEV-DDSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQ----------P
:..:: : . . :: . : .:. : .:: .. :. :. :
CCDS31 CTTTCGHGYQMRDVKCVNELASAVLEDTECHEASRPSD-RQSCVLTPCSFISKLETALLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
630 640 650 660 670
pF1KA0 --------RWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEAVRPEE
.:. .::. :: .::.: : : : : :. : : : :. :: :
CCDS31 TVLIKKMAQWRHGSWTPCSVSCGRGTQARYVSCRDALDRIADESY----C--AHLPRPAE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 RKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSE-----DEKLCDPNTRPVGEKN
: .: :: .:. ..:: :.:.::. .. ::.. : . ::. :::..::. :..
CCDS31 IWDCFTP-CG-EWQAGDWSPCSASCGHGKT-TRQVLCMNYHQPIDENYCDPEVRPLMEQE
1210 1220 1230 1240 1250
740 750
pF1KA0 CTGPPCD-----------------------------------------RQWTVSDWGPCS
:. : :: .. :: ::
CCDS31 CSLAACPPAHSHFPSSPVQPSYYLSTNLPLTQKLEDNENQVVHPSVRGNQWRTGPWGSCS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPCGDKNCPAHWLAQDWERCNTTC
.::. : : : :. .:. . : :. .:: .. :: :: .: .: .:. ::
CCDS31 SSCSGGLQHRAVVCQDENGQSA--SYCDAASKPPELQQCGPGPCP-QWNYGNWGECSQTC
1320 1330 1340 1350 1360 1370
820 830 840 850 860
pF1KA0 GRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLAKKPPEESTCFERPC---FKWYTSPWSECTK
: :.:.:::.: .. :: : .: ...::: : . : .:. ::. :.
CCDS31 GGGIKSRLVIC-QFPNG--QILEDHNCEIVNKPPSVIQCHMHACPADVSWHQEPWTSCSA
1380 1390 1400 1410 1420 1430
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 TCGVGVRMRDVKC---YQGTDIVRGCDPLVKPVGRQACDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNC
.:: : ..:.: : .: .:. . :: ..:: ::.
CCDS31 SCGKGRKYREVFCIDQFQRKLEDTNCSQVQKPPTHKACRSVRCPSWKANSWNECSVTCGS
1440 1450 1460 1470 1480 1490
930 940 950
pF1KA0 ALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS
CCDS31 GVQQRDVYCRLKGVGQVVEEMCDQSTRPCSQRRCWSQDCVQHKGMERGRLNCSTSCERKD
1500 1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117 aa)
initn: 982 init1: 334 opt: 687 Z-score: 621.1 bits: 126.5 E(32554): 2.8e-28
Smith-Waterman score: 789; 25.4% identity (44.3% similar) in 796 aa overlap (22-806:545-1083)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MDGRWQCSCWAWFLLVLAVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWG
:: : :. : .:..:: ::
CCDS39 KSNRCVTNSIPAAEGTLCQTGNIEKGWCYQGDCVPFGTW---P--QSIDGG-------WG
520 530 540 550 560
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRS
:. : ::.:::::.:. ::: . .:. :.. : : :::. : .. :: .:.
CCDS39 PWSLWGECSRTCGGGVSSSLRHC----DSPAPSGGGKYCLGERKRYRSCNTDPCPLGSRD
570 580 590 600 610
120 130 140 150 160
pF1KA0 FREEQCVSFNSHVYNGRTHQWKPLYPDDYVHISSKPCDLHCTTVDGQRQLM--VPAR-DG
:::.::..:.. . :. ..::: :. . ::: :.: . .: .:: ::
CCDS39 FREKQCADFDNMPFRGKYYNWKP-----YTGGGVKPCALNCLA-EGYNFYTERAPAVIDG
620 630 640 650 660 670
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 TSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGCDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLG
:.:. .: .:..:.:. .:::..: : :.: .: ::::.: . : . . . :
CCDS39 TQCN-ADSLDICINGECKHVGCDNILGSDAREDRCRVCGGDGSTCDAIEGFFNDSLPRGG
680 690 700 710 720 730
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 YSLVTHIPAGARDIQIVERKKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRR
: :..:: :. :.. : : . .:: .:. :..:: . .: :..:..:::. .:.:
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pF1KA0 PMDVYETGIEYIVAQGPTNQGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSE
: : :. . : :::...: ::: ::: . . : : :.
CCDS39 PTDEPES----LEALGPTSENLIVMV---------------LLQEQNLG----IRYKFN-
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.:
CCDS39 ---------------VP-------------------------------------------
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.: : :.:..
CCDS39 --------------------ITRT-------------------------------GSGDN
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:: :
CCDS39 EVGFTWN-----------------------------------------------------
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:. : :. :::::. ::.
CCDS39 ------------------HQ-------------P-----WS-----ECSATCAGGVQRQE
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..: : : :...::: ..: .. : . : :.: ..: :::.:: :.. :.:
CCDS39 VVCKRLDDNSIVQNNYCDPDSKPPENQRACNTEPCPPEWFIGDWLECSKTCDGGMRTRAV
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: . ..:. . .. . : . :: :.. : : .: ::: .::::: ::: .
CCDS39 LCIRKIGPSEEETLDYSGCLTH---RPVEKEPCNNQSCPPQWVALDWSECTPKCGPGFKH
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: :. . :. . : ...: . :. : .:...::: ::..:: :. .:
CCDS39 RIVLCKSSDLSKTFPAAQCPEESKPPVRIRCSLGRCPPPRWVTGDWGQCSAQCGLGQQMR
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: : . :.. :.: ..: ... : .: : . ... :.:
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::
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:.
CCDS43 -------------------------------------------PS---------------
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: : . : ::..: : :.. : : .:. :.:. :
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:: : : : : ...:: :::::: : : : :.: . . .::
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.. :.. : :... :. :: .::.: : : ::... ....:.. : : ::
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pF1KA0 AIHPCGDKNC--PA--HWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCME-LANGKPQTRSGPECGL
. : . : : .::.. : .:..:: ::..::.. : : ..:: . .. .:.
CCDS43 MHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSH
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. :: :: . ::. . :: .: : :.: : :. . ..:.: .:.: ::
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:. :: : :.. . : ::..: : ... :.:.: ....:..:.:.: :.: ..
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: . : : . :: ::..:. : : : ..: . . .: .:: .. : .
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..: . :: ::: . ::
CCDS10 VQACNSHACPPQWSL------------------------------------------GP-
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:. :: .::.: :.. :: : ....::::: .: . : ::
CCDS10 ---------WSQCSKTCGRGVRKRELLCKGSAAETLPESQCTSLPRPELQEGCVLGRCPK
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. :.:..: .:..::: ::.:: . : : . .:: : .: ::: : ::
CCDS10 NSRLQWVASSWSECSATCGLGVRKREMKCSEKGFQGKLITFPERRCRNIKKPNLDLEETC
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CCDS10 ACNTNFCPAPEKREDPSCVDFFNW-CHLVPQHGVCNHKFYGKQCCKSCTRKI
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CCDS10 FHSPETSNNHGVGTHGATQSFSQPARSTAISCIGAYRQYKLCNTNVCPESSRSIREVQCA
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..:: :: :.:.: :: . ::: ...: ..:::. .: : ... .::. :.:: ..
CCDS10 VEIPEGATKINITEMYKSNNYLALRSRSGRSIINGNWAIDRPGKYEGGGTMFTYKRPNEI
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. :: .:. ..:. : . . :.:....
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: : :. .: : ...: :: . : .. :.: .: .:. :: :...:
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820 830 840 850 860 870
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CCDS10 VICVRKNADTFEVLDPSECSFLEKPPSQQSCHLKPCGAKWFSTEWSMCSKSCQGGFRVRE
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pF1KA0 YYSKACCRSCRPPHS
::. ::: ::
CCDS10 YYKTACCASCTRVANRQTGFLGSR
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..... ::: : :..::: ... ... . ::..:: . . .: . . :
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::
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CCDS73 RPEARRPCLRVPCPAQWRLGAWSQCSATCGE-GIQQRQV-------VCRTNANSLG--HC
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CCDS12 YRGGGVKACSLTCLAEGFNFYTERAAAVVDGTPCR-PDTVDICVSGECKHVGCDRVLGSD
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CCDS12 PPATMRCNLRRCPPARWVAGEWGECSAQCGVGQRQ---RSVRCTSHTGQASHECTEALRP
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:50:50 2016 done: Fri Nov 4 00:50:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]